С3 - geno 2.0 results

[asan-kaygy]

N114310   Alkurdi   Jamil Alkurdi 1880-1968   CT   C-M168   CTS10116+, CTS10362+, CTS10762+, CTS1083+, CTS109+, CTS11144+, CTS11358+, CTS11489+, CTS11544+, CTS11575+, CTS11612+, CTS11820+, CTS12051+, CTS125+, CTS12652+, CTS1831+, CTS1854+, CTS1996+, CTS2+, CTS2267+, CTS2377+, CTS244+, CTS2457+, CTS2491+, CTS2848+, CTS3221+, CTS3331+, CTS336+, CTS3385+, CTS3430+, CTS3431+, CTS3662+, CTS3910+, CTS4021+, CTS4032+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4740+, CTS5004+, CTS5318+, CTS5410+, CTS5457+, CTS5532+, CTS6266+, CTS6383+, CTS6723+, CTS6800+, CTS6865+, CTS6866+, CTS6907+, CTS6934+, CTS7167+, CTS7355+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8148+, CTS8243+, CTS8395+, CTS8889+, CTS8980+, CTS93+, CTS9395+, CTS9828+, F1012+, F1030+, F1044+, F1067+, F1090+, F1093+, F1118+, F1140+, F1143+, F1144+, F1165+, F1208+, F1217+, F1219+, F1223+, F1241+, F1243+, F1245+, F1271+, F1288+, F1307+, F1323+, F1367+, F1382+, F1420+, F1453+, F1490+, F1506+, F1564+, F1574+, F1597+, F1622+, F1641+, F1646+, F1668+, F1677+, F1678+, F1688+, F1717+, F1727+, F1847+, F1871+, F1911+, F1938+, F1953+, F1963+, F1970+, F1996+, F2057+, F2067+, F2074+, F2111+, F2129+, F2146+, F2166+, F2226+, F2232+, F2253+, F2258+, F2259+, F2262+, F2302+, F2305+, F2331+, F2377+, F2379+, F2391+, F2442+, F2446+, F2449+, F2479+, F2485+, F2501+, F2512+, F2539+, F2606+, F2607+, F2613+, F2632+, F2645+, F2649+, F2664+, F2670+, F2678+, F2681+, F2689+, F2695+, F2718+, F2736+, F2745+, F2774+, F2792+, F2802+, F2803+, F2847+, F2849+, F2858+, F2888+, F2897+, F2909+, F2951+, F2969+, F2982+, F2988+, F3014+, F3043+, F3061+, F3068+, F3071+, F3076+, F3122+, F3174+, F3178+, F3183+, F3301+, F3313+, F3319+, F3320+, F3324+, F3333+, F3388+, F3395+, F3399+, F3400+, F3411+, F3454+, F3462+, F3487+, F3497+, F3537+, F3553+, F3565+, F3581+, F3611+, F3643+, F3670+, F3695+, F3696+, F3698+, F3702+, F3712+, F3718+, F3719+, F3744+, F3754+, F3758+, F3788+, F3789+, F3790+, F3809+, F3862+, F3879+, F3895+, F3911+, F3934+, F3952+, F3998+, F4004+, F4005+, F4010+, F4011+, F4045+, F734+, F767+, F791+, F847+, F882+, F894+, F907+, F909+, F917+, F936+, F950+, L566+, L781+, M130+, M139+, M168+, M216+, M294+, M42+, M94+, P184+, P255+, P260+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF15+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF263+, PF272+, PF278+, PF292+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF601+, PF667+, PF719+, PF720+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V183+, V189+, V199+, V232+, V52+, V77+, V9+, Z1300+, Z1303+

[Gabriel]

