АвторТема: 23andMe или Y-DNA 37  (Прочитано 12845 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 864
  • Страна: 00
  • Рейтинг +95/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a2 'Dinaric-N' (I-CTS10228)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #30 : 29 Апрель 2014, 23:25:23 »
rs - это номенклатура SNP в ncbi ::)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?rs=7892996

Я так понимаю, можно эти данные использовать для уточнения гаплогруппы, предсказанной 23andme.

Нашла одну:

http://ytree.morleydna.com/predict

А тут совпало)
Тоже J1)))
« Последнее редактирование: 29 Апрель 2014, 23:42:24 от митохондрия »

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 864
  • Страна: 00
  • Рейтинг +95/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a2 'Dinaric-N' (I-CTS10228)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #31 : 29 Апрель 2014, 23:35:45 »
J1 YSC0000078, YSC0000187, PF4636, PF4661, CTS5169, CTS10640, CTS1138, CTS1547, CTS1983, CTS3210, CTS3401, CTS3492, CTS4025, CTS4133, CTS426, CTS4294, CTS5285, CTS5394, CTS7412, CTS7598, CTS8183, CTS8340, F1825, F2058, F4200, F4287, F4289, L765, M497, PF4630, PF4632, PF4653, PF4656, PF4659, PF4662, PF4664, PF4668, PF4669, PF4672, PF4675, PF4676, PF4695, PF4738, PF4759, PF4761, PF4762, PF4764, PF4768, PF4769, PF4773, PF4774, PF4780, PF4787, PF4788, YSC0000063, YSC0000068, YSC0000069, YSC0000079, YSC0000172, YSC0000175, YSC0000177, YSC0000198, YSC0000199, YSC0000209, YSC0000218, YSC0000226, L321/PF4646, M267/PF4782, L255

most likely:
J1
J1-YSC0000078 (J1-YSC0000187, J1-PF4636)

и  по ISOGG:

J1-L255 (J1-L321, J1-M267)


Значение данного гаплотипа удивило нас.)

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 864
  • Страна: 00
  • Рейтинг +95/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a2 'Dinaric-N' (I-CTS10228)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #32 : 29 Апрель 2014, 23:46:28 »
Результаты с расширением Гугл Хрома для ISOGG:

http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpJ.html


Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4822
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1667/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #33 : 30 Апрель 2014, 08:22:53 »
кусок данных из 23andme из текстового файла который я скачала с 23andme.  Там можно отдельно данные Y-хромосомы скачать.
А так я конвертировала эти данные для предиктора в одной программке:
А тут совпало)
Тоже J1)))
Ну ясно. Совет "пройдитесь по списку" дал бы тот же самый результат. Неудивительно - исходные данные одни и те же. Навряд ли в них может быть ошибка - как оказалось при сравнении аутосом одного и того же человека, тестировавшегося в FTDNA и 23andMe, процент неуверенных прочтений снипов - один или менее, и они просто записываются в no call. Остальные снипы совпали.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1046
  • Страна: ru
  • Рейтинг +215/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #34 : 18 Июнь 2014, 15:05:36 »
Нужны пояснения знатоков.
В 23&ме определили гаплогруппу как R1b1b2a1a, т.е. R1b-L11. При этом в разделе Mutation Mapper во всех снипах, определяющих данную ветку, указан no call.


Каким же образом они определили R1b-L11? Поясните, пож., кто в теме.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4822
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1667/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #35 : 18 Июнь 2014, 15:23:15 »
Нужны пояснения знатоков.
В 23&ме определили гаплогруппу как R1b1b2a1a, т.е. R1b-L11. При этом в разделе Mutation Mapper во всех снипах, определяющих данную ветку, указан no call.
Попробуйте перейти по ссылке rs13304168 (L52). У меня мутация мито 961G (U4a1a) тоже не показывается в их утилите, а в browse raw data уже отображается.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1046
  • Страна: ru
  • Рейтинг +215/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #36 : 18 Июнь 2014, 15:33:19 »
Там тоже обозначено: "no call" ???

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4822
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1667/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #37 : 18 Июнь 2014, 15:40:01 »
Там тоже обозначено: "no call" ???
Можно еще другие три снипа посмотреть. Сейчас проверил у себя, все четыре в BRD отображаются правильно (предковые значения). У меня чип v3.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1046
  • Страна: ru
  • Рейтинг +215/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #38 : 18 Июнь 2014, 16:02:59 »
Все три снипа отсутствуют в чипе.
"No SNPs matching 'rs9786283' found in the data from your chip." Такой же ответ по всем трем.


Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4822
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1667/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: 23andMe или Y-DNA 37
« Ответ #39 : 18 Июнь 2014, 16:15:40 »
Все три снипа отсутствуют в чипе.
"No SNPs matching 'rs9786283' found in the data from your chip." Такой же ответ по всем трем.
Ну тогда не знаю, остается списать на недоработку программистов. Пробегитесь поиском по списку отсюда, там довольно много снипов уровня R1b1a2a1a и ниже, например
L151   R1b1a2a1a   16492547   rs2082033   C->T

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100