АвторТема: YFull. Филогенетическое дерево Q.  (Прочитано 6173 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2615/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
YFull. Филогенетическое дерево Q.
« : 22 Август 2013, 10:20:30 »
Опубликован новый драфт дерева снипов из серии Y, найденных в семплах с гаплогруппой Q из проекта "1000 геномов".
Из основных изменений:
Уточнена позиция для снипа L474, который неправильно указан в дереве ISOGG. Он переходит с уровня Q1a на уровень Q1a2.
Поставлен под сомнение снип M365.3, как нестабильный - он встречается в семплах HG01979 и NA19774, имеющих субклад Q1a2a1a1, а не Q1a1b1a.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2615/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #1 : 22 Август 2013, 18:56:29 »
Обновилось дерево на сайте YFull до версии YTree v1.5 at 22 August 2013
Для гаплогруппы Q включены все изменения, показанные в схеме.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #2 : 22 Август 2013, 19:00:49 »
почему так много семплов лежат в корне L341/L341.2/L341.1  :o

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5308
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2615/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #3 : 22 Август 2013, 19:07:44 »
почему так много семплов лежат в корне L341/L341.2/L341.1  :o
Слишком много субкладов, лежащих ниже L341, а на таких плохих образцах существует большая возможность того, что один из снипов, маркирующих нижележащий субклад, не определился.
Например NA19735 имеет M19- M194- P105- L663- L766- SA01?
Значит есть некоторая вероятность, что NA19735 будет Q1a2a1a1e (SA01+), поэтому будет некорректно поместить его в Q-L341.2*.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #4 : 24 Февраль 2014, 22:18:47 »
New YSNP Tree (Hg Q) by YFull

Новое дерево снипов гаплогруппы Q oт YFull.

https://drive.google.com/file/d/0B4NkfVzTjWulYU1SUDR3c0hDZFE/edit?usp=sharing

http://yfull.com/tree/Q/

Изменения коснулись узлов L53-L54. Y-снипы, бывшие в субкладе L54 вынесены в отдельный блок, так как нет семплов, позволяющих точно их спозиционировать. Их локализация или L63 или L54.
Также использован образец палеоэскимоса Saqqaq (NWT01-M120). С его помощью разбит на подгруппы большой блок снипов с двойной локализацией.
Добавлен новый субклад Q-Y2816, в который вошли два образца NA19771 и NA19795 (жители Лос-Анжелеса мексиканского происхождения). В образовании этого субклада принял косвенное участие кловисский мальчик Anzick1, так как именно отрицательные у него снипы и образовали новый субклад под Z780. 

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +567/-2
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #5 : 01 Август 2014, 22:38:27 »
анонс.

если я правильно понял, то выделилась ветка выше L301 и параллельная Y2990

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #6 : 03 Август 2014, 21:38:30 »
анонс.

если я правильно понял, то выделилась ветка выше L301 и параллельная Y2990

Да, всё верно.
Сейчас мы имеем под Q-Y2250 две ветви - Q-Y2290 (общую для двух человек с абсолютно разным происхождением: казаха и португальца) и иранцев Q-L301.
Сейчас у нас появился индиец, который обладает двумя SNP общими с протестированным иранцем Q-L301.
Таким образом, параллельно Q-Y2990 мы имеем ветвь Q-Y5185, которая определяется двумя SNP: Y5185 и Y5186.
Соответственно, появился ещё один факт, подтверждающий, что индо-иранская общность имела не только общий язык, но и общую популяционную базу. Правда пока это единичный факт, но тем не менее это вклад "в копилку" инструментария для проверки постулатов сравнительной лингвистики средствами генетической генеалогии.

UPD Синдха HGDP00165 по новым SNP проверить не удается - они в его сиквенсе не определены... Так что он так и остается Q-Y2250*
« Последнее редактирование: 03 Август 2014, 21:48:05 от Шад »

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #7 : 13 Август 2014, 23:34:31 »
Про новые снипы под Q1b

1) Три кластера ашкенази AJ1 (Y2750), AJ2 (Y2780) и AJ3 под Q-Y2200.
http://goo.gl/mtbl7J

2) Идентифицирован субклад Q-Y5185, параллельный Q-Y2990 и включающий иранский Q-L301.
http://goo.gl/VwTIQD

3) Субклад Q-Y2220 разделен ассирийским Q-L245 на две части. Выделена ветвь Y2220+ Y2228+ Y2209-. К ней принадлежат упомянутый ассириец из Турции и берберский еврей.
Относительно образца PGP130 из Марокко. Благодаря уважаемому Семарглу была проведена проверка снипов уровня Q-Y2220
Цитировать
Y2220 -
Y2202-
Y2228 n/a
Y2229-
Y2253-
Y2356-
Y2595-
Таким образом, он однозначно принадлежит к вышерасположенному субкладу Q-L245 (xY2220). Возможно, что протестированный не имеет отношения к берберским евреям, а является арабом, положение которых на филогенетическом дереве гаплогруппы пока окончательно не прояснено.
« Последнее редактирование: 14 Август 2014, 16:59:07 от Шад »

