АвторТема: мтДНК: Гаплогруппа J  (Прочитано 86557 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19621
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #360 : 06 Ноябрь 2012, 12:50:21 »
Затащи данные в Генбанк или как он там называется.

Оффлайн mefo

  • Сообщений: 1189
  • Страна: ru
  • Рейтинг +180/-0
  • Y-ДНК: N-Z16975 Neuri
  • мтДНК: J2b1a6a1
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #361 : 06 Ноябрь 2012, 13:07:08 »
Затащи данные в Генбанк или как он там называется.
В MitoSearch уже закинул, но там почему-то только до HVR2...

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19621
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #362 : 06 Ноябрь 2012, 13:25:46 »
Затащи данные в Генбанк или как он там называется.
В MitoSearch уже закинул, но там почему-то только до HVR2...

Ну и в YSearch всех маркеров не вбить

Оффлайн NMT

  • Сообщений: 70
  • Страна: 00
  • Рейтинг +6/-0
  • Y-ДНК: I2a1b
  • мтДНК: C5c1a
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #363 : 02 Январь 2013, 21:50:38 »
подскажите, заслал данные в ГенБанк, где там можно посмотреть (ссылку плз) свое положение в списке таких же засланцев? типа таблицы, а то у FTDNA моловато "близких" совпаденцев, мож здесь больше повезет...

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #364 : 26 Май 2013, 11:43:49 »
По этой ссылке таблица, где митоJ могут посмотреть откуда представители разных субкладов гаплогруппы. И добавить себя.
http://goo.gl/CTn4T

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #365 : 26 Май 2013, 11:45:16 »
подскажите, заслал данные в ГенБанк, где там можно посмотреть (ссылку плз) свое положение в списке таких же засланцев? типа таблицы, а то у FTDNA моловато "близких" совпаденцев, мож здесь больше повезет...

Там такого нет. Это вообще публичная база Национального института здоровья США. Для академических целей. Предполагается, что  те, кто заслал данные будут рады, что сделали что-то полезное для науки.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #366 : 26 Май 2013, 11:46:57 »
подскажите, заслал данные в ГенБанк, где там можно посмотреть (ссылку плз) свое положение в списке таких же засланцев? типа таблицы, а то у FTDNA моловато "близких" совпаденцев, мож здесь больше повезет...

Вот здесь есть дерево, построенное по публичным данным из ГенБанка: http://www.phylotree.org/ (билд от 30.09.2012)

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #367 : 26 Май 2013, 12:37:41 »
подскажите, заслал данные в ГенБанк, где там можно посмотреть (ссылку плз) свое положение в списке таких же засланцев? типа таблицы, а то у FTDNA моловато "близких" совпаденцев, мож здесь больше повезет...

Вот ещё ссылочка на труды нашего уважаемого Valery
Цитировать
Our online database of full mitochondrial sequences is a browsable phylogenetic tree with some supporting information such as the list of mutations, ages for all mentioned haplogroups etc. Current release is ver. 8.1 of January 4, 2013. For haplogroups L, N, M and most of R descendants the database is up to date while for R0/HV/H/V and JT it's about 8 months outdated - this will be fixed soon. Note that we keep the list of full sequences in our offline database always up to date. Follow this link to open the online database of complete sequences.
http://forensicdna.ru/online.html#humanmtdna

Оффлайн Elena V

  • Сообщений: 56
  • Страна: ru
  • Рейтинг +15/-0
  • мтДНК: J1c4b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #368 : 26 Май 2013, 18:02:12 »
Вот здесь есть дерево, построенное по публичным данным из ГенБанка: http://www.phylotree.org/ (билд от 30.09.2012)

В этом древе я нашла себя по своему коду Генбанка и уже по самому последнему субкладу J1c4b, только недавно обновленному в FTDNA, и кликнув на ссылку, увидела все свои данные в Генбанке. А вот мой единственный полный совпаденец не участвует в этом проекте. И вообще там нас всего двое с этим субкладом, а в FTDNA у меня уже семь совпаденцев, хотя и не полных.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #369 : 26 Май 2013, 18:43:15 »
Вот здесь есть дерево, построенное по публичным данным из ГенБанка: http://www.phylotree.org/ (билд от 30.09.2012)

В этом древе я нашла себя по своему коду Генбанка и уже по самому последнему субкладу J1c4b, только недавно обновленному в FTDNA, и кликнув на ссылку, увидела все свои данные в Генбанке. А вот мой единственный полный совпаденец не участвует в этом проекте. И вообще там нас всего двое с этим субкладом, а в FTDNA у меня уже семь совпаденцев, хотя и не полных.

К сожалению, в силу того что митоДНК мутирует гораздо медленнее, для генеалогических целей сравнивать корректно можно только результаты полного сиквенса. Всё остальное лежит в диапазоне "от нуля до плюс бесконечности".

