Да, среди J2 14-17 больше всего (с учетом содержании J2 во всей моей базе).
Еще повышенный процент 14-17 в J1, Q, T

Столкнулся со следующими любопытными случаями, связанными с локусом DYS385:
1 случай. Имеется 111 гаплотипов якутов N1c1. Из них 103 гаплотипа с DYS385=11,13.
Еще 7 гаплотипов имеют отклонения от модального (предкового) значения на один повтор. И есть один гаплотип с DYS385=13,19 !

Мы имеем дело с единственным приходом семьи основателей народа якутов.
Может быть, было повторное проникновение носителей N1c1 из того же региона, откуда вышел основной род?

Столкнулся со следующими любопытными случаями, связанными с локусом DYS385:
1 случай. Имеется 111 гаплотипов якутов N1c1. Из них 103 гаплотипа с DYS385=11,13.
Еще 7 гаплотипов имеют отклонения от модального (предкового) значения на один повтор. И есть один гаплотип с DYS385=13,19 !
2 случай. Выборка из 14 гаплотипов, несомненно относящихся к одному и тому же субкладу С3с. Модальное значение по маркеру DYS385=11,12. И опять: вижу гаплотип с DYS385=12,19. По остальным 15 (!) маркерам полное совпадение с модальным гаплотипом.
Что скажете, уважаемые форумчане?

RecLOH

Цитата: Centurion от 03 Января 2010, 12:15:34

RecLOH

Уважаемый Centurion, а каким образом recLOH происходит в DYS385?
Может быть 11 -> 19, 13 -> 13 ?
Для примера с С3с: 11 -> 19, 12 -> 12 ?
Каков механизм?

Recombination on the Y chromosome does not only take place during meiosis, but virtually at every mitosis when the Y chromosome condenses, because it doesn't require pairing between chromosomes. Recombination frequency even exceeds the frame shift mutation frequency (slipped strand mispairing) of (average fast) Y-STRs, however many recombination products may lead to infertile germ cells and "daughter out".

Палиндромами в ДНК называются последовательности, которые одинаковы в обеих цепях. В Y-хромосоме они могут достигать гигантской длины в три миллиона оснований, или «букв» ген-кода.

Никто не мог понять природы палиндромов, поэтому Пэйдж предположил, что они служат своего рода буфером, защищающим распределенные в них гены от нежелательных мутаций. Другая возможная функция палиндромов – направление, «адресация» систем ДНК к месту возникшей мутации для ее исправления.

Вполне возможно, что все это так и есть на самом деле. Однако у своих пациентов Пэйдж обнаружил, что палиндромы являются, как он образно назвал, ахиллесовой пятой Y-хромосомы. Дело в том, что именно палиндромы в ходе удвоения хромосомы при подготовке к делению могут приводить к образованию «дицентрических» Y, то есть вариантов с двумя центромерами.

Спасибо.