АвторТема: Оракул AdMix4  (Прочитано 36554 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #60 : 12 Ноябрь 2012, 17:00:16 »
Новая версия оракула: http://db.tt/y2GijTjP
Метод оценки расстояний улучшен - добавлены веса для компонентов, зависящие от количества этого компонента. Теперь разница между 60% и 70% имеет меньшее значение, чем между 5% и 15%.
В файле input.txt добавлен новый параметр - степень для весов. По умолчанию 2. Если поставить 0, то все веса получаются равными единице, что дает прежний метод наименьших квадратов.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #61 : 12 Ноябрь 2012, 17:20:38 »
Некоторые результаты.


Я теперь не такой британец, как раньше. Результаты практически на 100% соответствуют действительности:

1 Abhkasian+German-South+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,00141
2 Abhkasian+Belarusian_V+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,04718
3 Adygei+Belarusian_V+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,11503
4 Adygei+Polish_V+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,14574
5 Adygei+Croatian+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,16737
6 Abhkasian+Russian_cossack+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,1732
7 Abhkasian+Russian_North+Tartar_Mishar+Ukrainian_V @ 3,18196
8 Adygei+Russian_cossack+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,19064
9 Abhkasian+Polish_V+Russian_North+Tartar_Mishar @ 3,20915
10 Abhkasian+Russian_North+Tartar_Mishar+Ukrainian @ 3,22102



zastrug теперь намного в большей степени русский, чем раньше:

1 Latvian+Lithuanian_V+Russian_cossack+Russian_cossack @ 10,05619
2 Lithuanian+Lithuanian_V+Russian_cossack+Russian_cossack @ 10,1497
3 Lithuanian+Lithuanian_V+Lithuanian_V+Mordovian_V @ 10,1743
4 Latvian+Lithuanian_V+Polish_V+Russian_cossack @ 10,19984
5 Latvian+Lithuanian_V+Mordovian_V+Polish_V @ 10,23446
6 Lithuanian_V+Lithuanian_V+Mordovian_V+Polish_V @ 10,28758
7 Lithuanian_V+Polish_V+Russian+Russian_cossack @ 10,33425
8 Latvian+Lithuanian+Polish_V+Russian_cossack @ 10,34054
9 Lithuanian+Lithuanian_V+Polish_V+Russian_cossack @ 10,35548
10 Lithuanian+Polish_V+Russian_cossack+Russian_cossack @ 10,36669


VictorV:

1 Iberian+Lithuanian+Mordovian+Russian_V @ 6,89827
2 Russian_V+Russian_V+Russian_V+Sorb @ 6,97295
3 Lithuanian+Sorb+Tatar_Kryashen+Welsh @ 7,03285
4 Lithuanian+Mordovian+Russian_V+Spaniard @ 7,08547
5 Belarusian+Lithuanian+Orcadian+Tatar_Kryashen @ 7,11122
6 Iberian+Lithuanian+Mordovian+Sorb @ 7,11469
7 Iberian+Lithuanian+Mordovian+Welsh @ 7,12229
8 Iberian+Latvian+Lithuanian+Mordovian @ 7,12698
9 Russian_V+Russian_V+Sorb+Sorb @ 7,13063
10 Iberian+Latvian+Mordovian+Russian_V @ 7,14261

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10727
  • Страна: tt
  • Рейтинг +2053/-46
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #62 : 12 Ноябрь 2012, 17:31:20 »
Но в "классической" версии у меня поляки в основном, а здесь прибалты... Ну дай Бог будет прорыв по прямой отцовской линии - откуда  взялся прапрадед в начале 19 века в Тверской губернии, тогда и разберемся. Пока две основные версии - либо Ярославская губерния, либо губернии бывшего Литовского княжества.

