АвторТема: Три бесплатных теста Sequencing.com  (Прочитано 4786 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн MCB

  • Сообщений: 71
  • Страна: 00
  • Рейтинг +47/-1
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #15 : 04 Январь 2020, 00:30:30 »
Анцестри сейчас не занимается полигенными моделями - а только мутациями с сильными, опасными эффектами (список тут: https://www.ancestry.com/health/variants ). Их на чипе считанные десятки на все болезни из их списка болезней - в то время как в природе число таких мутаций исчисляется десятками тысяч. Но создатели этого анализа подобрали самые распространенные в Америке мутации, и оказывается, что для некоторых этнических групп из России и для некоторых болезней подавляющее большинство носителей имеет именно мутации из их списка. В первую очередь это Ашкеназы и гены BRCA1/2: в большинстве случаев в этой популяции обнаруживаются всего 3 мутации, и все 3 на списке Анцестри. Наоборот, ашкеназская мутация в гене LDLR (семейная гиперхолестеринэмия) отсутствует в их списке.

Оффлайн Alexey_V.B.Автор темы

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #16 : 04 Январь 2020, 01:26:57 »
1. Ваше мнение по мед. тестам MyHeritage: конкурент ли 23andMe с Ancestry или еще нет? 
2. Из 23andMe и Ancestry - имеет ли одна осязаемые преимущества?

Оффлайн MCB

  • Сообщений: 71
  • Страна: 00
  • Рейтинг +47/-1
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #17 : 04 Январь 2020, 02:13:14 »
Ны мы совсем заоффтопились, впору просить модераторов передвинуть все, что не о треклятом sequencing.com.

MyHeritage имеет приличные продукты - довольно большой список опасных мутаций, наподобие Анцестри, и кое-какие полигенные предсказатели риска, как у 23эндМи (но основанные только на литературных данных, в то время как 23andMe использует и собственные наработки). Списки болезней и мутаций разные, а надежность полигенных предсказаний не доказывается собственными публикациями компаний, к сожалению.

Для узкой задачи поиска мутаций BRCA1/2 у ашкеназов все три компании годятся.

Оффлайн Alexey_V.B.Автор темы

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Медицинские тесты Sequencing.com
« Ответ #18 : 14 Январь 2020, 16:02:38 »
Для интересующихся еще один пока бесплатный тест: Arthritis Prevention https://sequencing.com/arthritis-prevention-dna-report
Похоже, что возможность определения риска артрита суставов (колена, бедра и запястья) зависит от выборки участков ДНК при аутосомном тесте.
Из файлов 23andMe, Ancestry и MyHeritage - мне по всем трём рисков результат дал файл Ancestry. По двум другим файлам (23andMe и MyHeritage) результат только по двум из трёх рисков. У одного подопечного файл Ancestry позволил определить риск артрита по всем трём суставам, а файл MyHeritage - только один из трёх рисков, по двум: "Not enough genetic data for analysis".

Оффлайн Alexey_V.B.Автор темы

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #19 : 02 Февраль 2020, 13:13:59 »
кидка на специальный медицинский тест на редкие болезни по персональному заказу: Genome Sequencing for Health (30X) Regular price €599.00 EUR - Sale price€299.00 EUR  https://www.dantelabs.com/collections/advanced-dna-tests/products/whole-genome-sequencing?variant=32330833625223 Еще и полный геном впридачу!
The Rare Disease special pricing is reserved to Rare Disease Patients. Please upload your diagnosis after your order to qualify.
Whole Genome Sequencing 30X (industry standard coverage)
Now with a new Rare Disease Report
Analysis of 100% of your DNA
Raw Data available free of charge (FASTQ, BAM and VCF)
Sequenced in our own new European Sequencing Center

