АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 233363 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн istov

  • Сообщений: 109
  • Страна: sk
  • Рейтинг +9/-8
  • Y-ДНК: .....
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1800 : 12 Февраль 2019, 14:14:48 »
В подходящей по времени для ИЕ долине Сват также дефицит степи.
В долине Сват ни одного ария не оттестировали, что просто является фактом что подтверждают и археологи и антропологи.

Оффлайн falcon16

  • Сообщений: 208
  • Рейтинг +443/-5
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1801 : 12 Февраль 2019, 14:25:35 »
В долине Сват ни одного ария не оттестировали, что просто является фактом что подтверждают и археологи и антропологи.
Ага на каждом черепе ария стоит клеймо что он арий. и каждый археолог запросто может по останкам определить языковую принадлежность. ;D
Дайте ссылочку на книжечку установленных фактов 

Оффлайн Чёрная Гадюка

  • Сообщений: 3
  • Страна: cs
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: I2-PH908
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1802 : 17 Февраль 2019, 20:19:16 »
Всем привет! Может ли кто-нибудь проверить этот образец для последующих SNP?

RT5, 1918-1754 BC, Mikhailovsky II, Samara, Russia, Srubnaya_Pokrovka, R1a1a1b2-Z93, U2e2a

Соответствующая статья:

Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague

Цитировать
Shotgun sequencing of RT5 resulted in 1.14 billion raw reads and a 4.2-fold average human genomic coverage (Supplementary Table 3). Genetic sex identification assigned RT5 to a male, which is in line with the anthropological assignment (Fig. 1a, Supplementary Methods). Nuclear contamination estimates based on X-chromosomal heterozygosity were low in RT5, estimated at an average of 0.5% (Supplementary Table 4), which permitted the usage of all generated human data. Y-chromosomal and mitochondrial assignment revealed the individual carrying R1a1a1b and U2e2a haplogroups, respectively.

БАМ файл: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERR2261879






Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6145
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1034/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1803 : 21 Февраль 2019, 21:17:56 »
Запоздавшая статья: в 2014 она была бы очень важно, а сейчас уже как-то блекло смотрится:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/ajpa.23607

New genetic evidence of affinities and discontinuities between bronze age Siberian populations

Clémence Hollard, Vincent Zvénigorosky, Alexey Kovalev, Yurii Kiryushin, Alexey Tishkin, Igor Lazaretov, Eric Crubézy, Bertrand Ludes, Christine Keyser

First published: 14 June 2018
https://doi.org/10.1002/ajpa.23607

 Abstract

Objectives

This work focuses on the populations of South Siberia during the Eneolithic and Bronze Age and specifically on the contribution of uniparental lineage and phenotypical data to the question of the genetic affinities and discontinuities between western and eastern populations.

Materials and Methods

We performed molecular analyses on the remains of 28 ancient humans (10 Afanasievo (3600–2500 BC) and 18 Okunevo (2500–1800 BC) individuals). For each sample, two uniparentally inherited systems (mitochondrial DNA and Y‐chromosome DNA) were studied, in order to trace back maternal and paternal lineages. Phenotype‐informative SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) were also analyzed, along with autosomal STRs (Short Tandem Repeats).

Results

Most of the Afanasievo men submitted to analysis belonged to a single sub‐haplogroup, R1b1a1a, which reveals the predominance of this haplogroup in these early Bronze Age populations. Conversely, Okunevo individuals carried more diverse paternal lineages that mostly belonged to Asian/Siberian haplogroups. These differences are also apparent, although less strongly, in mitochondrial lineage composition and phenotype marker variant frequencies.

Discussion

This study provides new elements that contribute to our understanding of the genetic interactions between populations in Eneolithic and Bronze Age southern Siberia. Our results support the hypothesis of a genetic link between Afanasievo and Yamnaya (in western Eurasia), as suggested by previous studies of other markers. However, we found no Y‐chromosome lineage evidence of a possible Afanasievo migration to the Tarim Basin. Moreover, the presence of Y‐haplogroup Q in Okunevo individuals links them to Native American populations, as was suggested by whole‐genome sequencing.

Полный текст
https://www.researchgate.net/publication/325762743_New_genetic_evidence_of_affinities_and_discontinuities_between_bronze_age_Siberian_populations

Supporting information
https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1002%2Fajpa.23607&file=ajpa23607-sup-0001-suppinfo1.docx
https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1002%2Fajpa.23607&file=ajpa23607-sup-0002-suppinfot1.docx
« Последнее редактирование: 21 Февраль 2019, 21:29:13 от Шад »

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1163
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1804 : 21 Февраль 2019, 23:21:37 »
Ура! Замечательная новость! Знаменитый человек из Чеддара - мезолитический WHG из Британии возрастом ок. 9 тысяч лет оказался нашим человеком - I2-Y10705  )
Опубликованы статья и сырые данные "Population Replacement in Early Neolithic Britain"
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/02/18/267443.full.pdf
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB31249
Буду проверять.








« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 11:01:41 от mikhail a. »

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10774
  • Страна: az
  • Рейтинг +1658/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1805 : 23 Февраль 2019, 07:26:45 »
Михаил, опубликуйте это в разделе про дДНК. Вы запостили новость раньше, потому и приоритет за вами :)

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10774
  • Страна: az
  • Рейтинг +1658/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1806 : 23 Февраль 2019, 09:11:43 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5446
  • Страна: ru
  • Рейтинг +415/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1807 : 23 Февраль 2019, 09:23:01 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Кто ещё показал светлую кожу из дДНК 10000 летней давности?