North-East-European   69.53%
Atlantic_Mediterranean_Neolithic   20.41%
West-Asian   4.74%

1       52.9%    German-South (derived)    +   47.1%    North-East-European (ancestral)    @   2.58
2       61%    German_V (derived)    +   39%    North-East-European (ancestral)    @   2.71
3       91.9%    Polish_V (derived)    +   8.1%    Lithuanian_V (derived)    @   2.78
4       61.4%    Austrian (derived)    +   38.6%    North-East-European (ancestral)    @   2.79
5       76%    Polish_V (derived)    +   24%    Polish (derived)    @   2.81
6       98.1%    Polish_V (derived)    +   1.9%    North-East-European (ancestral)    @   2.81
7       99.5%    Polish_V (derived)    +   0.5%    Paleo-Siberean (ancestral)    @   2.82
8       95.9%    Polish_V (derived)    +   4.1%    Lithuanian (derived)    @   2.82
9       99.4%    Polish_V (derived)    +   0.6%    Koryak (derived)    @   2.83
10       93%    Belarusian_V (derived)    +   7%    North-East-European (ancestral)    @   2.84
11       93.2%    Polish_V (derived)    +   6.8%    Russian (derived)    @   2.84
12       96.6%    Polish_V (derived)    +   3.4%    Latvian (derived)    @   2.85
13       78.2%    Belarusian_V (derived)    +   21.8%    Lithuanian_V (derived)    @   2.86
14       99.7%    Polish_V (derived)    +   0.3%    East-Siberean (ancestral)    @   2.86
15       99.7%    Polish_V (derived)    +   0.3%    Nivhi (derived)    @   2.87
16       97.9%    Polish_V (derived)    +   2.1%    Belarusian (derived)    @   2.87
17       99.8%    Polish_V (derived)    +   0.2%    Chukchi (derived)    @   2.88
18       100%    Polish_V (derived)    +   0%    Pygmy (ancestral)    @   2.88
19       100%    Polish_V (derived)    +   0%    West-Asian (ancestral)    @   2.88
20       100%    Polish_V (derived)    +   0%    North-European-Mesolithic (ancestral)    @   2.88



Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #63 : 12 Ноябрь 2012, 17:37:00 »
У меня теперь вместо двух прибалтов и скандинава - два скандинава и прибалт:
1 Lithuanian_V+Swedish_V+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 6,84353
2 Russian_North+Swedish_V+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 7,14436
3 Russian+Swedish_V+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 7,19
4 Chuvash+Latvian+Swedish_V+Swedish_V @ 7,27533
5 Latvian+Mordovian+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 7,28493
6 Latvian+Swedish_V+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 7,34664
7 Lithuanian_V+Swedish_V+Swedish_V+Tatar @ 7,42492
8 Chuvash+Lithuanian_V+Swedish_V+Swedish_V @ 7,4328
9 Estonian+Swedish_V+Swedish_V+Tartar_Mishar @ 7,43576
10 Estonian+Swedish_V+Swedish_V+Tatar @ 7,44032

Может быть, игнорировать расхождения по компонентам, где наличие менее 2-3%? Так как шум обычно укладывается в эти количества.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #64 : 12 Ноябрь 2012, 17:43:38 »
Может быть, игнорировать расхождения по компонентам, где наличие менее 2-3%? Так как шум обычно укладывается в эти количества.
Можно. Это легко сделать поставив порог, например, 2,5 вместо 0,5. Но тогда будет сразу очень много разнообразных близких приближений.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #65 : 12 Ноябрь 2012, 17:47:13 »
Как бы то ни было, машина воспринимает меня на World22, при наличии тех или иных факторов, т.е. компонентов в базе, как сорба. Я уже писал и ещё раз повторюсь, что при общении с иностранцами в Эмиратах, где очень много народу с разных стран, при вопросе в мой адрес " ты откуда?" я отвечал ответом на вопрос: "а ты как думаешь?"( ну когда ясно, что не бритиш, по причине не идеального английского), получая  в ответ предположение, что я либо восточный немец, либо западный поляк.... Удивительно, но мнение машины на  World22  совпало объективным мнением людей работающих на международном поле, т.е. имеющих возможность салкиваться с разными людьми в различных точках Земного Шара.... A surprising  Phenomenon , т.е. на неком региональном расовом поле  де факто генетически мы таковы, какие мы есть в совокупности компонентов, которые в нас содержатся... но ведь именно так и складывались  отдельные этносы и народы, имея в себе различные компоненты! У меня в уме возникает аналогия со сложными проектами, которые содержат в себе уникальный набор компонентов и становятся в силу этого неповторимыми, но могут приводить к похожим результатам.
Мне кажется, у вас есть какая-то черточка, которая воспринимается людьми как однозначно центральноевропейская. Люди обычно судят по нескольким бросающимся в глаза показателям, а остальные факты подгоняют под уже сложившееся мнение. Боюсь, при помощи оракулов мы не вычислим, какие именно снипы отвечают за вашу восточногерманскость  :)

