Выложены тезисы докладов принятых оргкомитетом для рассмотрения и составления окончательной программы V(XXI) Всероссийского археологического съезда:
http://konf.asu.ru/archeo/?page=%D1%81ollection&char=%D0%90Из них к палеогенетике относятся следующие:
А.А. Журавлев1,2, А.С. Пилипенко1,2,3, В.И. Молодин2,3, Д.В. Папин2,4, Д.В. Поздняков2, Р.О. Трапезов1,2
1Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН, 2Институт археологии и этнографии СО РАН, 3Новосибирский государственный университет, Новосибирск; 4Алтайский государственный университет, Барнаул
ГЕНОФОНД мтДНК И Y-ХРОМОСОМЫ АНДРОНОВСКОГО И ПОСТАНДРОНОВСКОГО НАСЕЛЕНИЯ ЮЖНОЙ СИБИРИ Работа выполнена при поддержке гранта Министерства образования и науки РФ (постановление №220), полученного Алтайским государственным университетом (договор №14.Z50.31.0010, проект «Древнейшее заселение Сибири: формирование и динамика культур на территории Северной Азии»)
Миграция носителей андроновской культуры на территорию Южной Сибири была одним из ключевых событий, определивших характер этнокультурных процессов в регионе как непосредственно в 1-й половине II тысячелетия до н.э., так и в последующие периоды эпохи бронзы. Исследование серий древних индивидов методами палеогенетики открывает принципиально новые возможности для реконструкции популяционно-генетических последствий миграции носителей андроновской культуры на юг Сибири.
В рамках данной работы проведено масштабное исследование локальных групп населения юга Сибири андроновского и постандроновского времени. В качестве основных моделей были выбраны группы населения андроновского времени из Барнаульского Приобья (могильник Фирсово-XIV) и Барабинской лесостепи (могильник Тартас-1), а также ряд синхронных групп с других территорий (Минусинская и Кузнецкая котловины). Исследование включало анализ разнообразия вариантов митохондриальной ДНК (мтДНК) и Y-хромосомы.
Полученные генетические результаты показали, что андроновская серия из могильника Фирсово-XIV демонстрирует состав генетических вариантов, свойственный мигрантам, в неизменном или незначительно измененном виде. Об этом свидетельствует сильное доминирование западно-евразийских вариантов мтДНК и присутствие вариантов гаплогруппы R1a1 Y-хромосомы, характерных для андроновского населения.
Население андроновского времени, сформировавшее могильник Тартас-1, демонстрирует смешанный состав. В генофонде мтДНК присутствуют как варианты, которые могли быть привнесены в регион носителями андроновской культуры (гаплогруппа T и другие западно-евразийские кластеры), так и восточно-евразийские варианты, привнесенные в генофонд популяции автохтонным населением региона (гаплогурппы A, C, D и другие). Эти результаты коррелируют с наличием на могильнике Тартас-1 синкретичных комплексов, отражающих процессы культурного взаимодействия мигрантов и предшествовавшего им населения Барабы. Следует отметить, что в генофонде мтДНК группы из могильника Тартас-1 существенно доминируют именно компоненты автохтонного происхождения. Полученные к настоящему времени результаты по Y-хромосоме свидетельствуют, что вклад мигрантов в состав мужского генофонда был более существенным. Таким образом, участие женского и мужского компонентов пришлого и автохтонного населения в процессах этнокультурного взаимодействия могло существенно отличаться.
Результаты исследования генофонда мтДНК населения эпохи поздней бронзы свидетельствует об участии в их формировании как пришлых носителей андроновской культуры, так и локальных групп автохтонного доандроновского населения в различном соотношении, что коррелирует с данными археологии и физической антропологии.
