АвторТема: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs  (Прочитано 18159 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #30 : 01 Февраль 2013, 11:32:12 »
VL62 не пробили для тестирования в FTDNA?

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #31 : 06 Февраль 2013, 15:27:49 »
Значит, такое дерево снипов пока получается:

Оффлайн Dimitri

  • Сообщений: 310
  • Страна: ru
  • Рейтинг +43/-0
  • Y-ДНК: N1a1a1a2b (L708>Y9022>B181)
  • мтДНК: HV9
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #32 : 06 Февраль 2013, 16:16:32 »
Уважаемый moglley!

А чем Вы обосновываете сибирское происхождение мутаций M178 и L708?
С помощью TNT я проанализировал наиболее вероятные филогенетические деревья для объединенного набора N1c-гаплотипов из баз FTDNA и SMGF.
Во всех этих деревьях азиатская ветка L708(xL1026) значительно обогатилась гаплотипами монгольского происхождения, а поволжская ветка L708(xL1026), хоть и сохранила российский состав гаплотипов, но произростала из обширного моногольского куста.

Вот одно из таких деревьев:
  ,-- Borgoyakov_203299_M178_xL708
   |  ,----- L1026
|--|  |  ,-- Legits_SMGF
   |  |  |     ,-- Mongolia_SMGF
   `--|  |  ,--|  ,-- Bavuu_Y_SMGF
      |  |  |  `----- Ochir_Lochon_Mondir_SMGF
      `--|  |        ,-- Sandaraev_203300
         |  |        |     ,-- Finland_SMGF
         |  |     ,--|  ,----- WпїЅпїЅchter_N56160
         |  |     |  `--|  ,-- Mousawi_M6651
         `--|  ,--|     `----- Gusmanov_225440
            |  |  |  ,-- Damdin_Tasran_SMGF
            |  |  `--|  ,-- Baljinnyam_Ish_SMGF
            |  |     `--|  ,-- Mongolia_SMGF
            |  |        `--|  ,-- Choidog_SMGF
            |  |           `----- Adamov_119747
            `--|     ,-- Luvsantseren_SMGF
               |  ,----- Mongolia_SMGF
               |  |        ,-- Bavchin_SMGF
               |  |     ,--|  ,-- Tsevegjav_SMGF
               |  |     |  `----- Mongolia_SMGF
               `--|  ,--|     ,-- Gunaajav_SMGF
                  |  |  |  ,----- Ayur_SMGF
                  |  |  `--|  ,-- Delger_Duut_SMGF
                  `--|     `----- Mongolia_SMGF
                     |  ,-- Khaltar_Dulamjav_Khukh_SMGF
                     |  |  ,-- Bayandalai_SMGF
                     `--|  |  ,-- Mongolia_SMGF
                        `--|  |  ,-- Bayan_Agj_SMGF
                           `--|  |  ,-- Mongolia_SMGF
                              `--|  |  ,-- Kyrgyzstan_SMGF
                                 |  |  |        ,-- Mangal_SMGF
                                 `--|  |     ,----- Nanzad_Shagdar_SMGF
                                    |  |  ,--|  ,-- Gonchig_SMGF
                                    `--|  |  `--|  ,-- Buyant_SMGF
                                       |  |     `----- Dugar_Khorchin_Norov_SMGF
                                       |  |        ,-- Galdan_SMGF
                                       `--|     ,----- Bat_Baljir_Bodon_Khelu_Dayan_Ra_SMGF
                                          |  ,--|  ,-- Galsan_Dash_SMGF
                                          |  |  `--|  ,-- Bat_SMGF
                                          |  |     `----- Badar_Bud_SMGF
                                          `--|     ,-- Tonkhoino_Api_SMGF
                                             |  ,----- Ulzii_SMGF
                                             |  |  ,-- Namsrai_Jav_Jigjid_Urkhiandai_SMGF
                                             `--|  |  ,-- Ardnatseren_Jamsran_Tsogt_Andre_SMGF
                                                `--|  |  ,-- Khuushaan_SMGF
                                                   `--|  |     ,-- Byamba_Tseden_Shar_SMGF
                                                      `--|  ,----- Mongolia_SMGF
                                                         |  |     ,-- Golitsin_184206
                                                         `--|  ,--|  ,-- Pleshivy_152820
                                                            |  |  `----- Akhtariev_96047
                                                            `--|     ,-- Parshin_199035
                                                               |  ,----- Golodyaev_151523
                                                               `--|  ,-- Gavrilov_N59644
                                                                  `--|  ,-- Ushakov_176781
                                                                     `----- Kurbatsky_199032

Исходя из этого я считаю, что обе эти мутации (M178 и L708) случились в Монголии.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #33 : 06 Февраль 2013, 17:28:03 »
Пока обосновываю тем, что в период 8-10 тысяч назад в Монголии было плохо.
Думаю, первые ребятки пришли откуда-то извне, скорее всего, из каких-то регионов Китая.
Надо будет поправиться.

Возможны два варианта:
1. N ледниковый период разделил на две части - кхмеры и мы.
2. Все N пришли на север после ледникового периода.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #34 : 06 Февраль 2013, 19:09:54 »
Торопился.
Продолжу сейчас.

У меня такое мнение, что какая-то только созданная гаплогруппа и которая ныне имеет ареал обитания, отличный от представителей ближайших гаплогрупп, может сформироваться, только если возникнит какой-то барьер с ближайшими родственниками, либо эти гаплогруппы расселятся в несколько отдалённые регионы.
Генетический дрейф, конечно, возможен, но, я считаю, менее вероятен.

