АвторТема: Анализ родства по данным Х-хромосомы  (Прочитано 22980 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11140
  • Страна: az
  • Рейтинг +1896/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #195 : 03 Февраль 2019, 05:20:14 »
К дочери от матери действительно может перейти одна из Х-хромосом, частично рекомбинированная с другой, но это ограниченное явление. Для упрощения жизни им можно пренебречь.
Если ситуация криминальная, то можно задействовать митотестами и посмотреть родство по прочим аутосомам. Так и так, отдельный икс-тест мало кто заказывает, почти все выживают эти данные из ФФ.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #196 : 09 Июнь 2019, 22:58:23 »
Уважаемый Шад опубликовал в соседней теме сообщение, заставившее меня наверное впервые более серьёзно задуматься о том, откуда ко мне пришла моя X-хромосома.

X-хромосома ведь тоже не рекомбинируется, как Y?

Тогда получается, что я мог получить X-хромосому либо отца мамы, либо мамы мамы.

Мой двоюродный племянник Марк Попов является моим совпаденцем также и по X-хромосоме. У нас следующие цепочки родственных линий (все женские фамилии - девичьи):

Цитировать
Ярослав Волков < Ольга Бурцева < Иван Бурцев/Клавдия Кладова

Марк Попов < Наталья Бурцева < Михаил Бурцев < Иван Бурцев/Клавдия Кладова

Далее идёт следующая нить рассуждений:

1. Марк мог получить X-хромосому только от моей двоюродной сестры Натальи Бурцевой.

2. Мама моей двоюродной сестры не является моей биологической родственницей, поэтому, если бы Наталья Бурцева получила её X-хромосому и передала Марку, совпадения у него со мной бы не было.

3. Значит Наталья Бурцева передала сыну X-хромосому, которую получила от своего отца Михаила Бурцева.

4. Михаил Бурцев получил X-хромосому от своей мамы Клавдии Кладовой.

5. Раз X-хромосома Марка совпала с моей, значит младшая сестра Михаила Бурцева, Ольга Бурцева (моя мама), передала мне, своему сыну, X-хромосому, которую она, как и её старший брат Михаил, тоже получила от своей мамы Клавдии Кладовой, а не X-хромосому от своего отца Ивана Бурцева.

Правильно ли я рассудил?

Тогда все мои совпаденцы по X-хромосоме, получается - это родство по моей бабушке Клавдии Кладовой (мамы мамы)?

Сейчас по направлению к Хьюстону движется набор с генетическим материалом моей двоюродной тёти Юлии Кухаревой, двоюродной сестры моей мамы (дочь старшей сестры мамы моей мамы) по следующим цепочкам родственных линий (все женские фамилии - девичьи):

Цитировать
Юлия Кухарева < Домника Кладова < Яков Кладов/Марфа Кладова (девичья фамилия неизвестна)

Ольга Бурцева < Клавдия Кладова < Яков Кладов/Марфа Кладова (девичья фамилия неизвестна)

Если набор благополучно дойдёт до Хьюстона, тест пройдёт нормально, биологическое родство с моей мамой и со мной подтвердится.

В случае, если я и моя мама совпадём с ней по X-хромосоме, будет ли это значить, что моя бабушка Клавдия Кладова получила свою X-хромосому от своей мамы Марфы Дмитриевны Кладовой (девичья фамилия неизвестна)?

Соответственно, если я и моя мама не совпадём с Юлией Кухаревой по X-хромосоме, значит моя бабушка получила свою X-хромосому от своего отца Якова Кладова?

Тогда получится определить либо что все мои совпаденцы по X-хромосоме - это родство по моему прадеду (отец мамы мамы) Якову Кладову, либо что все мои совпаденцы по X-хромосоме - это родство по моей прабабушке (мама мамы мамы) Марфы Кладовой (девичья фамилия неизвестна)?
« Последнее редактирование: 10 Июнь 2019, 00:52:32 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #197 : 10 Июнь 2019, 01:15:46 »
Как обычно, написал, а потом начал читать тему.

У женщин 2 полученные X-хромосомы как раз рекомбинируются.

Дядя Марка Попова, мой двоюродный брат Андрей Бурцев, младший брат Натальи Бурцевой, его мамы, также, как и я, является совпаденцем Марка по X-хромосоме. А Андрей Бурцев получил свою X-хромосому от своей мамы, которая не является моей биологической родственницей.

То есть, Марку от его мамы достался X-хромосомный микс от дедушки (папы мамы - по которому совпадение со мной) и бабушки (мамы мамы - по которому совпадение с Андреем Бурцевым).

Значит, и у меня такой же X-хромосомный микс от моей мамы.

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #198 : 10 Июнь 2019, 11:14:30 »

У женщин 2 полученные X-хромосомы как раз рекомбинируются.


