АвторТема: YP335  (Прочитано 12393 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP335
« Ответ #15 : 10 Июль 2014, 15:37:34 »
Возможный новый снип:  22934285 С -> T.  Есть у 260248 и 260036. В пересечениях с 255244 его не видно.
Хорошо бы на уровне снипов отделить "поволжскую" подветь - на дереве они обычно далеко от других.
YP591 - выделяет новую подветвь в R-YP355.
Положительный для 260036 и 260248
Отрицательный для 255244
На дерево будет внесен в ближайшие несколько дней.

Оффлайн Таракан

  • "На стяге твоем такой же кот, лишь только цвет другой" (с)
  • Сообщений: 1968
  • Страна: ru
  • Рейтинг +202/-0
    • Татарский ДНК-проект "Идель"
  • Y-ДНК: R1a-YP5233
  • мтДНК: U4 (Ulrike)
Re: YP335
« Ответ #16 : 10 Июль 2014, 15:52:42 »
YP591 - выделяет новую подветвь в R-YP355.
Положительный для 260036 и 260248
Отрицательный для 255244
На дерево будет внесен в ближайшие несколько дней.

Т.е. ветвь на которой Боднар и Сушков объединяется с 260248 (а может и еще с кем-то)? Есть ли уже возможность прикинуть возраст, когда разошлись новоиспеченные R-YP591 c ветвью на которой находится Амиров (YP335-B3A)?

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 587
  • Страна: ru
  • Рейтинг +129/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
Re: YP335
« Ответ #17 : 10 Июль 2014, 19:11:57 »
Возможный новый снип:  22934285 С -> T.  Есть у 260248 и 260036. В пересечениях с 255244 его не видно.
Хорошо бы на уровне снипов отделить "поволжскую" подветь - на дереве они обычно далеко от других.
YP591 - выделяет новую подветвь в R-YP355.
Положительный для 260036 и 260248
Отрицательный для 255244
На дерево будет внесен в ближайшие несколько дней.

Интересно, почему у меня проект даже не предполагает этого снипа? Остальным предлагает тестирование, а мне - нет.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP335
« Ответ #18 : 10 Июль 2014, 20:22:20 »
YP591 - выделяет новую подветвь в R-YP355.
Положительный для 260036 и 260248
Отрицательный для 255244
На дерево будет внесен в ближайшие несколько дней.

Т.е. ветвь на которой Боднар и Сушков объединяется с 260248 (а может и еще с кем-то)? Есть ли уже возможность прикинуть возраст, когда разошлись новоиспеченные R-YP591 c ветвью на которой находится Амиров (YP335-B3A)?
Данных мало. Считая методом выборочных пар, получаем дату ВБОП ветви Амирова и Боднаря ~2350 лет назад

Для субклада YP591 ВБОП ~1560 лет назад.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP335
« Ответ #19 : 10 Июль 2014, 20:24:23 »
Возможный новый снип:  22934285 С -> T.  Есть у 260248 и 260036. В пересечениях с 255244 его не видно.
Хорошо бы на уровне снипов отделить "поволжскую" подветь - на дереве они обычно далеко от других.
YP591 - выделяет новую подветвь в R-YP355.
Положительный для 260036 и 260248
Отрицательный для 255244
На дерево будет внесен в ближайшие несколько дней.

Интересно, почему у меня проект даже не предполагает этого снипа? Остальным предлагает тестирование, а мне - нет.
Вы далеко отстоите от других представителей ветви, поэтому админы предполагают у вас YP591 отрицательным.

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 587
  • Страна: ru
  • Рейтинг +129/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
Re: YP335
« Ответ #20 : 10 Июль 2014, 21:52:00 »
Вы далеко отстоите от других представителей ветви, поэтому админы предполагают у вас YP591 отрицательным.

Спасибо за пояснения. Не могли бы Вы еще пояснить, почему 255830 в  дереве R1a Z-280   https://drive.google.com/file/d/0B-b3KeGG3Un1SXg5VFlLeDJhbnM/edit?usp=sharing помещен ко мне ближе Паевского 196421? Потому что, судя по дереву сравнения http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/tools/build-tree-and-asd-pairs/ у меня с Паевским гаплотипы намного ближе?

