АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 306053 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12295
  • Страна: az
  • Рейтинг +2536/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1800 : 23 Февраль 2019, 09:11:43 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5443
  • Страна: ru
  • Рейтинг +419/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1801 : 23 Февраль 2019, 09:23:01 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Кто ещё показал светлую кожу из дДНК 10000 летней давности?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12295
  • Страна: az
  • Рейтинг +2536/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1802 : 23 Февраль 2019, 09:52:53 »
G2 из Ирана вроде

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +360/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1803 : 23 Февраль 2019, 10:36:34 »
К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Farroukh позволю себе не согласиться с Вами. Покрытие Чеддара как раз неплохое 2,3. Это позволило довольно надежно определить его пигментацию, причем по расширенному количеству параметров.
Кстати, пигментации различных WHG, а так же неолитического "Свена" в статье специально посвящены два абзаца. Из западных охотников-собирателей сравнивались Чеддар, Лошбур и Ла Бранья.

The Mesolithic Cheddar Man and the Neolithic sample from Carsington Pasture Cave, Derbyshire (‘Sven’) had sufficient coverage to estimate heterozygosity. Consistent with recent ancestry from larger or more admixed populations, Sven showed slightly higher levels of heterozygosity than Cheddar Man (Supplementary Figure S10). None of the Mesolithic and Neolithic British individuals analysed here had a derived lactase persistence allele (see Supplementary Table S2). We predicted pigmentation characteristics for Cheddar Man and Sven using Hirisplex25 and a recently-developed method for predicting skin pigmentation26. Previously, predictions on the level of skin pigmentation were mostly derived using two SNPs in SLC45A2 and SLC24A5 that indicate lack of hypo-pigmentation when in the ancestral state18. However, here we integrate 36 rather than 2 SNPs allowing more precise prediction26. Cheddar Man is predicted to have had dark or dark to black skin, blue/green eyes and dark brown possibly black hair, whereas Sven most likely had intermediate to dark skin pigmentation, brown eyes and black possibly dark brown hair (see Pigmentation section in the Supplementary Materials for a detailed discussion of the results). This is in line with the current hypothesis that alleles commonly associated with lighter skin were introduced in Western Europe by ANFs19.
 
We also analysed two previously-published WHGs, and find potential temporal and/or geographical variation in pigmentation characteristics. Loschbour22 from Luxembourg is ~2000 years younger than Cheddar Man, and is predicted to have had intermediate skin pigmentation. Furthermore, the Loschbour individual most likely had blue/green eyes. In contrast, La Braña18 from northern Spain who is slightly later than Loschbour is predicted to have had dark to dark to black skin and hazel/green eye colour. Both La Braña and Loschbour were predicted to have had black, possibly dark brown hair. These results imply that quite different skin pigmentation levels coexisted in WHGs at least by around 6000 BC

Что касается субклада Y10705 то он довольно редкий и массе своей концентрируется в центральной Европе: Британские острова и вдоль Рейна. Одна из веток присутствует на Балканах и у славя. И еще любопытнеее, что еще одна ветка обнаружена у татар.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5443
  • Страна: ru
  • Рейтинг +419/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1804 : 23 Февраль 2019, 10:46:04 »
А вот этот образец не перепроверяли? Он всё таки J или I?

Epipaleolithic   France   Aven des Iboussières, Malataverne [IBS-6 (25-1)]   M   10090-9460 BCE (based on a direct date of Iboussieres 39)
77062
J?
J:P209:19179335T->C; IJ:P126:21225770C->G   U5b2a

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12295
  • Страна: az
  • Рейтинг +2536/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1805 : 23 Февраль 2019, 12:14:28 »
Я неточно выразился. Имел в виду, что не определили его субклад на уровне ~9 тыс. лет, остановившись на верхнепалеолитическом Y10705. Думаю, если bam окажется на Yfull, то найдётся и более глубокий нисходящий возрастом ~9 тыс. лет.
« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 13:18:07 от Farroukh »

Оффлайн Ильгиз

  • Сообщений: 686
  • Страна: ru
  • Рейтинг +47/-6
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1806 : 26 Февраль 2019, 07:39:29 »
Вот это было? "Matrilineal and patrilineal genetic continuity of two iron age individuals from a Pazyryk culture burial"
https://www.researchgate.net/publication/331179436_Matrilineal_and_patrilineal_genetic_continuity_of_two_iron_age_individuals_from_a_Pazyryk_culture_burial

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1271
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1536/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1807 : 26 Февраль 2019, 09:10:49 »
Вот это было? "Matrilineal and patrilineal genetic continuity of two iron age individuals from a Pazyryk culture burial"
https://www.researchgate.net/publication/331179436_Matrilineal_and_patrilineal_genetic_continuity_of_two_iron_age_individuals_from_a_Pazyryk_culture_burial

Статья судя по всему ещё не опубликована. По крайней мере на сайте журнала она числится как PAPER UNDER PROCESSING:

http://www.krepublishers.com/Journals/IJHG-6-ListofPapers-PresentStatus.html

 REF. NO. IJHG-709

PAPER UNDER PROCESSING

On The Genetic Continuity of the Iron Age Pazyryk Culture:

Geographic Distributions of the Paternal and Maternal Lineages from the Ak-Alakha-1 Burial

Dmitrii G. Tikhonov1, Cemal Gurkan2, 3,*, Elena D. Tikhonova4, Gokce Y. A. Peler5 and Victor M. Dyakonov6

1Scientific Research Institute of Health, North-Eastern Federal University, Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation

2Turkish Cypriot DNA Laboratory, Committee on Missing Persons in Cyprus Turkish Cypriot Member Office, Nicosia (North Cyprus), Turkey

3Dr. Fazil Kucuk Faculty of Medicine, Eastern Mediterranean University, Famagusta, (North Cyprus), Turkey

4“Meditsinskiy Vestnik. Zdorov'ye.” (Medical Bulletin. Health.), Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation

5Department of Contemporary Turkic Languages and Literatures, Erciyes University, Kayseri, Turkey

6Archaeology Department, Institute for Humanitarian Research and Problems of Indigenous People of the North, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation


Да и журнал какой-то подозрительный.

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2879
  • Страна: ru
  • Рейтинг +951/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1808 : 26 Февраль 2019, 09:20:12 »
Да и журнал какой-то подозрительный.

Scopus  - наше всё!

Онлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19645
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1512/-57
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16

Оффлайн Ильгиз

  • Сообщений: 686
  • Страна: ru
  • Рейтинг +47/-6
Постер по анализу днк доскифского, скифского и черняховского населения Украины, плюс кочевники скифского времени из Казахстана, Урала и Кавказа:

https://www.etis.ee/File/DownloadPublic/25dff7e1-1cdf-4a88-8462-b9df81003037?name=poster_Scythians_MariJarve.pdf&type=application%2Fpdf
Что-то не пойму. Это новые образцы, 31 человек?  Те которые ромбики. Интересно полная статья выйдет с гг.?
В списке учреждений указан музей г.Стерлитамака. Из энц-дии прочитал что там хранятся образцы с переволочанских курганов

Цитировать
ПЕРЕВОЛОЧАНСКИЕ КУРГАНЫ, археологический памятник прохоровской (раннесарматской) культуры (см. Сарматская культура). Датируются 5—4 вв. до н.э. Находятся в 1,5 км к Ю.-З. от д.Переволочан Хайбуллинского р-на.
Материалы хранятся в Музее археологии и этнографии, Стерлитамакском музее.
http://башкирская-энциклопедия.рф/component/content/article/2-statya/5115-perevolochanskie-kurgany.html
Наверняка один из этих образцов под ScySar_SU.
Написал авторам и спросил о статье. Как ни странно -ответили.
Сказали что полная статья с мт и Y гг выйдет через несколько месяцев, надеются. Несколько месяцев это апрель-май наверное.

Меня в статье интересует больше не гг, а кто и откуда протестирован.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1271
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1536/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Написал авторам и спросил о статье. Как ни странно -ответили.
Сказали что полная статья с мт и Y гг выйдет через несколько месяцев, надеются. Несколько месяцев это апрель-май наверное.

Меня в статье интересует больше не гг, а кто и откуда протестирован.

Ну в этом деле несколько месяцев обычно на полгода-год растягивается. Так что скорее осенью.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1271
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1536/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.nature.com/articles/s41598-019-39802-1

Article | Open | Published: 05 March 2019

Ancestral mitochondrial N lineage from the Neolithic ‘green’ Sahara

Stefania Vai, Stefania Sarno, Martina Lari, Donata Luiselli, Giorgio Manzi, Marina Gallinaro, Safaa Mataich, Alexander Hübner, Alessandra Modi, Elena Pilli, Mary Anne Tafuri, David Caramelli & Savino di Lernia

Scientific Reports volume 9, Article number: 3530 (2019)

Abstract

Because Africa’s climate hampers DNA preservation, knowledge of its genetic variability is mainly restricted to modern samples, even though population genetics dynamics and back-migrations from Eurasia may have modified haplotype frequencies, masking ancient genetic scenarios. Thanks to improved methodologies, ancient genetic data for the African continent are now increasingly available, starting to fill in the gap. Here we present newly obtained mitochondrial genomes from two ~7000-year-old individuals from Takarkori rockshelter, Libya, representing the earliest and first genetic data for the Sahara region. These individuals carry a novel mutation motif linked to the haplogroup N root. Our result demonstrates the presence of an ancestral lineage of the N haplogroup in the Holocene “Green Sahara”, associated to a Middle Pastoral (Neolithic) context.

