АвторТема: Геном неандертальца сделали общедоступным  (Прочитано 10241 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Алтайский неандерталец оказался R1a ;D
По дереву ISOGG v8.02 от 3 January 2013 он R1a1a1b1a
Z282+

ps на правах шутки, но Z282 у него положительный

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
меньше надо было кости руками трогать  ;D

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5213
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2480/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
меньше надо было кости руками трогать  ;D
Зато работу опубликовали. ;)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1437/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Алтайский неандерталец оказался R1a ;D
По дереву ISOGG v8.02 от 3 January 2013 он R1a1a1b1a
Z282+

ps на правах шутки, но Z282 у него положительный

Че ща на родстве твориться.  :D

Оффлайн RomanS

  • Сообщений: 2340
  • Страна: cx
  • Рейтинг +500/-0
http://www.vesti.ru/doc.html?id=1061225

Денисова пещера на Алтае — золотая жила для биологов, антропологов, генетиков и даже археологов. Она состоит из более чем 20 культурных слоёв различных эпох. Ещё в XIX веке учёные начали изучение артефактов, найденных во время раскопок в этой пещере. Именно там более 280 тысяч лет назад жили наши предки.

В 2010 году в руки доктору Сванте Пеэбо (Svante Pääbo) из Института эволюционной антропологии общества Макса Планка попала фаланга пальца неандертальца, найденная при раскопках в Денисовой пещере. Находка принадлежала русским учёным — Анатолию Деревянко и Михаилу Шунькову из Российской академии наук.

Генетический материал, содержавшийся в фаланге, учёные подвергли подробному анализу. Для того чтобы составить полную карту данных, каждая позиция генома 0,038-граммовой кости проверялась по 50 раз. Сделать это было необходимо, чтобы заметить даже малейшее отличие генома этого конкретного неандертальца от той информации, которую он унаследовал от своих родителей.

Отметим, что в Денисовой пещере жили не только неандертальцы, но и так называемый Денисовский человек. Хотя достоверность существования последнего до сих пор подвергается сомнениям в научном мире, можно сказать, что его геном существенно отличался от генома неандертальца.

Пеэбо и его команда несколькими годами ранее определили, что митохондриальная ДНК этого пальца отличается от ДНК современного человека по 385 нуклеотидам, тогда как ДНК неандертальца отличается от нашего всего по 202 нуклеотидам. Но тогда последовательности генома были проанализированы не так подробно, как в этот раз.

"Мы получили определённые знания по многим аспектам жизни и неандертальцев, и денисовских людей. Мы также улучшили наши знания об изменениях, которые произошли в геномах современных людей, когда они отделились от предков и пошли по своему пути развития", — говорит Пеэбо.

Результаты своих трудов учёные выложили в Интернет, чтобы каждый генетик смог работать с этим материалом. Такой подробный анализ генетических последовательностей неандертальца был проведён впервые. Можно сказать, что даже геном современного человека не был изучен столь пристально.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1112/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Не про эту расшифровку у нас на днях шутили?
Алтайский неандерталец оказался R1a ;D
По дереву ISOGG v8.02 от 3 January 2013 он R1a1a1b1a
Z282+

ps на правах шутки, но Z282 у него положительный

меньше надо было кости руками трогать  ;D
Зато работу опубликовали. ;)

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2723
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Некоторые снип-мутации встречаются в трёх разных гаплогруппах, независимо друг от друга. Почему бы и у неандартальца какая-то мутация случайно совпала с уже известными.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1112/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Некоторые снип-мутации встречаются в трёх разных гаплогруппах, независимо друг от друга. Почему бы и у неандартальца какая-то мутация случайно совпала с уже известными.

Кстати, действительно. Почему нет? А есть оригинал этой публикации?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5662
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1804/-12
  • мтДНК: H1b
Некоторые снип-мутации встречаются в трёх разных гаплогруппах, независимо друг от друга. Почему бы и у неандартальца какая-то мутация случайно совпала с уже известными.

Кстати, действительно. Почему нет? А есть оригинал этой публикации?
Там же есть ссылка, в сообщении: http://www.eva.mpg.de/neandertal/index.html
http://cdna.eva.mpg.de/neandertal/altai/bam/

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1048
  • Рейтинг +142/-1
Представлена У-хромосома. Это, кажется, первые данные по У. В ноябре прошлого года в краткой переписке с T.Krahn в ответ на пожелание удачи в работе, он ответил - I'd love to do Y research on male Neanderthal or Denisova samples but I didn't get a hold on such a sample yet.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1112/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Bonnie Schrack тоже это комментировала
Цитировать
Woo-hoo! I'm looking at a Neanderthal Y chromosome sequence! :-) We've been waiting a long, long time for this! Too cool. Big congratulations and thanks to Svante Paabo and his team for their great work, and G. Magoon for putting the data in a useful format for us all.
Далее там очень интересные комментарии.
https://www.facebook.com/bonnie.schrack/posts/10101673722518508

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1048
  • Рейтинг +142/-1
Шад
Цитировать
А есть оригинал этой публикации?
The group will present a paper describing the genome later this year. “But we make the genome sequence freely available now to allow other scientists to profit from it even
before it is published” says Pääbo.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1112/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1112/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #13 : 01 Апрель 2013, 22:15:54 »
Людмила

А можно ли сделать обзор последней информации по неандератальцу? Насколько я понимаю, Вы в этой теме продвинулись дальше остальных:
Сегодня, 21:16
Цитировать
Могу сообщить, что T.Krahn ответил на мое письмо по поводу У-неанд. :
To me it looks like most of the data is false mapping and maybe they didn't have any male
Neanderthal DNA after all.

Он пытался идентифицировать маркеры, которые предположительно могли иметь место после отделения неанд.ветви и до разделения А00 и А0-Т (PR202, PR855, PR1216, PR1219,PR1220, PR1273,PR1278,PR5761) и нашел, что многие из них имеют 2ую локализацию на Х и аутосомах, или находятся в проблематичной области центромеры).
Томас прислал всю базу данных по снипам, включая шимпанзе с гориллой ("I made a quick & dirty comparison with all known SNPs that I have").
Всё таки контаминация, ошибка прочтения или что-то другое?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10074
  • Страна: ru
  • Рейтинг +566/-2
Re: Геном неандертальца сделали общедоступным
« Ответ #14 : 01 Апрель 2013, 22:33:09 »
И что бы это значило?
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest/50959/0/
Nea
то что неандерталец микс из R1a и R1b   ;D днк археологов

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100