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 383
  • Страна: ru
  • Рейтинг +153/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Re: YP335
« Ответ #21 : 11 Июль 2014, 04:10:30 »
Заранее наверно трудно сказать, кто будет YP591+, а кто  YP591-. Хорошо бы всем протестироваться (кроме "поволжской" ветви), так как в данном случае отрицательный результат - это тоже очень важный результат. Пока не будет  YP591-, мы не узнаем где проходят границы снипа. А "поволжской" ветви надо свои снипы искать. Еще один Big Y делать или "приватные" снипы проверять.

Оффлайн Finder

  • Сообщений: 68
  • Страна: ru
  • Рейтинг +28/-7
  • Y-ДНК: R1a-YP335 мтДНК: T2b
Re: YP335
« Ответ #22 : 29 Июль 2014, 18:16:11 »
Tryastsin 323094 YP335+
« Последнее редактирование: 31 Июль 2014, 20:48:19 от Finder »

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 9159
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
Re: YP335
« Ответ #23 : 10 Сентябрь 2014, 10:24:05 »
Новый гаплотип или маркеры; YP335-; 111 маркеров; R-CTS3402; R1a1a; Sulek from Bidziny, 1344; Poland; N8884; Z280+, CTS3402+, YP335-, L366- (на расстоянии 11 от R-M512; R1a1a; Malyi; Poland; 311318)

Оффлайн LeslaАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8484
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1939/-8
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Re: YP335
« Ответ #24 : 10 Сентябрь 2014, 10:54:28 »
Новый гаплотип или маркеры; YP335-; 111 маркеров; R-CTS3402; R1a1a; Sulek from Bidziny, 1344; Poland; N8884; Z280+, CTS3402+, YP335-, L366- (на расстоянии 11 от R-M512; R1a1a; Malyi; Poland; 311318)
А вот это интересно. Гаплотип предсказан как относящийся к ветке "CTS3402_A", имеющий свой снип YP335.
Или гомоплазия, или снип не покрывает всю ветку. Я склоняюсь к первому, т.к. уж больно далек Sulek от представителей YP335. Да и его приближенец Malyi также скорее всего к ветки не относится.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5006
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2213/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP335
« Ответ #25 : 18 Сентябрь 2014, 09:04:16 »
#207573 / Kraft / "CTS3402_A" YP295+ YP335+

Оффлайн Таракан

  • "На стяге твоем такой же кот, лишь только цвет другой" (с)
  • Сообщений: 1968
  • Страна: ru
  • Рейтинг +202/-0
    • Татарский ДНК-проект "Идель"
  • Y-ДНК: R1a-YP5233
  • мтДНК: U4 (Ulrike)
Re: YP335
« Ответ #26 : 19 Сентябрь 2014, 20:26:45 »
О времени образования и расхождения YP335* с двумя YP591 ремарочка. Считать все эти скорости мутаций и время расхождений не умею - просто информация к размышлению. Для обозначенных людей мы имеем 408 общих (есть у всех троих, маркеры, которые у кого-то отсутствуют отсеивались). На 408 маркерах YP335* имеет расхождение в 80 из них с каждым из YP591 (разумеется частично на одних и тех же, а частично на отличающихся маркерах). Т.е. чуть не дотягивает до четверти в различиях... Сравнение представителей YP591 между собой показало 72 отличия. Не берусь делать какие-то выводы, но поставлю вопрос так - можно ли предположить, что линия YP335* с YP591 разошлась довольно-таки через непродолжительно время?

ЗЫ. Понимаю, что наверняка надо смотреть на то какие маркеры и т.д.

Оффлайн vhb

  • Сообщений: 117
  • Страна: ua
  • Рейтинг +51/-0
  • Amor patriae nostra lex
  • Y-ДНК: R1a1a [R-YP591]
  • мтДНК: HV1a2
Re: YP335
« Ответ #27 : 19 Сентябрь 2014, 21:53:25 »
В моих результатах (#260036) по Big Y в разделе Matching указано, что у меня с моим совпаденцем по ветке YP591 (Davydov, #260248) есть отличие в два снипа - PF5508 и PF6069. Такие же отличия (либо по первому снипу, либо по второму, либо по обоим) есть и с рядом других лиц.

