АвторТема: Анализ родства по данным Х-хромосомы  (Прочитано 40699 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #195 : 10 Июнь 2019, 15:38:29 »
Вопрос инактивации одной из Х-хромосом подробно обсуждался здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,6551.msg223040.html#msg223040

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 687
  • Страна: aq
  • Рейтинг +118/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #196 : 10 Июнь 2019, 16:20:58 »
Вопрос инактивации одной из Х-хромосом подробно обсуждался здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,6551.msg223040.html#msg223040

По Х-хромосоме и митоДНК много написано здесь на форуме, а также в интернете. К сожалению, не всё написанное соответствует действительности, тесты митоДнк это подтверждают. Меня же, в первую очередь интересуют "хитромудрые" алгоритмы, с помощью которых можно было бы вычислять родственные связи, хотя бы последних четырёх поколений :)

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 687
  • Страна: aq
  • Рейтинг +118/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #197 : 10 Июнь 2019, 18:20:33 »

Тему с самого начала прочтите. Там в стартовых сообщениях именно алгоритм и описан.

Английским не владею, поэтому в нобелевской премии отказали.
Остаётся уповать на то, что кто-нибудь из знатоков напишет на русском.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #198 : 10 Июнь 2019, 19:51:11 »
Ярослав, хромосомый браузер может Вам помочь сформулировать более точные выводы. В том числе и более точно локализовать участки, унаследованные от дедушки и бабушки.

Спасибо!!! А ведь это и правда выход!

У Марка Попова с Андреем Бурцевым общий участок синего цвета, который Марк получил через маму от своей бабушки (мамы мамы), которая не является биологической родственницей моей мамы и меня.

А вот он, этот общий участок Марка Попова с моей мамой (красный) и со мной (зелёный), который, согласно выявленной мной выше цепочке Марк получил через свою маму от своего деда (отца мамы), моего дяди Михаила Бурцева, а Михаил Бурцев - от своей мамы Клавдии Кладовой, а я с мамой, раз он у нас общий с Марком - тоже от мамы моей мамы Клавдии Кладовой.

По идее остальные совпаденцы на этом участке, если такие найдутся, тоже должны быть в родстве по линиям Клавдии Кладовой?

« Последнее редактирование: 10 Июнь 2019, 20:07:50 от Yaroslav »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #199 : 10 Июнь 2019, 20:24:07 »
http://forum.molgen.org/index.php/topic,10629.0.html

Дико извиняюсь за капитано-очевидность, но все икс-хитросплетения между Ярославом и Марком (при заведомо известном родстве) можно посмотреть по схеме из вышеприведённой схемы (той, что для мужчин).

Достаточно шагнуть в третий круг, и станут очевидны все возможные доноры общего икса. Тем более, если мито не совпадают, то варианты сузятся.

Заглубляясь в изучение рандомного алгоритма икс-рекомбинации можно вызвать перегрев и задымление мозгов :)
Верьте мне, из икса самого по себе толком выудить мало что получится, и поэтому этот тест так и не получил самостоятельного широкого применения. Не считая редких случаев типа "внучка &патербабка"

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #200 : 11 Июнь 2019, 04:01:54 »
Ну как сказать...
Например, в случае Ярослава (икс-матч при известной генеалогии обоих субъектов) мы попадаем в третий (если смотреть от диаметра к центру) круг. 8 потенциальных предков. Мито-матча нет, поэтому уже 7.

При заведомо известных родословных точно указать предка не составит труда. При неизвестной родословной даже у одного из субъектов поиск становится практически нереализуемым.

Будем надеяться, что ситуация постепенно прояснится...

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #201 : 11 Июнь 2019, 07:46:18 »
Farroukh, проскочил мимо опубликованной тобой схемы. То есть, этот участок X-хромосомы у меня и у двоюродного племянника всё-таки от моей бабушки (мамы мамы).

Вопрос теперь, будут ли общие сегменты с совпаденцами на этом участке означать родство по линии моей бабушки (мамы мамы)?

Я вчера проверил у Марка, из 30 X-матчевых совпаденцев у него на этом участке никого.

У мамы около 180 X-совпаденцев, т.к. две X-хромосомы. Просмотрел вчера около 40, пока что на этом участке находятся какие-то иностранные тётьки:

7,78 cM; 700 SNP; 18935349 - 23083714   Donna KwapisVelez

6,51 cM; 650 SNP; 17718693 - 22520187   Mrs. Monica . Hägerstrand Selander

4,70 cM; 550 SNP; 13457293 - 17470897   Natalya B Reyes

5,89 cM; 600 SNP; 17718693 - 22398548   Terttu Makela

FTDNA всех вангует как 5th Cousin - Remote Cousin.

P.S. Если я по обыкновению потянул в этой теме одеяло слишком уж на себя, пусть тогда строгие модераторы перенесут мои сообщения ко мне на раён, в Старо-Оскольский уезд Курской губернии, т.к. моя X-хромосома родом оттуда :)
« Последнее редактирование: 11 Июнь 2019, 09:09:00 от Yaroslav »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #202 : 11 Июнь 2019, 08:32:23 »
Ярослав, при имеющихся данных чётко установить общего предка со всеми указанными персонажами невозможно.  :)
Задача имеет более 9000 вариантов решений. КРоме шуток, ни денег, ни времени не хватит дополнительно протестировать такую уйму людей ради того, чтобы удостовериться в существовании общей конкретной пра...бабушки, жившей Б-г знает когда.

