АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 313224 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1294
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1593/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1755 : 28 Декабрь 2018, 20:56:17 »
http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/76/1171

Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа

Статья появилась в открытом доступе:

https://www.researchgate.net/publication/329886912_An_Unusual_Burial_of_a_Xiongnu-Sarmatian_Era_Warrior_in_the_Western_Siberian_Forest-Steppe_Results_of_a_Paleogenetic_Analysis_in_Russian

STR-маркеры:

DYS456 16
DYS389I 13
DYS390 24
DYS389II 28
DYS458 18
DYS19 13
DYS385a/b 13/16
DYS393 13
DYS391 10
DYS439 12
DYS635 24
DYS392 16
Y GATA H4  11
DYS437 14
DYS438 11
DYS448 23
Предсказанная гаплогруппа Q (Q1a)


Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1757 : 05 Январь 2019, 21:30:44 »
Поляко пишет, что в новой версии статьи по Южной/Центральной Азии ожидается 110(!) образцов из долины реки Сват Железного века, причем среди них будет два генетических аутлайера, предположительно, с 50% адмиксом средней степной Бронзы:

Цитировать
...
There will be 110 samples from the Iron Age Swat Valley in the Central/South Asian paper, including two outliers that probably have around 50% Steppe_MLBA ancestry. I have a hunch that the story of South Asian R1a-L657 will soon be much better known.
...

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5803
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2026/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1758 : 12 Январь 2019, 20:59:13 »
Часть сообщений - в соседней теме http://forum.molgen.org/index.php/topic,9518.0.html
Продолжение дискуссии наверняка будет...

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1294
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1593/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1759 : 14 Январь 2019, 05:11:44 »
В комментариях у Davidski пользователь Arza дал ссылки на ENA, там выкладывают геномы из двух, ещё не опубликованных исследований:

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB29189
Study: PRJEB29189
This study includes mitogenomes and whole nuclear genomes from prehistoric Iberian remains
Name
Ancient Iberian genomes
Submitting Centre
Universita degli studi di Ferrara
Secondary accession(s)
ERP111469
Description
We used a combination of shotgun and whole genome capture strategies to generate whole genome data from 4 ancient human remains from the Iberian Peninsula (coverage from 0.4-4.8x) dated around 4500-3500 yB. Also, we used target DNA capture on array to reconstruct complete nuclear genomes from 13 additional ancient human remains from North and South of the Iberian Peninsula, also dated around to the Copper Age

Исследование: PRJEB29189
Это исследование включает в себя митогеномы и целые ядерные геномы из доисторических иберийских останков.
Древние иберийские геномы
Университет дельи Студия ди Феррара
Описание
Мы использовали комбинацию стратегий для получения данных полного генома из 4 древних человеческих останков с Пиренейского полуострова (покрытие 0,4-4,8х), датированных около 4500-3500 лет назад. Кроме того, мы использовали целевой ДНК-захват на массиве для реконструкции полных ядерных геномов из 13 дополнительных древних человеческих останков с севера и юга Пиренейского полуострова, также датированных медным веком.


Study: PRJEB28451
Blood ties: Unraveling ancestry and kinship in a Stone Age mass burial
Name
Blood ties in Koszice burial site
Submitting Centre
CENTRE FOR GEOGENETICS
Secondary accession(s)
ERP110657
Description
In 2011 archaeological excavations near the village of Koszyce, Poland, uncovered a 5000-year-old mass burial with the remains of 15 men, women and children belonging to the Globular Amphora culture. All had suffered violent deaths but had been buried with great care. To shed new light on this apparent tragedy we conducted a detailed interdisciplinary investigation of the skeletons. Genome-wide kinship analyses revealed an extended family with several first- and second-degree relationships. The bodies had been carefully arranged according to these relationships by someone who knew the deceased. Strontium isotope measurements of tooth enamel indicate a semi-settled lifestyle. The analyses provide an unprecedented level of insight into social behavior, group structure, and violent intergroup conflict at the end of the Neolithic period in Europe.

