АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 256480 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1770 : 23 Январь 2019, 19:18:36 »
Ещё дДНК с Пиренейского полуострова:

https://royalsocietypublishing.org/doi/full/10.1098/rspb.2018.2288

A western route of prehistoric human migration from Africa into the Iberian Peninsula

G. González-Fortes, F. Tassi, E. Trucchi, K. Henneberger, J. L. A. Paijmans, D. Díez-del-Molino, H. Schroeder, R. R. Susca, C. Barroso-Ruíz, F. J. Bermudez, C. Barroso-Medina, A. M. S. Bettencourt, H. A. Sampaio, A. Grandal-d'Anglade, A. Salas, A. de Lombera-Hermida, R. Fabregas Valcarce, M. Vaquero, S. Alonso, M. Lozano, X. P. Rodríguez-Alvarez, C. Fernández-Rodríguez, A. Manica, M. Hofreiter and G. Barbujani

Published:23 January 2019

https://doi.org/10.1098/rspb.2018.2288

Abstract

Being at the western fringe of Europe, Iberia had a peculiar prehistory and a complex pattern of Neolithization. A few studies, all based on modern populations, reported the presence of DNA of likely African origin in this region, generally concluding it was the result of recent gene flow, probably during the Islamic period. Here, we provide evidence of much older gene flow from Africa to Iberia by sequencing whole genomes from four human remains from northern Portugal and southern Spain dated around 4000 years BP (from the Middle Neolithic to the Bronze Age). We found one of them to carry an unequivocal sub-Saharan mitogenome of most probably West or West-Central African origin, to our knowledge never reported before in prehistoric remains outside Africa. Our analyses of ancient nuclear genomes show small but significant levels of sub-Saharan African affinity in several ancient Iberian samples, which indicates that what we detected was not an occasional individual phenomenon, but an admixture event recognizable at the population level. We interpret this result as evidence of an early migration process from Africa into the Iberian Peninsula through a western route, possibly across the Strait of Gibraltar.

Находясь на западной окраине Европы, Иберия имела своеобразную предысторию и сложную картину неолитизации. В нескольких исследованиях, основанных на современных популяциях, сообщалось о наличии ДНК вероятного африканского происхождения в этом регионе, и в целом был сделан вывод о том, что это было результатом недавнего потока генов, вероятно, в исламский период. Здесь мы приводим доказательства гораздо более древнего потока генов из Африки в Иберию путем секвенирования целых геномов из четырех человеческих останков из северной Португалии и южной Испании, датируемых около 4000 лет назад (от среднего неолита до бронзового века). Мы обнаружили, что один из них имеет митогеном однозначно западноафриканского или западно-центральноафриканского происхождения, ранее не обнаруживавшийся, насколько нам известно, в доисторических останках за пределами Африки. Наш анализ древних ядерных геномов показывает небольшие, но существенные уровни близости к субсахарской Африке в нескольких образцах древнего иберийского происхождения, что указывает на то, что обнаруженное нами было не случайным индивидуальным явлением, а смешением, распознаваемым на уровне популяции. Мы интерпретируем этот результат как свидетельство раннего процесса миграции из Африки на Пиренейский полуостров по западному маршруту, возможно, через Гибралтарский пролив.

sample ID site Cal yBP Gen. cov Mt. hg. Biol sex Y hg
COV20126 Covacha del Ángel, Lucena (ES) 3637 ± 60 0.39× L2a1 XY G2a2b
LU339 Sima del Ángel, Lucena (ES) 4889 ± 68 4.78× H3
LD1174 Lorga de Dine (PT) 4467 ± 61 3.76× U5b2b5 XX
LD270 Lorga de Dine (PT) 4386 ± 128 4.20× U8a

Оффлайн Tambio

  • Сообщений: 314
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • Y-ДНК: R-L1280
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1771 : 23 Январь 2019, 20:33:08 »
Генетические корни трипольцев.
Разве трипольцы жили в пещерах? Я читал, что они жили в "городах". Если это так, то жители пещер могут и не иметь отношения к трипольцам, а быть просто соседями.

