АвторТема: C3 — Новые SNP  (Прочитано 15646 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
C3 — Новые SNP
« : 07 Август 2013, 19:42:26 »
Ассаляму ъалейкум!
Предлагаю здесь писать новые найденные SNP у представителей C3
В 23andme у двух C3-M217 (rs2032668) заметил новый SNP L69+ (rs9786274) (мультигаплогрупный)
Ссылка на 23andme результаты: http://digilander.libero.it/asquecco/ZIP_Files/Y_DNA-Forums_a.zip
Таблицы периодически обновляются: https://www.facebook.com/pages/YDNA-SNPs-Comparison-Project/166307390055000?fref=ts
« Последнее редактирование: 07 Август 2013, 19:53:07 от Migifbug »

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7954
  • Страна: kz
  • Рейтинг +695/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #1 : 28 Август 2013, 07:42:28 »
А у кого этот снип нашли?
У алшинов?

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #2 : 28 Август 2013, 08:04:32 »
А у кого этот снип нашли?
У алшинов?
Нет...
Jeong и An_C3
M217+ (rs2032668  — СС)
P44+ (i4000194 — AA)
M48- (i3000070 — AA)
M86- тоже...

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #3 : 24 Сентябрь 2013, 08:49:49 »
Experimental tree:
• C3 M217, P44, Z1453
• • C3a M93
• • C3b P62
• • C3c IMS-JST002613-27
• • C3d Z1338/F2613
• • • C3d1 Z1300
• • • • C3e1a M407
• • C3e L1373
• • • C3e1 F3918
• • • • C3e1a P39
• • • • C3e1b F1756 (Del448cluster)
• • • C3e2 L1368, L1369
• • • • C3e2a P53.1
• • • • C3e2b F4002 (Starcluster)
• • • • C3e2c M48
• • • • • C3e2c1 M77, M86, L1370, L1372
• • • • • • C3e2c1a1 L1367, L1371

1. Не нашел ниодного M48 с отрицательными L1370, L1372, значит они могут оказаться даже выше M48, значит их можно проверить Старкластеру
2. У • • • • C3e2a P53.1 подтвердился L1373+ (Stout & Belesov) теперь надо проверить L1368, L1369
3. У • • • • C3e1a P39 в проверке L1368, L1369

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7954
  • Страна: kz
  • Рейтинг +695/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #4 : 24 Сентябрь 2013, 09:04:26 »
Старкластер подтвердил L1368+, L1369+?

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #5 : 24 Сентябрь 2013, 09:19:01 »
Старкластер подтвердил L1368+, L1369+?
Нет ещё, но он полуавтоматом (Танака подтвержден, а он теоретически от M48 дальше, чем старкластер), но лучше бы проверить конечно же

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2071
  • Рейтинг +523/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #6 : 19 Октябрь 2013, 08:09:02 »
В работе Yan et al. (2013) Y Chromosomes of 40% Chinese Are Descendants of Three Neolithic Super-grandfathers
http://arxiv.org/abs/1310.3897
опубликованы снипы монгола из Внутренней Монголии (образец YCH168), Y-STR гаплотип которого относится к старкластеру С3.
В построенном авторами Yan et al. (2013) генеалогическом дереве образец YCH168 формирует отдельную ветвь с 38 мутациями:

1. F3827+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
2. F3834+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
3. F914+.
4. F3845+.
5. F966+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
6. F3747+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
7. F3886+.
8. F3897+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
9. F4141+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
10. F3757+.
11. F1630+.
12. F1687+.
13. F3919+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
14. F3770+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
15. F1918+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
16. F2007+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
17. F3939+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
18. F3779+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
19. F3945+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
20. F3960+.
21. F3791+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
22. F3795+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
23. F3796+.
24. F2914+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
25. F3991+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
26. F3996+.
27. F4002+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
28. F3810+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
29. F4023+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
30. F4026+.
31. F4031+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
32. F4039+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov. Обнаружена и у C3e-P53.1.
33. F3618+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov.
34. F3815+.
35. F4346+.
36. F4042+. Эта мутация есть также у N114402 Mogzolov. Обнаружена и у C3e-P53.1.
37. F4044+.
38. F2872+.
У образцов YCH168 и N114402 - 24 общих мутаций. По-видимому, среди них и надо искать снип, маркирующий весь старкластер. Снип F4002 входит в этот список.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7954
  • Страна: kz
  • Рейтинг +695/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #7 : 19 Октябрь 2013, 08:47:15 »
Спасибо за информацию, подскажите откуда вы список снипов увидели?
В статье есть количество снипов, но перечня нет.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2071
  • Рейтинг +523/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #8 : 19 Октябрь 2013, 08:54:19 »
Часть дополнительной информации не вошла в pdf файл. Экселовские таблицы в архиве:
https://www.dropbox.com/s/fkjwb2dw9ahytqw/%5BarXiv-1310.3897v1%5DYan%20S_2013_Y%20Chromosomes%20of%2040percent%20Chinese%20Are%20Descendants%20of%20Three%20Neolithic%20Super-grandfathers.zip


Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 7954
  • Страна: kz
  • Рейтинг +695/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #9 : 19 Октябрь 2013, 09:02:02 »
Спасибо.

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #10 : 19 Октябрь 2013, 10:29:21 »
У образцов YCH168 и N114402 - 24 общих мутаций. По-видимому, среди них и надо искать снип, маркирующий весь старкластер. Снип F4002 входит в этот список.

Мы с ISOGG этот СНиП уже проверяем.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2071
  • Рейтинг +523/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #11 : 19 Октябрь 2013, 11:05:24 »
...СНиП...
СНиП - Строительные Нормы и Правила  ;D. Чувствуется техническое образование. ;)

Оффлайн Gabriel

  • Сообщений: 241
  • Страна: kz
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: C3b2a [FTDNA: C3c] L1370, L1371, L1367 - alshin cls.
  • мтДНК: U2e1b1
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #12 : 19 Октябрь 2013, 13:18:46 »
...СНиП...
СНиП - Строительные Нормы и Правила  ;D. Чувствуется техническое образование. ;)

Техническое,  но не в этой направлении, а Информационные технологии.  Так же и гуманитарное имеется.

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #13 : 20 Октябрь 2013, 11:45:16 »
Experimental tree:
• C3 M217, P44, Z1453
• • C3a M93
• • C3b P62
• • C3c IMS-JST002613-27
• • C3d Z1338/F2613
• • • C3d1 Z1300
• • • • C3e1a M407
• • C3e L1373
• • • C3e1 F3918
• • • • C3e1a P39
• • • • C3e1b F1756 (Del448cluster)
• • • C3e2 L1368, L1369
• • • • C3e2a P53.1
• • • • C3e2b F4002 (Starcluster)
• • • • C3e2c M48
• • • • • C3e2c1 M77, M86, L1370, L1372
• • • • • • C3e2c1a1 L1367, L1371

1. Не нашел ниодного M48 с отрицательными L1370, L1372, значит они могут оказаться даже выше M48, значит их можно проверить Старкластеру
2. У • • • • C3e2a P53.1 подтвердился L1373+ (Stout & Belesov) теперь надо проверить L1368, L1369
3. У • • • • C3e1a P39 в проверке L1368, L1369
14143 Stout L1368+, L1369+, L1373+
Экспериментальное дерево относительно P53.1 подтвердилось
Experimental tree:
• C3 M217, P44, Z1453
• • C3a M93
• • C3b P62
• • C3c IMS-JST002613-27
• • C3d Z1338/F2613
• • • C3d1 Z1300
• • • • C3e1a M407
• • C3e L1373
• • • C3e1 F3918
• • • • C3e1a P39
• • • • C3e1b F1756 (Del448cluster)
• • • C3e2 L1368, L1369
• • • • C3e2a P53.1
• • • • C3e2b F4002 (Starcluster)
• • • • C3e2c M48
• • • • • C3e2c1 M77, M86, L1370, L1372
• • • • • • C3e2c1a1 L1367, L1371
Осталось откорректировать уровень L1368, L1369 (может быть чуть древнее) и уровень L1370 и L1372 относительно SNP M48, M77, M86, при этом уже известно, что L1372 выше (древнее), чем L1370
Попросил уважаемого Stout проверить ещё L1370 и L1372

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2071
  • Рейтинг +523/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: C3 — Новые SNP
« Ответ #14 : 30 Октябрь 2013, 12:56:40 »
202353 Gotov: F4002+

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100