АвторТема: GEDmatch.Com - инструменты для популяционного анализа  (Прочитано 131380 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4079
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1584/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
это первый матч
Largest segment = 34.0 cM
Total of segments > 7 cM = 52.1 cM
2 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.1
2
673853 SNPs used for this comparison.
Largest segment = 16.8 cM
Total of segments > 7 cM = 37.2 cM
3 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.3

673663 SNPs used for this comparison.
3
Largest segment = 10.6 cM
Total of segments > 7 cM = 34.0 cM
4 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

658153 SNPs used for this comparison.

Здравствуйте!

посмотрите FAQ по аутосомам: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8868.0.html

там есть ряд ценных рекомендаций. особенно про составные сегменты.
по своему опыту добавлю, что шансы найти родство при Ваших исходных ничтожно малы.

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
Здравствуйте. У меня вопрос к экспертам.
Из четырех моих дедушек-бабушек трое – коми-зыряне с хорошо проработанной генеалогией до рубежа 16-17 веков. Жесткий изолят. Настолько, что многие персоны генеалогического дерева 17-18 веков одновременно являются моими предками и с материнской стороны, и со стороны бабушки отца. Все, включая боковые ветви, сысольские и удорские коми.
А вот дед по отцу родом из Припяти. Генеалогия проработана до середины 18 века. Гаплогруппа J2b. Украинско- польский кластер на Yfull https://yfull.com/tree/J-Y29718/    Z – 1043, которой относится кластер, редкая для всех мест ветвь J2B с противоречивой дискуссией о ее происхождение. 
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Второй вопрос: какой калькулятор запустить и что указать в строке: «Population substring to search»?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6777
  • Страна: th
  • Рейтинг +1081/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Совсем не факт. Протестируйте отца или деда по отцу- это единственный надёжный способ.

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Совсем не факт. Протестируйте отца или деда по отцу- это единственный надёжный способ.


Это, к сожалению, уже не возможно

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Надо принимать во внимание только комбинации, где одной стороной выступают коми - допустим, 77% Komi + 23% Ukrainian-Center, 73% Komi + 27% Belarusian, в таком духе. Если с одно стороны неправильная популяция, то и с другой ожидается неправильная.
Цитировать
Второй вопрос: какой калькулятор запустить и что указать в строке: «Population substring to search»?
Попробуйте Eurogenes EUtest, JTest, K36. В MDLP обычно игнорируется "эффект калькулятора" (ЕМНИП за исключением K23b, его тоже можно попробовать).
« Последнее редактирование: 01 Февраль 2018, 12:39:27 от Srkz »

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
А что указать в строке population ?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
А что указать в строке population ?
Это не нужно

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
Цитировать
Надо принимать во внимание только комбинации, где одной стороной выступают коми - допустим, 77% Komi + 23% Ukrainian-Center, 73% Komi + 27% Belarusian, в таком духе. Если с одно стороны неправильная популяция, то и с другой ожидается неправильная.

Спасибо. Eurogenes EUtest V2 K15 - коми вообще не выдает. Jtest дает:

#       Primary Population (source)   Secondary Population (source)   Distance
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
2       61.4%   Komi   +   38.6%   North_Russian   @   4.28
3       54.6%   Komi   +   45.4%   Erzya   @   4.28
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
5       89.9%   Erzya   +   10.1%   Selkup   @   4.43
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
7       94.3%   Erzya   +   5.7%   Nganassan   @   4.82
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
9       93%   Erzya   +   7%   Chukchi   @   4.85
10       93.3%   Erzya   +   6.7%   Koryak   @   4.87
11       62.7%   Komi   +   37.3%   East_Russian   @   4.91
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26
15       87.7%   North_Russian   +   12.3%   Selkup   @   5.38
16       81.8%   Komi   +   18.2%   PL   @   5.42
17       79.2%   Udmurt   +   20.8%   LIT   @   5.45
18       60%   Udmurt   +   40%   North_Russian   @   5.53
19       76.9%   Udmurt   +   23.1%   Northwest_Russian   @   5.59
20       91.2%   North_Russian   +   8.8%   Chukchi   @   5.62

Подскажите, пжл, что значат цифры в конце каждой строки.
« Последнее редактирование: 08 Февраль 2018, 12:01:30 от пенелопа »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
По этому калькулятору дед по отцу примерно беларус:
Цитировать
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 602
  • Страна: ru
  • Рейтинг +132/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
По этому калькулятору дед по отцу примерно беларус:
Цитировать
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26

Скорее из псковской, смоленской или тверской популяции.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Подскажите, пожалуйста, что это за популяции в EUtest:

Ukrainian-Russian

EE

East_Russian

Где вообще можно глянуть, из каких регионов брали образцы для популяций этого калькулятора?