Исследование: PRJEB28451
Узы крови: распутывание родословной и родство в массовом захоронении в каменном веке
Кровные узы в могильнике Кошице
ЦЕНТР ГЕОГЕНЕТИКИ
Описание
В 2011 году в результате археологических раскопок вблизи деревни Кошице, Польша, было обнаружено 5000-летнее массовое захоронение с останками 15 мужчин, женщин и детей, принадлежащих культуре шаровидных амфор. Все перенесли насильственные смерти, но были похоронены с большой заботой. Чтобы пролить новый свет на эту очевидную трагедию, мы провели подробное междисциплинарное исследование скелетов. Геномный анализ родства выявил расширенную семью с несколькими родственниками первой и второй степени. Тела были аккуратно разложены в соответствии с этими отношениями кем-то, кто знал покойных. Измерения изотопа стронция зубной эмали указывают на полуоседлый образ жизни. Анализ обеспечивает беспрецедентный уровень понимания социального поведения, групповой структуры и насильственных межгрупповых конфликтов в конце периода неолита в Европе.

На anthrogenice'е уже успели скачать и исследовать Y-хромосомы из первой статьи, про иберийцев: https://anthrogenica.com/showthread.php?16234-Bell-Beaker-Archaeology-and-Ancient-DNA&p=537571&viewfull=1#post537571

Three of the four ancient samples from Iberia that were uploaded to the European Nucelotide Archive today were males. As expected, all three lack R-M269 and belong to lineages that are uncommon or flat out non-existent in modern Iberians:

COV20126 - Bronze age individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a2-L181

LU339 - Chalcolithic individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a1b1-L161.1

LD270 - Chalcolithic individual from Portugal (Lorga de Dinel):
Y-chromosome haplogroup: H2a1a2-SK1193

Оффлайн hgv

  • Сообщений: 609
  • Страна: ua
  • Рейтинг +153/-0
  • Y-ДНК: N1c1
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1760 : 22 Январь 2019, 09:57:49 »
Генетические корни трипольцев.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1294
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1593/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1761 : 23 Январь 2019, 08:44:09 »
https://www.asu.ru/news/events/31738/

Археологи опорного АлтГУ намерены разгадать загадку андроновской культуры бронзового века

22 января 2019 Управление информации и медиакоммуникаций

Российский фонд фундаментальных исследований поддержал проект опорного Алтайского государственного университета, посвященный социокультурной адаптации древнего населения Алтая – андроновской культуры периода бронзового века.

 В работе над проектом также примет участие Институт цитологии и генетики СО РАН (г.Новосибирск) и, в частности, один из ведущих российских специалистов в области палеогенетики, кандидат биологических наук Александр Сергеевич Пилипенко.

    «С помощью генетики мы надеемся верифицировать полученные нами результаты. То есть определить, является ли андроновская культуры пришлой для территории Алтая, или это ее родина. Сейчас генетика обладает значительным банком биологических данных, который позволяет определять, где прародина того, или иного народа. Таким образом, сопоставив данные трех направлений проекта, мы определим, как они соотносятся с традиционными археологическими данными, и в итоге сформируем модель древнего общества андроновской культуры», - подытожил Дмитрий Папин.




Что-то поздно они спохватились, как бы уже понятно что андроновцы пришлые.

Оффлайн hyper

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +14/-2
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1762 : 23 Январь 2019, 14:11:09 »
Археологи опорного АлтГУ намерены разгадать загадку андроновской культуры бронзового века

 В работе над проектом также примет участие Институт цитологии и генетики СО РАН (г.Новосибирск) и, в частности, один из ведущих российских специалистов в области палеогенетики, кандидат биологических наук Александр Сергеевич Пилипенко.

пришлой для территории Алтая, или это ее родина

Что-то поздно они спохватились, как бы уже понятно что андроновцы пришлые.

Если всё это опять сведется к митоДНК и 17 маркерам, как обычно у Пилипенко, то всё это вообще будет бессмысленно. Понятно, что эти исследования это отдаленное будущее, в то время как никакой тайны андроновской культуры откуда она появилась уже нет, андроновская культура пришлая на территории Алтая. Есть запрос на глубокое тестирование по глубокому набору снипов и аутосомному анализу со всей территории андроновской культуры, чтобы определить место происхождения всех индоиранских народов.

