Вчера появились ссылки на новое исследование Hellenthal et al, например, от нашей замечательной
пенелопы:
Время и место миграций человека уточнили с помощью генов
Анализ геномов человеческих популяций позволил установить, с кем и когда они контактировали в недавнем прошлом.
Выйдя из Африки и расселившись, наш брат вовсе не остался сидеть на захваченных местах, а продолжал блуждать по земле. Эти блуждания происходили и после формирования цивилизаций, да и продолжаются до сих пор: каждый может вспомнить про миграции варварских племён в древнеримские времена, что же до сего дня, то тут достаточно просто выйти на улицу, чтобы убедиться, что народы по-прежнему в движении и перемешиваются. Такие блуждания иногда происходят мирно, иногда — совсем не мирно, но, так или иначе, это отражается в генетической истории популяции.
Можно ли сейчас, проанализировав геном людей из разных уголков земного шара, восстановить историю миграций?
Это сложно, но вполне возможно, как показали Гаррет Гелленталь (Garrett Hellenthal) из Университетского колледжа Лондона (Великобритания) и его коллеги из Оксфорда и Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка (Германия). Учёные проанализировали ДНК почти полутора тысяч человек из 95 популяций по всему миру. Итогом работы стала интерактивная популяционно-генетическая карта человечества; кроме того, результаты исследований опубликованы в журнале Science.
Полученные генетические данные во многих случаях подтверждают исторические: так, например, в ДНК хазарейцев нашли монгольский след, который появился в их геноме во времена Монгольской империи, что вполне согласуется с историческими источниками. Такие же монгольские следы удалось найти ещё в нескольких популяциях вплоть до Турции, в которых они появились примерно в то же время, что и у хазарейцев.
С другой стороны, удалось обнаружить такие генетические примеси, которые до сих пор от внимания исследователей ускользали: например, у людей ту в современном Китае нашли следы европейской ДНК, похожей на ту, что есть у современных греков. Появилась эта европейская примесь около 1 200 года н. э., и связана она, очевидно, с купцами, ходившими в то время Великим шёлковым путём. Надо ли говорить, что нынешние (гео)политические границы слабо отражают миграционно-генетическую картину? Так, на территории Пакистана в некоторых группах обнаруживается влияние древней Европы, в других есть следы африканских арабов, живших южнее Сахары, к третьим в геном затесалась ДНК из Восточной Азии.
http://compulenta.computerra.ru/chelovek/biologiya/10011487/
http://www.sciencemag.org/content/343/6172/747.abstract
Интерактивная популяционно-генетическая карта: http://admixturemap.paintmychromosomes.com/
Карта довольно любопытна. Само исследование я не читал (по причине платности доступа к нему), однако в FAQ, прилагаемом к карте, изложена основная суть метода. Он достаточно сложен - сначала каждый геном (всего использовано 1530 геномов) разбивается на мелкие участки, далее по каждому участку находятся наиболее типичные варианты для макрорегионов - Африка, Америка, Центральная и Южная Азия, Восточная Азия, Европа, Ближний Восток, Океания. Теперь мы имеем что-то наподобие результатов этнокалькулятора в режиме Chromosome painting - каждая хромосома каждого участника раскрашена в радужный цвет. В примере из FAQ у представителя нигерийского народа йоруба получилось ~80% Африки, остальное разделили между собой Ближний Восток, Европа, в меньшей степени Центральная-Южная и Восточная Азия.
Сравнивая между собой эти раскраски, можно моделировать смешение представителей разных популяций, и находить наиболее вероятные варианты - смешивание каких групп могло породить интересующую нас популяцию? Расстояния в сМ между полученными из одного источника участками известны, известны длины этих участков и их количество. Таким образом, можно оценить время их получения. На графиках в правом нижнем углу карты показаны эти соотношения, однако математическая модель не расписывается. Дана такая подробность - если график имеет форму убывающей гиперболы, значит, указанные в заголовке популяции связаны с одним и тем же источником адмикса. Если же наоборот, прибывает - эти две популяции представляют разные источники.
Сразу виден один из недостатков метода - в качестве источников примеси рассматриваются лишь современные популяции, хотя со времен смешения они могли сильно измениться. Непонятно, как вычисляется направление потока генов? Если у северных русских показана польская примесь, а у поляков примесь от северных русских, видимо, это говорит, что они получили общие сегменты из одного источника, которым были праславяне?
Ехидный Поляко уже нашел на карте у литовцев заметную примесь от восточноафриканского народа Hadza. Однако она показывается лишь в одном из вариантов расчета, есть и вполне адекватные - литовцы, как смесь поляков и белорусов. Не понимая сути расчетов, мне сложно интерпретировать этот результат
В любом случае я за применение новых методов, так как, по ощущениям, из традиционных этнокалькуляторов на основе Admixture чего-то нового уже не выжать. Плохо, что на карте практически не представлены народы России, хотя результаты северных русских, чувашей и народов Кавказа смотрятся любопытно.
Тема: Интерактивная этнокарта от Hellenthal et al (Прочитано 7318 раз)