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #66 : 12 Ноябрь 2012, 17:50:02 »
Можно. Это легко сделать поставив порог, например, 2,5 вместо 0,5. Но тогда будет сразу очень много разнообразных близких приближений.
Нет, это порог разницы между компонентами, а надо игнорировать только компоненты, которых мало у самого человека. Допустим, убрать Сибирь (явная случайность) у уважаемого VictorV и Поволжье исчезнет. А значит, и родители с противоположной, европейской стороны станут поближе.
Провел эксперимент. Отредактировал входной файл, убрал большую часть Сибири и Indo-Iranian перекинул в West Asian:
1 Belarusian_V+Croatian_V+Russian_South+Russian_V @ 0
2 Croatian_V+Russian_South+Russian_South+Russian_V @ 0,90113
3 Croatian_V+Russian_South+Russian_V+Ukrainian-Center @ 1,24886
4 Belarusian+Belarusian_V+Croatian_V+Russian_V @ 1,42055
5 Croatian_V+Lithuanian_V+Russian_South+Russian_V @ 1,44089
6 Belarusian+Croatian_V+Russian_South+Russian_V @ 1,48597
7 Croatian_V+Polish_V+Russian_South+Russian_V @ 1,52919
8 Croatian_V+Russian_South+Russian_South+Ukrainian-West @ 1,58286
9 Belarusian_V+Croatian_V+Russian_South+Russian_South @ 1,62988
10 Belarusian_V+Croatian_V+Lithuanian_V+Russian_V @ 1,63251

Вот вам и русский юг, и Малороссия, и прапрабабушка-болгарка. Надо было, конечно, подогнать количества, чтобы в сумме было 100%, но и так вроде нормально.
« Последнее редактирование: 12 Ноябрь 2012, 17:57:33 от Srkz »

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #67 : 12 Ноябрь 2012, 17:53:51 »
Нет, это порог разницы между компонентами, а надо игнорировать только компоненты, которых мало у самого человека. Допустим, убрать Сибирь (явная случайность) у уважаемого VictorV и Поволжье исчезнет. А значит, и родители с противоположной, европейской стороны станут поближе.
А, понял. Сейчас сделаем. Это легко.

Пока что результаты Eugene:

1 Finnish-South+Latvian_V+Lithuanian+Mordovian @ 8,50417
2 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,53246
3 Estonian+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,5401
4 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Polish_V @ 8,54097
5 Estonian+Finnish-South+Latvian_V+Mordovian @ 8,60337
6 Estonian+Finnish-South+Latvian_V+Tartar_Mishar @ 8,65033
7 Finnish-North+Latvian_V+Mordovian+Polish_V @ 8,65579
8 Finnish-North+Latvian_V+Lithuanian+Mordovian @ 8,67458
9 Finnish-North+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,71638
10 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Russian_South @ 8,7429


Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #68 : 12 Ноябрь 2012, 18:01:44 »
Пока что результаты Eugene:

1 Finnish-South+Latvian_V+Lithuanian+Mordovian @ 8,50417
2 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,53246
3 Estonian+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,5401
4 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Polish_V @ 8,54097
5 Estonian+Finnish-South+Latvian_V+Mordovian @ 8,60337
6 Estonian+Finnish-South+Latvian_V+Tartar_Mishar @ 8,65033
7 Finnish-North+Latvian_V+Mordovian+Polish_V @ 8,65579
8 Finnish-North+Latvian_V+Lithuanian+Mordovian @ 8,67458
9 Finnish-North+Latvian_V+Mordovian+Swedish @ 8,71638
10 Finnish-South+Latvian_V+Mordovian+Russian_South @ 8,7429