Оффлайн сармат

  • Сообщений: 5377
  • Страна: ru
  • Рейтинг +420/-48
  • Y-ДНК: J2a1 Z6049 DYS438=7, DYS450=7.
  • мтДНК: U5a1d2b.
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1763 : 23 Январь 2019, 15:06:38 »
Цитировать
пришлой для территории Алтая, или это ее родина

Генетически, вполне вероятно что местные ребята были, в общем будем смотреть.

Оффлайн hyper

  • Сообщений: 24
  • Страна: 00
  • Рейтинг +14/-2
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1764 : 23 Январь 2019, 16:26:03 »
Цитировать
пришлой для территории Алтая, или это ее родина

Генетически, вполне вероятно что местные ребята были, в общем будем смотреть.

Практически невероятно. Местные ребята это окуневцы, которые были Q1a..., NO(?), а перед этим там были афанасьевцы R1b-Z2103. От них ничего не осталось, физический облик окуневцев, афансьевцев. алтайских андроновцев отличался так, что они выглядели как представители разных рас и малых рас, очень сильно отличались друг от друга.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1294
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1593/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1765 : 23 Январь 2019, 19:18:36 »
Ещё дДНК с Пиренейского полуострова:

https://royalsocietypublishing.org/doi/full/10.1098/rspb.2018.2288

A western route of prehistoric human migration from Africa into the Iberian Peninsula

G. González-Fortes, F. Tassi, E. Trucchi, K. Henneberger, J. L. A. Paijmans, D. Díez-del-Molino, H. Schroeder, R. R. Susca, C. Barroso-Ruíz, F. J. Bermudez, C. Barroso-Medina, A. M. S. Bettencourt, H. A. Sampaio, A. Grandal-d'Anglade, A. Salas, A. de Lombera-Hermida, R. Fabregas Valcarce, M. Vaquero, S. Alonso, M. Lozano, X. P. Rodríguez-Alvarez, C. Fernández-Rodríguez, A. Manica, M. Hofreiter and G. Barbujani

Published:23 January 2019

https://doi.org/10.1098/rspb.2018.2288

Abstract

Being at the western fringe of Europe, Iberia had a peculiar prehistory and a complex pattern of Neolithization. A few studies, all based on modern populations, reported the presence of DNA of likely African origin in this region, generally concluding it was the result of recent gene flow, probably during the Islamic period. Here, we provide evidence of much older gene flow from Africa to Iberia by sequencing whole genomes from four human remains from northern Portugal and southern Spain dated around 4000 years BP (from the Middle Neolithic to the Bronze Age). We found one of them to carry an unequivocal sub-Saharan mitogenome of most probably West or West-Central African origin, to our knowledge never reported before in prehistoric remains outside Africa. Our analyses of ancient nuclear genomes show small but significant levels of sub-Saharan African affinity in several ancient Iberian samples, which indicates that what we detected was not an occasional individual phenomenon, but an admixture event recognizable at the population level. We interpret this result as evidence of an early migration process from Africa into the Iberian Peninsula through a western route, possibly across the Strait of Gibraltar.

Находясь на западной окраине Европы, Иберия имела своеобразную предысторию и сложную картину неолитизации. В нескольких исследованиях, основанных на современных популяциях, сообщалось о наличии ДНК вероятного африканского происхождения в этом регионе, и в целом был сделан вывод о том, что это было результатом недавнего потока генов, вероятно, в исламский период. Здесь мы приводим доказательства гораздо более древнего потока генов из Африки в Иберию путем секвенирования целых геномов из четырех человеческих останков из северной Португалии и южной Испании, датируемых около 4000 лет назад (от среднего неолита до бронзового века). Мы обнаружили, что один из них имеет митогеном однозначно западноафриканского или западно-центральноафриканского происхождения, ранее не обнаруживавшийся, насколько нам известно, в доисторических останках за пределами Африки. Наш анализ древних ядерных геномов показывает небольшие, но существенные уровни близости к субсахарской Африке в нескольких образцах древнего иберийского происхождения, что указывает на то, что обнаруженное нами было не случайным индивидуальным явлением, а смешением, распознаваемым на уровне популяции. Мы интерпретируем этот результат как свидетельство раннего процесса миграции из Африки на Пиренейский полуостров по западному маршруту, возможно, через Гибралтарский пролив.

