АвторТема: NGS в R1a-Z280  (Прочитано 59107 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #45 : 19 Март 2014, 11:50:16 »
По L784,получаются, чтобы определить место на Древе надо сначало проверять CTS3607/S3363, Y2205 (или CTS3607/S3363 известны?), потом Y3S, Y32, Y2192-94 , Y2364 ?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #46 : 19 Март 2014, 11:57:07 »
По L784,получаются, чтобы определить место на Древе надо сначало проверять CTS3607/S3363, Y2205 (или CTS3607/S3363 известны?), потом Y3S, Y32, Y2192-94 , Y2364 ?
Да, но следует учитывать что картина очень быстро меняется и возможно скоро появится структура снипов для всех CTS1211+ CTS3402-,так как на подходе еще много новых данных. Количество снипов будет постоянно увеличиваться и я не знаю, насколько целесообразно будет их все по одному проверять. Даже у Т. Крана цена одного снипа 35$. Также следует учитывать, что заказывая по одному известные снипы, Вы только определитесь со свим положением относительно известных линий, но ничего нового не найдете.

Оффлайн Таракан

  • "На стяге твоем такой же кот, лишь только цвет другой" (с)
  • Сообщений: 2145
  • Страна: ru
  • Рейтинг +265/-0
    • Татарский ДНК-проект "Идель"
  • Y-ДНК: R1a-YP5233
  • мтДНК: U4 (Ulrike)
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #47 : 19 Март 2014, 12:14:20 »
Да, но следует учитывать что картина очень быстро меняется и возможно скоро появится структура снипов для всех CTS1211+ CTS3402-,так как на подходе еще много новых данных. Количество снипов будет постоянно увеличиваться и я не знаю, насколько целесообразно будет их все по одному проверять. Даже у Т. Крана цена одного снипа 35$. Также следует учитывать, что заказывая по одному известные снипы, Вы только определитесь со свим положением относительно известных линий, но ничего нового не найдете.

Т.е., грубо говоря, сейчас целесообразен Биг-Y, чем заказ снипов (по времени тестирования все одно - одинаково)?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #48 : 19 Март 2014, 12:48:04 »
Да, но следует учитывать что картина очень быстро меняется и возможно скоро появится структура снипов для всех CTS1211+ CTS3402-,так как на подходе еще много новых данных. Количество снипов будет постоянно увеличиваться и я не знаю, насколько целесообразно будет их все по одному проверять. Даже у Т. Крана цена одного снипа 35$. Также следует учитывать, что заказывая по одному известные снипы, Вы только определитесь со свим положением относительно известных линий, но ничего нового не найдете.

Т.е., грубо говоря, сейчас целесообразен Биг-Y, чем заказ снипов (по времени тестирования все одно - одинаково)?
Смотря в каком случае. Для определения места ветви относительно других ветвей, достаточно одного протестированного из этой ветви.
Для выявления снипов, характеризующих ветвь, необходимо два образца из этой ветви, причем желательно отстоящих друг от друга как можно дальше.
Если структура снипов ветви уже хорошо известна, то можно обойтись и заказом отдельных снипов, если известны снипы близкого совпаденца, но вы не найдете новых снипов, которые будут вас объединять с этим вашим совпаденцем. Так что все индивидуально, но сейчас, когда структура ветвей только выявляется, оптимальным конечно будет протестироваться с помощью любого доступного поставщика услуг NGS, исходя из бюджета и своих потребностей.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #49 : 19 Март 2014, 14:26:58 »
#188911 / Ermis / R1a-Neuri Z92+ Z660+ Z661+ Z686+ Y1401+
CTS214- CTS5149- CTS4648-
Z2466? Z2468? Y1400?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8443
  • Страна: ar
  • Рейтинг +957/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #50 : 19 Март 2014, 18:09:36 »
Да, но следует учитывать что картина очень быстро меняется и возможно скоро появится структура снипов для всех CTS1211+ CTS3402-,так как на подходе еще много новых данных. Количество снипов будет постоянно увеличиваться и я не знаю, насколько целесообразно будет их все по одному проверять. Даже у Т. Крана цена одного снипа 35$. Также следует учитывать, что заказывая по одному известные снипы, Вы только определитесь со свим положением относительно известных линий, но ничего нового не найдете.

