АвторТема: мтДНК: Гаплогруппа J  (Прочитано 86807 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн wozaixuexi

  • Сообщений: 56
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • Y-ДНК: C-Y15552
  • мтДНК: J1d1a1
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #405 : 11 Март 2017, 12:16:23 »
Получил результаты своего mtFullSequence теста.

Я - J1d1a. :)
Кит 573477

Остался нерешенным один вопрос, как можно загрузить свои результаты в базу Генбанк? https://www.ncbi.nlm.nih.gov/myncbi/
Хотелось бы принести максимальную пользу исследователям, чтобы вложенные в тестирование деньги не пропадали напрасно.

Мои предки по материснкой линии происходят из западного Казахстана. По результатам тестов оказалось, что в долгосрочной перспективе они, предположительно, берут истоки из аравийского полуострова. При этом, в совпаденцах оказались преимущественно арабы.
В целом, все совпаденцы установлены по HVR1 записям, однако, не оказалось ни одного по HVR2 и FMS, соответственно.

Соответствующие совпаденцы из базы FTDNA

Вкладка matches map

Вкладка ancestral origins

Вкладка haplogroup origins

Загрузил данные на Митосёрч: User ID UPVQT

В проект https://www.familytreedna.com/public/J-mtDNA/ вступил.

----------------------------------------------------------------------

1.
HVR1 DIFFERENCES FROM rCRS
16069T 16126C 16193T 16300G 16309G

HVR2 DIFFERENCES FROM rCRS
73G 152C 195C 263G 295T 309.1C 315.1C 462T 489C

CODING REGION DIFFERENCES FROM rCRS
593C 709A 750G 1007A 1438G 2706G 3010A 4216C 4769G 6366C 7028T 7119A 7789A 7963G 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13392C 13708A 14766T 15326G 15452A

2.
HVR1 DIFFERENCES FROM RSRS
C16069T T16126C A16129G T16187C C16189T C16193T T16223C G16230A T16278C A16300G A16309G C16311T C16519T

HVR2 DIFFERENCES FROM RSRS
C146T A247G C295T 309.1C 315.1C C462T T489C 522.1A 522.2C

CODING REGION DIFFERENCES FROM RSRS
T593C G709A A769G A825t G1007A A1018G A2758G C2885T G3010A T3594C G4104A T4216C T4312C G6366c G7119A G7146A T7256C A7521G G7789A A7963G T8468C T8655C G8701A C9540T T10664C A10688G C10810T C10873T C10915T A11251G A11914G A12612G T12705C G13105A G13276A T13392C T13506C T13650C G13708A C15452a

----------------------------------------------------------------------

На http://dna.jameslick.com получил такой результат:

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) J1d1a1

Defining Markers for haplogroup J1d1a1:
HVR2: 73G 152C 263G 295T 462T 489C
CR: 750G 1007A 1438G 2706G 3010A 4216C 4769G 7028T 7789A 7963G 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13392C 13708A 14766T 15326G 15452A
HVR1: 16069T 16126C 16193T 16300G 16309G

Marker path from rCRS to haplogroup J1d1a1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 4216C ⇨ R2'JT ⇨ 11251G 15452A 16126C ⇨ JT ⇨ 295T 489C 10398G 12612G 13708A 16069T ⇨ J ⇨ 462T 3010A ⇨ J1 ⇨ 16193T ⇨ J1(C16193T) ⇨ 152C 7789A 7963G ⇨ J1d ⇨ 16300G ⇨ J1d1 ⇨ 1007A 16309G ⇨ J1d1a ⇨ 13392C ⇨ J1d1a1 ⇨ 195C (309.1C) (315.1C) 593C 709A 6366C 7119A

Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(31): 73G 152C 263G 295T 462T 489C 750G 1007A 1438G 2706G 3010A 4216C 4769G 7028T 7789A 7963G 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13392C 13708A 14766T 15326G 15452A 16069T 16126C 16193T 16300G 16309G
Extras(5): 195C (309.1C) (315.1C) 593C 709A 6366C 7119A

2) J1d1a

Defining Markers for haplogroup J1d1a:
HVR2: 73G 152C 263G 295T 462T 489C
CR: 750G 1007A 1438G 2706G 3010A 4216C 4769G 7028T 7789A 7963G 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13708A 14766T 15326G 15452A
HVR1: 16069T 16126C 16193T 16300G 16309G