P.S. Я в свою ФФ вкладку даже не заглядываю, ибо там одни родственнчики от предков реликтового периода с пересечениями уровня 30-40 сМ.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #203 : 11 Июнь 2019, 08:50:50 »
Ярослав, при имеющихся данных чётко установить общего предка со всеми указанными персонажами невозможно.  :)
Задача имеет более 9000 вариантов решений. КРоме шуток, ни денег, ни времени не хватит дополнительно протестировать такую уйму людей ради того, чтобы удостовериться в существовании общей конкретной пра...бабушки, жившей Б-г знает когда.

P.S. Я в свою ФФ вкладку даже не заглядываю, ибо там одни родственнчики от предков реликтового периода с пересечениями уровня 30-40 сМ.

Тут по-моему как повезёт. Нужно списываться, узнавать места географических пересечений. Вроде как бывало, что выстреливало. Умные люди вообще говорят, что без хорошего годного генеалогического древа в такие тесты лучше вообще носа не казать :)

В твоей ситуации, понятно, что крайне на хватает протестированных из твоего региона. Такая же ситуёвина, если почитать форум, была и у нас, восточно-европейцев, ещё лет 7 назад. Зато наверно географически тебя и твоих земляков не так развозит по этнокалькуляторным картам, как нас. И возможно, что попадись в сети FTDNA твой 7-юродный родич, всё будет более чётко, чем у нас.

Понятно, что в случае иностранных подданных скепсис ещё выше, так как вряд ли кто-то из родичей моих ближайших предков мог мигрировать зарубеж.

Но, что интересно, если не ошибаюсь, в отличие от аутосом, здесь хотя бы сразу идёт хоть какое-никакое, но указание, откуда ветры дуют, в данном случае со стороны моей бабушки (мамы мамы).

Пробежался быстро по своим X-хромосомным совпаденцам, благо их у меня всего 11. У меня на этом участке находится один только польский дяденька. Есть ли он у мамы - пока что ещё не дошёл.

5,59 cM; 600 SNP; 10144807 - 13452805   Jerzy Pańkowski   5th Cousin - Remote Cousin
« Последнее редактирование: 11 Июнь 2019, 10:06:53 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #204 : 11 Июнь 2019, 10:26:10 »
В силу особенностей Х-мачинга как раз среди женских матчей очень много составных УПСов. Все-таки здесь чаще идет цепочка HIR, а не сплошной цельный FIR.
Посему совпадение по Х между двумя мужчинами изначально выглядит более перспективным с точки зрения поиска общего предка. Даже в случае составного УПСа оный хотя бы состоит из более-менее солидных кусков.

Спасибо!

То есть, получается, что Паньковского хорошо бы проработать, возможно и будет какой-то толк.

Вспомнился мой с мамой аутосомный совпаденец Панков (уважаемый Punchic), мой старо-оскольский земляк. Но это так, скорее всего просто совпадение в сходстве фамилий, понятное дело. Вряд ли он даже наш общий совпаденец, позже проверю.

Оффлайн Punchic

  • Сообщений: 210
  • Страна: ru
  • Рейтинг +124/-0
  • Y-ДНК: R-YP5917
  • мтДНК: V1a1a
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #205 : 11 Июнь 2019, 10:52:19 »

Спасибо!

То есть, получается, что Паньковского хорошо бы проработать, возможно и будет какой-то толк.

Вспомнился мой с мамой аутосомный совпаденец Панков (уважаемый Punchic), мой старо-оскольский земляк. Но это так, скорее всего просто совпадение в сходстве фамилий, понятное дело. Вряд ли он даже наш общий совпаденец, позже проверю.

Я уже проверил - просто совпадение  :( Да и польская ветка по Y, все отдаляется. TMRCA ~ 2ky. Аутосомы тоже ничего не показывают, даже несмотря на то, что прабабушка и прадед 7-юродные родственники от самого раннего Панкова. (ROH видно)

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18704
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4679/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #206 : 11 Июнь 2019, 11:07:19 »
Я уже проверил - просто совпадение  :( Да и польская ветка по Y, все отдаляется. TMRCA ~ 2ky. Аутосомы тоже ничего не показывают, даже несмотря на то, что прабабушка и прадед 7-юродные родственники от самого раннего Панкова. (ROH видно)

Тут вообще сюжет интересно разворачивается :)

Проверил In common with. Оказывается, аутосомно Паньковский мой общий совпаденец с... моим отцом!

Вот неполный список наших общих совпаденцев. В экран смартфона ещё не влезли некто C.F., а также Valya Shenfeld.

Каким тогда образом мы с Паньковским попали друг к другу на X-хромосому - вообще вопрос загадочный :)

« Последнее редактирование: 11 Июнь 2019, 11:17:25 от Yaroslav »

Оффлайн Ruslan_70

  • Сообщений: 26
  • Страна: by
  • Рейтинг +5/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #207 : 18 Август 2019, 17:51:56 »
Подскажите, о какой степени родства может идти речь?
https://ibb.co/Y7gHy6m

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #208 : 18 Август 2019, 17:59:53 »
Подскажите, о какой степени родства может идти речь?
https://ibb.co/Y7gHy6m

Четырёх-шестиюродное.    ;D

Оффлайн Ruslan_70

  • Сообщений: 26
  • Страна: by
  • Рейтинг +5/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #209 : 18 Август 2019, 18:07:09 »
Подскажите, о какой степени родства может идти речь?
https://ibb.co/Y7gHy6m

Четырёх-шестиюродное.    ;D
В общем бесполезное дело :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.