Т.е., грубо говоря, сейчас целесообразен Биг-Y, чем заказ снипов (по времени тестирования все одно - одинаково)?
Да, в данный момент это самый быстрый и полный вариант.
Еще следует учесть, что вновь найденные снипы FTDNA не спешит запускать, и может затягивать из запуск, рассчитывая на заказы BigY.


Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9632
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2927/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #51 : 19 Март 2014, 18:30:34 »
#188911 / Ermis / R1a-Neuri Z92+ Z660+ Z661+ Z686+ Y1401+
CTS214- CTS5149- CTS4648-
Z2466? Z2468? Y1400?
Отлично! Спасибо!
Похоже Y1401+ маркирует какую-то часть парагруппы "нёвры".

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #52 : 19 Март 2014, 19:13:42 »
Уверен что сегодня будут выявлены снипы, объединяющие "западных" с "восточными".
Не выйдет  ;D
Это знак  ;D
Никто из них не оказался "вятичами". Пора переименовывать по снипам, как с L1280 сделали. Быстрее вырвемся из плена обманчивой схожести веток.
А может и выйдет.  ;D
Уважаемый Łukasz Lubicz Łapiński заметил мою ошибку и обратил на нее внимание.
#192605 / Gemega / R1a-Vjatichi-West Y1392-.

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 602
  • Страна: ru
  • Рейтинг +132/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #53 : 26 Март 2014, 21:29:52 »
Уважаемый Семаргл, с учетом новых данных, имеет ли мне смысл протестировать какие либо нисходящие от CTS3402 снипы?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #54 : 27 Март 2014, 08:59:49 »
Уважаемый Семаргл, с учетом новых данных, имеет ли мне смысл протестировать какие либо нисходящие от CTS3402 снипы?
Советую пока пару недельку подождать. Посмотреть как будет развиваться ситуация. На подходе еще несколько результатов BigY.
На основании полученных результатов мы попросим Томаса Крана включить необходимые SNP в лист заказа.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #55 : 29 Март 2014, 09:27:09 »
#297289 / Protasievich / "Volga-Carpathian" Y2903+ Y2904+
Отрицательные значения узнать можно будет только после получения VCF.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #56 : 29 Март 2014, 10:23:31 »
Определена позиция L366 на новом дереве.
Как и предполагалось ранее, он братский к L365.

#253337 / Mansfield / "Prussian L366+"
YP237+ YP234+ YP235+ YP236+
Снипы YP238, YP239, YP240, YP241, YP242, YP243, YP244, YP245, YP246, YP247 похоже в минусе, но окончательное заключение будет сделано после получения VCF.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #57 : 29 Март 2014, 10:37:06 »
Определена позиция L366 на новом дереве.
Как и предполагалось ранее, он братский к L365.

#253337 / Mansfield / "Prussian L366+"
YP237+ YP234+ YP235+ YP236+
Снипы YP238, YP239, YP240, YP241, YP242, YP243, YP244, YP245, YP246, YP247 похоже в минусе, но окончательное заключение будет сделано после получения VCF.
ура!

Оффлайн RomanS

  • Сообщений: 2377
  • Страна: cx
  • Рейтинг +530/-0
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #58 : 30 Март 2014, 13:25:48 »
#297289 / Protasievich / "Volga-Carpathian" Y2903+ Y2904+
Отрицательные значения узнать можно будет только после получения VCF.

Владимир, здравствуйте!

Из-за загруженности и проблем с доступом к интернету здесь, я как-то немного упустил нить развития событий. В связи с этим, такие вопросы:

1. Уже есть данные Биг Игрека ещё кого-то из "волго-карпатичей", кроме Протасьевича?

2. вот эти два новых положительных снипа, это приватные снипы или маркируют ветку "волго-карпатичей"?

С уважением,

РоманС

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: NGS в R1a-Z280
« Ответ #59 : 30 Март 2014, 14:29:58 »
#297289 / Protasievich / "Volga-Carpathian" Y2903+ Y2904+
Отрицательные значения узнать можно будет только после получения VCF.
Окончательный вывод по данным из VCF.
Y2902+ Y2903+ Y2904+ Y2910+ Y2915+

снипы Y2898, Y2899, Y2900, Y2906, Y2608, Y2916 не охвачены в BigY, но они должны быть положительными, так как расположены выше снипов Y2910, Y2915.
Итак, восточных волгокарпатичей или южнорусскую ветвь маркируют снипы Y2910, Y2915.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.