Финны и прибалты это круто, а вот Поволжье не очень (в данном случае :) ).
« Последнее редактирование: 12 Ноябрь 2012, 18:08:52 от Srkz »

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #69 : 12 Ноябрь 2012, 18:17:18 »
А вот уважаемый VictorV, если убрать Сибирь и распределить ее между европейскими компонетами, но West Asian и Indo-Iranian не трогать:
1 Iberian+Lithuanian+Mordovian+Welsh @ 4,72829
2 Russian_V+Russian_V+Sorb+Sorb @ 4,85616
3 Iberian+Lithuanian+Mordovian+Orcadian @ 4,96413
4 Belarusian+Russian_V+Russian_V+Welsh @ 5,04138
5 Basque+Russian_V+Russian_V+Sorb @ 5,09118
6 Lithuanian+Russian_V+Russian_V+Sorb @ 5,14006
7 Czech+Russian_V+Russian_V+Sorb @ 5,17348
8 Lithuanian+Russian_V+Russian_V+Welsh @ 5,19161
9 Iberian+Lithuanian+Russian_V+Welsh @ 5,21121
10 Lithuanian+Russian_V+Russian_V+Spaniard @ 5,2195

Все-таки сорбы появляются из низкого WA и высокого I-I. В Европе самый высокий Indo-Iranian у норвежцев, рядом оркнейцы, британцы и шведы. Что бы это значило? Похоже, действительно следы очень давнего расселения, если между собой пересекаются горный Афганистан и окраина Европы
« Последнее редактирование: 12 Ноябрь 2012, 18:35:42 от Srkz »