Гаплогруппа N1c-L708, как мы знаем, характерна для регионов, находящихся к северу от пустынных мест - Монголии-Тибета-Памира.

Если для региона Балтийского и Северного морей, Ладоги можнол найти работы, предлагающие разбор их гидрографии и температур, то для регионов, пограничных для N я не нашёл.
Как известно, во время оледенения, Китай был разделён непроходимой пустыней на северную и южную части, в которых были пригодные для обитания человека условия.
Как мы знаем, когда ледники Гималаев-Памира начали таять, появились огромные водоёмы к северу от Памира и главные реки Сибири и Китая стали намного более полноводнее, чем они сейчас.
Тогда ещё был Марыч, что предполагает практически непроходимый водораздел от Гибралтара до Амура.
 Но это было 16-13 тысяч лет назад.

Если возраст гаплогрупп N, N1 превышает эти даты, то можно сказать, что в то время они обитали южнее этого водораздела.

Возраст гаплогрупп N-L729, N1-TAT и N-M178 близок к этому возрасту и тут может быть вариант о происхождении данных гаплогрупп как с северной части, после того, как водный барьер стал проходим, но может быть и вариант проникновения данных гаплогрупп уже после  исчезания барьера.

Есть работы о климатических условиях в древние времена в Тариме.

О климате же всех Монголий, а также территорий к западу и востоку от них в период 4000-8000 лет назад я работ пока не нашёл.
Я предполагаю,

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #35 : 06 Февраль 2013, 21:16:31 »
Уважаемый Yurgan, если Вы не будете оформлять Ваши находки в части изучения Geno 2.0 авторскими правами, то, может быть есть резон создать открытый ёксель на gojgle, чтобы постепенно участникам совместно заполнять его новыми данными, а то немало людей присоединяется к проекту.

Например, сегодня присоединился N1-P189.2.

Заполнение желательно буквами нуклеотидов (A,C,G,T).
Возможно, что неплохо туда бы включить и O, как реперную точку.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +795/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #36 : 06 Февраль 2013, 21:47:48 »
Из России Владимир Волков первый и пока единственный кто имеет серию снипов названную VL. Ссылку разместили в ISOGG
VL = Vladimir Volkov, Tomsk University, Russia
здесь
http://isogg.org/tree/index.html
:)

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8718
  • Страна: gt
  • Рейтинг +649/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #37 : 06 Февраль 2013, 22:57:53 »
Из России Владимир Волков первый и пока единственный кто имеет серию снипов названную VL. Ссылку разместили в ISOGG
VL = Vladimir Volkov, Tomsk University, Russia
здесь
http://isogg.org/tree/index.html
:)
Спасибо.
Ну тогда надо уговаривать Томаса на запуск еще нескольких снипов, например VL37
« Последнее редактирование: 08 Февраль 2013, 09:50:24 от Yurgan »

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19276
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1386/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #38 : 06 Февраль 2013, 23:03:52 »
Веренич утверждает, что этот снип не Юрган открыл.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8718
  • Страна: gt
  • Рейтинг +649/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #39 : 06 Февраль 2013, 23:28:27 »
Веренич утверждает, что этот снип не Юрган открыл.
Его нашли в 1000 genomes, я определил его положение и он был запущен в Томской лаборатории, как и ряд других.
Была бы у меня возможность делать полный сиквенскY-хромосомы, я бы много снипов нашел и запустил бы.
 
« Последнее редактирование: 08 Февраль 2013, 09:50:42 от Yurgan »

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19276
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1386/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #40 : 06 Февраль 2013, 23:34:15 »
Ром, так ты бы мог уже сотню снипов обозвать SR1, SR2, SR3...

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8718
  • Страна: gt
  • Рейтинг +649/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #41 : 07 Февраль 2013, 22:48:51 »


CTS2262 и CTS6380 есть в проекте 1000 genomes и являются общими для N1a и N1b

Теперь нужно получить raw-data 213565   Palviainen

И будем ждать результатов уважаемого Dmitry


« Последнее редактирование: 07 Февраль 2013, 23:04:25 от Yurgan »

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7909
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #42 : 07 Февраль 2013, 23:00:48 »
Ром, так ты бы мог уже сотню снипов обозвать SR1, SR2, SR3...
В чём вопрос, ребята?
Я в курсе того, что Роман вскрыл туеву хучу снипов.
Называйте их так, как как хотите.

Главное - вбить их в панель FTDNA.

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19276
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1386/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #43 : 07 Февраль 2013, 23:01:50 »
Ром, так ты бы мог уже сотню снипов обозвать SR1, SR2, SR3...
В чём вопрос, ребята?
Я в курсе того, что Роман вскрыл туеву хучу снипов.
Называйте их так, как как хотите.

Главное - вбить их в панель FTDNA.

Да уже вбили и давно пользуем, только Рома скромничает видимо.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8718
  • Страна: gt
  • Рейтинг +649/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #44 : 07 Февраль 2013, 23:02:50 »
Ром, так ты бы мог уже сотню снипов обозвать SR1, SR2, SR3...
В чём вопрос, ребята?
Я в курсе того, что Роман вскрыл туеву хучу снипов.
Называйте их так, как как хотите.

Главное - вбить их в панель FTDNA.
Самое главное, чтобы их запустили и можно было заказывать.
Даже не все Z пока запущены.
А там есть действительно интересные снипы.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100