Оффлайн istov

  • Сообщений: 109
  • Страна: sk
  • Рейтинг +9/-8
  • Y-ДНК: .....
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1772 : 23 Январь 2019, 20:50:26 »
Разве трипольцы жили в пещерах? Я читал, что они жили в "городах". Если это так, то жители пещер могут и не иметь отношения к трипольцам, а быть просто соседями.
Это трипольцы, тут сомнений нет, там найдены трипольские вещи, керамика, в общем типичная трипольская культура. Да и других культур в тех местах нет.
Хоронят же вообще не обязательно точно там где живут, а в стороне, у вас кладбище прямо под окнами вашего дома?
Данная же пещера использовалась трипольцами как укрытие, от непогоды, что естественно для пещеры.  Там захоронены те кто там умер.

Оффлайн vvw1717

  • Сообщений: 111
  • Страна: ru
  • Рейтинг +111/-0
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1773 : 26 Январь 2019, 10:40:47 »

На антрогениеке пишут что Y-гаплогруппы определены неправильно. Они должны быть следующие:

By the way, their Y-HG for COV20126 is wrong and two of the other samples were male. I don't know how they missed they were male since they have great coverage (for ancient DNA). This is what I saw in the BAM files a couple of weeks ago, but others are free to check for themselves:

https://anthrogenica.com/showthread....l=1#post537779

COV20126 - Bronze age individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a2-L181

LU339 - Chalcolithic individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a1b1-L161.1

LD270 - Chalcolithic individual from Portugal (Lorga de Dinel):
Y-chromosome haplogroup: H2a1a2~-SK1193
https://anthrogenica.com/showthread.php?97-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News/page235
"В 2011 году в результате археологических раскопок вблизи деревни Кошице, Польша, было обнаружено 5000-летнее массовое захоронение с останками 15 мужчин, женщин и детей, принадлежащих культуре шаровидной амфоры. Все перенесли насильственные смерти, но были похоронены с большой осторожностью. Чтобы пролить новый свет на эту очевидную трагедию, мы провели подробное междисциплинарное исследование скелетов. Анализ родственных связей во всем геноме выявил расширенную семью с несколькими отношениями первой и второй степени. Тела были тщательно обставлены в соответствии с этими отношениями кем-то, кто знал покойных. Измерения изотопа стронция зубной эмали указывают на полуоседлый образ жизни. Анализ обеспечивает беспрецедентный уровень понимания социального поведения, групповой структуры и насильственных межгрупповых конфликтов в конце неолита в Европе..."
Y-хромосомы четырех мужчин:
RISE1160 = I2a2a1b-CTS10057
RISE1162 = I2a2a1b2a-L801
RISE1163 = I2a2a1b2a-L801
RISE1165 = I2a2a1b2-Z161
"В это время в Польше доминировала культура шаровидных амфор, которая подразделялась на среднепольскую, западную и восточную группы; первая и последняя продолжали традиции строительства мегалитических конструкций; для второй были характерны ямные захоронения."
Палеогенетика КША
"У двух обитателей кургана в районе Ягодно на окраине Вроцлава, живших 2800 лет до н. э., с очень высокой вероятностью обнаружены: NO.1 — Y-хромосомная гаплогруппа G; NO.2 — одна из трёх Y-хромосомных гаплогрупп — J, I или E. Однако, относятся ли они к неолитической культуре шаровидных амфор или к раннему этапу культуры шнуровой керамики пока неясно[5]. У двух представителей культуры шаровидных амфор и польского местонахождения Kowal, живших в 2850—2570 годах до н. э., определены митохондриальные гаплогруппы K и K2a[6][7]. Также определены Y-хромосомные гаплогруппы I2, I2a2a, I2a2a1b, I2a2a1b2 и митохондриальные гаплогруппы H1b, H28, J1c, J1c3, K1b1a1, T2b (Илятка), U5b1d1, U5b2b1, W5 (Kierzkowo)"

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1774 : 27 Январь 2019, 00:43:34 »
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0210718

Medieval mummies of Zeleny Yar burial ground in the Arctic Zone of Western Siberia

    Sergey Mikhailovich Slepchenko ,    Alexander Vasilyevich Gusev,    Evgenia Olegovna Svyatova,    Jong Ha Hong,    Chang Seok Oh,    Do Seon Lim,    Dong Hoon Shin