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4778
  • Страна: ru
  • Рейтинг +345/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3127
  • мтДНК: V16
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #70 : 12 Ноябрь 2012, 18:33:25 »
Мне кажется, у вас есть какая-то черточка, которая воспринимается людьми как однозначно центральноевропейская. Люди обычно судят по нескольким бросающимся в глаза показателям, а остальные факты подгоняют под уже сложившееся мнение. Боюсь, при помощи оракулов мы не вычислим, какие именно снипы отвечают за вашу восточногерманскость  :)
Я о совпадении мнений людей и машины и это очень странно - люди говорят об антропологии, а машина о  наборе похожих участков генома. Скорее всего действительно это просто совпадение, хотя огромное число приближений, причём  в разных проектах, именно с поляками,  говорит о многом. Например в AF 23andMe я имею по рейтингу на первом месте Польшу при любой установке ползунка по сМ, на втором месте Россия, на третьем Германия.
Не пойму только одного, если мы говорим по близости сорбов по генам к русским и украинцам с белорусами, почему ни у кого кроме меня сорбы в результатах  не отметились, хотя по логике должны были бы. По хорошему надо бы разобраться - не баг ли в методике? Если он, то понять где и ликвидировать его.
Касательно восточно-германскости, так я  под ней  и  подразумеваю западно-славянскость. Большая часть восточных немцев и есть онемеченные  полабы,  ободриты и сорбы - вы только взгляните на название восточно-германских городов и местечек - например: Пулов,  Лютов, Любек, Росток, Пора. Дассов. Зелен, Деммин, Козеров, Иннович, Румор, Мильцов, Гремич, Крёслин, Мильцов, Крокау.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #71 : 12 Ноябрь 2012, 18:38:16 »
Мне кажется, у вас есть какая-то черточка, которая воспринимается людьми как однозначно центральноевропейская. Люди обычно судят по нескольким бросающимся в глаза показателям, а остальные факты подгоняют под уже сложившееся мнение. Боюсь, при помощи оракулов мы не вычислим, какие именно снипы отвечают за вашу восточногерманскость  :)
Я о совпадении мнений людей и машины и это очень странно - люди говорят об антропологии, а машина о  наборе похожих участков генома. Скорее всего действительно это просто совпадение, хотя огромное число приближений, причём  в разных проектах, именно с поляками,  говорит о многом. Например в AF 23andMe я имею по рейтингу на первом месте Польшу при любой установке ползунка по сМ, на втором месте Россия, на третьем Германия.
Не пойму только одного, если мы говорим по близости сорбов по генам к русским и украинцам с белорусами, почему ни у кого кроме меня сорбы в результатах  не отметились, хотя по логике должны были бы. По хорошему надо бы разобраться - не баг ли в методике? Если он, то понять где и ликвидировать его.
Касательно восточно-германскости, так я  под ней  и  подразумеваю западно-славянскость. Большая часть восточных немцев и есть онемеченные  полабы,  ободриты и сорбы - вы только взгляните на название восточно-германских городов и местечек - например: Пулов,  Лютов, Любек, Росток, Пора. Дассов. Зелен, Деммин, Козеров, Иннович, Румор, Мильцов, Гремич, Крёслин, Мильцов, Крокау.
Да, я тоже подразумевал западных славян. Почему у вас появились сорбы, понятно - это особенность тех 5% ваших генов, которые сближают вас именно с ними, и не похожи на типичный русский набор. Но Indo-Iranian действительно очень интересный компонент, сейчас напишу о нем.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #72 : 12 Ноябрь 2012, 18:44:52 »
Новая версия: http://db.tt/0FN1Qhpr
Как всегда, без обратной совместимости.  ;D
В input.txt сейчас можно указать пороговое значение  компонентов. Если какой-то из них оказывается меньше этого порога, то приравнивается к нулю. После обнуления всех незначительных компонентов, остальные пропорционально увеличиваются, чтобы сумма была 100%.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 6129
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #73 : 12 Ноябрь 2012, 18:47:56 »
Я посмотрел распределение Indo-Iranian (далее ИИ), он встречается в заметных количествах (84,4) исключительно у реликтового этноса калашей в горах Афганистана. У их соседей - пуштунов, его уже только 8,7%. У норвежцев количество ИИ сравнимо с индусами (3,8 и 4%)! Предполагаю, что во время миграций древних племен из Малой Азии на Запад и на Восток эти снипы были распространены заметно сильнее, но потом вымылись из генофонда и сохранились только в двух изолированных зонах. Или это была не Малая Азия? Надо уточнить происхождение калашей.
Update: В общем, я не готов рассуждать, откуда взялся в Европе ИИ, но компонент явно очень древний и специфичный.
Уважаемый VictorV: West Asian 2,31 ; Indo-Iranian 2,48 ;
Sorb:                        West Asian 3,7 ; Indo-Iranian 1,8 ;
Russian_V                West Asian 4 ; Indo-Iranian 1,1 ;
Ukrainian_V              West Asian 7,4 ; Indo-Iranian 0,7 ;
« Последнее редактирование: 12 Ноябрь 2012, 19:02:14 от Srkz »

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4778
  • Страна: ru
  • Рейтинг +345/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3127
  • мтДНК: V16
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #74 : 12 Ноябрь 2012, 19:02:21 »
Я посмотрел распределение Indo-Iranian (далее ИИ), он встречается в заметных количествах (84,4) исключительно у реликтового этноса калашей в горах Афганистана. У их соседей - пуштунов, его уже только 8,7%. У норвежцев количество ИИ сравнимо с индусами (3,8 и 4%)! Предполагаю, что во время миграций древних племен из Малой Азии на Запад и на Восток эти снипы были распространены заметно сильнее, но потом вымылись из генофонда и сохранились только в двух изолированных зонах. Или это была не Малая Азия? Надо уточнить происхождение калашей.
Update: В общем, я не готов рассуждать, откуда взялся в Европе ИИ, но компонент явно очень древний и специфичный.
Поразительно, но моя Y J1-L1189+ некогда явилась из Малой Азии, причём на этой же ветке находятся несколько немцев, норвежец и шотландец. Понятное дело, что  напрямую связывать аутосомы и Y не имеет смысла, но тем не менее наводку то эти связи, хотя и смутную, но  всё-таки дают!
« Последнее редактирование: 12 Ноябрь 2012, 19:12:51 от VictorV. »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100