АвторТема: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп  (Прочитано 14671 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #15 : 19 Февраль 2013, 16:14:46 »
Поясню. При кроссинговере кусок Y вместе со снипом оказывается в X. Там он "живет" сколько-то поколений, а потом опять кроссинговер с Y - и этот кусок перебрасывает обратно. Но этот Y мог быть совсем другой гаплогруппы, чем тот, откуда взялся снип.
Теперь понятно. Но мне кажется,хотя могу ошибаться, что такое явление тоже очень редкое.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #16 : 27 Март 2013, 22:40:48 »
Новости от ISOGG. Теперь в номенклатуре отдельно обозначаются возвратные мутации. Выявленные снипы с обратной мутацией обозначаются восклицательным знаком.
Например:
у R1a1 снип  Page65.2!/SRY1532.2!/SRY10831.2!
Тот же снип с единичкой(.1) и без восклицательного знака характеризует всех ВТ , кроме конечно R1a1 и всех ниже по дереву, у которых прошла возвратная мутация.
См.: http://forum.molgen.org/index.php/topic,4641.msg179616.html#msg179616

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #17 : 30 Март 2013, 23:33:16 »
Поясню. При кроссинговере кусок Y вместе со снипом оказывается в X. Там он "живет" сколько-то поколений, а потом опять кроссинговер с Y - и этот кусок перебрасывает обратно. Но этот Y мог быть совсем другой гаплогруппы, чем тот, откуда взялся снип.
Теперь понятно. Но мне кажется,хотя могу ошибаться, что такое явление тоже очень редкое.

Начал читать сегодня Льва Самуиловича Клейна "Древние миграции и происхождение индоевропейских народов"... Что заставило задуматься? Его тезис о стереотипах мышления и желании выстроить древовидную структуру как схему какого-либо процесса. Тогда как жизнь сложнее. В связи с этим он предлагает представлять схему развития языков не в виде древовидной структуры, а в виде "дельты реки", отдельные рукава которой пересекаются. Если Alex AXe прав в своей догадке, то та же судьба ждет дерево снипов. Как дерево схема мутаций Y-хромосомы возможно и не представимо. Но если объяснить механизм "перескока" кроссинговером, то все может стать на свои места.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #18 : 30 Март 2013, 23:56:49 »
Думаю здесь нельзя провести параллели, мутации железо-бетонны, а язык нет. Это как говорить: "у него финно-угорские гены".

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #19 : 31 Март 2013, 00:08:14 »
Думаю здесь нельзя провести параллели, мутации железо-бетонны, а язык нет. Это как говорить: "у него финно-угорские гены".

Я тут не претендую на истину в последней инстанции. Просто отметил некий параллелизм в механизмах. Если конечно Alex AXe прав насчет кроссинговера.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #20 : 31 Март 2013, 02:18:42 »
В связи с этим он предлагает представлять схему развития языков не в виде древовидной структуры, а в виде "дельты реки", отдельные рукава которой пересекаются.
Очень интересно. Размышляя над языковым деревом, я пришёл к той же аналогии с "дельтой реки".
Но с Y-деревом ситуация совершенно другая.
Развитие языков мы не во всех местах можем выстроить древовидно не только от неполного нашего знания, но и потому, что объективно развитие не было древовидным.
В то же время развитие прямых мужских линий от "Y-Адама" (не условного, а абсолютно реального мужчины, его условность только в названии, т.е. в том,что он не был Адамом в библейском смысле, т.е. первочеловеком) и до современных мужчин носит абсолютно объективно древовидный характер, причём до последних времён (может последней тысячи лет) строго бифуркационный характер(т.е. из узла разветвления выходят только две линии и никак не больше). А то что мы не можем в каких-то местах достоверно это дерево реконструировать, это другая проблема, связанная либо с нашим недостаточным знанием, либо с какими-то особенностями изменения Y-ДНК, например  с тем же кроссинговером.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #21 : 01 Апрель 2013, 22:46:21 »
В то же время развитие прямых мужских линий от "Y-Адама" (не условного, а абсолютно реального мужчины, его условность только в названии, т.е. в том,что он не был Адамом в библейском смысле, т.е. первочеловеком) и до современных мужчин носит абсолютно объективно древовидный характер, причём до последних времён (может последней тысячи лет) строго бифуркационный характер (т.е. из узла разветвления выходят только две линии и никак не больше).

Очень важный вывод! Особенно для STR-филогении. Мы ведь часто видим несколько ветвей из одного узла. А это явно иллюзия. То же касается и древа снипов.
Впору закладывать в алгоритм какие-то ограничения по ветвлению и определять ещё неоткрытые снипы (узлы) как когда-то открывали планеты дальние Солнечной системы - ещё не видя в телескоп, расчётным путем.
Так недавно обнаружилось, что Q1a1 и Q1a2 имеют общие снипы, расположенные выше их. И так будет со всеми ситуациями, когда от условного узла отходит более двух ветвей. Обнаружатся какие-то снипы выше.
Интересно - кто-то до этого это формулировал? Тянет на постулат VVR.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17195
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #22 : 23 Май 2013, 09:44:53 »
Я как-то обсуждал тему Шона Коллинза Райта, ирландского американца с африканской гаплогруппой E1b1a7a :)
Тут на днях дядя Шон получил результаты генодвашного теста. И ничего не понял. В его списке снипов нашлись... внимание, пгеинтегеснейшая подгобность... десятки снипов, присущих соседней E1b1b1 и совсем далёкой R1b1a2!

Возникает вопрос: к какой гаплогруппе он относится?


Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #23 : 23 Май 2013, 11:22:19 »
Тут на днях дядя Шон получил результаты генодвашного теста. И ничего не понял. В его списке снипов нашлись... внимание, пгеинтегеснейшая подгобность... десятки снипов, присущих соседней E1b1b1 и совсем далёкой R1b1a2!

Огласите, пожалуйста, весь список.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17195
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #24 : 23 Май 2013, 11:33:55 »
Всё здесь

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #25 : 23 Май 2013, 11:35:35 »
потому что гена2 это шлак. есть 2 версии чипа и делают всем как получится.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17195
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #26 : 23 Май 2013, 12:27:12 »
Проблема не том, шлак это или не шлак. Если ФТДНА говорит, что у него E1b1a, а гено2 находит 15 снипов E1b1b и R1b1a2, то вопрос - какая у него гаплогруппа?

По СТР-ам он типичный E1b1aс небольшим уклоном в E1b1b1b2. И как же быть?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #27 : 23 Май 2013, 12:34:53 »
Проблема не том, шлак это или не шлак. Если ФТДНА говорит, что у него E1b1a, а гено2 находит 15 снипов E1b1b и R1b1a2, то вопрос - какая у него гаплогруппа?

По СТР-ам он типичный E1b1aс небольшим уклоном в E1b1b1b2. И как же быть?
так я тебе и говорю что этот тест это шлак и результаты тоже у многих такие же.  :)

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17195
  • Страна: az
  • Рейтинг +5967/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #28 : 23 Май 2013, 13:20:36 »
То есть это что - ошибочное выявление снипов, которых на самом деле нет?
Или надо по новой перестраивать древо гаплогрупп, и искать общего предка, уникального для E1b1 и R1b1?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Одинаковые SNPs у разных гаплогрупп
« Ответ #29 : 23 Май 2013, 13:26:18 »
То есть это что - ошибочное выявление снипов, которых на самом деле нет?
Или надо по новой перестраивать древо гаплогрупп, и искать общего предка, уникального для E1b1 и R1b1?
ищи общего предка

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.