АвторТема: Некоторые вопросы о полном геноме  (Прочитано 1659 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Некоторые вопросы о полном геноме
« : 16 Февраль 2014, 10:17:35 »
Прошу мэтров прокомментировать эти, казалось бы, очевидные вопросы

1) По идее, извлечь полный геном (ПГ) можно из любой соматической клетки. Поскольку пересылка слюны (зубов, костей и т. п.) по почте намного проще, чем крови, то лучше всего годится слюна. Однако некоторые лаборатории для полногеномного секвенса настаивают на использовании крови. В чём причина предпочтения?

2) Возможно ли из данных ПГ получить фактический биологический возраст организма на момент взятия пробы или на момент смерти (если речь об умершем человека)?

3) Проводилась ли антропологическая реконструкция внешнего облика человека на основе данных его ПГ?

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Некоторые вопросы о полном геноме
« Ответ #1 : 20 Февраль 2014, 12:17:10 »
Ответы на вышеозвученные вопросы:
Цитировать
1) По идее, извлечь полный геном (ПГ) можно из любой соматической клетки. Поскольку пересылка слюны (зубов, костей и т. п.) по почте намного проще, чем крови, то лучше всего годится слюна. Однако некоторые лаборатории для полногеномного секвенса настаивают на использовании крови. В чём причина предпочтения?
При выделении ДНК из слюны в секвенирование попадает некоторый объём метагенома (бактерий/симбионтов/паразитов) и ферментов, что некоторым образом усложнит работу с полученными последовательностями. В крови подобных примесей значительно меньше.

Цитировать
2) Возможно ли из данных ПГ получить фактический биологический возраст организма на момент взятия пробы или на момент смерти (если речь об умершем человека)?
Сам код ДНК с возрастом не меняется, но определённые изменения в ДНК происходят (меняется метилирование, накапливаются повреждения). Методы оценки возраста по биологическим образцам существуют, однако они недостаточно точные. Геномные маркёры старения есть, но многие из них теряют актуальность при долгом хранении и выделении ДНК. Также маркёры старения показывают биологический возраст конкретных клеток, а в любом сложном организме клетки разновозрастные. Для оценки биологического возраста всего человека нужно ориентироваться на долгоживущие стволовые или постмитотические клетки. Однако биологический возраст необязательно совпадает с хронологическим (пил, курил...). Чаще биологический возраст клеток оценивают по негенетическим маркерам - оксидативно-модифицированные белки и липиды, сникшие митохондрии и прочее. Но тут те же проблемы + сохранить такие маркеры ещё сложнее.

Цитировать
3) Проводилась ли антропологическая реконструкция внешнего облика человека на основе данных его ПГ?
Можно определить расу и пигментацию, найти ближайших родственников и посмотреть на них.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.