АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 269864 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6255
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1131/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1800 : 21 Февраль 2019, 21:17:56 »
Запоздавшая статья: в 2014 она была бы очень важно, а сейчас уже как-то блекло смотрится:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/ajpa.23607

New genetic evidence of affinities and discontinuities between bronze age Siberian populations

Clémence Hollard, Vincent Zvénigorosky, Alexey Kovalev, Yurii Kiryushin, Alexey Tishkin, Igor Lazaretov, Eric Crubézy, Bertrand Ludes, Christine Keyser

First published: 14 June 2018
https://doi.org/10.1002/ajpa.23607

 Abstract

Objectives

This work focuses on the populations of South Siberia during the Eneolithic and Bronze Age and specifically on the contribution of uniparental lineage and phenotypical data to the question of the genetic affinities and discontinuities between western and eastern populations.

Materials and Methods

We performed molecular analyses on the remains of 28 ancient humans (10 Afanasievo (3600–2500 BC) and 18 Okunevo (2500–1800 BC) individuals). For each sample, two uniparentally inherited systems (mitochondrial DNA and Y‐chromosome DNA) were studied, in order to trace back maternal and paternal lineages. Phenotype‐informative SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) were also analyzed, along with autosomal STRs (Short Tandem Repeats).

Results

Most of the Afanasievo men submitted to analysis belonged to a single sub‐haplogroup, R1b1a1a, which reveals the predominance of this haplogroup in these early Bronze Age populations. Conversely, Okunevo individuals carried more diverse paternal lineages that mostly belonged to Asian/Siberian haplogroups. These differences are also apparent, although less strongly, in mitochondrial lineage composition and phenotype marker variant frequencies.

Discussion

This study provides new elements that contribute to our understanding of the genetic interactions between populations in Eneolithic and Bronze Age southern Siberia. Our results support the hypothesis of a genetic link between Afanasievo and Yamnaya (in western Eurasia), as suggested by previous studies of other markers. However, we found no Y‐chromosome lineage evidence of a possible Afanasievo migration to the Tarim Basin. Moreover, the presence of Y‐haplogroup Q in Okunevo individuals links them to Native American populations, as was suggested by whole‐genome sequencing.

Полный текст
https://www.researchgate.net/publication/325762743_New_genetic_evidence_of_affinities_and_discontinuities_between_bronze_age_Siberian_populations

Supporting information
https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1002%2Fajpa.23607&file=ajpa23607-sup-0001-suppinfo1.docx
https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1002%2Fajpa.23607&file=ajpa23607-sup-0002-suppinfot1.docx
« Последнее редактирование: 21 Февраль 2019, 21:29:13 от Шад »

Онлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1801 : 21 Февраль 2019, 23:21:37 »
Ура! Замечательная новость! Знаменитый человек из Чеддара - мезолитический WHG из Британии возрастом ок. 9 тысяч лет оказался нашим человеком - I2-Y10705  )
Опубликованы статья и сырые данные "Population Replacement in Early Neolithic Britain"
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/02/18/267443.full.pdf
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB31249
Буду проверять.








« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 11:01:41 от mikhail a. »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11387
  • Страна: az
  • Рейтинг +2095/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1802 : 23 Февраль 2019, 07:26:45 »
Михаил, опубликуйте это в разделе про дДНК. Вы запостили новость раньше, потому и приоритет за вами :)

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11387
  • Страна: az
  • Рейтинг +2095/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1803 : 23 Февраль 2019, 09:11:43 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5443
  • Страна: ru
  • Рейтинг +418/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1804 : 23 Февраль 2019, 09:23:01 »
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Кто ещё показал светлую кожу из дДНК 10000 летней давности?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11387
  • Страна: az
  • Рейтинг +2095/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1805 : 23 Февраль 2019, 09:52:53 »
G2 из Ирана вроде

Онлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1253
  • Страна: ru
  • Рейтинг +332/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1806 : 23 Февраль 2019, 10:36:34 »
К сожалению, покрытие было не очень удачным, и его субклад (на древе Yfull он идёт как палеолитический I2-Y10705, охватывающий почти всю Западную Европу.
Характерно, что он описан как темнокожий. При этом палеолитический J2 из Грузии - светлокожий. Видимо, распространение светлого пигмента ~10000 лет назад было явно не повсеместно.

