Анализ родства по данным Х-хромосомы

[RE-L124C41+]

Я имел ввиду количество совпаденцев в таблице матчей по Х. У женщин матчей по X обычно бывает гораздо больше, чем у мужчин.

Ясно, спасибо!

А по совпаденцам не получится? Я тоже сомневался, когда отправлял бабку и деда, но у бабки дед из Вильно и в совпаденцах выдало много литовцев, которых у деда не было, собственно так и определил.

Да там хрень какая-то) У них есть есть общие совпаденцы=) Но сами между собой не совпадают.  И везде когда-то непонятные "азиаты" пробегали. Вот я и засомневалась теперь.

upd

Код: [Выделить]

Largest segment = 4.4 cM
Total of segments > 3 cM = 21.0 cM
6 matching segments

 

[RE-L124C41+]

Я бы при сомнениях в такой ситуации, просто бы написал в суппорт. Так мол и так. Извините, но так вышло, что не уверен, где дедушка, а где бабушка. Не могли бы Вы глянуть.       

Ох, а можно так? Дед уже в батче на Y37 стоит. Может дождаться ответа?

[ankr21]

Я бы при сомнениях в такой ситуации, просто бы написал в суппорт. Так мол и так. Извините, но так вышло, что не уверен, где дедушка, а где бабушка. Не могли бы Вы глянуть.       

Ох, а можно так? Дед уже в батче на Y37 стоит. Может дождаться ответа?

Я думаю все будет нормально. Вы не перепутали. Я пока не встречал у мужчин больше 200 матчей по Х. Даже у евреев и финнов. А у T537877 их больше 2000. Значит это женщина.

[gecube_ru]

Все нормально. Не переживайте. Ничего не перепутали

[RE-L124C41+]

Я думаю все будет нормально. Вы не перепутали. Я пока не встречал у мужчин больше 200 матчей по Х. Даже у евреев и финнов. А у T537877 их больше 2000. Значит это женщина.

Все нормально. Не переживайте. Ничего не перепутали

Спасибо!

[Mich Glitch]

Проверил только своих мальчиков. При стандартных настройках, самое большее 600 матчей. T079447.     

[Mich Glitch]

Дед уже в батче на Y37 стоит.

Ещё лучше. Если игрек хромосомы не окажется - сами сообщат.   

Ждём-с.

[Mich Glitch]

Так. Есть девочка с 2000 матчей. Полагаю это допустимый максимум.
Причём первая в списке.

[Mich Glitch]

Вторая в списке. И тоже 2000 матчей.

У кавалеров попадался ноль матчей.

[ankr21]

Так. Есть девочка с 2000 матчей. Полагаю это допустимый максимум.
Причём первая в списке.

У девочек это норма. Будет интересно найти кого-то со 100 и менее матчей. 600 матчей у T079447 круто. может и больше бывает, но мне не попадались такие.

[ankr21]

Кстати, у меня два результата.
23andme - M093548 - 14 матчей,
FTDNA - T475560 - 46 матчей.
Вывод очевиден.

[Шад]

Решил и я пополнить ряды вопрошающих:)

Не понял следующего расклада по Х-хромосоме.

Сын и теща
hr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
X   97,530,969   154,886,032   85.0   5,645
Largest segment = 85.0 cM
Total of segments > 7 cM = 85.0 cM Actual.

Сын и тесть
Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
X   5,089,281   67,776,820   76.8   6,946
X   70,416,562   97,987,863   15.7   2,134
Largest segment = 76.8 cM
Total of segments > 7 cM = 92.5 cM Actual.

Сын и жена
Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
X   2,321   154,886,292   196.1   24,969
Largest segment = 196.1 cM
Total of segments > 7 cM = 196.1 cM Actual.

Жена и теща
Chr   Start Location   End Location   Centimorgans (cM)   SNPs
X   118,624   154,886,032   196.1   14,173
Largest segment = 196.1 cM
Total of segments > 7 cM = 196.1 cM Actual.

В принципе, всё как положено. Х-хромосома - от матери, один крупный сегмент - 196.1 сМ. Перешел к сыну от бабушки через мать. Правда есть расхождения по началу позиции и числу снипов. Что как-бы подразумевает какой-то сбой алгоритма.

Дальше - больше. Сын в сравнении с бабушкой уже показывает 85 сМ. И пересечение с дедушкой на 76,8 сМ.

Или я что-то не понимаю или это какая-то халтура со стороны GEDmatch.

[gecube_ru]

В Гедматче нет проблемы. А вот в ФТДНА есть. Я так понимаю, что у меня т.к. одна Х хромосома, то и результат должен быть один. Ан вон нет!

Как вот это объяснить?

"rs5940510","X","154683663","TT"
"rs12557310","X","154735698","CC"
"rs1454268","X","154758477","CC"
"rs6642287","X","154780283","--"
"rs1084451","X","154816439","CC"
"rs5940536","X","154821956","GG"
"rs5983743","X","154823227","AA"
"rs5940540","X","154833182","TT"
"rs5940403","X","154835342","CC"
"rs6642233","X","154866118","AA"
"rs676920","X","154880326","GG"
"rs553678","X","154892230","GG"
"rs659139","X","154898561","CC"
"rs669237","X","154916845","GG"
"rs35842692","X","4935714","AC"
"rs35361563","X","5411068","AG"
"rs17883004","X","1410495","GG"

[RE-L124C41+]

По дедушкиному Y пришел ответ R-M198. Теперь пойду читать другие ветки форума с целью просвещения=)

Киты не перепутались, все в порядке! Дорогие форумчане, спасибо за моральную поддержку!

[MikSa]

Подскажите, пожалуйста, если Х-совпадение в районе центромеры и сегменты больше 3сМ, но меньше 5сМ, при этом общее число сегментов по фтдна 20 при общей длине 70сМ и наибольшем сегменте 22сМ, можно ли уверенно считать, что родство именно по женской линии?