У самой-то женщины нет. Она обладает двумя Х-хромосомами, от её отца и матери.
А вот при дальнейшей передачи своим детям происходит рекомбинация. Сын получает только одну Х-хромосому от своей матери, а дочка одну Х-хромосому от отца и одну Х-хромосому от матери.
Вопрос заключается в том, существует ли определённый алгоритм при рекомбинации двух Х-хромосом при передачи их от матери детям?

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6232
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1096/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #199 : 10 Июнь 2019, 15:38:29 »
Вопрос инактивации одной из Х-хромосом подробно обсуждался здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,6551.msg223040.html#msg223040

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #200 : 10 Июнь 2019, 16:20:58 »
Вопрос инактивации одной из Х-хромосом подробно обсуждался здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,6551.msg223040.html#msg223040

По Х-хромосоме и митоДНК много написано здесь на форуме, а также в интернете. К сожалению, не всё написанное соответствует действительности, тесты митоДнк это подтверждают. Меня же, в первую очередь интересуют "хитромудрые" алгоритмы, с помощью которых можно было бы вычислять родственные связи, хотя бы последних четырёх поколений :)

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 555
  • Страна: aq
  • Рейтинг +87/-0
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #201 : 10 Июнь 2019, 18:20:33 »

Тему с самого начала прочтите. Там в стартовых сообщениях именно алгоритм и описан.

Английским не владею, поэтому в нобелевской премии отказали.
Остаётся уповать на то, что кто-нибудь из знатоков напишет на русском.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #202 : 10 Июнь 2019, 19:51:11 »
Ярослав, хромосомый браузер может Вам помочь сформулировать более точные выводы. В том числе и более точно локализовать участки, унаследованные от дедушки и бабушки.

Спасибо!!! А ведь это и правда выход!

У Марка Попова с Андреем Бурцевым общий участок синего цвета, который Марк получил через маму от своей бабушки (мамы мамы), которая не является биологической родственницей моей мамы и меня.

А вот он, этот общий участок Марка Попова с моей мамой (красный) и со мной (зелёный), который, согласно выявленной мной выше цепочке Марк получил через свою маму от своего деда (отца мамы), моего дяди Михаила Бурцева, а Михаил Бурцев - от своей мамы Клавдии Кладовой, а я с мамой, раз он у нас общий с Марком - тоже от мамы моей мамы Клавдии Кладовой.

По идее остальные совпаденцы на этом участке, если такие найдутся, тоже должны быть в родстве по линиям Клавдии Кладовой?

« Последнее редактирование: 10 Июнь 2019, 20:07:50 от Yaroslav »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11140
  • Страна: az
  • Рейтинг +1896/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #203 : 10 Июнь 2019, 20:24:07 »
http://forum.molgen.org/index.php/topic,10629.0.html

Дико извиняюсь за капитано-очевидность, но все икс-хитросплетения между Ярославом и Марком (при заведомо известном родстве) можно посмотреть по схеме из вышеприведённой схемы (той, что для мужчин).

Достаточно шагнуть в третий круг, и станут очевидны все возможные доноры общего икса. Тем более, если мито не совпадают, то варианты сузятся.

Заглубляясь в изучение рандомного алгоритма икс-рекомбинации можно вызвать перегрев и задымление мозгов :)
Верьте мне, из икса самого по себе толком выудить мало что получится, и поэтому этот тест так и не получил самостоятельного широкого применения. Не считая редких случаев типа "внучка &патербабка"

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11140
  • Страна: az
  • Рейтинг +1896/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #204 : 11 Июнь 2019, 04:01:54 »
Ну как сказать...
Например, в случае Ярослава (икс-матч при известной генеалогии обоих субъектов) мы попадаем в третий (если смотреть от диаметра к центру) круг. 8 потенциальных предков. Мито-матча нет, поэтому уже 7.

При заведомо известных родословных точно указать предка не составит труда. При неизвестной родословной даже у одного из субъектов поиск становится практически нереализуемым.

Будем надеяться, что ситуация постепенно прояснится...

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #205 : 11 Июнь 2019, 07:46:18 »
Farroukh, проскочил мимо опубликованной тобой схемы. То есть, этот участок X-хромосомы у меня и у двоюродного племянника всё-таки от моей бабушки (мамы мамы).

Вопрос теперь, будут ли общие сегменты с совпаденцами на этом участке означать родство по линии моей бабушки (мамы мамы)?

Я вчера проверил у Марка, из 30 X-матчевых совпаденцев у него на этом участке никого.

У мамы около 180 X-совпаденцев, т.к. две X-хромосомы. Просмотрел вчера около 40, пока что на этом участке находятся какие-то иностранные тётьки:

7,78 cM; 700 SNP; 18935349 - 23083714   Donna KwapisVelez

6,51 cM; 650 SNP; 17718693 - 22520187   Mrs. Monica . Hägerstrand Selander

4,70 cM; 550 SNP; 13457293 - 17470897   Natalya B Reyes

5,89 cM; 600 SNP; 17718693 - 22398548   Terttu Makela

FTDNA всех вангует как 5th Cousin - Remote Cousin.

