АвторТема: Y33 и его снипы  (Прочитано 15595 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн LeslaАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 8796
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2123/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK01/VK03+)
Y33 и его снипы
« : 23 Декабрь 2013, 09:45:45 »
Благодаря, в том числе, новым результатам уважаемого forbid уточняется схема снипов субклада CTS3402


Образовалась крупная подгруппа Y33+, Y36+, Y2191+. Думаю в дальнейшем схема будет еще больше структурироваться и будут выяснены позиции уже известных снипов под CTS3402.

Мои благодарности Semargl и команде YFULL за информацию!
http://forum.molgen.org/index.php/topic,5752.msg215683.html#msg215683

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2614/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #1 : 23 Декабрь 2013, 13:20:55 »
Сделал заказ в лаборатории Томаса Крана на включение 30 снипов из этой схемы в список доступных для заказа.
В список заказанных вошли следующие снипы:
Y35, Y32, Y2192, Y2193, Y2194, Y2364, Y36, Y2191, CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395, Y2607, Y2608, Y2609, Y2610, Y2611, Y2612, Y2613, Y2614, Y2615, Y2616, Y2617, Y2618

По приведенной выше схеме можно увидеть, что под CTS3402 выделились две крупные подветви. Одна, назовем ее условно R-Y33, маркируется тремя снипами: Y33, Y36, Y2191 и вторая ветвь, назовем ее R-Y2607, маркируется снипами: Y2607, Y2608, Y2609, Y2610, Y2611, Y2612, Y2613, Y2614, Y2615, Y2616, Y2617, Y2618.
Также под R-Y33 выделена еще одна подветвь, назовем ее пока R-Y1387 и для нее характерны следующие снипы: CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395.
Более подробная иерархия этих снипов пока не определена. Все эти снипы не являются приватными и некоторые из них характеризуют достаточно большие ветви (или даже группы ветвей), как Y33.
Отношение наших кластеров к этим снипам (или наоборот :) ) еще неясно.
В субклад R-Y2607 вошли два образца - один из США и один из Украины, но нет их СТР маркеров.
В субклад R-Y33 вошли #152839 и #123791 и несколько других образцов из Европы.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #2 : 23 Декабрь 2013, 13:30:32 »
Цитировать
Сделал заказ в лаборатории Томаса Крана на включение 30 снипов из этой схемы в список доступных для заказа.
бесплатно? или платил?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2614/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #3 : 23 Декабрь 2013, 13:33:25 »
Цитировать
Сделал заказ в лаборатории Томаса Крана на включение 30 снипов из этой схемы в список доступных для заказа.
бесплатно? или платил?
платил

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #4 : 23 Декабрь 2013, 13:42:28 »
платил
ну ты прямо филантроп  :)

Оффлайн VVizard741

  • 600 years on the river Northern Dvina
  • Сообщений: 1124
  • Страна: ru
  • Рейтинг +250/-0
  • Vilegodskaya Permtsa - SolVychegodsk
    • Православные приходы и монастыри Севера
  • Y-ДНК: R1a-YP951-FGC39315 6. Vorontsov clan
  • мтДНК: H3*, мж: T1a*; ммж: U5b2a1a2
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #5 : 24 Декабрь 2013, 06:12:58 »
Сделал заказ в лаборатории Томаса Крана на включение 30 снипов из этой схемы в список доступных для заказа.
В список заказанных вошли следующие снипы:
По приведенной выше схеме можно увидеть, что под CTS3402 выделились две крупные подветви. Одна, назовем ее условно R-Y33, маркируется тремя снипами: Y33, Y36, Y2191
...
Также под R-Y33 выделена еще одна подветвь, назовем ее пока R-Y1387 и для нее характерны следующие снипы: CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395.
...
В субклад R-Y33 вошли #152839 и #123791 и несколько других образцов из Европы.
Спасибо! Как только решится вопрос с окончательной передачей материала моего 277296 Крану, обязательно буду заказывать Y36, Y2191 и далее по списку CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395. По мере включения Краном в возможность заказа. Однако, последний ответ FTDNA:
Цитировать
I will check with shipping and the lab for a final total.  In looking at the account I didn't see an unopened vial listed, but I will see what the lab says and I will let you know.
-Darren Marin
был 15 декабря. Празднуют  :)

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1502
  • Страна: ru
  • Рейтинг +723/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1a или U8a1a1b
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #6 : 24 Декабрь 2013, 10:56:46 »
Извините, а можно спросить, а то я немного не в теме :( где на схеме L1280 ? :-[
А понял, еще не показаны...

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2614/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #7 : 24 Декабрь 2013, 11:01:58 »
Извините, а можно спросить, а то я немного не в теме :( где на схеме L1280 ? :-[
Еще ни один L1280 не проверил ни один из этих снипов :)
Поэтому положение L1280 относительно новых снипов неизвестно.

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1423
  • Страна: ru
  • Рейтинг +198/-6
  • Y-ДНК: N-Y4339>Y5611>F1983; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #8 : 24 Декабрь 2013, 11:34:16 »
Спасибо! Как только решится вопрос с окончательной передачей материала моего 277296 Крану, обязательно буду заказывать Y36, Y2191 и далее по списку CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395.
Может, вам стоит подождать следующей скидки на BigY?  По цене выйдет примерно так же как заказ 12-ти отдельных снипов, но плюс еще будете знать свои приватные снипы.

Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248+ Y20842+ (South Scandinavia, Germanic tribes AD) RU-SE
  • Сообщений: 5343
  • Страна: england
  • Рейтинг +1162/-1
  • Neolithic Era
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11555 (Eastern, BRY-TAM, RU), Prague-Korchak Culture / Western Ukraine (?)
  • мтДНК: T1a-T152C! RU-UA-IRL (Anatolian neolithic farmers)
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #9 : 24 Декабрь 2013, 11:35:18 »
Извините, а можно спросить, а то я немного не в теме :( где на схеме L1280 ? :-[
Еще ни один L1280 не проверил ни один из этих снипов :)
Поэтому положение L1280 относительно новых снипов неизвестно.

Имеет смысл проверить? :)
А с какого из них лучше начать?

Оффлайн VVizard741

  • 600 years on the river Northern Dvina
  • Сообщений: 1124
  • Страна: ru
  • Рейтинг +250/-0
  • Vilegodskaya Permtsa - SolVychegodsk
    • Православные приходы и монастыри Севера
  • Y-ДНК: R1a-YP951-FGC39315 6. Vorontsov clan
  • мтДНК: H3*, мж: T1a*; ммж: U5b2a1a2
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #10 : 24 Декабрь 2013, 11:42:59 »
Спасибо! Как только решится вопрос с окончательной передачей материала моего 277296 Крану, обязательно буду заказывать Y36, Y2191 и далее по списку CTS8816, Y1387, Y1388, Y1389, Y1390, Y1391, Y1392, Y1393, Y1394, Y1395.
Может, вам стоит подождать следующей скидки на BigY?  По цене выйдет примерно так же как заказ 12-ти отдельных снипов, но плюс еще будете знать свои приватные снипы.
Big Y я заказал для самого молодого из клана - 236530. А 277296 старше его на 80 лет и общий предок предполагается в 17 веке. Поэтому его хочу проверить у Крана.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2614/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #11 : 24 Декабрь 2013, 11:51:08 »
Имеет смысл проверить? :)
А с какого из них лучше начать?
В данный момент у Томаса Крана доступен для заказа только Y33.
Насколько я знаю, уважаемый VVizard741 уже заказал этот снип.

Заказ Big Y вместо одиночных снипов выгоднее, но здесь стоит понимать, что первые результаты по нему будут не ранее конца февраля и не факт, что Big Y будет включать регионы, где находятся эти снипы. Ну и сиквенирование по Сангеру (у Крана) и NGS немного разные вещи.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2614/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #12 : 27 Декабрь 2013, 08:58:41 »
Пришло уведомление от YSeq.
Цитировать
The primers for the following markers have been ordered today:

Y35 15694658 G A OK
Y32 7983562 T A OK
Y2192 6622559 G T OK
Y2193 13958937 T C OK
Y2194 15167077 T C OK

Y36 23133370 A G OK

CTS8816 18223485 A T OK
Y1387 21256038 C T OK
Y1389 2664249 C T OK
Y1390 17801963 C T OK
Y1391 21299861 A T OK
Y1392 18104226 T C OK
Y1393 18688732 T C OK
Y1394 21168643 T C OK
Y1395 14479605 G T OK

Y2607 7256304 C T OK
Y2608 15132283 T C OK
Y2609 15537641 C T OK
Y2610 16021485 C T OK
Y2612 16189885 G T OK
Y2613 16846638 A G OK
Y2614 17887992 C T OK
Y2615 21290952 A G OK
Y2616 22170668 A G OK
Y2618 28596863 G T OK



Your order has been updated to the following status.

New status: Processing
Итак, благодаря помощи уважаемого Томаса Крана, новые снипы для CTS3402 проверены и им созданы праймеры.
В самое ближайшее время они будут доступны для заказа.
Теперь осталось решить проблему с передачей образцов из FTDNA в лабораторию YSeq. Если Макс будет препятствовать передаче, то для заказа этих снипов нужно будет заново отослать свой образец. Особых проблем с пересылкой быть не должно.
Также, надеюсь в скором будущем, в лаборатории Крана будут доступны новые панели STR маркёров разработанные YFull.

Учитывая опыт Астрид и Томаса, и более дешевую цену на тесты, они должны стать серьезными конкурентами для FTDNA.

Оффлайн RGS

  • Сообщений: 326
  • Страна: ru
  • Рейтинг +23/-6
  • Y-ДНК: R1a [Z93+Z2124+YP349+YP1456+]
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #13 : 27 Декабрь 2013, 09:23:29 »
Деревья ветвей гаплогрупп разрастаются все больше, открывают больше и больше снипов, а цена на них не падает. 39 баксов слишком высокая цена за каждый снип. Да еще и результат делается долго. Уверен,что большая часть участников днк- проектов в лучшем случае ограничатся заказом снипов находящихся у основания ветвей, а остальные (по причине высокой цены за каждый снип) вряд ли станут массово востребованы.

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1137
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-4
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Y33 и его снипы
« Ответ #14 : 27 Декабрь 2013, 10:33:29 »
Цитировать
Также, надеюсь в скором будущем, в лаборатории Крана будут доступны новые панели STR маркёров разработанные YFull.
А новые панели по какой то методике разрабатываются?
Или будут включены все маркеры подряд, выявленные  YFull ?
Интересно насколько сильно изменятся трактовки результатов 67-111 маркеров, при добавлении  новых панелей.
« Последнее редактирование: 27 Декабрь 2013, 11:01:42 от Andymeon »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100