PLOS
    Published: January 25, 2019
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0210718

Abstract

Notwithstanding the pioneering achievements of studies on arctic mummies in Siberia, there are insufficient data for any comprehensive understanding of the bio-cultural details of medieval people living in the region. In the Western Siberian arctic, permafrost mummies have been found in 12th to 13th century graves located in the Zeleny Yar (Z-Y) burial ground (66°19'4.54"С; 67°21'13.54"В). In 2013–2016, we were fortunate to be able to excavate that cemetery, locating a total of 47 burials, including cases of mummification. Some of these mummies had been wrapped in a multi-layered birch-bark cocoon. After removal of the cocoon, we conducted interdisciplinary studies using various scientific techniques. Gross anatomical examination and CT radiography showed that the internal organs were still well preserved inside the body cavities. Under light and electron microscopy, the histological findings were very similar to those for naturally mummified specimens discovered in other countries. Ancient DNA analysis showed that the Z-Y mummies’ mtDNA haplotypes belong to five different haplogroups, namely U5a (#34), H3ao (#53), D (#67–1), U4b1b1 (#67–2), and D4j8 (#68), which distinguish them for their unique combination of Western- and Eastern Siberia-specific mtDNA haplogroups. Our interdisciplinary study obtained fundamental information that will form the foundation of successful future investigations on medieval mummies found in the Western Siberian arctic.

Несмотря на новаторские достижения в изучении арктических мумий в Сибири, данных для всестороннего понимания биокультурных особенностей средневековых людей, проживавщих в регионе, недостаточно. В Западно-Сибирской Арктике мумии в вечной мерзлоте были обнаружены в могилах XII-XIII веков, расположенных в могильнике Зеленый Яр (Z-Y) (66 ° 19'4.54 "с.ш.; 67 ° 21'13.54" в.д.). В 2013-2016 годах нам посчастливилось раскопать это кладбище, в общей сложности 47 захоронений, включая случаи мумификации. Некоторые из этих мумий были завернуты в многослойный берестяной кокон. После удаления кокона мы провели междисциплинарные исследования с использованием различных научных методов. Общий анатомический осмотр и компьютерная томография показали, что внутренние органы все еще хорошо сохранились внутри полостей тела. При световой и электронной микроскопии гистологические результаты были очень похожи на те, которые были получены для естественно мумифицированных образцов в других странах. Анализ древней ДНК показал, что гаплотипы мтДНК мумий из Зелёного Яра принадлежат к пяти различным гаплогруппам, а именно: U5a (# 34), H3ao (# 53), D (# 67–1), U4b1b1 (# 67–2) и D4j8 (# 68), которые отличают их уникальной комбинацией гаплогрупп мтДНК, специфичных для Западной и Восточной Сибири. Наше междисциплинарное исследование получило фундаментальную информацию, которая послужит основой для будущих успешных исследований средневековых мумий, обнаруженных в Западно-Сибирской Арктике.


Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10138
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1559/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1775 : 27 Январь 2019, 01:17:38 »
Опять только мито.  :( Как же это.....Чисто для галочки отрабатывают?

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1776 : 27 Январь 2019, 01:25:16 »
Опять только мито.  :( Как же это.....Чисто для галочки отрабатывают?

Ну, анализ делали корейцы, а у них пока нет лабораторий уровня Гарварда или Копенгагена. Да и в России таких нету. На всём постсоветском пространстве только в Эстонии есть продвинутая лаборатория.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1777 : 27 Январь 2019, 01:28:07 »
https://trv-science.ru/2019/01/15/markina-zoomuzeum-msu/

15.01.2019 / № 270 / с. 8 /  Надежда Маркина / 

Экспонаты Зоомузея МГУ заговорили на языке генов

ДНК, выделенная из экспонатов Зоологического музея МГУ, помогает биологам находить ответы на загадки систематики и эволюции животного мира.

