АвторТема: Геномы высших приматов  (Прочитано 2692 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Геномы высших приматов
« : 05 Июль 2013, 09:47:05 »
Опубликованы результаты нового крупномасштабного исследования геномов высших приматов.

В журнале “Nature” 3 июля 2013 г. опубликована статья «Генетическое разнообразие и популяционная история высших приматов», подписанная 55 генетиками (лидеры группы – Ксавьер Прадо-Мартинес из Института эволюционной биологии в Барселоне и Питер Садмант из университета штата Вашингтон в Сиэтле).

Авторы изучили 89 млн точечных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) у 79 представителей различных подвидов всех шести видов крупных человекообразных обезьян – шимпанзе, горилл и орангутанов, – а также у 9 людей (трех африканцев и шести жителей других континентов). 

http://antropogenez.ru/single-news/article/323/
« Последнее редактирование: 05 Июль 2013, 10:02:09 от пенелопа »

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #1 : 05 Июль 2013, 09:54:40 »
Great ape genetic diversity and population history

    Nature
    (2013)
    doi:10.1038/nature12228

Received 30 December 2012 Accepted 26 April 2013 Published online 03 July 2013
   
    Javier Prado-Martinez,   
    Peter H. Sudmant,   
    Jeffrey M. Kidd,   
    Heng Li,   
    Joanna L. Kelley,   
    Belen Lorente-Galdos,   
    Krishna R. Veeramah,   
    August E. Woerner,   
    Timothy D. O’Connor,   
    Gabriel Santpere,   
    Alexander Cagan,   
    Christoph Theunert,   
    Ferran Casals,   
    Hafid Laayouni,   
    Kasper Munch,   
    Asger Hobolth,   
    Anders E. Halager,   
    Maika Malig,   
    Jessica Hernandez-Rodriguez,   
    Irene Hernando-Herraez,   
    Kay Prüfer,   
    Marc Pybus,   
    Laurel Johnstone,   
    Michael Lachmann,   
    Can Alkan   
    et al.

"Most great ape genetic variation remains uncharacterized1, 2; however, its study is critical for understanding population history3, 4, 5, 6, recombination7, selection8 and susceptibility to disease9, 10. Here we sequence to high coverage a total of 79 wild- and captive-born individuals representing all six great ape species and seven subspecies and report 88.8 million single nucleotide polymorphisms. Our analysis provides support for genetically distinct populations within each species, signals of gene flow, and the split of common chimpanzees into two distinct groups: Nigeria–Cameroon/western and central/eastern populations. We find extensive inbreeding in almost all wild populations, with eastern gorillas being the most extreme. Inferred effective population sizes have varied radically over time in different lineages and this appears to have a profound effect on the genetic diversity at, or close to, genes in almost all species. We discover and assign 1,982 loss-of-function variants throughout the human and great ape lineages, determining that the rate of gene loss has not been different in the human branch compared to other internal branches in the great ape phylogeny. This comprehensive catalogue of great ape genome diversity provides a framework for understanding evolution and a resource for more effective management of wild and captive great ape populations".

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature12228.html
« Последнее редактирование: 05 Июль 2013, 10:02:21 от пенелопа »

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #2 : 05 Июль 2013, 10:46:48 »
Интересно, насколько корректным будет продложение дерева Y-SNP вниз, до высших приматов?

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #3 : 05 Июль 2013, 12:09:06 »
Интересно, насколько корректным будет продложение дерева Y-SNP вниз, до высших приматов?
Некорректным.
У людей всех видов (включая неандертальцев, денисовцев и, даже австралопитеков) 23 пары хромосомы, а у остальных приматов, 24 пары.

Так что на нашей Y-ДНК что-то залетело с исчезнувшей аутосомы приматов. А там, у общих предков людей и остальных приматов, этот участок должен был подвергаться рекомбинации.

Оффлайн mladshij

  • Сообщений: 801
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-0
  • Darth Vader
  • Y-ДНК: R1a-Z92 -> YP569 -> Y85137
  • мтДНК: H1
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #4 : 05 Июль 2013, 12:38:33 »
Интересно, насколько корректным будет продложение дерева Y-SNP вниз, до высших приматов?
Некорректным.
У людей всех видов (включая неандертальцев, денисовцев и, даже австралопитеков) 23 пары хромосомы, а у остальных приматов, 24 пары.

Так что на нашей Y-ДНК что-то залетело с исчезнувшей аутосомы приматов. А там, у общих предков людей и остальных приматов, этот участок должен был подвергаться рекомбинации.

Неверно. Хромосома не исчезла. Произошло слияние хромосом 2A и 2B и получилась 2-ая хромосома человека. Y-хромосома не имеет никакого отношения к данному процессу. Она осталась "как есть".

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #5 : 05 Июль 2013, 12:55:08 »

mladshij
Цитировать
Произошло слияние хромосом 2A и 2B и получилась 2-ая хромосома человека. Y-хромосома не имеет никакого отношения к данному процессу.

Все правильно.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17097
  • Страна: az
  • Рейтинг +5908/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Геномы высших приматов
« Ответ #6 : 29 Декабрь 2023, 07:59:51 »
Dynamic evolution of great ape Y chromosomes

Линия человека (Homo) разошлась с линиями шимпанзе (Pan), гориллы (Gorilla) и орангутанга (Pongo) ~6, ~7 и ~13 млн лет назад соответственно. Линии бонобо и шимпанзе (также принадлежащие к роду Pan) разошлись примерно 1 млн лет назад.

Упрощённая схема:



Наукообразная диаграмма (те же плюс макак):



 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.