АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 275640 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 151
  • Страна: ru
  • Рейтинг +60/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1980 : 30 Сентябрь 2019, 15:01:06 »
Подскажите, была ли работа с данными по неолитизации Балкан? Были ли геномы балканских охотников, и что с этими охотниками стало с приходом неолита?

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5517
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2303/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1981 : 30 Сентябрь 2019, 16:08:24 »
Подскажите, была ли работа с данными по неолитизации Балкан? Были ли геномы балканских охотников, и что с этими охотниками стало с приходом неолита?
Вот такая статья была http://forum.molgen.org/index.php/topic,10034.msg380919.html#msg380919

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 151
  • Страна: ru
  • Рейтинг +60/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1982 : 01 Октябрь 2019, 11:48:38 »
А мезолитические охотники Южной Европы это чистые WHG? На Балканах, как я понимаю, уже была небольшая неолитическая примесь вследствие контакта с анатолийскими охотниками. А что с Италией и Испанией?

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 5517
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2303/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1983 : 01 Октябрь 2019, 12:25:44 »
А мезолитические охотники Южной Европы это чистые WHG? На Балканах, как я понимаю, уже была небольшая неолитическая примесь вследствие контакта с анатолийскими охотниками. А что с Италией и Испанией?
У меня уже повылетели подробности из головы, но суть в том, что генофонд "древних западноевропейцев" динамически менялся и до неолита - то одна примесь прилетит, то другая. Какой момент времени и какую местность примем за наиболее чистых WHG, те ими и будут. Наверное, как раз удобнее всего объявить ими преднеолитических южноевропейцев )

ЕМНИП у меня получалось, что WHG 14-16 тлн это одно, а 7-9 тлн уже другое. При этом "испанец" la Brana оказывался в первом кластере, хронологически соответствуя второму. Но могу уже и напутать.

Ещё статья на тему неолитизации Балкан, более подробная http://forum.molgen.org/index.php/topic,9993.0.html
« Последнее редактирование: 01 Октябрь 2019, 13:03:41 от Srkz »

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1424
  • Страна: ru
  • Рейтинг +200/-6
  • Y-ДНК: N-Y4339>Y5611>F1983; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1984 : 01 Октябрь 2019, 16:44:19 »
Геномные результаты подтверждают предыдущие результаты ПЦР и устраняют оставшиеся сомнения относительно подлинности останков царской семьи.
А вот по рюриковичам не написали подобное, боюсь, как бы ещё одна ни с кем не совпадающая ДНК-линия не нарисовалась  :(
То, что результаты анализов останков Романовых положительны, уже было обнародовано ранее
например:
https://rg.ru/2015/11/11/ekspertiza-site.html
, а по Рюриковичам анализы, видимо, только подоспели и не хотят преждевременно разрушать интригу.
Что интересно, там написано, что проанализировали несколько древних Рюриковичей, хотя, конечно, самым интересным будет результат находящегося в пяти поколениях от Рюрика. Я так понял, там будет геномный результат, т.е. кроме субклада Y-гаплогруппы, будет еще мито и аутосомы, которые можно будет прогнать на этнокалькуляторе.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1173
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1342/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1985 : 02 Октябрь 2019, 05:15:07 »
Французы вроде как изучают древнюю ДНК из Азербайджана:

https://www.theses.fr/s214421

https://www.mnhn.fr/sites/mnhn.fr/files/documents/publication_complete.pdf

Машинный перевод:

Палеогенетические исследования миграций людей вокруг Каспийского моря в период протоистории.
Целью данного тезиса является изучение потоков населения между севером и югом Центральной Азии, чтобы понять, каким образом установлено экстремальное биологическое и культурное разнообразие, характерное для этого региона сегодня. Использование древних данных ДНК в Европе для реконструкции демографической истории населения позволило проследить две волны миграции в начале и конце периода неолита (Skoglund et al. 2012, 2014, Gamba et al. 2014, Lazaridis et al. 2014, Allentoft et al. 2015, Haak et al. 2014). В частности, в конце неолитического периода популяции из степей (Ямная) излучали в Западную Европу и Восточную Азию. В этом тезисе мы проверим, происходила ли миграция этих популяций и в направлении Южной Евразии.
Мы сосредоточимся на событиях, произошедших во времена неолита и протоистории вокруг Каспийского моря (Азербайджан, Туркменистан, Узбекистан и Иран). Семь археологических памятников были выбраны потому, что они показывают значительные археологические и культурные изменения между эпохой неолита и бронзы или бронзы и железного века, которые могут быть вызваны влиянием степных народов: изменения в типах керамики, похоронные практики, отсутствие престижных объектов.  Изучение древней ДНК, как митохондриальной, так и ядерной, человеческих останков по крайней мере двух периодов, рассматриваемых на каждом объекте, покажет, связаны ли эти культурные переходы с миграциями населения, и если да, то в количественном выражении покажет влияние этих потоков генов.
Отбор проб проводился в сотрудничестве со специалистами-археологами из этого региона (Х. Бендезу-Сармьенто; Б. Лионе).  Кроме того, эта диссертация будет включать в себя коллекцию Sialk из антропологической коллекции Музея Отмена. В конце концов, мы можем взять образец из 250 человеческих останков. Предварительные исследования, проведенные во время стажировки магистра в 2016 году, подтвердили наличие древней ДНК для двух изученных объектов (Улугское депе, Туркменистан; Менеш-Тепе, Азербайджан) и показали, что митохондриальные гаплогруппы, аналогичные древним популяциям Леванта и степей, действительно были найдены, что подтвердило осуществимость проекта.
Докторант будет отвечать за этапы молекулярной биологии, которые будут проходить в чистых помещениях платформы MNHN по палеогеномике и молекулярной генетике, а также за биоинформационный анализ полученных последовательностей. Он проведет сравнительный анализ данных, полученных на основе данных из древних геномов Западной Евразии, имеющихся в базах данных, а также геномических данных, полученных Лабораторией по современным популяциям в Центральной Азии.
Докторант будет интегрирован в Лабораторию экоантропологии и этнобиологии, команда которой обладает опытом изучения генетического разнообразия существующих популяций в Центральной Азии и располагает обширной генетической базой данных как митохондриальных, так и ядерных данных от нескольких сотен человек из нескольких популяций этого региона, которая может служить современной справочной базой.  Ему также будет полезно сотрудничество с Ф. Джеем (Laboratoire de Recherche en Informatique, UMR8623) в области восстановления демографической истории населения на основе данных по всему диахроническому геному.
Параллельно с этой генетической работой проводится изотопный анализ (совместно с М.Машкуром и Е.Машкуром).  Dufour (UMR7209) и морфометрические (в сотрудничестве с M. Friess (UMR7206)) будут проводиться на одних и тех же образцах для получения полной характеристики образцов.

Ложка дёгтя: 1) Пока всё это не опубликовано. 2) Французские лаборатории сильно отстают от немецких и американских, нормальных полных геномов они не публиковали.         
                   

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 388
  • Страна: ru
  • Рейтинг +375/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1986 : 02 Октябрь 2019, 22:13:36 »
 https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000166
Группа ученых из России, Германии, Бельгии и Нидерландов восстановила и упорядочила РНК древнего волка возрастом около 14 тыс. лет, останки которого были найдены в вечной мерзлоте в Сибири.Теперь ученым из Копенгагенского университета, Тюбингенского университета, Северо-восточного федерального университета и Королевского бельгийского института естествознания удалось восстановить и упорядочить РНК из рекордно старого образца.
Мумифицированные останки волка возрастом около 14,3 тыс. лет по кличке Щенок Туман (Tumat Puppy) были обнаружены в сибирской вечной мерзлоте. Исследователи изолировали и проанализировали РНК, взятую из ткани печени животного, и сравнили ее с тканью из двух гораздо более поздних образцов волка, живших в XVI и XX веках.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1173
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1342/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1987 : 03 Октябрь 2019, 00:13:34 »
https://nplus1.ru/news/2019/10/02/ancient-strain

В Поволжье обнаружили древнейшего возбудителя средневековой пандемии чумы

В Поволжье обнаружили древнейший штамм чумной палочки, которая стала виновницей средневековой пандемии в Европе, говорится в Nature Communications. Палеогенетики получили геном этой бактерии из останков, найденных в городе Лаишево в Татарстане. Она дала начало линиям, которые распространились в Европе и неоднократно вызывали вспышки заболевания в разных частях континента. По мнению авторов, говорить о точном происхождении возбудителя Черной смерти пока рано, и нужны дополнительные исследования.

https://www.nature.com/articles/s41467-019-12154-0

Phylogeography of the second plague pandemic revealed through analysis of historical Yersinia pestis genomes