Коллекции животных и растений естественнонаучных музеев знакомят посетителей с бесконечным разнообразием живого мира, а для науки хранят это разнообразие экземпляров, собранных натуралистами в течение веков. Причем в музейных экспонатах, заспиртованных, заформалиненных и высушенных в виде тушек и чучел, сохранен не только внешний облик живущих или уже не живущих на планете существ. В них законсервирована информация, которая может рассказать о родственных связях с другими организмами и, следовательно, об их эволюции. Носитель этой информации — ДНК. Нужно только уметь ее прочитать. Сегодня, когда молекулярно-генетические методы прочно вошли в практику полевых зоологов, они используются и в музеях. При всех крупных музеях естественной истории в мире имеются лаборатории генетического анализа, и в них исследуется богатейший материал, за которым и ходить-то никуда не надо — вот он, под рукой. С помощью молекулярной генетики музейные экспонаты в информационном смысле «оживают». И музеи выходят на новый уровень научных исследований — возможность обращения к генетике радикально расширяет использование их коллекций как источника получения новых знаний.

Такая лаборатория теперь есть и в Зоологическом музее МГУ на Большой Никитской. Она начала работать в 2016 году, когда музей отметил свое 225-летие. Называется она Лабораторией исторической ДНК. Слово «исторической» не должно вводить в заблуждение — здесь работают с ДНК животных, живших в исторический период, образцы которых собраны специалистами. Это название подчеркивает возраст музейных экспонатов — им от десятков до пары сотен лет, но не тысячи лет (тогда речь идет уже о палеоДНК, или древней ДНК). Но из образцов «исторического» возраста выделить ДНК гораздо труднее, чем из свежих. Прежде всего нужно обеспечить высокую степень стерильности, чтобы избежать контаминации, проще говоря— загрязнения.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10138
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1559/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1778 : 27 Январь 2019, 21:51:40 »
Да и в России таких нету. На всём постсоветском пространстве только в Эстонии есть продвинутая лаборатория.
А как же так что при Курчатовском? Ее ж так пиарили, так пиарили.... Или просто бюджет осваивали?

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1779 : 28 Январь 2019, 07:46:21 »
Они пока ничего выдающегося не опубликовали. Ждём-с.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1780 : 30 Январь 2019, 20:53:37 »
https://www.nature.com/articles/s41467-018-08018-8

Article | Open | Published: 30 January 2019

Compound-specific radiocarbon dating and mitochondrial DNA analysis of the Pleistocene hominin from Salkhit Mongolia

Thibaut Devièse, Diyendo Massilani, Seonbok Yi, Daniel Comeskey, Sarah Nagel, Birgit Nickel, Erika Ribechini, Jungeun Lee, Damdinsuren Tseveendorj, Byambaa Gunchinsuren, Matthias Meyer, Svante Pääbo & Tom Higham

Nature Communicationsvolume 10, Article number: 274 (2019)

Abstract

A skullcap found in the Salkhit Valley in northeast Mongolia is, to our knowledge, the only Pleistocene hominin fossil found in the country. It was initially described as an individual with possible archaic affinities, but its ancestry has been debated since the discovery. Here, we determine the age of the Salkhit skull by compound-specific radiocarbon dating of hydroxyproline to 34,950–33,900 Cal. BP (at 95% probability), placing the Salkhit individual in the Early Upper Paleolithic period. We reconstruct the complete mitochondrial genome (mtDNA) of the specimen. It falls within a group of modern human mtDNAs (haplogroup N) that is widespread in Eurasia today. The results now place the specimen into its proper chronometric and biological context and allow us to begin integrating it with other evidence for the human occupation of this region during the Paleolithic, as well as wider Pleistocene sequences across Eurasia.


https://naked-science.ru/article/sci/uchenye-iz-oksforda-tochnee-opredelili

Ученые из Оксфорда точнее определили возраст черепа самого раннего человека, найденного в Монголии

Эти кости, найденные в северо-восточной части Монголии, в долине Салхит, на сегодня считаются единственным ископаемым гоминина эпохи плейстоцена, обнаруженным на территории страны.

... Оксфордская команда повторно изучила череп и пришла к выводу, что его владелец жил 34 950-33 900 лет назад. ... Кроме того, из костей были извлечены анализы ДНК, с помощью чего ученым удалось реконструировать полный митохондриальный геном образца, что также подтвердило мнение о том, что череп действительно принадлежит современному человеку. Сейчас продолжается работа по созданию ядерной ДНК, чтобы узнать больше о генетике черепа. ...