304254   Turkey    C3    13 24 16 10 11-15 11 13 12 13 11 29   

 CTS10116+, CTS10362+, CTS1083+, CTS109+, CTS11358+, CTS11544+, CTS11575+, CTS11820+, CTS12051+, CTS125+, CTS1831+, CTS1996+, CTS2267+, CTS2377+, CTS244+, CTS3221+, CTS3331+, CTS3430+, CTS3431+, CTS3662+, CTS3910+, CTS4032+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4740+, CTS5318+, CTS5410+, CTS5457+, CTS5532+, CTS6266+, CTS6383+, CTS6723+, CTS6800+, CTS6865+, CTS6907+, CTS7355+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8148+, CTS8243+, CTS8980+, CTS93+, CTS9828+, F1030+, F1044+, F1090+, F1140+, F1208+, F1217+, F1219+, F1241+, F1245+, F1288+, F1307+, F1367+, F1396+, F1490+, F1574+, F1597+, F1646+, F1677+, F1678+, F1688+, F1699+, F1717+, F1727+, F1756+, F1788+, F1871+, F1906+, F1911+, F1963+, F1996+, F2067+, F2111+, F2146+, F2166+, F2253+, F2258+, F2302+, F2305+, F2379+, F2386+, F2446+, F2449+, F2485+, F2501+, F2512+, F2606+, F2607+, F2632+, F2649+, F2661+, F2664+, F2670+, F2678+, F2695+, F2718+, F2774+, F2792+, F2803+, F2847+, F2858+, F2888+, F2897+, F2909+, F2951+, F2969+, F3043+, F3068+, F3122+, F3174+, F3319+, F3324+, F3333+, F3348+, F3388+, F3395+, F3400+, F3411+, F3447+, F3462+, F3537+, F3553+, F3581+, F3696+, F3698+, F3702+, F3712+, F3718+, F3719+, F3738+, F3752+, F3769+, F3776+, F3783+, F3787+, F3805+, F3825+, F3831+, F3844+, F3847+, F3851+, F3862+, F3868+, F3896+, F3904+, F3914+, F3918+, F3923+, F3927+, F3929+, F3931+, F3937+, F3950+, F3951+, F3952+, F3954+, F3955+, F3971+, F3972+, F3977+, F3980+, F3981+, F3982+, F3985+, F3986+, F4003+, F4006+, F4010+, F4012+, F4015+, F4017+, F4032+, F734+, F767+, F791+, F847+, F882+, F894+, F909+, F917+, F936+, L566+, L781+, M130+, M139+, M168+, M216+, M217+, M294+, M42+, M94+, P184+, P255+, P260+, P44+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF15+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF263+, PF272+, PF278+, PF292+, PF3123+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF601+, PF667+, PF719+, PF720+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V183+, V189+, V199+, V232+, V52+, V77+, V9+, Z1890+

[asan-kaygy]

304254   Turkey    C3    13 24 16 10 11-15 11 13 12 13 11 29   

 CTS10116+, CTS10362+, CTS1083+, CTS109+, CTS11358+, CTS11544+, CTS11575+, CTS11820+, CTS12051+, CTS125+, CTS1831+, CTS1996+, CTS2267+, CTS2377+, CTS244+, CTS3221+, CTS3331+, CTS3430+, CTS3431+, CTS3662+, CTS3910+, CTS4032+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4740+, CTS5318+, CTS5410+, CTS5457+, CTS5532+, CTS6266+, CTS6383+, CTS6723+, CTS6800+, CTS6865+, CTS6907+, CTS7355+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8148+, CTS8243+, CTS8980+, CTS93+, CTS9828+, F1030+, F1044+, F1090+, F1140+, F1208+, F1217+, F1219+, F1241+, F1245+, F1288+, F1307+, F1367+, F1396+, F1490+, F1574+, F1597+, F1646+, F1677+, F1678+, F1688+, F1699+, F1717+, F1727+, F1756+, F1788+, F1871+, F1906+, F1911+, F1963+, F1996+, F2067+, F2111+, F2146+, F2166+, F2253+, F2258+, F2302+, F2305+, F2379+, F2386+, F2446+, F2449+, F2485+, F2501+, F2512+, F2606+, F2607+, F2632+, F2649+, F2661+, F2664+, F2670+, F2678+, F2695+, F2718+, F2774+, F2792+, F2803+, F2847+, F2858+, F2888+, F2897+, F2909+, F2951+, F2969+, F3043+, F3068+, F3122+, F3174+, F3319+, F3324+, F3333+, F3348+, F3388+, F3395+, F3400+, F3411+, F3447+, F3462+, F3537+, F3553+, F3581+, F3696+, F3698+, F3702+, F3712+, F3718+, F3719+, F3738+, F3752+, F3769+, F3776+, F3783+, F3787+, F3805+, F3825+, F3831+, F3844+, F3847+, F3851+, F3862+, F3868+, F3896+, F3904+, F3914+, F3918+, F3923+, F3927+, F3929+, F3931+, F3937+, F3950+, F3951+, F3952+, F3954+, F3955+, F3971+, F3972+, F3977+, F3980+, F3981+, F3982+, F3985+, F3986+, F4003+, F4006+, F4010+, F4012+, F4015+, F4017+, F4032+, F734+, F767+, F791+, F847+, F882+, F894+, F909+, F917+, F936+, L566+, L781+, M130+, M139+, M168+, M216+, M217+, M294+, M42+, M94+, P184+, P255+, P260+, P44+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF15+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF263+, PF272+, PF278+, PF292+, PF3123+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF601+, PF667+, PF719+, PF720+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V183+, V189+, V199+, V232+, V52+, V77+, V9+, Z1890+