    Maria A. Spyrou, Marcel Keller, Rezeda I. Tukhbatova, Christiana L. Scheib, Elizabeth A. Nelson, Aida Andrades Valtueña, Gunnar U. Neumann, Don Walker, Amelie Alterauge, Niamh Carty, Craig Cessford, Hermann Fetz, Michaël Gourvennec, Robert Hartle, Michael Henderson, Kristin von Heyking, Sarah A. Inskip, Sacha Kacki, Felix M. Key, Elizabeth L. Knox, Christian Later, Prishita Maheshwari-Aplin, Joris Peters, John E. Robb, Jürgen Schreiber, Toomas Kivisild, Dominique Castex, Sandra Lösch, Michaela Harbeck, Alexander Herbig, Kirsten I. Bos & Johannes Krause - Show fewer authors

Nature Communications volume 10, Article number: 4470 (2019) | Download Citation

Abstract

The second plague pandemic, caused by Yersinia pestis, devastated Europe and the nearby regions between the 14th and 18th centuries AD. Here we analyse human remains from ten European archaeological sites spanning this period and reconstruct 34 ancient Y. pestis genomes. Our data support an initial entry of the bacterium through eastern Europe, the absence of genetic diversity during the Black Death, and low within-outbreak diversity thereafter. Analysis of post-Black Death genomes shows the diversification of a Y. pestis lineage into multiple genetically distinct clades that may have given rise to more than one disease reservoir in, or close to, Europe. In addition, we show the loss of a genomic region that includes virulence-related genes in strains associated with late stages of the pandemic. The deletion was also identified in genomes connected with the first plague pandemic (541–750 AD), suggesting a comparable evolutionary trajectory of Y. pestis during both events.

Эх, ну могли бы за компанию хоть одного древнего булгарина протестировать, что за дискриминация.

Оффлайн falcon16

  • Сообщений: 229
  • Рейтинг +554/-5
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1988 : 04 Октябрь 2019, 20:55:31 »
Kinship-based social inequality in Bronze Age Europe  Mittnik 2019 
The genetic shifts in Germany's Lech Valley from the Late Neolithic to the Middle Bronze Age) - https://eurogenes.blogspot.com/2019/09/is-yamnaya-overrated.html?commentPage=4&fbclid=IwAR1v7Wr8F7gYvv7c3N48p3eCsj6G9drKJ1PjpHXcNFp2GIbfHxI_QCH6XOs

https://anthrogenica.com/showthread.php?8066-Genetic-Genealogy-amp-Ancient-DNA-in-the-News-(DISCUSSION-ONLY)&p=607272&viewfull=1#post607272



BBC (Bell Beaker Complex)
Augsburg – Hugo-Eckener-Straße (HUGO) 2562-2345 2270-2039
Haunstetten – Unterer Talweg 58-62 (UNTA) 2470-2310 2455-2204
Haunstetten – Unterer Talweg 85 I (northern group) (UNTA) 2465-2300 2397-2149
Haunstetten – Unterer Talweg 85 II (southern group) (UNTA) 2456-2155 2290-2141
Wehringen – Hochfeld (WEHR) 2463-2215 2463-2215
Königsbrunn – Ampack (AMPA) 2476-2310 2476-2310

EBA (Early Bronze Age)
Haunstetten – Postillionstraße (POST) 2197-2034 1939-1772
Haunstetten – Unterer Talweg 58-62 (UNTA) 2031-1900 1971-1776
Haunstetten – Unterer Talweg 85 (UNTA) 2025-1895 1960-1774
Königsbrunn – Obere Kreuzstraße (OBKR) 2136-1977 2011-1780
Wehringen – Hochfeld (WEHR) 2029-1916 1918-1772