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #8 : 14 Октябрь 2014, 15:49:02 »
v2.25 available now.
Q: 225 SNPs, 16 subclades
http://yfull.com/tree/Q/

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 383
  • Страна: ru
  • Рейтинг +373/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #9 : 01 Январь 2018, 01:22:30 »
 ??? ??? ??? Q-Y4943FGC6995/Y4943 * Y4938/FGC6963formed 500 ybp, TMRCA 300 ybp
https://www.yfull.com/tree/Q-Y4943/ если эти 7 шведов окажутся еще и с одной фамилии, то какая цель преследуется?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #10 : 01 Январь 2018, 14:11:40 »
??? ??? ??? Q-Y4943FGC6995/Y4943 * Y4938/FGC6963formed 500 ybp, TMRCA 300 ybp
https://www.yfull.com/tree/Q-Y4943/ если эти 7 шведов окажутся еще и с одной фамилии, то какая цель преследуется?

Честно говоря, не смотрю особо то, что происходит в "скандинавских субкладах", таких как Q-L527. Там у них своя компания.
В приведенном примере действительно преобладают люди, имеющие одну фамилию, но, как минимум, двое имеют другие фамилии. Что, в принципе, не удивительно в диапазоне 300-500 лет.
Так что цель вполне нормальная. Равно как и определение "семейного терминального снипа".

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 383
  • Страна: ru
  • Рейтинг +373/-2
  • Y-ДНК: G2a1
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #11 : 01 Январь 2018, 17:34:40 »
Где можно посмотреть их семейный проект? А данного -Y4943FGC6995/Y4943 * Y4938/FGC6963 терминального снипа еще не достаточно для маркирования их ветви? Если генетические результаты стр показывают недалекое родство внутри фамилии на документально подтверждаемом временном промежутке, то разве двух гаплотипов не достаточно для оценки генвозраста ветви и определения "семейного" снипа?  7 id YFull  не излишества ли в данном случае?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6263
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1135/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #12 : 01 Январь 2018, 17:46:53 »
Где можно посмотреть их семейный проект? А данного -Y4943FGC6995/Y4943 * Y4938/FGC6963 терминального снипа еще не достаточно для маркирования их ветви? Если генетические результаты стр показывают недалекое родство внутри фамилии на документально подтверждаемом временном промежутке, то разве двух гаплотипов не достаточно для оценки генвозраста ветви и определения "семейного" снипа?  7 id YFull  не излишества ли в данном случае?

Так как они не раскрывают информацию о себе в YFull, то я вряд ли вправе сообщать такие подробности.
Попробуйте им написать - для этого есть система внутренних сообщений в YFull, привязанная к ID.

Оффлайн Oleg V.

  • Сообщений: 734
  • Страна: ru
  • Рейтинг +155/-0
  • GEDmatch: T159830; FTDNA: 543061
  • Y-ДНК: R1a-Z92>YP569
  • мтДНК: ?
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #13 : 08 Февраль 2018, 19:45:40 »
Заметил интересное обновление - появился китайский образец YF11187 в ветке Q-Y37165 (https://www.yfull.com/tree/Q-M120/). Его ВБОП с образцом, предоставленным каким-то институтом (YF04274), оценён всего лишь в 75 лет! К тому же ВБОП китайца и перуанца из Q-M120* - всего лишь 6600 лет. Получается, китайцы не так уж давно отделились от индейцев? Я думал, индейцы разошлись с остальными 10-12 тысяч лет назад, кроме, возможно, на-дене.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 5514
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2298/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: YFull. Филогенетическое дерево Q.
« Ответ #14 : 08 Февраль 2018, 21:43:34 »
Заметил интересное обновление - появился китайский образец YF11187 в ветке Q-Y37165 (https://www.yfull.com/tree/Q-M120/). Его ВБОП с образцом, предоставленным каким-то институтом (YF04274), оценён всего лишь в 75 лет! К тому же ВБОП китайца и перуанца из Q-M120* - всего лишь 6600 лет. Получается, китайцы не так уж давно отделились от индейцев? Я думал, индейцы разошлись с остальными 10-12 тысяч лет назад, кроме, возможно, на-дене.
Разве там где-то написано, что образец научный?? Просто родственники, наверное. Основные индейские ветви Q идут под другим снипом https://www.yfull.com/tree/Q-M1107/

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100