Морли рассортировало
C3  F3952R, F4010, F1574, CTS12051, CTS1831, CTS244, CTS3430, CTS5410, CTS6723, CTS6865, CTS7355, CTS93, F1090, F1140, F1219, F1245, F1597, F1622, F1646, F1677, F1678, F1688, F1717, F1963, F2111, F2166, F2379, F2512, F2632, F2649, F2664, F2670, F2695, F2718, F2951, F3068, F3122, F3174, F3324, F3333, F3553, F3695, F3696, F3702, F3718, F3862, F734, F791, F882, F894, P44, M217, Z1453
C3~2  F1756, F3825, F3844, F3868, F3896, F3918, F3931, F3937, F3955, F3971, F4006, F4017
C3~2~1  F180, F3647, PF4076, Z1890, F3613, F3666, F3830, F4015
C3~2~2  F3787

[asan-kaygy]

supposedly Oghuz Turk - Chepni clan - отцовское происхождение.

[Gabriel]

304254   Turkey    C3    13 24 16 10 11-15 11 13 12 13 11 29   

 CTS10116+, CTS10362+, CTS1083+, CTS109+, CTS11358+, CTS11544+, CTS11575+, CTS11820+, CTS12051+, CTS125+, CTS1831+, CTS1996+, CTS2267+, CTS2377+, CTS244+, CTS3221+, CTS3331+, CTS3430+, CTS3431+, CTS3662+, CTS3910+, CTS4032+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4740+, CTS5318+, CTS5410+, CTS5457+, CTS5532+, CTS6266+, CTS6383+, CTS6723+, CTS6800+, CTS6865+, CTS6907+, CTS7355+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8148+, CTS8243+, CTS8980+, CTS93+, CTS9828+, F1030+, F1044+, F1090+, F1140+, F1208+, F1217+, F1219+, F1241+, F1245+, F1288+, F1307+, F1367+, F1396+, F1490+, F1574+, F1597+, F1646+, F1677+, F1678+, F1688+, F1699+, F1717+, F1727+, F1756+, F1788+, F1871+, F1906+, F1911+, F1963+, F1996+, F2067+, F2111+, F2146+, F2166+, F2253+, F2258+, F2302+, F2305+, F2379+, F2386+, F2446+, F2449+, F2485+, F2501+, F2512+, F2606+, F2607+, F2632+, F2649+, F2661+, F2664+, F2670+, F2678+, F2695+, F2718+, F2774+, F2792+, F2803+, F2847+, F2858+, F2888+, F2897+, F2909+, F2951+, F2969+, F3043+, F3068+, F3122+, F3174+, F3319+, F3324+, F3333+, F3348+, F3388+, F3395+, F3400+, F3411+, F3447+, F3462+, F3537+, F3553+, F3581+, F3696+, F3698+, F3702+, F3712+, F3718+, F3719+, F3738+, F3752+, F3769+, F3776+, F3783+, F3787+, F3805+, F3825+, F3831+, F3844+, F3847+, F3851+, F3862+, F3868+, F3896+, F3904+, F3914+, F3918+, F3923+, F3927+, F3929+, F3931+, F3937+, F3950+, F3951+, F3952+, F3954+, F3955+, F3971+, F3972+, F3977+, F3980+, F3981+, F3982+, F3985+, F3986+, F4003+, F4006+, F4010+, F4012+, F4015+, F4017+, F4032+, F734+, F767+, F791+, F847+, F882+, F894+, F909+, F917+, F936+, L566+, L781+, M130+, M139+, M168+, M216+, M217+, M294+, M42+, M94+, P184+, P255+, P260+, P44+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF15+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF263+, PF272+, PF278+, PF292+, PF3123+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF601+, PF667+, PF719+, PF720+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V183+, V189+, V199+, V232+, V52+, V77+, V9+, Z1890+