1_AITI_119 R-L2            R-L2            R1b1a2a1a2b1             
2_AITI_120 R-L2            R-L2            R1b1a2a1a2b1             
3_AITI_2 BT-M94          BT-M42          BT                       
32_AITI_3_d A               A               A                       
28_AITI_32_d A               A               A                       
29_AITI_33_d A               A               A                       
30_AITI_35_d A               A               A                       
4_AITI_36 CT-Z17711       CT-M168         CT                       
31_AITI_37_d A               A               A                       
5_AITI_40 R-L2            R-L2            R1b1a2a1a2b1             
6_AITI_43 BT-M94          BT-M42          BT                       
36_AITI_5_d A               A               A                       
7_AITI_50 BT-M94          BT-M42          BT                       
33_AITI_51_d CT-M5690        CT-M168         CT                       
34_AITI_53_d A               A               A                       
35_AITI_55_d A               A               A                       
37_AITI_62A_d A               A               A                       
38_AITI_62B_d A               A               A                       
39_AITI_65adult_d A               A               A                       
40_AITI_65child_d A               A               A                       
41_AITI_66_d A               A               A                       
8_AITI_70 R-V75.2         R-V75.2         R1b1a2a1a2c1g2a1a2b1     
9_AITI_72 BT-M299         BT-M42          BT                       
42_AITI_77A_d A               A               A                       
43_AITI_77B_d A               A               A                       
10_AITI_78 BT-M94          BT-M42          BT                       
11_AITI_86 R-P224          R-M207          R                       
44_AITI_87_d A               A               A                       
45_AITI_92_d A               A               A                       
46_AITI_95_d A               A               A                       
12_AITI_98 R-P312          R-P312          R1b1a2a1a2               
47_ALT_1_d A               A               A                       
48_ALT_2_d A               A               A                       
49_ALT_3_d A               A               A                       
50_ALT_4_d R-P310          R-P311          R1b1a2a1a               
51_AMP_1_d R-PF6495        R-M269          R1b1a2                   
52_FMW_d A               A               A                       
53_HUGO_167_d BT-Z11984       BT-M42          BT                       
54_HUGO_168_d A0-T-L1105      A0-T-L1085      A0-T                     
55_HUGO_169Sk1_d G-M3267         G-P287          G2                       
56_HUGO_171_d A               A               A                       
57_HUGO_180Sk1_d R-L743          R-L743          R1b1a2a1a2c1k1a1a       
58_HUGO_180Sk2_d R-PF6495        R-M269          R1b1a2                   
59_HUGO_190_d A               A               A                       
60_OBKR_117_d I-L258          I-L258          I1a1b3a1                 
61_OBKR_2_d A               A               A                       
62_OBKR_47_d A               A               A                       
63_OBKR_50_d J-PF4524        J-M304          J                       
66_OBKR_6_d A               A               A                       
64_OBKR_66_d A               A               A                       
65_OBKR_67_d R-M343          R-M343          R1b                     
67_OBKR_73_d A               A               A                       
68_OBKR_76_d A               A               A                       
13_OBKR_80 BT-M94          BT-M42          BT                       
69_OBKR_81_d A               A               A                       
70_OBKR_82_d A               A               A                       
71_OBKR_84_d A               A               A                       
72_OBKR_86_d R-M343          R-M343          R1b                     
73_OBKR_93_d A               A               A                       
74_OBKR_95_d A               A               A                       
75_OBKR_96_d A               A               A                       
76_OBKR_9A_d G-Z16575        G-Z7947         G2a1a1a1a1a1b1           
77_OTTM_100_d A               A               A                       
78_OTTM_109_d A               A               A                       
79_OTTM_110_d A               A               A                       
80_OTTM_141_d A               A               A                       
14_OTTM_141A A               A               A                       
81_OTTM_142_d A               A               A                       
82_OTTM_151ind1_d A               A               A                       
83_OTTM_151ind2_d BT-Z11985       BT-M42          BT                       
84_OTTM_152_d A               A               A                       
15_OTTM_154 BT-M9001        BT-M42          BT                       
16_OTTM_156 IJK-L16         IJK-L15         IJK                     
85_OTTM_165_d A               A               A                       
86_OTTM_79_d A               A               A                       
87_OTTM_81_d A               A               A                       
88_OTTM_84_d A               A               A                       
89_OTTM_87_d E-Y1193.2       E-M132          E1a                     
90_OTTM_91_d A               A               A                       
91_OTTM_92_d A               A               A                       
92_OTTM_94_d A               A               A                       
93_OTTM_97_d A               A               A                       
98_POST_1_d A               A               A                       
94_POST_12_d A               A               A                       
95_POST_131_d A               A               A                       
96_POST_140_d BT-M9069        BT-M42          BT                       
97_POST_16_d A               A               A                       
99_POST_2_d A1-L1112        A1-P305         A1                       
17_POST_28 R-P312          R-P312          R1b1a2a1a2               
100_POST_32_d A               A               A                       
101_POST_35_d A               A               A                       
18_POST_44 BT-M94          BT-M42          BT                       
19_POST_47 D-M179          D-M55           D1b                     
20_POST_50 BT-M94          BT-M42          BT                       
21_POST_6 BT-M94          BT-M42          BT                       
102_POST_85_d A               A               A                       
103_POST_99_d A               A               A                       
104_UNTA121_FK61_d A               A               A                       
105_UNTA58_147_d A               A               A                       
106_UNTA58_149_d BT-M9242        BT-M42          BT                       
107_UNTA58_152_d A               A               A                       
22_UNTA58_153 R-L23           R-L23           R1b1a2a                 
108_UNTA58_67_d C-K520          C-K516          C2e2a1                   
23_UNTA58_68Sk1 BT-M94          BT-M42          BT                       
109_UNTA58_68Sk2_d A               A               A                       
110_UNTA85_1336_d A               A               A                       
24_UNTA85_1343 BT-M94          BT-M42          BT                       
25_UNTA85_1412 R-L150.1        R-M269          R1b1a2                   
111_UNTA89_FK231_d A               A               A                       
26_WEHR_1192SkA BT-M94          BT-M42          BT                       
112_WEHR_1192SkB_d F-P158          F-M89           F                       
113_WEHR_1193_d A               A               A                       
114_WEHR_1414_d BT-M9214        BT-M42          BT                       
115_WEHR_1415adult_d A               A               A                       
27_WEHR_1415child R-L2            R-L2            R1b1a2a1a2b1             
116_WEHR_1474_d G-M3609         G-M201          G                       
117_WEHR_1564_d CT-M5782        CT-M168         CT                       
118_WEHR_1586_d A               A               A
« Последнее редактирование: 12 Октябрь 2019, 20:24:50 от falcon16 »