Marker path from rCRS to haplogroup J1d1a (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 4216C ⇨ R2'JT ⇨ 11251G 15452A 16126C ⇨ JT ⇨ 295T 489C 10398G 12612G 13708A 16069T ⇨ J ⇨ 462T 3010A ⇨ J1 ⇨ 16193T ⇨ J1(C16193T) ⇨ 152C 7789A 7963G ⇨ J1d ⇨ 16300G ⇨ J1d1 ⇨ 1007A 16309G ⇨ J1d1a ⇨ 195C (309.1C) (315.1C) 593C 709A 6366C 7119A 13392C

Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(30): 73G 152C 263G 295T 462T 489C 750G 1007A 1438G 2706G 3010A 4216C 4769G 7028T 7789A 7963G 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13708A 14766T 15326G 15452A 16069T 16126C 16193T 16300G 16309G
Extras(6): 195C (309.1C) (315.1C) 593C 709A 6366C 7119A 13392C

« Последнее редактирование: 12 Март 2017, 19:57:44 от wozaixuexi »

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1845/-12
  • мтДНК: H1b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #406 : 11 Март 2017, 13:49:15 »
Цитировать
как можно загрузить свои результаты в базу Генбанк?
http://forum.molgen.org/index.php/topic,1363.0.html

Онлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12834
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2549/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #407 : 12 Март 2017, 11:47:27 »
Получил результаты своего mtFullSequence теста.

Я - J1d1a. :)
Кит 573477

Поздравляю с первыми результатами!

Я же говорил, что Ваши результаты по закону справедливости должны быть интересными :)

Жаль, только, что митохондриальные гаплогруппы - это очень и очень обобщённо, из-за редко происходящих мутаций.

Соответствующие совпаденцы из базы FTDNA

Насколько я понял, это совпаденцы в HVR1. А кто у Вас в совпаденцах в Full Mt Sequence?

В проект https://www.familytreedna.com/public/J-mtDNA/ вступил.

Смотрю, кроме Вас, в проекте ещё три подтверждённых J1d1a: два арабских (321184 Mesmar и 457528 aldehany almutari) и один армянский (164226 Kassabian)


Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5709
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1845/-12
  • мтДНК: H1b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #408 : 12 Март 2017, 15:23:51 »
wozaixuexi, особенность митохондрии в том, что мутации происходят редко. Привязать их к какому-то времени и миграции необычайно сложно. Даже полное совпадение может означать и сотню лет до общего предка и несколько тысяч. Это даже не гадание на кофейной гуще...

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2589
  • Страна: ru
  • Рейтинг +793/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #409 : 12 Март 2017, 20:30:35 »
В целом, все совпаденцы установлены по HVR1 записям, однако, не оказалось ни одного по HVR2 и FMS, соответственно.

Практически это означает, что с теми, у кого на скриншоте полный митосёч, у Вас 4 и более мутаций разницы (генетическое расстояние). FTDNA до 3 мутаций показывает в таблице. Т.е. с этими товарищами у Вас общий предок несколько тысяч лет назад. Даже при самой оптимистичной трактовке средней частоты мутаций.

Оффлайн AlexanderK

  • Сообщений: 1975
  • Страна: ru
  • Рейтинг +353/-1
  • Y-ДНК: J1-PF7257
  • мтДНК: H11a1
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #410 : 12 Март 2017, 21:44:10 »
Я уже не раз приводил пример что данный тест совершенно бесполезен если вы только не проверяете кого то кого вы только точно знаете!
У меня у мамы 40 человек с ПОЛНЫМ совпадением. По FullMito. все - финны (финки). По FamilyFinder ни одна даже близко. По аутосома ни одна даже в 200 лет

Оффлайн wozaixuexi

  • Сообщений: 56
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • Y-ДНК: C-Y15552
  • мтДНК: J1d1a1
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #411 : 24 Март 2017, 06:34:26 »
Моя запись успешно добавлена в Генбанк KY765533

Мне присвоена гаплогруппа J1d1a1

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KY765533

Оффлайн lafarge

  • Сообщений: 12
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #412 : 31 Май 2017, 20:48:33 »
Уважаемые коллеги, у моей мамы J1c3.

В базе есть HVR1, HVR2, HVR1 FF и FMS FF.

Самые близкие - это HVR2 и FMS FF? Какая степень родства (столетия и т.д.) в этом случае?

И еще очень интересный момент: если с HVR 1-2 вылезла Европа, то в Family Finder у мамы подавляющее большинство - поляки. Это что значит? И каким образом Family Finder ищет совпаденцев - анализируя что? И mtDNA чем отличается от Family Finder - гены-то одни...? Запуталась.

Онлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12834
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2549/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #413 : 31 Май 2017, 21:11:17 »
lafarge, как мне в своё время здесь объяснили, в пределах документальной генеалогии могут быть только ближайшие общие предки с matches в FMS с Genetic Distance 0. В связи с тем, что мутации в митохондриях происходят 1 раз в тысячи лет. У Вашей мамы как в FTDNA  совпаденцами FMS?