Farroukh позволю себе не согласиться с Вами. Покрытие Чеддара как раз неплохое 2,3. Это позволило довольно надежно определить его пигментацию, причем по расширенному количеству параметров.
Кстати, пигментации различных WHG, а так же неолитического "Свена" в статье специально посвящены два абзаца. Из западных охотников-собирателей сравнивались Чеддар, Лошбур и Ла Бранья.

The Mesolithic Cheddar Man and the Neolithic sample from Carsington Pasture Cave, Derbyshire (‘Sven’) had sufficient coverage to estimate heterozygosity. Consistent with recent ancestry from larger or more admixed populations, Sven showed slightly higher levels of heterozygosity than Cheddar Man (Supplementary Figure S10). None of the Mesolithic and Neolithic British individuals analysed here had a derived lactase persistence allele (see Supplementary Table S2). We predicted pigmentation characteristics for Cheddar Man and Sven using Hirisplex25 and a recently-developed method for predicting skin pigmentation26. Previously, predictions on the level of skin pigmentation were mostly derived using two SNPs in SLC45A2 and SLC24A5 that indicate lack of hypo-pigmentation when in the ancestral state18. However, here we integrate 36 rather than 2 SNPs allowing more precise prediction26. Cheddar Man is predicted to have had dark or dark to black skin, blue/green eyes and dark brown possibly black hair, whereas Sven most likely had intermediate to dark skin pigmentation, brown eyes and black possibly dark brown hair (see Pigmentation section in the Supplementary Materials for a detailed discussion of the results). This is in line with the current hypothesis that alleles commonly associated with lighter skin were introduced in Western Europe by ANFs19.
 
We also analysed two previously-published WHGs, and find potential temporal and/or geographical variation in pigmentation characteristics. Loschbour22 from Luxembourg is ~2000 years younger than Cheddar Man, and is predicted to have had intermediate skin pigmentation. Furthermore, the Loschbour individual most likely had blue/green eyes. In contrast, La Braña18 from northern Spain who is slightly later than Loschbour is predicted to have had dark to dark to black skin and hazel/green eye colour. Both La Braña and Loschbour were predicted to have had black, possibly dark brown hair. These results imply that quite different skin pigmentation levels coexisted in WHGs at least by around 6000 BC

Что касается субклада Y10705 то он довольно редкий и массе своей концентрируется в центральной Европе: Британские острова и вдоль Рейна. Одна из веток присутствует на Балканах и у славя. И еще любопытнеее, что еще одна ветка обнаружена у татар.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5443
  • Страна: ru
  • Рейтинг +418/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1807 : 23 Февраль 2019, 10:46:04 »
А вот этот образец не перепроверяли? Он всё таки J или I?

Epipaleolithic   France   Aven des Iboussières, Malataverne [IBS-6 (25-1)]   M   10090-9460 BCE (based on a direct date of Iboussieres 39)
77062
J?
J:P209:19179335T->C; IJ:P126:21225770C->G   U5b2a

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11387
  • Страна: az
  • Рейтинг +2095/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1808 : 23 Февраль 2019, 12:14:28 »
Я неточно выразился. Имел в виду, что не определили его субклад на уровне ~9 тыс. лет, остановившись на верхнепалеолитическом Y10705. Думаю, если bam окажется на Yfull, то найдётся и более глубокий нисходящий возрастом ~9 тыс. лет.
« Последнее редактирование: 23 Февраль 2019, 13:18:07 от Farroukh »

Оффлайн Ильгиз

  • Сообщений: 643
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-4
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1809 : 26 Февраль 2019, 07:39:29 »
Вот это было? "Matrilineal and patrilineal genetic continuity of two iron age individuals from a Pazyryk culture burial"
https://www.researchgate.net/publication/331179436_Matrilineal_and_patrilineal_genetic_continuity_of_two_iron_age_individuals_from_a_Pazyryk_culture_burial