Морли рассортировало
C3  F3952R, F4010, F1574, CTS12051, CTS1831, CTS244, CTS3430, CTS5410, CTS6723, CTS6865, CTS7355, CTS93, F1090, F1140, F1219, F1245, F1597, F1622, F1646, F1677, F1678, F1688, F1717, F1963, F2111, F2166, F2379, F2512, F2632, F2649, F2664, F2670, F2695, F2718, F2951, F3068, F3122, F3174, F3324, F3333, F3553, F3695, F3696, F3702, F3718, F3862, F734, F791, F882, F894, P44, M217, Z1453
C3~2  F1756, F3825, F3844, F3868, F3896, F3918, F3931, F3937, F3955, F3971, F4006, F4017
C3~2~1  F180, F3647, PF4076, Z1890, F3613, F3666, F3830, F4015
C3~2~2  F3787

Думаю нужно вручную сортировать по Raw Data.  Там есть спорные данные, которые при транспорте показывает +, а есть вообще другие мутации на том же участке, на которые вообще никак не реагирует чип.

[Migifbug]

А есть Raw Data его?
Может позже внесу их в таблицу, сейчас пока другим занят

[asan-kaygy]

Ок, будем ждать.

[Bilal]

Hi,
I just saw that you are looking at my data . Did you find anything interesting?
Do you need the raw data to tell more?

[asan-kaygy]

Hi,
I just saw that you are looking at my data . Did you find anything interesting?
Do you need the raw data to tell more?

Can you send it to my mail babasan@yandex.ru
I will resend it to others

[Migifbug]

Обновил таблицу: https://www.dropbox.com/s/vt8x4u2gwg1d9t7/CSNP_Geno2.xls
(Добавил новых людей человек 5, а к старым новые анализы не смотрел)
Raw Data пока не смотрел ещё (только 1 новый Raw Data файл высылали мне)...

[asan-kaygy]

рахмет.

[Gabriel]

Оно действительно отличается при транспортировки.   

F4031   T -> A        у меня  F4031,Y,A,A       

этого SNP почему то нет.   Он должен быть общим со старкластером.

В Raw Data у Старкластера, данный СНП под вопросом, так как при первой перегонки показал положительный результат, второй отрицательный.  Спорные моменты думаю стоит отмечать. Потом смотреть в других тестах. 

Интересно как воспринимать СНП если должно было переход A->T  а там G.  Как новый СНП?))

[Migifbug]

Оно действительно отличается при транспортировки.   

F4031   T -> A        у меня  F4031,Y,A,A       

этого SNP почему то нет.   Он должен быть общим со старкластером.

В Raw Data у Старкластера, данный СНП под вопросом, так как при первой перегонки показал положительный результат, второй отрицательный.  Спорные моменты думаю стоит отмечать. Потом смотреть в других тестах. 

Интересно как воспринимать СНП если должно было переход A->T  а там G.  Как новый СНП?))

Как по мне, так лучше игнорировать всё сомнительное, и не тратить время... потому что предыдущие разбирательства просто привели к тому, что там ошибки бывают вот и всё, сомнительное осталось сомнительным и толку 0...

[Gabriel]

Оно действительно отличается при транспортировки.   

F4031   T -> A        у меня  F4031,Y,A,A       

этого SNP почему то нет.   Он должен быть общим со старкластером.

В Raw Data у Старкластера, данный СНП под вопросом, так как при первой перегонки показал положительный результат, второй отрицательный.  Спорные моменты думаю стоит отмечать. Потом смотреть в других тестах. 

Интересно как воспринимать СНП если должно было переход A->T  а там G.  Как новый СНП?))

Как по мне, так лучше игнорировать всё сомнительное, и не тратить время... потому что предыдущие разбирательства просто привели к тому, что там ошибки бывают вот и всё, сомнительное осталось сомнительным и толку 0...

Я имел ввиду смотреть его в Биг Игрик или в Фулгеноме.

[Bilal]

Обновил таблицу: https://www.dropbox.com/s/vt8x4u2gwg1d9t7/CSNP_Geno2.xls
(Добавил новых людей человек 5, а к старым новые анализы не смотрел)
Raw Data пока не смотрел ещё (только 1 новый Raw Data файл высылали мне)...

These are mutations that are unique to my data (so far): F3985+, PF3123+, Z1890+.
You don't list any of them in your spreadsheet. Especially F3985+ could be interesting...