АвторТема: Геном неандертальца сделали общедоступным  (Прочитано 10235 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1111/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #15 : 01 Апрель 2013, 22:34:51 »
И что бы это значило?
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest/50959/0/
Nea
то что неандерталец микс из R1a и R1b   ;D днк археологов

Хватали кости грязными руками. Печально:(
Если меня пригласят на раскопки - учту.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #16 : 01 Апрель 2013, 22:37:47 »
И что бы это значило?
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest/50959/0/
Nea
то что неандерталец микс из R1a и R1b   ;D днк археологов

Хватали кости грязными руками. Печально:(
Если меня пригласят на раскопки - учту.
если серьезно, то странный сиквенс

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #17 : 02 Апрель 2013, 08:34:06 »
Кстати, никто не обратил внимания:

Все эти неточности, указывающие на загрязнения сапиенсом останков неандертальцев, сводят на нет все статейки о наличии процентов неандертальской ДНК у современного человека.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8725
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #18 : 02 Апрель 2013, 09:19:43 »
Кстати, никто не обратил внимания:

Все эти неточности, указывающие на загрязнения сапиенсом останков неандертальцев, сводят на нет все статейки о наличии процентов неандертальской ДНК у современного человека.
Особенно когда утверждают, что у европейцев неандертальской ДНК больше.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1111/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #19 : 02 Апрель 2013, 09:49:02 »
Вот так рушатся красивые теории.
Как отмечено у одного нашего коллеги по форуму: На одном факте теорию не построишь, а вот разрушить уже построенную ему ничего не стоит.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #20 : 02 Апрель 2013, 09:50:49 »
Особенно когда утверждают, что у европейцев неандертальской ДНК больше.
Или перефразировав: можно утверждать, что археологов европейцев больше. :)

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1048
  • Рейтинг +142/-1
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #21 : 02 Апрель 2013, 10:20:26 »
Шад
Цитировать
Всё таки контаминация, ошибка прочтения или что-то другое?
Получается - либо контаминация, либо (как предполагал И.Рожанский, и Т.Кран не исключает) там вообще нет У ДНК. А те фрагменты, которые идентифицируются как Y, имеют гомологию в аутосомах и Х.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #22 : 02 Апрель 2013, 10:27:30 »
Вот так рушатся красивые теории.
Как отмечено у одного нашего коллеги по форуму: На одном факте теорию не построишь, а вот разрушить уже построенную ему ничего не стоит.
Насколько я понимаю, эти сведения еще ничего не опровергают, т.к. Y делали, скорее всего, по остаточному принципу.
Те нестыковки, которые есть, могут быть по причине скудности данных, и как следствие невозможности правильного выравнивания.
Можно сравнить у неандертальца "вес" файла с Y по отношению к файлам с данными остальным хромосом.
1 хромосома - 13 Gb - 247199719np
Y - 330 Mb - 57741652np
При равном качестве Y должен "весить" ~1/4 от 1 хромоcомы, а мы видим соотношение 1/40
Это конечно сильно упрощенно, но дает понимание о порядках разницы в качестве прочтения разных хромосом.



Оффлайн kirroid

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1071
  • Страна: by
  • Рейтинг +338/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #23 : 25 Сентябрь 2014, 06:06:27 »
Наткнулся сегодня утром на очень интересную  Афтор использовал BAM опубликованного генома неандертальца, чтобы посмотреть мутации на его Y хромосоме. Результат, к его удивлению, прекрасно лег на дерево ISOGG и показал, что неандерталец был носителем гаплогруппы R.

Cтатья тут - http://www.reddit.com/r/genetics/comments/2gt9d2/denisova_cave_neanderthal_was_ydna_haplogroup_r/

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #24 : 25 Сентябрь 2014, 06:25:59 »
Наткнулся сегодня утром на очень интересную  Афтор использовал BAM опубликованного генома неандертальца, чтобы посмотреть мутации на его Y хромосоме. Результат, к его удивлению, прекрасно лег на дерево ISOGG и показал, что неандерталец был носителем гаплогруппы R.

Cтатья тут - http://www.reddit.com/r/genetics/comments/2gt9d2/denisova_cave_neanderthal_was_ydna_haplogroup_r/
R1a Z280+. Мы писали об этом около года назад. Похоже на контаминацию.
« Последнее редактирование: 25 Сентябрь 2014, 06:43:00 от Semargl »

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5661
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #25 : 25 Сентябрь 2014, 08:06:35 »
Темы-клоны объединены.

Оффлайн Averoes

  • Сообщений: 206
  • Страна: ru
  • Рейтинг +14/-1
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #26 : 25 Сентябрь 2014, 14:05:06 »
Почему так остро стоит проблема загрязнения ископаемых останков современным материалом? Разве ДНК извлекают не изнутри кости?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5661
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-12
  • мтДНК: H1b
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #27 : 25 Сентябрь 2014, 16:10:45 »
Извлекают. Зубы и кости - очень пористый материал.
Видели кость под микроскопом? Решето...

Картинка из инета наугад:



Оффлайн Migifbug

  • Сообщений: 422
  • Страна: kz
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #28 : 25 Сентябрь 2014, 19:00:36 »
Как Вы смотрите на то, чтобы загрузить неандертальца в Yfull и сделать ему бесплатную интерпретацию? :)

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1063
  • Страна: ru
  • Рейтинг +81/-4
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #29 : 25 Сентябрь 2014, 19:23:32 »
какой интерес к баму проснулся ))

При попытке скачать :
Цитировать
В данный момент просмотр и скачивание этого файла недоступны.

За последнее время этот файл просматривали или скачивали слишком часто. Повторите попытку позже. Если файл очень большой или открыт для доступа широкому кругу пользователей, возможен отказ в доступе к нему в течение ближайших суток. Если через 24 часа ситуация не изменится, обратитесь к администратору домена.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100