Оффлайн Safiya

  • R1b Z2103
  • Сообщений: 476
  • Страна: ru
  • Рейтинг +135/-3
  • FTDNA 331841
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1989 : 05 Октябрь 2019, 02:00:19 »
Утверждать, что чума в Европу пришла из Лаишево, ученые не спешат. Они считают, что болезнь могла придти на территорию современного Татарстана из Средней Азии. Провести исследование останков из могил XIV-XVII веков на территории среднеазиатских стран пока не удалось.
Вероятно, именно чума и стала причиной гибели людей из поселения времен Золотой Орды на территории Аксубаевского района. Древнее захоронение было обнаружено случайно во время прокладки нефтепровода летом 2019 года.
https://www.kazan.kp.ru/online/news/3626925/

Из статьи годичной давности. В целом, интересно написано и очень легко читается:
Цитировать
Около 1320 года где-то в глубине Средней Азии был пойман, зажарен и съеден сурок. Для тех краёв это вполне обычное дело, и уж, конечно, неведомый любитель деликатесов понятия не имел, какого размаха события он запустил, просто хорошо поужинав и сняв шкурку для продажи.
https://life.ru/t/%D1%87%D1%83%D0%BC%D0%B0/1146105/chiornaia_smiert_epidiemiia_razrushivshaia_tsielyi_kontinient

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 7742
  • Страна: gr
  • Рейтинг +667/-123
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1990 : 05 Октябрь 2019, 14:49:37 »
от те раз   76_OBKR_9A_d G-Z16575        G-Z7947         G2a1a1a1a1a1b1   не в бровь а в глаз
снипу примерно 750 лет - возможно из палео но не германской бронзы
Пока не знаем является ли Z16575 эквивалентом Z7947, может образец будет Z16575+ и Z7947-

Оффлайн Uranium

  • Сообщений: 8
  • Страна: us
  • Рейтинг +3/-0
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1991 : 05 Октябрь 2019, 20:51:30 »
Владимир Волков о генетических исследованиях Рюриковичей:
https://youtu.be/Zkja1w5tXP0

Оффлайн Tamu

  • Сообщений: 533
  • Рейтинг +83/-0
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1992 : 12 Октябрь 2019, 11:03:07 »
https://science.sciencemag.org/content/suppl/2019/10/09/science.aax6219.DC1

OBKR 9A (который G2a1a)) в работе идёт как женский результат

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1424
  • Страна: ru
  • Рейтинг +200/-6
  • Y-ДНК: N-Y4339>Y5611>F1983; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1993 : 15 Октябрь 2019, 17:16:10 »
Известно, когда будет выступление по Рюриковичам?

Оффлайн Laszcz

  • von Wrbna, von Würben, de Vrbna, h. Wierzbna (de Verbno)
  • Сообщений: 1172
  • Страна: ru
  • Рейтинг +286/-31
    • laszczynski.pl
  • Y-ДНК: E-V13 (E-CTS9320*)
  • мтДНК: J1c2r
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1994 : 15 Октябрь 2019, 17:42:01 »
Известно, когда будет выступление по Рюриковичам?

PgmNr 2359/T: Genomic game of thrones: Ancient DNA analysis of European and Asian royal dynasties.
2:00PM-3:00PM Oct 17

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100