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1164
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1313/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1810 : 26 Февраль 2019, 09:10:49 »
Вот это было? "Matrilineal and patrilineal genetic continuity of two iron age individuals from a Pazyryk culture burial"
https://www.researchgate.net/publication/331179436_Matrilineal_and_patrilineal_genetic_continuity_of_two_iron_age_individuals_from_a_Pazyryk_culture_burial

Статья судя по всему ещё не опубликована. По крайней мере на сайте журнала она числится как PAPER UNDER PROCESSING:

http://www.krepublishers.com/Journals/IJHG-6-ListofPapers-PresentStatus.html

 REF. NO. IJHG-709

PAPER UNDER PROCESSING

On The Genetic Continuity of the Iron Age Pazyryk Culture:

Geographic Distributions of the Paternal and Maternal Lineages from the Ak-Alakha-1 Burial

Dmitrii G. Tikhonov1, Cemal Gurkan2, 3,*, Elena D. Tikhonova4, Gokce Y. A. Peler5 and Victor M. Dyakonov6

1Scientific Research Institute of Health, North-Eastern Federal University, Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation

2Turkish Cypriot DNA Laboratory, Committee on Missing Persons in Cyprus Turkish Cypriot Member Office, Nicosia (North Cyprus), Turkey

3Dr. Fazil Kucuk Faculty of Medicine, Eastern Mediterranean University, Famagusta, (North Cyprus), Turkey

4“Meditsinskiy Vestnik. Zdorov'ye.” (Medical Bulletin. Health.), Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation

5Department of Contemporary Turkic Languages and Literatures, Erciyes University, Kayseri, Turkey

6Archaeology Department, Institute for Humanitarian Research and Problems of Indigenous People of the North, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Yakutsk, Sakha Republic, Russian Federation


Да и журнал какой-то подозрительный.

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +774/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1811 : 26 Февраль 2019, 09:20:12 »
Да и журнал какой-то подозрительный.

Scopus  - наше всё!

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16

Оффлайн Ильгиз

  • Сообщений: 643
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-4
Постер по анализу днк доскифского, скифского и черняховского населения Украины, плюс кочевники скифского времени из Казахстана, Урала и Кавказа:

https://www.etis.ee/File/DownloadPublic/25dff7e1-1cdf-4a88-8462-b9df81003037?name=poster_Scythians_MariJarve.pdf&type=application%2Fpdf
Что-то не пойму. Это новые образцы, 31 человек?  Те которые ромбики. Интересно полная статья выйдет с гг.?
В списке учреждений указан музей г.Стерлитамака. Из энц-дии прочитал что там хранятся образцы с переволочанских курганов

Цитировать
ПЕРЕВОЛОЧАНСКИЕ КУРГАНЫ, археологический памятник прохоровской (раннесарматской) культуры (см. Сарматская культура). Датируются 5—4 вв. до н.э. Находятся в 1,5 км к Ю.-З. от д.Переволочан Хайбуллинского р-на.
Материалы хранятся в Музее археологии и этнографии, Стерлитамакском музее.
http://башкирская-энциклопедия.рф/component/content/article/2-statya/5115-perevolochanskie-kurgany.html
Наверняка один из этих образцов под ScySar_SU.
Написал авторам и спросил о статье. Как ни странно -ответили.
Сказали что полная статья с мт и Y гг выйдет через несколько месяцев, надеются. Несколько месяцев это апрель-май наверное.

Меня в статье интересует больше не гг, а кто и откуда протестирован.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1164
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1313/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Написал авторам и спросил о статье. Как ни странно -ответили.
Сказали что полная статья с мт и Y гг выйдет через несколько месяцев, надеются. Несколько месяцев это апрель-май наверное.

Меня в статье интересует больше не гг, а кто и откуда протестирован.

Ну в этом деле несколько месяцев обычно на полгода-год растягивается. Так что скорее осенью.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100