Оффлайн Elena V

  • Сообщений: 56
  • Страна: ru
  • Рейтинг +15/-0
  • мтДНК: J1c4b
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #370 : 26 Май 2013, 20:29:46 »
К сожалению, в силу того что митоДНК мутирует гораздо медленнее, для генеалогических целей сравнивать корректно можно только результаты полного сиквенса. Всё остальное лежит в диапазоне "от нуля до плюс бесконечности".

Вот я и ждала со своим полным сиквенсом, когда у меня появится полный совпаденец по полному сиквенсу. Появился через три года ожидания. И даже с предками с Волги, но - увы! - именно по женской линии его предки неизвестны. Пока что это меня подвигло на изучение боковых ветвей моей прямой женской линии.

Оффлайн rifatx77

  • Сообщений: 95
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: J2a1h2a
  • мтДНК: J1c2
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #371 : 19 Июнь 2013, 20:39:16 »
Товарищи-специалисты, помогите разобраться с Мито. Имею mtPlus. В кабинете висит J. Буду признателен

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #372 : 19 Июнь 2013, 21:11:39 »
Товарищи-специалисты, помогите разобраться с Мито. Имею mtPlus. В кабинете висит J. Буду признателен

1. Скачайте файл формата FASTA со страницы про мито в ФТДНА.
2. Закачайте его сюда: http://dna.jameslick.com/mthap/
3. Смотрите результат.

Оффлайн rifatx77

  • Сообщений: 95
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: J2a1h2a
  • мтДНК: J1c2
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #373 : 19 Июнь 2013, 21:57:33 »
Спасибо Шад. Но в этом сам не разберусь, что там к чему. Скопипастил часть. Это я так понимаю совпаденцы близкие? И от их гаплогруппы отталкиваться уже или как? И что с совпаденцами в личном кабинете? Их десятки.

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) J1c2b(AY495222)

Defining Markers for haplogroup J1c2b(AY495222):
HVR2: 73G (185A) 188G (228A) 263G 295T 462T 489C
CR: 750G 1438G 2706G 3010A 4216C 4454C 4769G 5033G 7028T 7674C 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13708A 14766T 14798C 15326G 15452A
HVR1: 16069T 16093Y 16126C

Marker path from rCRS to haplogroup J1c2b(AY495222) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 4216C ⇨ R2'JT ⇨ 11251G 15452A 16126C ⇨ JT ⇨ 295T 489C 10398G 12612G 13708A 16069T ⇨ J ⇨ 462T 3010A ⇨ J1 ⇨ (185A) (228A) 14798C ⇨ J1c ⇨ 188G ⇨ J1c2 ⇨ 4454C ⇨ J1c2b ⇨ 5033G 7674C 16093Y ⇨ J1c2b(AY495222) ⇨ (315.1C) (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(11): 73G (185A) 188G (228A) 263G 295T 462T 489C 16069T 16093T 16126C
Extras(0): (315.1C) (16519C)
Untested(20): 750 1438 2706 3010 4216 4454 4769 5033 7028 7674 8860 10398 11251 11719 12612 13708 14766 14798 15326 15452
« Последнее редактирование: 19 Июнь 2013, 22:06:39 от rifatx77 »

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6260
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1134/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: мтДНК: Гаплогруппа J
« Ответ #374 : 19 Июнь 2013, 22:29:12 »
Спасибо Шад. Но в этом сам не разберусь, что там к чему. Скопипастил часть. Это я так понимаю совпаденцы близкие? И от их гаплогруппы отталкиваться уже или как? И что с совпаденцами в личном кабинете? Их десятки.

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) J1c2b(AY495222)

Defining Markers for haplogroup J1c2b(AY495222):
HVR2: 73G (185A) 188G (228A) 263G 295T 462T 489C
CR: 750G 1438G 2706G 3010A 4216C 4454C 4769G 5033G 7028T 7674C 8860G 10398G 11251G 11719A 12612G 13708A 14766T 14798C 15326G 15452A
HVR1: 16069T 16093Y 16126C

Marker path from rCRS to haplogroup J1c2b(AY495222) (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 4216C ⇨ R2'JT ⇨ 11251G 15452A 16126C ⇨ JT ⇨ 295T 489C 10398G 12612G 13708A 16069T ⇨ J ⇨ 462T 3010A ⇨ J1 ⇨ (185A) (228A) 14798C ⇨ J1c ⇨ 188G ⇨ J1c2 ⇨ 4454C ⇨ J1c2b ⇨ 5033G 7674C 16093Y ⇨ J1c2b(AY495222) ⇨ (315.1C) (16519C)

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(11): 73G (185A) 188G (228A) 263G 295T 462T 489C 16069T 16093T 16126C
Extras(0): (315.1C) (16519C)
Untested(20): 750 1438 2706 3010 4216 4454 4769 5033 7028 7674 8860 10398 11251 11719 12612 13708 14766 14798 15326 15452

Это утилита выдает разные варианты, опираясь на известные гаплотипы. Нужно просмотреть весь список и найти Perfect Match. Есть  такое? Или опубликуйте все варианты.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100