АвторТема: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs  (Прочитано 18540 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #15 : 07 Январь 2013, 17:34:00 »
Поэтому, с Гено-2 я пока в стороне.

Оффлайн Bertarido

  • Сообщений: 16
  • Рейтинг +4/-0
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #16 : 07 Январь 2013, 22:16:37 »
Он в проекте N1c1 (N25747).

Мой результат должен быть в ближайшие неделю-две (213565), теперь на 60%.
Подождем.
Будет ясно расположение CTS10760, CTS8428, F4045.

А кто-нибудь из N-L1022 проверяется через Geno2.0?

Я думаю, что Hoegseth (N26887) ждет его результатов.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #17 : 08 Январь 2013, 17:56:54 »
Снипы из Geno2.0




И вот что примерно получается на данный момент



Снип CTS3223 выделяет ветвь Саво.

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1418
  • Страна: ru
  • Рейтинг +191/-6
  • Y-ДНК: N-Y5611; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #18 : 08 Январь 2013, 18:23:49 »
Снип CTS3223 выделяет ветвь Саво.
А как удалось определить такое положение CTS3223 и VL62?  Кто-то из карельских ветвей тоже проходил Geno2.0?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #19 : 08 Январь 2013, 19:10:55 »
Снип CTS3223 выделяет ветвь Саво.
А как удалось определить такое положение CTS3223 и VL62?  Кто-то из карельских ветвей тоже проходил Geno2.0?
Сводные данные из проекта 1000 genomes
Все эти снипы финно-карельской ветви есть в 1000 genomes

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #20 : 08 Январь 2013, 19:26:04 »
И вот что примерно получается на данный момент
L1032 или L1034?

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1418
  • Страна: ru
  • Рейтинг +191/-6
  • Y-ДНК: N-Y5611; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #21 : 08 Январь 2013, 19:32:57 »
Сводные данные из проекта 1000 genomes
Все эти снипы финно-карельской ветви есть в 1000 genomes
А почему вы их раньше не выкладывали?

CTS11520 и CTS3223 имеют своих "двойников" в Z-серии?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #22 : 08 Январь 2013, 20:39:23 »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #23 : 08 Январь 2013, 20:42:59 »
Сводные данные из проекта 1000 genomes
Все эти снипы финно-карельской ветви есть в 1000 genomes
А почему вы их раньше не выкладывали?
Там их ... очень много  ;D
Цитировать
CTS11520 и CTS3223 имеют своих "двойников" в Z-серии?
Нет, у этих двойников пока нет. Хотя они в 1000 genomes выявлены.

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1418
  • Страна: ru
  • Рейтинг +191/-6
  • Y-ДНК: N-Y5611; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #24 : 08 Январь 2013, 21:56:36 »
Там их ... очень много  ;D
Я в курсе, что много. Я просто хотел узнать поподробнее, как из этого множества вычленили сейчас эти несколько снипов.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #25 : 09 Январь 2013, 07:36:47 »
Там их ... очень много  ;D
Я в курсе, что много. Я просто хотел узнать поподробнее, как из этого множества вычленили сейчас эти несколько снипов.
Указаны позиции в Build37

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #26 : 10 Январь 2013, 08:19:12 »
Вот что получается на данный момент


CTS10760 может уйти выше, и стать на один уровень с VL29
Для выяснения этого  надо проверять линию N-VL29*
Ждем следующих результатов
« Последнее редактирование: 22 Январь 2013, 11:02:04 от Yurgan »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #27 : 22 Январь 2013, 11:01:34 »
Новая версия



У 223703 Karlsson'a указано F287 del PF2637 del

Позиция первого пока неизвестна, второго нет в 1000 genomes
У Geno 2.0 проблемы с инделами, может и здесь ошибка.

Но F4045 тоже делеция, но нормально работает, у всех L550 есть.

У остальных N1c1  F287   Y   G   C, а не делеция, но тоже показан как снип.
У R1a F287   Y   C   C





« Последнее редактирование: 22 Январь 2013, 11:08:49 от Yurgan »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 8726
  • Страна: gt
  • Рейтинг +671/-6
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #28 : 01 Февраль 2013, 11:02:03 »

Пока ничего нового, только проблемы.
Ostlund  - F4045 T T - это либо ошибка, либо указанные у других F4045 del  недотипированные
F4159 A G - то же непонятно, либо ошибка, либо новый снип.

Karlsson  F287 del PF2637 del - то же непонятно, то ли снипы, то ли недотипированы.

Holmes F2344 del тут тоже скорее ошибка, так как то же самое у Crowther'a

Расположение остальных снипов уже было известно.


« Последнее редактирование: 01 Февраль 2013, 11:11:44 от Yurgan »

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Hg N and Geno 2.0 Y-SNPs
« Ответ #29 : 01 Февраль 2013, 11:30:07 »
F4159 A G - то же непонятно, либо ошибка, либо новый снип.
Такого в Y-DNA быть не может в принципе.
Ошибка.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100