Оффлайн Farharaji

  • Сообщений: 984
  • Страна: aq
  • Рейтинг +170/-7
    • Ytree YF71444
  • Y-ДНК: R1b-DF98+FT22607+BY20662+
  • мтДНК: U5b1e1*
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #20 : 12 Март 2020, 21:31:06 »
Кстати. Узнал что Sequencing дает некоторые бесплатные результаты в рамках месячной бесплатной подписки! Можно выбрать Платинум, Голд, Сильвер подписку, на месяц или на год. При годовой 20% скидка, ну то есть за 10 месячную фактически оплачиваешь! Но...месяц дается бесплатно, если ты подтвердишь платежеспособность карточкой. То есть можно взять даже Платинум, 60дол. в месяц и просто если на карточке есть 60+у.е. то будет бесплатно месяц! А дальше через месяц можно просто отказаться или перейти на более слабую подписку. Например Сильвер стоит всего лишь 10 долларов в месяц! У них существует и Бесплатная простая подписка, где можно выбрать 2 вещи.
 Что дает подписка? Ну можно выбрать несколько вещей, гаджетов по разным подпискам разное количество, не все, но некоторое количество на свое усмотретие....В области как здоровья, так и диет, фитнесса и многого всего, в том числе и генеалогич. штучки, например. технич. отчет твоего результата, также геналогич. браузер(я еще сам не разобрался что эт такое, но видимо чтот круто, там и снипы и мито и прочее), но главное конечно же  Ancestry&Genealogy -Eone-Diagnomics Genome Center или EDGC, куда Секвенсинг скидывает ваши данные. То есть оч. гибкая и клиент ориентированная система. Вот собственно что пишут
NEW UPGRADED VERSION!
expanded reference datasets
6 continents, 22 subregions, 97 countries
enhanced genetic genealogy algorithms
the report contains new sections including Reference Dataset information and FAQs
easy, secure sharing of results with family and friends
download and print your results
beautiful, sophisticated report design

В общем собственно вот! Континенты дают в таком разрезе
Европа(до Урала)
Мидл Ист(Сев. Африка, Ближний Восток, Юго-зап. Азия)
Центральная Южная Азия(Средняя Азия, Афган и Индийский субконтинент)
Вост. Азия(собственно вся остальная Азия)
Африка(кроме Северной, которая в Мидл Исте)
ну и Америка конеш

каждый из этих "континентов" делится еще на более мелкие локация, а каждая локация еще и разбивается по странам в обшем то. Так что результаты будут прямо таки подробными(не факт конечн что достоверными)
Ну и самое ГЛАВНОЕ - Секвенсинг принимает сейчас результаты ПРАКТИЧЕСКИ всех Лабораторий! В том числе и идет сотрудничество и с Dante Labs 8)
Вот список откуда берет
Dante Labs(примечательно из всех компаниий Данте в самом топе списка!)
23andMe   
AncestryDNA
MyHeritage   
Genes for Good
Living DNA   
HomeDNA   
FamilyTreeDNA (FTDNA)   
Silverberry Genomix   
Toolbox Genomics   
Nebula Genomics   
Helix   
Vitagene   
24Genetics   
tellmeGen   
Veritas Genetics   
Genos   
Invitae   
GeneDx   
Ambry   
PCR   
Arrays   
GSA   
Axiom

Данные различных форматов FASTQ FASTA BAM SAM VCF CRAM GVCF gVCF TXT CSV TAB gz and zip compressed files
То есть очень гибкий клиент ориентированный подход. :)

Оффлайн KetoDude

  • Сообщений: 20
  • Страна: us
  • Рейтинг +5/-0
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #21 : 25 Апрель 2020, 17:38:14 »
Sequencing.com начал продавать полногеномное секвенирование WGS 30X за $399
https://sequencing.com/tests/order/genome-sequencing-dna-testing

Конкуренция на рынке WGS обостряется.
у Nebula, Dante Labs и Sequencing.com уже более или менее вменяемые цены. Ждем ответ 23andme  ;D

Оффлайн Farharaji

  • Сообщений: 984
  • Страна: aq
  • Рейтинг +170/-7
    • Ytree YF71444
  • Y-ДНК: R1b-DF98+FT22607+BY20662+
  • мтДНК: U5b1e1*
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #22 : 24 Май 2020, 17:08:38 »
Оказывается именно полногеномку Секвенсинг ком делает не сам,  а у Небулы ;D То есть отношения как у херитэйдж с фтдна. А вообще как я понял они по разным аспектам со многими сотрудничают. По той же медицине сами мало что делают,  но у партнеров оч. многое делают.

Оффлайн Alexey_V.B.Автор темы

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Три бесплатных теста Sequencing.com
« Ответ #23 : 22 Декабрь 2020, 19:27:15 »
Melanoma Skin Cancer Prevention по акции бесплатно https://sequencing.us10.list-manage.com/track/click?u=1c0e3379e8beec67d80bceb2a&id=a8353ce189&e=aa83b493e4

Результат анализа тот же и для файла atДНК, и для BAM файла WGS X30 Dante Labs, достоверность результатов разная.

 

Пример Low Risk



Анализ atДНК файла



Available Data used for analysis разных файлов (MyHeritage, FTDNA, Ancestry и 23andMe) от 21% до 54% - зависимости % от компании не прослеживается.

Анализ  BAM файла WGS X30 Dante Labs





« Последнее редактирование: 22 Декабрь 2020, 19:54:58 от Alexey_V.B. »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.