Я проверил оба снипа разделе Known SNPs - оба снипа представлены FTDNA как отрицательные для меня, но с данными, которые противоречат этому - PF5508 (A>T High confidence) и  PF6069 (G>C, Medium Confidence). По идее, если у меня с 260248 общий YP591 и отличие в PF5508 и PF6069,  эти снипы должны обозначить дополнительную ветку под YP591. В результатах от YFull это не отображено.

К сожалению, у меня нет доступа к данным Big Y других из моего списка Matching, чтоб проверить значение указанных снипов у них. Может кто-то посмотреть у Davydov, #260248 (PF5508 и PF6069), Slyadnev, #297613 (PF5508 и PF6069), Tereshko (#?) (PF5508), Kaubrys (#?) (PF5508)?

Онлайн Виталий77

  • Однодворец ищущий свои корни
  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +298/-0
  • FTDNA: 297613; ySearch: ZH52M
  • Y-ДНК: R1a-A7015, R1a1a1b1a2b3a1c2c2a1~(ISOGG)
  • мтДНК: H13a1a1c
Re: YP335
« Ответ #28 : 19 Сентябрь 2014, 23:28:41 »
В моих результатах (#260036) по Big Y в разделе Matching указано, что у меня с моим совпаденцем по ветке YP591 (Davydov, #260248) есть отличие в два снипа - PF5508 и PF6069. Такие же отличия (либо по первому снипу, либо по второму, либо по обоим) есть и с рядом других лиц.

Я проверил оба снипа разделе Known SNPs - оба снипа представлены FTDNA как отрицательные для меня, но с данными, которые противоречат этому - PF5508 (A>T High confidence) и  PF6069 (G>C, Medium Confidence). По идее, если у меня с 260248 общий YP591 и отличие в PF5508 и PF6069,  эти снипы должны обозначить дополнительную ветку под YP591. В результатах от YFull это не отображено.

К сожалению, у меня нет доступа к данным Big Y других из моего списка Matching, чтоб проверить значение указанных снипов у них. Может кто-то посмотреть у Davydov, #260248 (PF5508 и PF6069), Slyadnev, #297613 (PF5508 и PF6069), Tereshko (#?) (PF5508), Kaubrys (#?) (PF5508)?
Если надо, Пожалуйста! Но я ведь к другой ветви отношусь, R-YP578!!!
Slyadnev, #297613 Данные Y-Ful:

ChrY position:   22239128 (+strand)   
Reads:   94   
Position data:   23C 71G    
Weight for C:   0.251514277473   
Weight for G:   0.748485722527   
Probability of error:   0.351411878853 (0<->1)   
Sample allele:   S (C or G)    
Reference (hg19) allele:   G   
Known SNPs at this position:   PF6069 (C->G)

ChrY position:   22301220 (+strand)   
Reads:   58   
Position data:   42A 16T    
Weight for A:   0.717391304348   
Weight for T:   0.282608695652   
Probability of error:   0.307437730951 (0<->1)   
Sample allele:   W (A or T)    
Reference (hg19) allele:   A   
Known SNPs at this position:   PF5508 (T->A)

Оба этих снипа в разделе: Ambiguous (226)

Онлайн Виталий77

  • Однодворец ищущий свои корни
  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +298/-0
  • FTDNA: 297613; ySearch: ZH52M
  • Y-ДНК: R1a-A7015, R1a1a1b1a2b3a1c2c2a1~(ISOGG)
  • мтДНК: H13a1a1c
Re: YP335
« Ответ #29 : 19 Сентябрь 2014, 23:38:43 »
FTDNA:
SNP Name    Derived?    On Y-Tree?    Reference    Genotype    Confidence
PF6069           Yes(+)   No                   G            G           High

SNP Name    Derived?    On Y-Tree?    Reference    Genotype    Confidence
PF5508           Yes(+)   No                   A            A           High

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100