АвторТема: 1K Genomes Project  (Прочитано 2156 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
1K Genomes Project
« : 20 Ноябрь 2012, 16:37:35 »
Так как у многих, возможно возникали вопросы о принципах участия в 1K Genomes Project хочу поделиться пока печальным опытом продвинуть туда гаплтипы Q1a3 и Q1b. Эта попытка была предпринято мною по просьбе уважаемого Юргана. Мы оба считаем, что гаплогруппа Q скрывает ещё много сюрпризов.
Тогда как в проекте "1000 геномов" гаплгруппа Q представлена только многочисленными мексиканцами, переанцами и двумя вьетнамцами...
На предложение представить свои гаплотипы был получен ответ, что набор добровольцев окончен и выборки для проекта полностью сформированы в соответствии с целевыми популяциями.
Со списоком популяций можно ознакомится здесь: http://www.1000genomes.org/node/3
Таким образом, отсутствие в проекте некоторых субкладов означает не его дефект, а лишь их отсутствие в выборках по соответствующим популяциям. Так как объектом исследования проекта являются не гаплогруппы, а популяции.
Так как Q не так распространено, то оно вполне могло выпасть из многих популяций, где является минорной гаплогруппой. 

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: 1K Genomes Project
« Ответ #1 : 20 Ноябрь 2012, 18:30:10 »
Так как у многих, возможно возникали вопросы о принципах участия в 1K Genomes Project хочу поделиться пока печальным опытом продвинуть туда гаплтипы Q1a3 и Q1b. Эта попытка была предпринято мною по просьбе уважаемого Юргана. Мы оба считаем, что гаплогруппа Q скрывает ещё много сюрпризов.
Тогда как в проекте "1000 геномов" гаплгруппа Q представлена только многочисленными мексиканцами, переанцами и двумя вьетнамцами...
На предложение представить свои гаплотипы был получен ответ, что набор добровольцев окончен и выборки для проекта полностью сформированы в соответствии с целевыми популяциями.
Со списоком популяций можно ознакомится здесь: http://www.1000genomes.org/node/3
Таким образом, отсутствие в проекте некоторых субкладов означает не его дефект, а лишь их отсутствие в выборках по соответствующим популяциям. Так как объектом исследования проекта являются не гаплогруппы, а популяции.
Так как Q не так распространено, то оно вполне могло выпасть из многих популяций, где является минорной гаплогруппой.
В этом есть закономерность, не хотят тестировать именно российских граждан.
Русских там нет, нет ни одного россиянина.
Надо попробовать заинтересовать индейцев.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: 1K Genomes Project
« Ответ #2 : 20 Ноябрь 2012, 19:07:50 »
Из европейцев там только:
Utah residents (CEPH) with Northern and Western European ancestry (CEU)
Toscani in Italia (TSI)
British from England and Scotland (GBR)
Finnish from Finland (FIN)
Iberian populations in Spain (IBS)

Восточная Азия представлена китайцами, вьетнамцами и японцами.
А дальше Африка, Латинская Америка и Карибы, Южная Азия...
Короче, они делали ставку на географический охват.
Восточная часть Евразии вообще выпала из их зоны интересов.
Странно, что это им не интересно.

А может ситуация была как с многократно обсужденным сбором научных образцов в Дагестане:)
Нужно было быстро собрать коллекцию для исследования. А не заморачиваться с экспедициями к эвенкам и корякам на их стойбища...

Да и вообще как собирать образцы на 1/8 части суши при текущем нормативно-правовом регулировании? Так что их можно понять.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: 1K Genomes Project
« Ответ #3 : 20 Ноябрь 2012, 19:09:56 »
Могли бы просто попросить немного материала у известных лабораторий, которые уже собрали по всем канонам хорошие выборки.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8423
  • Страна: ar
  • Рейтинг +945/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: 1K Genomes Project
« Ответ #4 : 20 Ноябрь 2012, 19:25:14 »
Могли бы просто попросить немного материала у известных лабораторий, которые уже собрали по всем канонам хорошие выборки.
Прошу ответить
http://forum.molgen.org/index.php/topic,4988.msg162220.html#msg162220

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: 1K Genomes Project
« Ответ #5 : 06 Январь 2013, 14:38:58 »
Веренич про практическое использование результатов проекта 1K Genomes
http://goo.gl/WVY5v

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.