Поскольку климат Африки препятствует сохранению ДНК, знания о ее генетической изменчивости в основном ограничены современными образцами, даже несмотря на то, что динамика популяционной генетики и обратные миграции из Евразии, возможно, модифицировали частоты гаплотипов, маскируя древние генетические сценарии. Благодаря усовершенствованным методологиям древние генетические данные для африканского континента становятся все более доступными, что начинает заполнять этот пробел. Здесь мы представляем недавно полученные митохондриальные геномы от двух ~ 7000-летних особей из каменного укрытия Такаркори, Ливия, представляющие самые ранние и первые генетические данные для региона Сахары. Эти люди несут новую мутацию, связанную с корнем гаплогруппы N. Наш результат демонстрирует наличие базальной линии гаплогруппы N в голоценовой «Зеленой Сахаре», связанной со средним скотоводческим (неолитическим) контекстом.

Вот на дереве образец красным выделен.


Оффлайн Апти

  • Сообщений: 181
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
Paternal lineages in southern Iberia provide time frames for gene flow from mainland Europe and the Mediterranean world
https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/03014460.2019.1587507?journalCode=iahb20&fbclid=IwAR3oTgDMQuJqvxIDui47Fb1RZANsFB9_M7NulhDGKWGgqamiN8f84XrhHsc


Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1271
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1536/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.mdpi.com/2073-4425/10/3/207

Genes 2019, 10(3), 207; https://doi.org/10.3390/genes10030207 (registering DOI)

Ancient Mitochondrial Genomes Reveal the Absence of Maternal Kinship in the Burials of Çatalhöyük People and Their Genetic Affinities

Maciej Chyleński 1,* [OrcID] , Edvard Ehler 2 [OrcID] , Mehmet Somel 3 , Reyhan Yaka 3 [OrcID] , Maja Krzewińska 4 [OrcID] , Mirosława Dabert 5 , Anna Juras 6 [OrcID] and Arkadiusz Marciniak 1 [OrcID]

Received: 25 January 2019 / Revised: 4 March 2019 / Accepted: 4 March 2019 / Published: 11 March 2019

Abstract

Çatalhöyük is one of the most widely recognized and extensively researched Neolithic settlements. The site has been used to discuss a wide range of aspects associated with the spread of the Neolithic lifestyle and the social organization of Neolithic societies. Here, we address both topics using newly generated mitochondrial genomes, obtained by direct sequencing and capture-based enrichment of genomic libraries, for a group of individuals buried under a cluster of neighboring houses from the classical layer of the site’s occupation. Our data suggests a lack of maternal kinship between individuals interred under the floors of Çatalhöyük buildings. The findings could potentially be explained either by a high variability of maternal lineages within a larger kin group, or alternatively, an intentional selection of individuals for burial based on factors other than biological kinship. Our population analyses shows that Neolithic Central Anatolian groups, including Çatalhöyük, share the closest affinity with the population from the Marmara Region and are, in contrast, set further apart from the Levantine populations. Our findings support the hypothesis about the emergence and the direction of spread of the Neolithic within Anatolian Peninsula and beyond, emphasizing a significant role of Central Anatolia in this process.

Чатал-Хёйюк является одним из наиболее хорошо известных и глубоко исследованных неолитических поселений. Чатал-Хёюк использовался для обсуждения широкого спектра аспектов, связанных с распространением неолитического образа жизни и социальной организации неолитических обществ. Здесь мы рассматриваем обе темы, используя недавно сгенерированные митохондриальные геномы, полученные путем прямого секвенирования и обогащения геномных библиотек на основе захвата, для группы лиц, погребенных под группой соседних домов из классического слоя времён существования поселения. Наши данные свидетельствуют об отсутствии материнского родства между людьми, погребенными под полами зданий в Чатал-Хёйюке. Результаты могут быть потенциально объяснены либо высокой вариабельностью материнских линий в большой родственной группе, либо, альтернативно, преднамеренным отбором людей для захоронения на основе факторов, отличных от биологического родства. Наш популяционный анализ показывает, что неолитические центрально-анатолийские группы, включая Чатал-Хёйюк, имеют самую близкую близость с населением региона Мраморного моря и, напротив, находятся дальше от левантийских популяций. Наши результаты подтверждают гипотезу о возникновении и направлении распространения неолита на Анатолийском полуострове и за его пределами, подчеркивая значительную роль Центральной Анатолии в этом процессе.

Skeleton Number Building Age at Death Morphological Sex Proportion of Human DNA (%) Mt Coverage Molecular Sex Mitochondrial Haplogroup
20036 80 child (3–12) n.a. 3.3 235.94 Probable XY (0.0729) U3b
19159 80 adolescent (12–20) n.a. 4.5 14.30 Probable XY (0.0783) N
21981 89 infant (0–3) n.a. 26.6 8.14 XX (0.0005) K1a17
30900 89 infant (0–3) n.a. 1.0 35.07 Probable XY (0.0665) U
20810 96 adult (20+) male? 0.5 21.34 Not assigned W1c
19727 96 child (3–12) n.a. 2.0 24.83 XY (0.107) K
20832 96 older adult (50+) female? 0.6 7.18 XX (0.0042) H+73
20850 96 child (3–12) n.a. 0.5 10.02 XX (0.0027) H
20374 97 mature adult(35–50) male? 1.3 41.40 Not assigned X2b4
20351 97 adolescent (12–20) female? 0.6 17.91 Not assigned U5b2

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100