АвторТема: Y-SNP Compendium  (Прочитано 2331 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6301
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Y-SNP Compendium
« : 28 Ноябрь 2012, 09:51:58 »
Наиболее полный на текущий момент свод информации о снипах

Цитата: daver
I've put together a first cut at a comprehensive list of Y-SNPs covered by ISOGG and FTDNA; Geno 2.0 Y-SNPs will be added as they become available. Among other things, there is an indication as to whether each SNP is covered by ISOGG, FTDNA, Geno 2.0, 23andMEv2, and 23andMEv3. This is a 3.6MB zip file that unpacks to a 19MB Excel file (xls 1997-2003 format).

Feedback requested and welcome.

http://daver.info/SNP/SNP-Compendium.zip

Regards,
david

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6301
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Y-SNP Compendium
« Ответ #1 : 02 Декабрь 2012, 14:01:24 »
Компедиум обновили.

http://goo.gl/iCNTa

Цитировать
Second revision of a Compendium of SNP information from ISOGG, Finch2, and other sources. This version lists all of the SNPs in the ISOGG Index and most of the SNPs from Thomas Krahn's Finch2 databasee. These are cross-referenced against SNPs from the 23andME v2 and v3 Y-SNP lists, as well as the known Geno 2.0 SNPs (i.e., CTS, F, and PF SNPs not included yet).

Previous version of the file included all the sources used to generate the table, and was too big for convenient distribution. This version contains a flat copy of the table data.

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 512
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Y-SNP Compendium
« Ответ #2 : 15 Декабрь 2012, 10:53:01 »
Обновление, благодаря релизу разрешенных к публикации данных PF и CTS серий.

Многие снипы L и Z серий имеют PF и CTS синонимы. Например, у одного кита есть результат PF5163+ из Geno 2.0, а у другого Z2222+ от обычного тестирования. Если не приводить их к общему знаменателю, то путаницы не избежать.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9755
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Y-SNP Compendium
« Ответ #3 : 15 Декабрь 2012, 11:23:18 »
забавно как исследователи не стали убирать дубликаты когда включали их в чип, в итоге больше трети из 12 тыс это одни и те же снипы )))

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6301
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1221/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Y-SNP Compendium
« Ответ #4 : 14 Август 2014, 18:09:07 »
Текущая версия SNP-Compendium
https://dl.dropbox.com/u/92587284/SNP-Compendium.xls

Оффлайн Remmo

  • Сообщений: 255
  • Страна: ru
  • Рейтинг +37/-0
  • Y-ДНК: R1-Y178665/BY60213 (Y934>BY30762>BY30764>Y178665/BY60213)
  • мтДНК: Soon
Re: Y-SNP Compendium
« Ответ #5 : 26 Июнь 2018, 21:03:12 »
Текущая версия SNP-Compendium
https://dl.dropbox.com/u/92587284/SNP-Compendium.xls
Программа эта еще актуальна? Ссылка не рабочая

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100