АвторТема: Помогите мне разобраться с построением деревьев  (Прочитано 3171 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8690
  • Страна: gr
  • Рейтинг +798/-126
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)
Я же вам дал ссылку, по которой я сам учился

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)
Я же вам дал ссылку, по которой я сам учился
не понял в эксель просто копировать и фтдна - там же палиндромы (сложные) маркера что с ними делать например - 14   23   15   10   14-15   11   12   11   12   11   29   16   9-9   11   11   23   16   20   29   13-13-13-14   11   11   20-20   16   13   17   17   35-36   12   10
вместе с дефисами и вплотную или как то делить???

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8690
  • Страна: gr
  • Рейтинг +798/-126
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)
Я же вам дал ссылку, по которой я сам учился
не понял в эксель просто копировать и фтдна - там же палиндромы (сложные) маркера что с ними делать например - 14   23   15   10   14-15   11   12   11   12   11   29   16   9-9   11   11   23   16   20   29   13-13-13-14   11   11   20-20   16   13   17   17   35-36   12   10
вместе с дефисами и вплотную или как то делить???
Это уже тоже не проблемма
Берете гаплотипы как есть(тоесть с именами с номерами с датами смерти и гаплотипами и с дефисами итд) как есть и Кидаете сюда
http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8690
  • Страна: gr
  • Рейтинг +798/-126
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)
Я же вам дал ссылку, по которой я сам учился
не понял в эксель просто копировать и фтдна - там же палиндромы (сложные) маркера что с ними делать например - 14   23   15   10   14-15   11   12   11   12   11   29   16   9-9   11   11   23   16   20   29   13-13-13-14   11   11   20-20   16   13   17   17   35-36   12   10
вместе с дефисами и вплотную или как то делить???
Это уже тоже не проблемма
Берете гаплотипы как есть(тоесть с именами с номерами с датами смерти и гаплотипами и с дефисами итд) как есть и Кидаете сюда
http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html
выбираете например
V Generate PHYLIP data
Probability 95%
Mutation Rate FTDNA 0.004..0.0075
И нажимаете Execute

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
взял три гаплотипа и копипастил в утилиту http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html
нажал экзекьюте - выдало окно с массой расчетов...
где взять? не вижу...
"В появившемся новом окне под таблицей будет форма с гаплотипами в формате ych:"
п.с. где можно скачать филипс прогу ? мурку закачал уже...

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8690
  • Страна: gr
  • Рейтинг +798/-126
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
взял три гаплотипа и копипастил в утилиту http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html
нажал экзекьюте - выдало окно с массой расчетов...
где взять? не вижу...
Там окно ->PHYLIP compatible TMRCA table оттуда

например такой результат от трех гаплотипов
4
     modal 0 360 1350 510
    276909 360 0 1530 690
    251969 1350 1530 0 1620
    276902 510 690 1620 0


п.с. где можно скачать филипс прогу ? мурку закачал уже...
филипс
http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html
http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/getme.html

Mega 4.0
http://www.megasoftware.net/mega4/mega.html
http://mega.software.informer.com/4.0/

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
нашел!
уже подразобрался маленько =) , уже внес 10 L1264+
провели расчет возрастов =)
филип прога - у меня англоязычный кретинизм, нужно быть как я понял в фейсбуке зарегистрированным чтобы скачать ее?
п.с. а эту утилиту можно заиметь на компьютер (я часто езжу, как раз заняться нечем и выхода в интернет нет я бы за одну поездку все бы пересчитал) - http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html ?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6314
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1195/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Друзья лучше вместо фаллометрии* сделайте реально доброе дело и помогите мне разобраться с построением деревьев =))) приветствуется любая программа (пока с муркой разбираюсь но предпочтений нет) - ОЧЕНЬ ПРОШУ =)
Я же вам дал ссылку, по которой я сам учился
не понял в эксель просто копировать и фтдна - там же палиндромы (сложные) маркера что с ними делать например - 14   23   15   10   14-15   11   12   11   12   11   29   16   9-9   11   11   23   16   20   29   13-13-13-14   11   11   20-20   16   13   17   17   35-36   12   10
вместе с дефисами и вплотную или как то делить???

Вопрос - что нужно?
Файл в формате ych? 67-маркерные гаплотипы гаплогрупы G?

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Что делать дальше как получить дерево?!
И не могу закачать филип прогу, мурку скачал...но по ней пытаюсь разобраться кого куда...
п.с. Фаер - кстати вы говорили что Л1264+ порядка трех тыщ лет, но только я к любому гаплотипу оцениваюсь от 1800 лет до 3000 лет, кстати та веточка которую мы с Булатом обозвали как "ясская" - гаплотипы друг к другу по 1000 лет - что нас тотправляет во времена касогов и совсем свежую историю...

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
почему то в мурке bat файл не хочет с ych создавать rdf .....ну все перепроверил, может такое быть изза пробелов в ych когда он еще был txt? и слово modal оставляется или сносится?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +445/-6
  • Ultimate Matriarchy
почему то в мурке bat файл не хочет с ych создавать rdf .....ну все перепроверил, может такое быть изза пробелов в ych когда он еще был txt? и слово modal оставляется или сносится?

пробелы конвертер не любит, да. Modal он никак не парсит, для него это обычное имя, сохраняет как есть. Модал это не понятие филогении и ничего удивительного что Мурка этого слова как термина не воспринимает.

Оффлайн Михаил НочевнойАвтор темы

  • Сообщений: 2139
  • Страна: ru
  • Рейтинг +172/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
почему то в мурке bat файл не хочет с ych создавать rdf .....ну все перепроверил, может такое быть изза пробелов в ych когда он еще был txt? и слово modal оставляется или сносится?

пробелы конвертер не любит, да. Modal он никак не парсит, для него это обычное имя, сохраняет как есть. Модал это не понятие филогении и ничего удивительного что Мурка этого слова как термина не воспринимает.
ищу пробелы, модал сохранил на латыни.

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1503
  • Страна: ru
  • Рейтинг +723/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1a или U8a1a1b
http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html
Эта утилитка уже не работает?...
Вчера пробовал, работала, а сегодня не фурычит уже?..((

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12432
  • Страна: az
  • Рейтинг +2623/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Только что проверил - всё работает и генерирует

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100