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1781 : 31 Январь 2019, 03:09:54 »
мтДНК из средневековой Румынии:

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0193578

Maternal DNA lineages at the gate of Europe in the 10th century AD

    Ioana Rusu ,    Alessandra Modi ,    Stefania Vai,    Elena Pilli,    Cristina Mircea,    Claudia Radu,    Claudia Urduzia,    Zeno Karl Pinter,    Vitalie Bodolică,    Cătălin Dobrinescu,    Montserrat Hervella,    Octavian Popescu,    Martina Lari,    David Caramelli,    Beatrice Kelemen

    Published: March 14, 2018
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0193578

Abstract

Given the paucity of archaeogenetic data available for medieval European populations in comparison to other historical periods, the genetic landscape of this age appears as a puzzle of dispersed, small, known pieces. In particular, Southeastern Europe has been scarcely investigated to date. In this paper, we report the study of mitochondrial DNA in 10th century AD human samples from Capidava necropolis, located in Dobruja (Southeastern Romania, Southeastern Europe). This geographical region is particularly interesting because of the extensive population flux following diverse migration routes, and the complex interactions between distinct population groups during the medieval period. We successfully amplified and typed the mitochondrial control region of 10 individuals. For five of them, we also reconstructed the complete mitochondrial genomes using hybridization-based DNA capture combined with Next Generation Sequencing. We have portrayed the genetic structure of the Capidava medieval population, represented by 10 individuals displaying 8 haplotypes (U5a1c2a, V1a, R0a2’3, H1, U3a, N9a9, H5e1a1, and H13a1a3). Remarkable for this site is the presence of both Central Asiatic (N9a) and common European mtDNA haplotypes, establishing Capidava as a point of convergence between East and West. The distribution of mtDNA lineages in the necropolis highlighted the existence of two groups of two individuals with close maternal relationships as they share the same haplotypes. We also sketch, using comparative statistical and population genetic analyses, the genetic relationships between the investigated dataset and other medieval and modern Eurasian populations.

Учитывая малочисленность археогенетических данных, доступных для средневековых европейских популяций по сравнению с другими историческими периодами, генетический ландшафт этого возраста кажется головоломкой рассеянных, мелких, известных частей. В частности, Юго-Восточная Европа до сих пор практически не изучалась. В этой статье мы сообщаем об исследовании митохондриальной ДНК в останках людей 10-го века н. э. из некрополя Капидава, расположенного в Добрудже (Юго-Восточная Румыния, Юго-Восточная Европа). Этот географический регион особенно интересен из-за большого потока населения, следующего по различным миграционным маршрутам, и сложного взаимодействия между отдельными группами населения в средневековый период. Мы успешно обогатили и типировали контрольный регион  мтДНК у 10 особей. Для пяти из них мы также реконструировали полные митохондриальные геномы с использованием гибридизационного ДНК-захвата в сочетании с секвенированием следующего поколения. Мы получили картину генетической структуры средневековой популяции Капидавы, представленную 10 индивидуумами с 8 гаплотипами (U5a1c2a, V1a, R0a2'3, H1, U3a, N9a9, H5e1a1 и H13a1a3). Примечательным для этого участка является наличие как Центральноазиатских (N9a), так и общеевропейских гаплотипов мтДНК, устанавливающих Капидаву в качестве точки конвергенции между Востоком и Западом. Распределение линий мтДНК в некрополе высветило  существование двух групп из двух лиц с близкими материнскими отношениями, поскольку они имеют одни и те же гаплотипы. С помощью сравнительного статистического и популяционно-генетического анализа мы также очерчиваем генетические связи между исследуемым набором данных и другими средневековыми и современными евразийскими популяциями.

