АвторТема: C3 — Новые SNP  (Прочитано 17169 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #45 : 02 Февраль 2014, 17:31:03 »
Заказал кит для Дербет Ойрата.

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #46 : 09 Февраль 2014, 19:25:13 »
Пришли долгожданные и очень важные результаты: N14102  Savoy C3b P39+, L1373+, L1368-, L1369-

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #47 : 09 Февраль 2014, 19:53:01 »
Пришли долгожданные и очень важные результаты: N14102  Savoy C3b P39+, L1373+, L1368-, L1369-
Теперь L1373+ разделились на две ветки
• L1373+
• • L1368+, L1369+
• • • * (Tanaka from Japan)
• • • M48+ (C3c)
• • • F4002+ (Starcluster)
• • • P53+
• • F3918+
• • • P39+ (American Indian)
• • • F1756+ (DYS448=0)

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #48 : 10 Февраль 2014, 12:15:35 »
С учетом Биг У Танаки будет интересно посмотреть что выйдет.

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #49 : 10 Февраль 2014, 14:52:21 »
С учетом Биг У Танаки будет интересно посмотреть что выйдет.

Интересно будет узнать, что вообще будет представлять собой Big Y ))

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #50 : 10 Февраль 2014, 16:51:10 »
Расширенный WTY и Geno2
2 в одном.

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #51 : 10 Февраль 2014, 17:02:57 »
Расширенный WTY и Geno2
2 в одном.

Уже появились первые результаты?

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #52 : 10 Февраль 2014, 17:07:39 »
нет, но я думаю по структуре файлы отличаться мало будут, а с учетом что это ФТДНА скорее всего формат будет похож на WTY

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Новое древо ISOGG Y-C
« Ответ #53 : 01 Март 2014, 22:49:01 »
ISOGG  изменил  древо теперь  С3 - это С2

http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpC.html

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #54 : 01 Март 2014, 23:14:51 »
Правильно сделали.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #55 : 01 Апрель 2014, 07:55:16 »
Ruslan KZ Kit No: 268426
M217+, CTS10083+, CTS10116+, CTS10144+, CTS10241+, CTS10271+, CTS10442+, CTS10509+, CTS10534+, CTS10628+, CTS10663+, CTS10720+, CTS10834+, CTS10859+, CTS1097+, CTS11149+, CTS11354+, CTS11412+, CTS11544+, CTS1169+, CTS11820+, CTS12051+, CTS12472+, CTS12879+, CTS1367+, CTS1417+, CTS1518+, CTS1530+, CTS1532+, CTS1533+, CTS1795+, CTS2108+, CTS2267+, CTS2377+, CTS244+, CTS2550+, CTS2619+, CTS2626+, CTS2636+, CTS2637+, CTS2638+, CTS2639+, CTS2709+, CTS280+, CTS284+, CTS2941+, CTS2955+, CTS2988+, CTS2992+, CTS3067+, CTS3075+, CTS3231+, CTS3321+, CTS3430+, CTS358+, CTS3597+, CTS3649+, CTS3650+, CTS3658+, CTS3818+, CTS3850+, CTS3910+, CTS4032+, CTS4339+, CTS4437+, CTS46+, CTS4934+, CTS5151+, CTS5383+, CTS5410+, CTS5441+, CTS5454+, CTS5522+, CTS5874+, CTS5948+, CTS6009+, CTS6266+, CTS6285+, CTS6376+, CTS6378+, CTS6492+, CTS6723+, CTS6843+, CTS6865+, CTS6916+, CTS6985+, CTS7120+, CTS719+, CTS7275+, CTS7355+, CTS7507+, CTS7930+, CTS8127+, CTS8148+, CTS8216+, CTS8301+, CTS8325+, CTS8350+, CTS8507+, CTS8508+, CTS8595+, CTS8643+, CTS8896+, CTS914+, CTS93+, CTS9364+, CTS9456+, CTS9677+, CTS9679+, CTS9733+, CTS9757+, F1029+, F1030+, F1044+, F1090+, F1118+, F1140+, F1191+, F1208+, F1217+, F1219+, F1241+, F1245+, F1288+, F1307+, F1367+, F1396+, F1415+, F1490+, F15+, F1597+, F1622+, F1646+, F1677+, F1678+, F1688+, F1699+, F1717+, F1727+, F1743+, F1788+, F1804+, F1871+, F1905+, F1906+, F1911+, F1963+, F1987+, F1996+, F2111+, F2146+, F2166+, F2211+, F2253+, F2258+, F2282+, F2305+, F2327+, F2379+, F2386+, F2434+, F2446+, F2449+, F2485+, F2501+, F2512+, F2606+, F2607+, F2620+, F2632+, F2649+, F2661+, F2664+, F2670+, F2673+, F2678+, F2695+, F2718+, F2774+, F2792+, F2803+, F2808+, F2847+, F2858+, F2869+, F2888+, F2897+, F2909+, F2951+, F2969+, F2992+, F3032+, F3043+, F3068+, F3082+, F3122+, F3127+, F3174+, F3311+, F3319+, F3324+, F3333+, F3348+, F3388+, F3395+, F3396+, F3400+, F3410+, F3411+, F3447+, F3462+, F3464+, F3535+, F3537+, F3553+, F3581+, F3643+, F3670+, F3695+, F3696+, F3698+, F3702+, F3703+, F3712+, F3718+, F3719+, F3738+, F3751+, F3752+, F3765+, F3768+, F3769+, F3776+, F3783+, F3787+, F3805+, F3815+, F3831+, F3851+, F3862+, F3877+, F3892+, F3904+, F3908+, F3914+, F3923+, F3927+, F3929+, F3950+, F3951+, F3952+, F3953+, F3954+, F3972+, F3977+, F3980+, F3981+, F3982+, F3986+, F4000+, F4003+, F4010+, F4012+, F4025+, F4032+, F4039+, F4042+, F552+, F734+, F757+, F791+, F847+, F882+, F894+, F909+, F917+, F936+, IMS-JST002612+, IMS-JST022448_6+, IMS-JST022449_6+, K511+, L1002+, L1004+, L1005+, L1009+, L1013+, L1028+, L104+, L105+, L1053+, L1060+, L1061+, L1062+, L1071+, L108+, L1089+, L1090+, L1095+, L1098+, L1099+, L110+, L1101+, L1105+, L1112+, L1116+, L1118+, L1120+, L1121+, L1123+, L1124+, L1125+, L1127+, L1129+, L113+, L1132+, L1135+, L1136+, L1137+, L114+, L1142+, L1143+, L1145+, L1150+, L1155+, L1179+, L1184+, L1220+, L1225+, L1235+, L128+, L132+, L1370+, L1372+, L1373+, L141+, L1441+, L1462+, L1480+, L1492+, L244+, L292+, L403+, L413+, L418+, L438+, L440+, L604+, L74+, L76+, L777+, L957+, L962+, L969+, L970+, L977+, L985+, L986+, L989+, M130+, M168+, M216+, M217+, M251+, M252+, M256+, M270+, M294+, M299+, M42+, M48+, M77+, M86+, M94+, NGC1+, NGC5+, NGC9+, P108+, P143+, P19_1+, P255+, P260+, P27.1_2+, P305+, P44+, P48+, P9.1+, P97+, PAGES00026+, PAGES00081+, PAGES00085+, PF1014+, PF1062+, PF1179+, PF1378+, PF1389+, PF1402+, PF1403+, PF1405+, PF1407+, PF1408+, PF1410+, PF1411+, PF1412+, PF1413+, PF1414+, PF1415+, PF1417+, PF1418+, PF1419+, PF1580+, PF1842+, PF1911+, PF1914+, PF1915+, PF1916+, PF2723+, PF2862+, PF3561+, PF5498+, PF5884+, PF6021+, PF6039+, PF6079+, PF6082+, PF6139+, PF955+, PF956+, PK1+, PR1220+, PR202+, PR2119+, PR5761+, PR855+, SRY10831.1+, V221+, V238+, V241+, V250+, V71+, V77+, Y842+, YSC0000057+, YSC0000077+, YSC0000081+, YSC0000107+, YSC0000108+, YSC0000109+, YSC0000110+, YSC0000193+, YSC0000207+, YSC0000227+, YSC0000350+, YSC0000624+, YSC0000913+, Z1001+, Z1114+, Z1199+, Z1331+, Z1415+, Z1435+, Z1455+, Z1456+, Z1459+, Z1654+, Z1718+, Z1733+, Z177+, Z1802+, Z1925+, Z2065+, Z2212+, Z2235+, Z2344+, Z2380+, Z2975+, Z380+, Z47+, Z5997+, Z6030+, Z6032+, Z740+, Z848+, Z923+, Z96+, ZS167+