То есть, совпаденцы Вашей мамы в HVR1 - это тысячи лет назад.

Family Finder - это совсем другой тест. Это не митохондрии, а Ваши аутосомные хромосомы и X-хромосомы. Здесь, наоборот, определение родства неглубоко, но по всем Вашим предковым линиям.

То есть, в одном случае всё основано на однонуклеотидных полиморфизмах митохондриальной ДНК, а во втором - на однонуклеотидных полиморфизмах аутосомных и X-хромосом.

Оффлайн lafarge

  • Сообщений: 12
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #414 : 31 Май 2017, 21:39:35 »
Ярослав, спасибо за ответ!
У мамы 8 совпаденцев FMS FF с дистанцией 3. Это что значит? Что наши общие предки жили около 500-1000 лет назад и более? И что эта ген дистанция = 3 значит? Это весьма далеко, как я понимаю.

Итак, получается, что:
- По митохондриям 8 совпаденцев из Европы. Это значит, что общие предки есть, но жили сотни (а то и тысячи) лет назад. Так?

- А вот по FF в глаза бросаются поляки. То есть по линии ее бабушек-дедов не так давно - 50-100-200 лет назад - были, в частности, поляки? Так? (кстати, действительно, прабабка и прадед ее именно с тех краев - граница с Польшей и одно время польская территория).
« Последнее редактирование: 31 Май 2017, 22:05:38 от lafarge »

Оффлайн lafarge

  • Сообщений: 12
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #415 : 31 Май 2017, 21:47:03 »
И еще вдогонку про FF. Там почти 500 матчей.

И, допустим, 3rd cousin по FF - это же НЕ троюродный родственник? Большинство - 5th Cousin. Это какая степень родства?

И там в FF есть 3 параметра:
1)Longest block - максимум 23.
2)Shared Centimorgans - у нас максимум 66. Это много?
3)X-Match - а это что за матч? Он показывает более близкое родство? Почему у других совпаденцев нет этого X-Match?

Из указанных выше 3 параметров какой больше всего влияет на близость родства? А то как-то же эти 500 матчей надо анализировать) писать людям - вдруг родственники отыщутся.

Оффлайн lafarge

  • Сообщений: 12
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #416 : 31 Май 2017, 21:55:40 »
Вот в топе по маме родственник:
(5th Cousin, shared cent = 66, longest block = 10, X-match)


Это насколько близкий?

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 2589
  • Страна: ru
  • Рейтинг +793/-3
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #417 : 01 Июнь 2017, 00:07:18 »
Вот в топе по маме родственник:
(5th Cousin, shared cent = 66, longest block = 10, X-match)
Это насколько близкий?

пятый кузен - это шестиюродный родственник.

Вам будет полезно прочесть это пояснение:
http://forum.molgen.org/index.php/topic,8868.0.html

Оффлайн lafarge

  • Сообщений: 12
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #418 : 01 Июнь 2017, 02:59:16 »
Спасибо, прочитала. Получается, 66 разделяемых сентиморганов в FF - это совсем мало, и родство довольно далекое. Но про часть совпаденцев написан диапазон - 3-5 кузены. Вдруг повезет, и это окажется кто-то 4-юродный. Удивительно, как из всех людей в базе были отобраны почти 500 более менее совпаденцев. Наверняка среди них родственники затесались.

А 8 матчей по mtDNA - HVR-1 (дистанция 3) - эти господа насколько далеки? Лет 500-1000?
« Последнее редактирование: 01 Июнь 2017, 03:26:25 от lafarge »

Онлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 12834
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2549/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #419 : 01 Июнь 2017, 07:24:05 »
У мамы 8 совпаденцев FMS FF с дистанцией 3. Это что значит? Что наши общие предки жили около 500-1000 лет назад и более? И что эта ген дистанция = 3 значит? Это весьма далеко, как я понимаю.

Да, это далеко. Как я уже сказал выше, мутации в митохондриях происходят 1 раз в тысячи лет. У Вашей мамы разница с ними в 3 мутации. Так что там тысячелетия.

А 8 матчей по mtDNA - HVR-1 (дистанция 3) - эти господа насколько далеки?

Эти, если не ошибаюсь, даже ещё дальше. Если с теми 8 разница была в 3 мутации на всех участках, то с этими 3 мутации только на одном участке митохондриальной ДНК.
« Последнее редактирование: 01 Июнь 2017, 08:03:44 от Yaroslav »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100