sample ID site Cal yBP Gen. cov Mt. hg. Biol sex Y hg
COV20126 Covacha del Ángel, Lucena (ES) 3637 ± 60 0.39× L2a1 XY G2a2b
LU339 Sima del Ángel, Lucena (ES) 4889 ± 68 4.78× H3
LD1174 Lorga de Dine (PT) 4467 ± 61 3.76× U5b2b5 XX
LD270 Lorga de Dine (PT) 4386 ± 128 4.20× U8a

Оффлайн Tambio

  • Сообщений: 352
  • Страна: ru
  • Рейтинг +75/-0
  • Y-ДНК: R-L1280 (YP4850 ?)
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1766 : 23 Январь 2019, 20:33:08 »
Генетические корни трипольцев.
Разве трипольцы жили в пещерах? Я читал, что они жили в "городах". Если это так, то жители пещер могут и не иметь отношения к трипольцам, а быть просто соседями.

Оффлайн istov

  • Сообщений: 109
  • Страна: sk
  • Рейтинг +9/-8
  • Y-ДНК: .....
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1767 : 23 Январь 2019, 20:50:26 »
Разве трипольцы жили в пещерах? Я читал, что они жили в "городах". Если это так, то жители пещер могут и не иметь отношения к трипольцам, а быть просто соседями.
Это трипольцы, тут сомнений нет, там найдены трипольские вещи, керамика, в общем типичная трипольская культура. Да и других культур в тех местах нет.
Хоронят же вообще не обязательно точно там где живут, а в стороне, у вас кладбище прямо под окнами вашего дома?
Данная же пещера использовалась трипольцами как укрытие, от непогоды, что естественно для пещеры.  Там захоронены те кто там умер.

Оффлайн vvw1717

  • Сообщений: 135
  • Страна: ru
  • Рейтинг +121/-0
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1768 : 26 Январь 2019, 10:40:47 »

На антрогениеке пишут что Y-гаплогруппы определены неправильно. Они должны быть следующие:

By the way, their Y-HG for COV20126 is wrong and two of the other samples were male. I don't know how they missed they were male since they have great coverage (for ancient DNA). This is what I saw in the BAM files a couple of weeks ago, but others are free to check for themselves:

https://anthrogenica.com/showthread....l=1#post537779

COV20126 - Bronze age individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a2-L181

LU339 - Chalcolithic individual from Spain (Cueva del Angel):
Y-chromosome haplogroup: I2a1b1-L161.1

LD270 - Chalcolithic individual from Portugal (Lorga de Dinel):
Y-chromosome haplogroup: H2a1a2~-SK1193
https://anthrogenica.com/showthread.php?97-Genetic-Genealogy-and-Ancient-DNA-in-the-News/page235
"В 2011 году в результате археологических раскопок вблизи деревни Кошице, Польша, было обнаружено 5000-летнее массовое захоронение с останками 15 мужчин, женщин и детей, принадлежащих культуре шаровидной амфоры. Все перенесли насильственные смерти, но были похоронены с большой осторожностью. Чтобы пролить новый свет на эту очевидную трагедию, мы провели подробное междисциплинарное исследование скелетов. Анализ родственных связей во всем геноме выявил расширенную семью с несколькими отношениями первой и второй степени. Тела были тщательно обставлены в соответствии с этими отношениями кем-то, кто знал покойных. Измерения изотопа стронция зубной эмали указывают на полуоседлый образ жизни. Анализ обеспечивает беспрецедентный уровень понимания социального поведения, групповой структуры и насильственных межгрупповых конфликтов в конце неолита в Европе..."
Y-хромосомы четырех мужчин:
RISE1160 = I2a2a1b-CTS10057
RISE1162 = I2a2a1b2a-L801
RISE1163 = I2a2a1b2a-L801
RISE1165 = I2a2a1b2-Z161
"В это время в Польше доминировала культура шаровидных амфор, которая подразделялась на среднепольскую, западную и восточную группы; первая и последняя продолжали традиции строительства мегалитических конструкций; для второй были характерны ямные захоронения."
Палеогенетика КША
"У двух обитателей кургана в районе Ягодно на окраине Вроцлава, живших 2800 лет до н. э., с очень высокой вероятностью обнаружены: NO.1 — Y-хромосомная гаплогруппа G; NO.2 — одна из трёх Y-хромосомных гаплогрупп — J, I или E. Однако, относятся ли они к неолитической культуре шаровидных амфор или к раннему этапу культуры шнуровой керамики пока неясно[5]. У двух представителей культуры шаровидных амфор и польского местонахождения Kowal, живших в 2850—2570 годах до н. э., определены митохондриальные гаплогруппы K и K2a[6][7]. Также определены Y-хромосомные гаплогруппы I2, I2a2a, I2a2a1b, I2a2a1b2 и митохондриальные гаплогруппы H1b, H28, J1c, J1c3, K1b1a1, T2b (Илятка), U5b1d1, U5b2b1, W5 (Kierzkowo)"