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2133
  • Рейтинг +587/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #56 : 01 Апрель 2014, 12:28:40 »
Новые снипы, выявленные в результате обработки БАМ файлов статьи Lippold et al. (2014) в образцах С3с1-М77,М86.
Это три орочона (HGDP01204, 01206, 01208), два сибо (HGDP01247, 01250), один уйгур HGDP01302 - все из Китая.

Координаты указаны в GRCh37/hg19:

8 395 838 C -> T
8 480 384 G -> A
8 592 725 A -> G
15 043 282 A -> T
17 673 490 A -> G
21 053 145 A -> T
21 760 973 A -> T

Уровни снипов неизвестны, но эти мутации отсутствуют в образцах HGDP01205, 01230 - C3 старкластер. То есть в любом случае ниже L1373
Прошу посмотреть эти мутации в novel снипах образца 268426, а также еще:

19 188 381 G -> C

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #57 : 01 Апрель 2014, 13:24:58 »
Новые снипы, выявленные в результате обработки БАМ файлов статьи Lippold et al. (2014) в образцах С3с1-М77,М86.
Это три орочона (HGDP01204, 01206, 01208), два сибо (HGDP01247, 01250), один уйгур HGDP01302 - все из Китая.

Координаты указаны в GRCh37/hg19:

8 395 838 C -> T
8 480 384 G -> A
8 592 725 A -> G
15 043 282 A -> T
17 673 490 A -> G
21 053 145 A -> T
21 760 973 A -> T

Уровни снипов неизвестны, но эти мутации отсутствуют в образцах HGDP01205, 01230 - C3 старкластер. То есть в любом случае ниже L1373
Прошу посмотреть эти мутации в novel снипах образца 268426, а также еще:

19 188 381 G -> C

все так же, кроме первого (не проверялся). 

возможно они выше или на уровне L1372

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2133
  • Рейтинг +587/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #58 : 01 Апрель 2014, 14:07:06 »
Спасибо, уважаемый Gabriel.
Этот образец дает начало полноценному изучению гаплогруппы С-М48. Одним махом можно встать на уровень других, более изученных гаплогрупп (пока!). Есть ли план дальнейших действий?

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8267
  • Страна: kz
  • Рейтинг +751/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #59 : 01 Апрель 2014, 14:09:57 »
Спасибо, уважаемый Gabriel.
Этот образец дает начало полноценному изучению гаплогруппы С-М48. Одним махом можно встать на уровень других, более изученных гаплогрупп (пока!). Есть ли план дальнейших действий?
По идее нужно Биг У-и заказывать многим С2.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100