АвторТема: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare  (Прочитано 6249 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 942
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-107
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #15 : 20 Август 2013, 19:24:45 »
#   Population   Percent
1    African    92.12
2    Atlantic_Baltic    4.98
3    Australasian    1.58
4    East_Asian    0.95
5    Siberian    0.27
6    Amerindian    0.1

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1    ACB30    5.7
2    LWK30 (Behar)    7.26
3    Mandenka    7.59
4    San_He    7.83
5    Bantu_N.E. (HGDP)    7.83
6    Bantu_S.W._Herero (HGDP)    8.96
7    San    9.31
8    YRI30 (HGDP)    9.4
9    Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    9.71
10    Yoruba (HGDP)    9.77
11    Biaka_Pygmies    10.36
12    Mbuti_Pygmies    10.36
13    Hadza_He    13.63
14    ASW30 (HapMap3)    14.96
15    Sandawe_He    26.69
16    MKK30 (Dodecad)    32.3
17    Somali (Dodecad)    64.02
18    Dominican    65.58
19    Ethiopians (Behar)    68.84
20    Ethiopian_Jews (Behar)    71.72

Mixed Mode Population Sharing:

#       Primary Population (source)    Secondary Population (source)    Distance
1        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   FIN30 (1000Genomes)    @    2.12
2        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Finnish (Dodecad)    @    2.13
3        92.9%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7.1%   Russian_B (Behar)    @    2.15
4        92.9%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7.1%   Russian (HGDP)    @    2.16
5        92.9%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7.1%   Russian (Dodecad)    @    2.18
6        93.6%   Bantu_S.W._Herero (HGDP)    +    6.4%   Finnish (Dodecad)    @    2.2
7        93.6%   Bantu_S.W._Herero (HGDP)    +    6.4%   FIN30 (1000Genomes)    @    2.21
8        92.8%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7.2%   Mordovians (Yunusbayev)    @    2.21
9        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Belorussian (Behar)    @    2.23
10        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Swedish (Dodecad)    @    2.23
11        93.1%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    6.9%   Lithuanian (Dodecad)    @    2.24
12        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Norwegian (Dodecad)    @    2.24
13        93.1%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    6.9%   Lithuanians    @    2.24
14        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Polish (Dodecad)    @    2.28
15        93.7%   Bantu_S.W._Herero (HGDP)    +    6.3%   Lithuanian (Dodecad)    @    2.29
16        93.7%   Bantu_S.W._Herero (HGDP)    +    6.3%   Lithuanians    @    2.3
17        92.9%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7.1%   Ukranians (Yunusbayev)    @    2.3
18        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Orcadian (HGDP)    @    2.31
19        93%   Bantu_S.E._Tswana (HGDP)    +    7%   Orkney (1000 Genomes)    @    2.32
20        93.5%   Bantu_S.W._Herero (HGDP)    +    6.5%   Russian_B (Behar)    @    2.33

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #16 : 21 Август 2013, 08:33:13 »
В новом калькуляторе Вадима Веренича неандертальцы и денисовцы попали в один кластер с бушменами (Bushmen 99,97). Мне кажется, это потому, что они тоже были включены в расчет компонентов, иначе "эффект калькулятора" добавил бы им немного неафриканского происхождения.
Все-таки, видимо, смешивания людей современного типа и неандертальцев/денисовцев не было
Слегка упрощая, небольшая часть от изначального генетического разнообразия исчезла у африканцев и сохранилась одновременно у европейцев/азиатов и неандертальцев/денисовцев. Хотя есть заметно больше снипов, которые сохранились у неандертальцев/денисовцев и африканцев, но "вымылись" у европейцев и азиатов. По мере удаления людей от Африки генетическое разнообразие снижается.

Оффлайн galychanyn

  • Сообщений: 276
  • Страна: ua
  • Рейтинг +31/-0
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a1a (L260+, YP256+, YP254-)
  • мтДНК: H3g
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #17 : 21 Август 2013, 11:11:46 »
Neanderthal
Total SNPs in common: 924069
Match on at least one allele: 718538 (77.8%)
Match on both alleles: 435340 (47.1%)

Denisovian
Total SNPs in common: 923704
Match on at least one allele: 721600 (78.1%)
Match on both alleles: 440025 (47.6%)

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 942
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-107
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #18 : 21 Август 2013, 11:41:33 »
ого,  почти на треть больше чем у других, да вы  товарищ неандерталец!
 ;D вообще если честно какой-то сомнительный тест.
что он покажет у тех,  у кого Балкан еще выше?

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 942
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-107
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #19 : 21 Август 2013, 12:02:31 »
В новом калькуляторе Вадима Веренича неандертальцы и денисовцы попали в один кластер с бушменами (Bushmen 99,97). Мне кажется, это потому, что они тоже были включены в расчет компонентов, иначе "эффект калькулятора" добавил бы им немного неафриканского происхождения.
Все-таки, видимо, смешивания людей современного типа и неандертальцев/денисовцев не было
Слегка упрощая, небольшая часть от изначального генетического разнообразия исчезла у африканцев и сохранилась одновременно у европейцев/азиатов и неандертальцев/денисовцев. Хотя есть заметно больше снипов, которые сохранились у неандертальцев/денисовцев и африканцев, но "вымылись" у европейцев и азиатов. По мере удаления людей от Африки генетическое разнообразие снижается.
короче ничего не понятно. то писали что у африканцев нет примеси неандертальцев вообще, , то пишут что общих снипов с ними под сто процентов.
чушь полная,  если честно.
 ;D короче количество взамоисключающих параграфов в последних публикациях по неандертальцам переваливает все допустимые рамки))
« Последнее редактирование: 21 Август 2013, 12:30:27 от SSlava »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #20 : 21 Август 2013, 16:29:42 »
то писали что у африканцев нет примеси неандертальцев вообще, , то пишут что общих снипов с ними под сто процентов.
Правильно так: этно-специфичные снипы человека, которые есть у неандертальцев, в основном африканские. По поводу примеси -  у человека нет примеси шиманзе, тем не менее, 99% (или сколько там нынче считается) общих генов с ними из-за общности происхождения. Общих снипов, конечно, поменьше, но тоже найдется изрядно.

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 942
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-107
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #21 : 21 Август 2013, 18:42:13 »
Цитировать
Правильно так: этно-специфичные снипы человека, которые есть у неандертальцев, в основном африканские.
А откуда взялись новые снипы, не африканские?
И очень много их))

Оффлайн SSlava

  • Сообщений: 942
  • Страна: 00
  • Рейтинг +63/-107
  • Y-ДНК: J-CTS6804
Re: GEDmatch Neandertal&Denisov Compare
« Ответ #22 : 21 Август 2013, 18:43:36 »
Цитировать
По поводу примеси -  у человека нет примеси шиманзе, тем не менее, 99% (или сколько там нынче считается) общих генов с ними из-за общности происхождения. Общих снипов, конечно, поменьше, но тоже найдется изрядно.
Хм, так есть или нет примесь неандертальцев у человека?))
Вот недавно только говорили, что у африканцев ее практически нет, зато есть у всех европейцев))
Что это за снипы?))
Хм, и там то сравнение вроде и не по ним считает вообще на Гедматче?))

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1143
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1682/-11
  • Y-ДНК: G2a1

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.