А.С. Пилипенко1,2,3, С.В. Черданцев1,2, Н.В. Полосьмак2, В.И. Молодин2,3,
Р.О. Трапезов1,2, М.А. Балабанова4, А.А. Журавлев1,2, Д.В. Поздняков2
1Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН,
2Институт археологии и этнографии СО РАН,
3Новосибирский государственный университет, Новосибирск;
4Волгоградский государственный университет, Волгоград
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ РАННИХ КОЧЕВНИКОВ ЮЖНОЙ СИБИРИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ РЕГИОНОВ ЕВРАЗИИ (скифское и гунно-сарматское время)Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №14-50-00036)
С 1-й половины I тыс. до н.э. на обширных пространствах евразийского степного пояса происходит формирование многочисленных групп ранних кочевников. Эти группы доминировали в Центральной Евразии и сопредельных регионах на протяжении скифского и гунно-сарматского времени, а их потомки оказали существенное влияние на этнокультурные и демографические процессы в последующие периоды, вплоть до формирования генетического состава современного коренного населения многих регионов Евразии. Южная Сибирь и прилегающие территории Центральной Азии являлись одним из важных центров становления и развития ранних кочевников. Наш коллектив осуществляет масштабное исследование структуры генофонда ранних кочевников скифского и гунно-сарматского времени из различных районов Южной Сибири.
Наиболее репрезентативные серии индивидов исследованы для пазырыкской культуры Горного Алтая, тагарской культуры Минусинской котловины, хунну Забайкалья. Небольшие серии индивидов исследованы для других этнокультурных групп рассматриваемых периодов. В качестве сравнительного материала мы использовали собственные данные о структуре генофонда мтДНК сарматов Нижнего Поволжья и литературные данные о генетическом составе населения скифского и гунно-сарматского времени из западных районов евразийского степного пояса. Генетическая структура популяций оценивалась по составу генофонда митохондриальной ДНК (мтДНК) и Y-хромосомы. Суммарно нами
выполнено исследование более 300 образцов мтДНК и более 50 образцов Y-хромосомы.Полученные результаты свидетельствуют, что локальные группы населения Южной Сибири скифского времени сформировались незави симо от синхронных групп ранних кочевников из западных районов степного пояса Евразии. В состав их генофонда вошли компоненты как западноевразийского, так и восточноевразийского происхождения.
Западно-евразийские компоненты, по-видимому, были привнесены в Южную Сибирь с миграционными волнами в эпоху бронзы. Важно отметить, что группы ранних кочевников скифского времени из разных районов степного пояса демонстрируют высокое сходство по структуре генофонда мтДНК. При этом структура генофонда Y-хромосомы, вероятно, отличается более существенно.
Среди современных коренных популяций наибольшее сходство с населением Южной Сибири скифского времени демонстрируют некоторые тюркоязычные группы.Хунну Забайкалья демонстрируют принципиально отличающуюся структуру генофонда мтДНК, в частности резкое доминирование восточноевразийских вариантов центральноазиатского происхождения. Генофонд хунну сближает их с группами современного монголоязычного населения исследуемого региона. Распространение влияния хунну за пределы основного ареала в некоторых регионах сопровождалось их генетическим влиянием (Тува), а в других регионах, по-видимому, носило преимущественно политический и культурный характер (Горный Алтай, Минусинская котловина).
Ф.С. Шарко1, Е.С. Булыгина2, С.В. Цыганкова2, А.Д. Резепкин3, А.В. Недолужко2
1Институт биоинженерии, ФИЦ Биотехнологии РАН,
2НИЦ «Курчатовский институт», Москва;
3Институт истории материальной культуры РАН, Санкт-Петербург
АНАЛИЗ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК, ВЫДЕЛЕННОЙ ИЗ ЧЕЛОВЕЧЕСКИХ ОСТАНКОВ ДОЛЬМЕННОГО ПАМЯТНИКА ШУШУКРабота выполнена при финансовой поддержке РФФИ (проект №15-36-20172 «Уточнение гипотез возникновения мегалитических сооружений на Северном Кавказе, используя современные методы геномики»). Работа выполнена с использованием оборудования ресурсного центра молекулярной и клеточной биологии НИЦ «Курчатовский институт»
Конец неолита и начало бронзового века – ключевое время в истории заселения Северного Кавказа. Хотя археологические данные предполагают несколько гипотез, объясняющих возможные варианты человеческих миграций в этот регион, исследования генетических особенностей населения постнеолитического Кавказа к настоящему времени весьма ограничены [Недолужко и др., 2014, с. 34–39; Sokolov et al., 2016, p. 138–144].