P.S. Если я по обыкновению потянул в этой теме одеяло слишком уж на себя, пусть тогда строгие модераторы перенесут мои сообщения ко мне на раён, в Старо-Оскольский уезд Курской губернии, т.к. моя X-хромосома родом оттуда :)
« Последнее редактирование: 11 Июнь 2019, 09:09:00 от Yaroslav »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 11140
  • Страна: az
  • Рейтинг +1896/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #206 : 11 Июнь 2019, 08:32:23 »
Ярослав, при имеющихся данных чётко установить общего предка со всеми указанными персонажами невозможно.  :)
Задача имеет более 9000 вариантов решений. КРоме шуток, ни денег, ни времени не хватит дополнительно протестировать такую уйму людей ради того, чтобы удостовериться в существовании общей конкретной пра...бабушки, жившей Б-г знает когда.

P.S. Я в свою ФФ вкладку даже не заглядываю, ибо там одни родственнчики от предков реликтового периода с пересечениями уровня 30-40 сМ.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #207 : 11 Июнь 2019, 08:50:50 »
Ярослав, при имеющихся данных чётко установить общего предка со всеми указанными персонажами невозможно.  :)
Задача имеет более 9000 вариантов решений. КРоме шуток, ни денег, ни времени не хватит дополнительно протестировать такую уйму людей ради того, чтобы удостовериться в существовании общей конкретной пра...бабушки, жившей Б-г знает когда.

P.S. Я в свою ФФ вкладку даже не заглядываю, ибо там одни родственнчики от предков реликтового периода с пересечениями уровня 30-40 сМ.

Тут по-моему как повезёт. Нужно списываться, узнавать места географических пересечений. Вроде как бывало, что выстреливало. Умные люди вообще говорят, что без хорошего годного генеалогического древа в такие тесты лучше вообще носа не казать :)

В твоей ситуации, понятно, что крайне на хватает протестированных из твоего региона. Такая же ситуёвина, если почитать форум, была и у нас, восточно-европейцев, ещё лет 7 назад. Зато наверно географически тебя и твоих земляков не так развозит по этнокалькуляторным картам, как нас. И возможно, что попадись в сети FTDNA твой 7-юродный родич, всё будет более чётко, чем у нас.

Понятно, что в случае иностранных подданных скепсис ещё выше, так как вряд ли кто-то из родичей моих ближайших предков мог мигрировать зарубеж.

Но, что интересно, если не ошибаюсь, в отличие от аутосом, здесь хотя бы сразу идёт хоть какое-никакое, но указание, откуда ветры дуют, в данном случае со стороны моей бабушки (мамы мамы).

Пробежался быстро по своим X-хромосомным совпаденцам, благо их у меня всего 11. У меня на этом участке находится один только польский дяденька. Есть ли он у мамы - пока что ещё не дошёл.

5,59 cM; 600 SNP; 10144807 - 13452805   Jerzy Pańkowski   5th Cousin - Remote Cousin
« Последнее редактирование: 11 Июнь 2019, 10:06:53 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11904
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2232/-10
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2-Y92117
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #208 : 11 Июнь 2019, 10:26:10 »
В силу особенностей Х-мачинга как раз среди женских матчей очень много составных УПСов. Все-таки здесь чаще идет цепочка HIR, а не сплошной цельный FIR.
Посему совпадение по Х между двумя мужчинами изначально выглядит более перспективным с точки зрения поиска общего предка. Даже в случае составного УПСа оный хотя бы состоит из более-менее солидных кусков.

Спасибо!

То есть, получается, что Паньковского хорошо бы проработать, возможно и будет какой-то толк.

Вспомнился мой с мамой аутосомный совпаденец Панков (уважаемый Punchic), мой старо-оскольский земляк. Но это так, скорее всего просто совпадение в сходстве фамилий, понятное дело. Вряд ли он даже наш общий совпаденец, позже проверю.

Оффлайн Punchic

  • Сообщений: 111
  • Страна: ru
  • Рейтинг +53/-0
  • Y-ДНК: R-YP5917
  • мтДНК: V1a1a
Re: Анализ родства по данным Х-хромосомы
« Ответ #209 : 11 Июнь 2019, 10:52:19 »

Спасибо!

То есть, получается, что Паньковского хорошо бы проработать, возможно и будет какой-то толк.

Вспомнился мой с мамой аутосомный совпаденец Панков (уважаемый Punchic), мой старо-оскольский земляк. Но это так, скорее всего просто совпадение в сходстве фамилий, понятное дело. Вряд ли он даже наш общий совпаденец, позже проверю.

Я уже проверил - просто совпадение  :( Да и польская ветка по Y, все отдаляется. TMRCA ~ 2ky. Аутосомы тоже ничего не показывают, даже несмотря на то, что прабабушка и прадед 7-юродные родственники от самого раннего Панкова. (ROH видно)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100