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1294
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1593/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #1769 : 27 Январь 2019, 00:43:34 »
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0210718

Medieval mummies of Zeleny Yar burial ground in the Arctic Zone of Western Siberia

    Sergey Mikhailovich Slepchenko ,    Alexander Vasilyevich Gusev,    Evgenia Olegovna Svyatova,    Jong Ha Hong,    Chang Seok Oh,    Do Seon Lim,    Dong Hoon Shin

PLOS
    Published: January 25, 2019
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0210718

Abstract

Notwithstanding the pioneering achievements of studies on arctic mummies in Siberia, there are insufficient data for any comprehensive understanding of the bio-cultural details of medieval people living in the region. In the Western Siberian arctic, permafrost mummies have been found in 12th to 13th century graves located in the Zeleny Yar (Z-Y) burial ground (66°19'4.54"С; 67°21'13.54"В). In 2013–2016, we were fortunate to be able to excavate that cemetery, locating a total of 47 burials, including cases of mummification. Some of these mummies had been wrapped in a multi-layered birch-bark cocoon. After removal of the cocoon, we conducted interdisciplinary studies using various scientific techniques. Gross anatomical examination and CT radiography showed that the internal organs were still well preserved inside the body cavities. Under light and electron microscopy, the histological findings were very similar to those for naturally mummified specimens discovered in other countries. Ancient DNA analysis showed that the Z-Y mummies’ mtDNA haplotypes belong to five different haplogroups, namely U5a (#34), H3ao (#53), D (#67–1), U4b1b1 (#67–2), and D4j8 (#68), which distinguish them for their unique combination of Western- and Eastern Siberia-specific mtDNA haplogroups. Our interdisciplinary study obtained fundamental information that will form the foundation of successful future investigations on medieval mummies found in the Western Siberian arctic.

Несмотря на новаторские достижения в изучении арктических мумий в Сибири, данных для всестороннего понимания биокультурных особенностей средневековых людей, проживавщих в регионе, недостаточно. В Западно-Сибирской Арктике мумии в вечной мерзлоте были обнаружены в могилах XII-XIII веков, расположенных в могильнике Зеленый Яр (Z-Y) (66 ° 19'4.54 "с.ш.; 67 ° 21'13.54" в.д.). В 2013-2016 годах нам посчастливилось раскопать это кладбище, в общей сложности 47 захоронений, включая случаи мумификации. Некоторые из этих мумий были завернуты в многослойный берестяной кокон. После удаления кокона мы провели междисциплинарные исследования с использованием различных научных методов. Общий анатомический осмотр и компьютерная томография показали, что внутренние органы все еще хорошо сохранились внутри полостей тела. При световой и электронной микроскопии гистологические результаты были очень похожи на те, которые были получены для естественно мумифицированных образцов в других странах. Анализ древней ДНК показал, что гаплотипы мтДНК мумий из Зелёного Яра принадлежат к пяти различным гаплогруппам, а именно: U5a (# 34), H3ao (# 53), D (# 67–1), U4b1b1 (# 67–2) и D4j8 (# 68), которые отличают их уникальной комбинацией гаплогрупп мтДНК, специфичных для Западной и Восточной Сибири. Наше междисциплинарное исследование получило фундаментальную информацию, которая послужит основой для будущих успешных исследований средневековых мумий, обнаруженных в Западно-Сибирской Арктике.


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100