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10774
  • Страна: az
  • Рейтинг +1658/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1808 : 23 Февраль 2019, 09:52:53 »
G2 из Ирана вроде

Оффлайн falcon16

  • Сообщений: 208
  • Рейтинг +443/-5
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1809 : 23 Февраль 2019, 10:27:34 »
Кто ещё показал светлую кожу из дДНК 10000 летней давности?
Pigmentation - https://genetiker.wordpress.com/pigmentation/   Afontova gora 2, Satsurblia   Georgia, I1072   Natufian, Bon 002  Asia Minor
Игреки для сопоставления  Ancestral Journeys -  https://web.archive.org/web/20170917024854/http://www.ancestraljourneys.org/palaeolithicdna.shtml

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1163
  • Страна: ru
  • Рейтинг +269/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1810 : 23 Февраль 2019, 10:36:34 »
К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Farroukh позволю себе не согласиться с Вами. Покрытие Чеддара как раз неплохое 2,3. Это позволило довольно надежно определить его пигментацию, причем по расширенному количеству параметров.
Кстати, пигментации различных WHG, а так же неолитического "Свена" в статье специально посвящены два абзаца. Из западных охотников-собирателей сравнивались Чеддар, Лошбур и Ла Бранья.

The Mesolithic Cheddar Man and the Neolithic sample from Carsington Pasture Cave, Derbyshire (‘Sven’) had sufficient coverage to estimate heterozygosity. Consistent with recent ancestry from larger or more admixed populations, Sven showed slightly higher levels of heterozygosity than Cheddar Man (Supplementary Figure S10). None of the Mesolithic and Neolithic British individuals analysed here had a derived lactase persistence allele (see Supplementary Table S2). We predicted pigmentation characteristics for Cheddar Man and Sven using Hirisplex25 and a recently-developed method for predicting skin pigmentation26. Previously, predictions on the level of skin pigmentation were mostly derived using two SNPs in SLC45A2 and SLC24A5 that indicate lack of hypo-pigmentation when in the ancestral state18. However, here we integrate 36 rather than 2 SNPs allowing more precise prediction26. Cheddar Man is predicted to have had dark or dark to black skin, blue/green eyes and dark brown possibly black hair, whereas Sven most likely had intermediate to dark skin pigmentation, brown eyes and black possibly dark brown hair (see Pigmentation section in the Supplementary Materials for a detailed discussion of the results). This is in line with the current hypothesis that alleles commonly associated with lighter skin were introduced in Western Europe by ANFs19.
 
We also analysed two previously-published WHGs, and find potential temporal and/or geographical variation in pigmentation characteristics. Loschbour22 from Luxembourg is ~2000 years younger than Cheddar Man, and is predicted to have had intermediate skin pigmentation. Furthermore, the Loschbour individual most likely had blue/green eyes. In contrast, La Braña18 from northern Spain who is slightly later than Loschbour is predicted to have had dark to dark to black skin and hazel/green eye colour. Both La Braña and Loschbour were predicted to have had black, possibly dark brown hair. These results imply that quite different skin pigmentation levels coexisted in WHGs at least by around 6000 BC

Что касается субклада Y10705 то он довольно редкий и массе своей концентрируется в центральной Европе: Британские острова и вдоль Рейна. Одна из веток присутствует на Балканах и у славя. И еще любопытнеее, что еще одна ветка обнаружена у татар.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5446
  • Страна: ru
  • Рейтинг +415/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1811 : 23 Февраль 2019, 10:46:04 »
А вот этот образец не перепроверяли? Он всё таки J или I?

Epipaleolithic   France   Aven des Iboussières, Malataverne [IBS-6 (25-1)]   M   10090-9460 BCE (based on a direct date of Iboussieres 39)
77062
J?
J:P209:19179335T->C; IJ:P126:21225770C->G   U5b2a

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10774
  • Страна: az
  • Рейтинг +1658/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1812 : 23 Февраль 2019, 12:14:28 »
Я неточно выразился. Имел в виду, что не определили его субклад на уровне ~9 тыс. лет, остановившись на верхнепалеолитическом Y10705. Думаю, если bam окажется на Yfull, то найдётся и более глубокий нисходящий возрастом ~9 тыс. лет.
« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 13:18:07 от Farroukh »

Оффлайн falcon16

  • Сообщений: 208
  • Рейтинг +443/-5
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1813 : 23 Февраль 2019, 13:54:41 »
https://www.facebook.com/%E7%88%B6%E7%B3%BB%E7%A5%96%E6%BA%90%E7%A0%94%E7%A9%B6%E6%89%80Y-Haplogroup-4-Folks-176752829705724/?tn-str=k*F
из "новенького" Pavlov1 - Ydna I    и Vestoniche43 углубили до IJ*

« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 14:21:41 от falcon16 »

Оффлайн Ильгиз

  • Сообщений: 605
  • Страна: ru
  • Рейтинг +37/-4
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1814 : 26 Февраль 2019, 07:39:29 »
Вот это было? "Matrilineal and patrilineal genetic continuity of two iron age individuals from a Pazyryk culture burial"
https://www.researchgate.net/publication/331179436_Matrilineal_and_patrilineal_genetic_continuity_of_two_iron_age_individuals_from_a_Pazyryk_culture_burial

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100