Данная работа направлена на изучение генетических источников происхождения мегалитических сооружений на Северном Кавказе:
выяснение происхождения дольменов (1-я половина II тыс. до н.э.), раскопанных в могильнике Шушук (Майкопский район, Республика Адыгея) Майкопской археологической экспедицией [Резепкин, 2013, с. 119–120].В качестве основного подхода был использован один из методов современной археологической генетики – анализ митохондриальной ДНК. Работы по выделению древней ДНК проводились в специально оборудованной чистой зоне Межинститутского сектора молекулярной палеогенетики ФИЦ Институт Цитологии и Генетики СО РАН с соблюдением всех необходимых для подобных экспериментов условий. В частности, были использованы комплекты спецодежды для чистых помещений, проводилась обработка рабочих поверхностей и приборов реагентом DNAAWAY (ThermoFisherScientific, США) и ультрафиолетом, на всех стадиях эксперимента присутствовали контрольные образцы, кроме того, анализировалась ДНК у всех сотрудников, осуществлявших работы в палеогенетической лаборатории.
Для анализа использовали 15 образцов (человеческие зубы), извлеченных из 4 дольменов могильного комплекса Шушук. Выделение ДНК из зубов проводили по стандартной методике с небольшими модификациями[Orlando et al., 2009, p. 21754–21759]. В итоге, древнюю ДНК удалось выделить из десяти образцов. Для амплификации участков D-петли митохондриальной ДНК (мтДНК) использовали праймерные системы, предложенные ранее [Sampietro et al., 2005. p. 535–548] и разработанные авторами исследования. Последовательность полученных ПЦР-фрагментов (длиной от 90 до 150 п.н.), покрывающих участок D-петли мтДНК, прочитывали, используя секвенатор ABI 3730 × l (ThermoFisherScientific, США).
Последовательности ДНК анализировали и выравнивали при помощи программы BioEdit, а программа mtDNAprofiler позволила получить список нуклеотидных отличий от референсной мтДНК (rCRS), который затем был использован для определения митохондриальных гаплотипов людей, захороненных в могильнике Шушук (применялась программа HaploGrep [Weissensteiner et al., 2016, w. 58–63]) (табл.).
Митохондриальные гаплогруппы, характерные для древних людей, обнаруженных в дольменах могильника Шушук, который относят к позднебронзовому периоду, отличаются от описанных нами ранее для представителей майкопской и новосвободненской культур [Недолужко и др., 2014, с. 34–39; Sokolov et al., 2016, p. 138–144]. В проанализированных образцах преобладает гаплотип R7a'b, что предполагает родство (по материнской линии) между людьми, принадлежащими к позднебронзовой мегалитической культуре и захороненными в дольменах могильника Шушук.
Более того, гаплотип R7 широко представлен у современного населения Индостана, в то время как выявленная нами гаплогруппа J1 встречается у коренного населения Республики Адыгея, так же как и родственная R7 гаплогруппа R1 [Chaubey et al., 2008]. Окончательный ответ о генетическом наследии Адыгеи может предоставить полногеномный анализ древних людей, захороненных в могильнике Шушук, и сравнение этих генетических данных с этногенетическими картами, построенными для современного населения Евразии.
Анализ данных глубокого севенирования (NGS) исследованных образцов не выявил патогенных бактерий и вирусов (в качестве референса взяли все полные геномы бактерий и вирусов представленные в базе NCBI на 13.12.2016). Нами были обнаружены лишь геномные последовательности микроорганизмов, населяющих почвы.
Антропологический материал из могильника Шушук:
митохонриальные гаплотипы древних людей
Номер образца Источник Митохондриальный гаплотип
1 Дольмен №5 J1b1a1
2 Дольмен №5, скелет №2 U5a1b1
3 Дольмен №5, скелет №5 R7a'b
4 Дольмен №6 R7a'b
5 Дольмен №6 R7a'b
6 Дольмен №6, скелет №2 R7a'b
7 Дольмен №9 M8/N
8 Дольмен №9, скелет №2 G1b
9 Дольмен №10 R7a'b
10 Дольмен №10 R7a'b