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 178
  • Страна: ru
  • Рейтинг +23/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Кстати, я вот писал  про мобильное приложение http://forum.molgen.org/index.php/topic,6092.msg403160.html#msg403160
Очень удобно, кстати.  Получаешь PUSH уведомление о совпадениях и смотришь.  Если видишь, что пользователь по идее говорит по русски, пишешь письмо и спрашиваешь .  Куда удобнее, чем смотреть совпадения в FTDNA или на сайте того же Gedmath .

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 687
  • Страна: aq
  • Рейтинг +118/-0
С помощью базы данных GED Match полиции США опять удалось поймать убийцу-насильника после 30-ти лет бузуспешного поиска:
https://www.gazeta.ru/science/2018/05/21_a_11758933.shtml

Оффлайн Feroce

  • Сообщений: 1907
  • Страна: ru
  • Рейтинг +608/-0
  • Потомок помещичьих крестьян Бессоновых(Безсоновых)
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP569>>Y11268>>>>Y86309/FT74365)
  • мтДНК: мтДНК в ожидании
У gedmath нашлось мобильное приложение:

GEDmatch, Kirill Kudin
https://itunes.apple.com/ru/app/gedmatch/id1215112695?mt=8




А вопрос такой: как интерпретировать "total cM " и largest cM  в программе?
Полгода не заходил в приложение и сегодня обнаружил, что оно давно уже не обновляет совпадения и пропало из iTunes.
Может кто знаком с разработчиком приложения?

Оффлайн Станислава Терещенко

  • Сообщений: 6
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Добрый день! У меня вопрос по поводу дистанций в Oracle и Оr4.  Насколько важно смотреть на дистанцию в различных калькуляторах? Например, в 3 калькуляторах мне выдаются довольно близкие и одинаковые названия и популяции, но самая ближайшие дистанции 5, 5,6,8,8,10 и тд тп.
То есть цифра изначально большая.
А на других калькуляторах самое близкое значение уже меньше, например 3 или 4, а в последнем калькуляторе  и самые дальние значение  ближе, чем в других калькуляторах первые.

Eurogenes EUtest
1 Southwest_Russian @ 6.464371
2 Estonian_Polish @ 7.435607
3 Ukrainian_Belgorod @ 7.441883
4 Kargopol_Russian @ 7.855106
5 Belorussian @ 7.979885
6 Erzya @ 8.210104
7 Russian_Smolensk @ 8.374781
8 Lithuanian @ 9.905124
9 Polish @ 11.475938
10 Ukrainian @ 12.687358

MDLP K23b
1 Russian-Upper-Volga_ @ 5.601648
2 Erzya_ @ 5.651031
3 Russian_Vologda_ @ 6.051419
4 Russian-North_ @ 6.228769
5 Russian_Meshtchyora_ @ 6.267435
6 Mordovian_ @ 6.591326
7 Russian_North_ @ 6.641616
8 Russian-West_ @ 7.419563
9 Finn_East_ @ 7.867873
10 Finnish_FIN_ @ 7.937615

Вот последние 2 калькулятора, тут все значения ближе, чем в парвых, значит ориентироваться на них? Первые калькуляторы мне не подходят?

MDLP World
1 Mordovian_V @ 3.954214
2 Ukrainian_V @ 5.097991
3 Ukrainian-Center @ 6.196055
4 Ukrainian-West @ 6.319921
5 Ukrainian-East @ 6.636633
6 Russian_cossack @ 6.644701
7 Russian_South @ 6.844413
8 Ukrainian @ 7.144650
9 Russian_V @ 7.579736

MDLP K16 Modern
1 Cossack_Kuban @ 3.795999
2 Russian_CentralRussia @ 4.228504
3 Russian_Tver @ 4.481949
4 Belarusian_Kobryn_Brest @ 4.498834
5 Russian_Kostroma @ 4.684186
6 Belarusian_East_EastBelarus @ 4.693571
7 Russian_CentralRussia @ 4.814293
8 Russian_SouthRussia @ 4.862890
9 Pole_Poland @ 5.004658
10 Russian_cossack_Kuban @ 5.062016
11 Ukrainians_east_EastUkraine @ 5.279266
12 Ukrainians_north_NorthUkraine @ 5.397770
13 Belarusian_Belarus @ 5.458704
14 Finn_WestFinland @ 5.798429
15 Ukrainian_Ukraine @ 5.808726
16 Erzya_Moksha_Mordovia @ 5.907428
17 Pole_Wroclaw @ 5.947031
18 Pole_WestPoland @ 6.199608
19 Belarusian_West_WestBelarus @ 6.215925
20 Ingrians_Ingermanland @ 6.484031

С этим вопрос. Дистанции важно учитывать независимо от калькулятора, например все дистанции во всех калькуляторах в пределах значения 5 к вам близки? Или в каждом калькуляторе важны не значения дистанции, а порядковый номер, ну допустим 1 десять популяций к вам близки?
Заранее большое спасибо за ответ!

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.