Продолжение: ещё 6 митогеномов из этого места:

https://www.nature.com/articles/s41598-018-37760-8

Article | Open | Published: 30 January 2019

Mitochondrial ancestry of medieval individuals carelessly interred in a multiple burial from southeastern Romania


    Ioana Rusu, Alessandra Modi, Claudia Radu, Cristina Mircea, Adriana Vulpoi, Cătălin Dobrinescu, Vitalie Bodolică, Tiberiu Potârniche, Octavian Popescu, David Caramelli & Beatrice Kelemen

Scientific Reportsvolume 9, Article number: 961 (2019) | Download Citation
Abstract

The historical province of Dobruja, located in southeastern Romania, has experienced intense human population movement, invasions, and conflictual episodes during the Middle Ages, being an important intersection point between Asia and Europe. The most informative source of maternal population histories is the complete mitochondrial genome of archaeological specimens, but currently, there is insufficient ancient DNA data available for the medieval period in this geographical region to complement the archaeological findings. In this study, we reconstructed, by using Next Generation Sequencing, the entire mitochondrial genomes (mitogenomes) of six medieval individuals neglectfully buried in a multiple burial from Capidava necropolis (Dobruja), some presenting signs of a violent death. Six distinct maternal lineages (H11a1, U4d2, J1c15, U6a1a1, T2b, and N1a3a) with different phylogenetic background were identified, pointing out the heterogeneous genetic aspect of the analyzed medieval group. Using population genetic analysis based on high-resolution mitochondrial data, we inferred the genetic affinities of the available medieval dataset from Capidava to other ancient Eurasian populations. The genetic data were integrated with the archaeological and anthropological information in order to sketch a small, local piece of the mosaic that is the image of medieval European population history.

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 899
  • Страна: ua
  • Рейтинг +370/-5
    • r1b-pf7562.blogspot.com
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1782 : 03 Февраль 2019, 00:14:37 »
На Антрогенике выложили результаты всех мужчин культуры шаровидных амфор из https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB28451:

RISE1160: I2a2a1b-CTS10057
RISE1162: I2a2a1b2a-L801
RISE1163: I2a2a1b2a-L801
RISE1165: I2a2a1b2-Z161
RISE1168: I2a2a1b2a-L801
RISE1169: I2a2a1b2a-L801
RISE1171: I2a2a1b2a-L801
RISE1173: I2a2a1b2a-L801
RISE1241: I2a2a1b2a-L801
RISE1250: I2a2a-L59
RISE1252: I2a2a1-CTS616
RISE1254: I2a2a1b2a-L801

https://anthrogenica.com/showthread.php?97-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News&p=544003&viewfull=1#post544003

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1131
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1235/-0
  • Y-ДНК: C-F5481
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1783 : 03 Февраль 2019, 01:04:24 »
На Антрогенике выложили результаты всех мужчин культуры шаровидных амфор из https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB28451:

RISE1160: I2a2a1b-CTS10057
RISE1162: I2a2a1b2a-L801
RISE1163: I2a2a1b2a-L801
RISE1165: I2a2a1b2-Z161
RISE1168: I2a2a1b2a-L801
RISE1169: I2a2a1b2a-L801
RISE1171: I2a2a1b2a-L801
RISE1173: I2a2a1b2a-L801
RISE1241: I2a2a1b2a-L801
RISE1250: I2a2a-L59
RISE1252: I2a2a1-CTS616
RISE1254: I2a2a1b2a-L801

https://anthrogenica.com/showthread.php?97-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News&p=544003&viewfull=1#post544003

Если я правильно понял там многие погребённые - родственники.

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 94
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1784 : 04 Февраль 2019, 22:20:04 »
Такой вопрос:

В  работе "Genome diversity in the Neolithic Globular Amphorae culture and the spread of Indo-European languages"
http://public-files.prbb.org/publicacions/141b7a60-b57a-0135-7280-00155df14f0e.pdf

утверждается, что один из образцов КША содержал 15% степного компонента. В Figure 3 есть два диаграмма Admixture c K=3 и K=4.

В К=3 эту примесь можно увидеть в одном образце. В К=4 ее уже нет. Образцы КША те же, что использовались в The Genomic History of Southeastern Europe.
Там делали анализ и с большем количеством предковых популяций, но степной примеси не обнаружили. Тем не менее, авторы "Genome diversity..." посчитали возможным говорить о следе ограниченной миграции. В чем причина разночтений? Авторы "Genome diversity..." допустили ошибку из-за маленького расширения? К их выводам не стоит серьезно относиться? Или есть какой-то подвох? Авторы вроде указывают, что расширение было в этом случае оптимальным

"The optimal value of K was evaluated
through a cross-validation procedure, thus identifying the
number of ancestral populations for which the model had
the best predictive accuracy"

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100