АвторТема: Оракул AdMix4  (Прочитано 32921 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #30 : 10 Ноябрь 2012, 20:48:52 »
Сегодня экспериментировал над тем же. Отсортировал популяции по наличию Северо-Восточной Европы. В моем случае оказалось, что популяции после 70-й можно отбросить - они все равно никогда не выпадают. Для вас порог будет, конечно, дальше. Комбинации в основном получились менее правдоподобные, но усредненное местоположение примерно там же, что и в JTest.

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 325
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #31 : 10 Ноябрь 2012, 20:58:50 »
У меня ближе всего получился микс балкарцы+белорусы+татары-мишари+британцы.  ???

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #32 : 10 Ноябрь 2012, 21:04:48 »
У меня первая тройка:
1. Latvian; Estonian; Orcadian; Chuvash;  2.65
2. Lithuanian_V; Estonian; Norwegian_V; Chuvash;  2.65
3. Lithuanian_V; Estonian; Swedish_V; Tatar;  2.65
Тоже сдвиг на северо-запад.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #33 : 10 Ноябрь 2012, 21:08:21 »
А по моему - не лучше:
Теперь, я, конечно, полнейший прусс, Но где же моя русская суть?


Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #34 : 10 Ноябрь 2012, 21:18:18 »
Подождем файла для Восточной Европы. Но хотя бы это уже не Германия и не Атлантический океан  8)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #35 : 10 Ноябрь 2012, 22:06:20 »
Самый интересный случай (PM094847M1):

Расстояния очень большие. По калькулятору получается комбинация Поволжье/Север/Россия/Балканы, но откуда при этом взялись 5% Африки, загадка. Возможно, Ближний Восток?


Мама, но ее данные сгенерированы, поэтому могут быть ошибки.

M094956:

По четырем главным европейским компонентам идеально подходит к West_Russian, однако из-за низкого Средиземноморья и высокой Турции расстояния сравнительно большие.

Отец.

M054647:

Тут хотя бы эрзя вместо коми  ;D Видимо,тоже микс

Микс только я. Тут по линии отца сестра бабушки, эрзян нет.

M362901:
Ярко выраженное Поволжье

Бабушка, эрзянка.

Оффлайн Clavis

  • Сообщений: 1544
  • Страна: ru
  • Рейтинг +103/-0
  • y+mito-search: RK448
    • Семёнов Михаил Юрьевич домашняя страничка
  • Y-ДНК: G2a2b2a1a1a2a (L1264+)
  • мтДНК: HV9, ранее известная как HV3a
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #36 : 11 Ноябрь 2012, 00:59:16 »
Интересно, для данных от Family Finder сделают такую же программу?

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 325
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #37 : 11 Ноябрь 2012, 06:36:11 »
А по моему - не лучше:
У меня чуток лучше. Хотя все равно очень забавно и действительности не особо соответствует.
Получаюсь, что я родом прямо из Чернобыльской зоны (из ее белорусской части - радиационно-экологический заповедник "Полесье"). Ну, оно и понятно - где еще такие мутанты могут водиться.  ;D
Либо, как вариант, один из моих родителей жил в Западном Казахстане, к северу от Каспия возле Атырау (Гурьев) - ну, это еще куда ни шло.
Но вот другой - прямо в центре Дании, возле городка Videbaek.  Однако... ???

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 325
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #38 : 11 Ноябрь 2012, 06:48:39 »
Завершил оптимизацию и отладку. Все равно работает ОЧЕНЬ медленно.  :(
В принципе и ясно - объем вычислений почти в 250 раз больше, чем при использовании J-Testa Поляко. Получается более 90 миллиардов значений, которые надо обработать.

Думаю, частично сократить набор используемых популяций. 253 - это чересчур. Даже сокращение его примерно на треть уже даст выигрыш в скорости в 5 раз.

Кстати, а что это за выборки: Russian_V, Belarusian_V и т.п. Чем они отличаются от просто Russian и Belarusian?

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #39 : 11 Ноябрь 2012, 07:20:08 »
Кстати, а что это за выборки: Russian_V, Belarusian_V и т.п. Чем они отличаются от просто Russian и Belarusian?
По аналогии с Dodecad предполагаю, что это выборки из состава участников проекта Веренича, а популяции без буквы V взяты из общедоступных источников.

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #40 : 11 Ноябрь 2012, 07:25:28 »
Мама, но ее данные сгенерированы, поэтому могут быть ошибки.
То есть это фазированные данные? Я хотел сгенерировать данные отца (он умер) путем вычитания из моего генома генома матери, это такой же метод? Разница получается очень большая

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #41 : 11 Ноябрь 2012, 08:24:11 »
А меня посчитать можно?

M235407 - я
M035833 - мама (Волга, отчасти эрзя)
M233048 - двоюродный брат с материнской стороны
M233435 - тетя по отцу (белорусы)
M000047 - муж-украинец (Сумская + Днепропетровская обл.)
Пожалуйста:
M235407 - я:
1. East_Russian ; UA ; UA ; LIT ;  4.24
2. Ukrainian-Russian ; East_Russian ; UA ; LIT ;  4.24
3. UA ; UA ; LIT ; Erzya ;  4.36
4. West_Russian ; East_Russian ; UA ; LIT ;  4.47
5. East_Russian ; UA ; Belorussian ; LIT ;  4.47
6. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ;  4.47
7. Ukrainian-Russian ; UA ; LIT ; Erzya ;  4.47
8. East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; UA ;  4.47
9. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ;  4.58
10. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; LIT ;  4.58
11. North_Russian ; UA ; UA ; LIT ;  4.58
12. East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; LIT ;  4.58
13. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ; LIT ;  4.58
14. Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Belorussian ; LIT ;  4.58
15. East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Belorussian ;  4.58
16. Ukrainian-Russian ; North_Russian ; UA ; LIT ;  4.58
17. Northwest_Russian ; UA ; UA ; Erzya ;  4.58
18. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ; LIT ;  4.69
19. UA ; Belorussian ; LIT ; Erzya ;  4.69
20. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; LIT ;  4.69
Если знать о беларусах по отцу, UA+LIT можно посчитать за Беларусь  :) И в каждой комбинации один предок получился с Волги. Вообще, конечно, доминирует Украина.

M035833 - мама (Волга, отчасти эрзя):
1. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ;  3.16
2. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ; Erzya ;  3.16
3. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ;  3.46
4. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Erzya ;  3.46
5. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Belorussian ; Erzya ;  3.46
6. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ;  3.46
7. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Erzya ;  3.46
8. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; North_Russian ; Northwest_Russian ;  3.61
9. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; LIT ;  3.61
10. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ;  3.61
11. Ukrainian-Russian ; East_Russian ; LIT ; Erzya ;  3.61
12. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ; Erzya ;  3.61
13. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; Erzya ;  3.74
14. Ukrainian-Russian ; East_Russian ; East_Russian ; LIT ;  3.74
15. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; North_Russian ;  3.74
16. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; North_Russian ; LIT ;  3.74
17. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ; Komi ;  3.74
18. Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ;  3.74
19. East_Russian ; UA ; LIT ; Erzya ;  3.74
20. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ;  3.74
И часть Украины, похоже, досталась от мамы. Или так сложились гены, или Волга была сравнительно южная.

M233048 - двоюродный брат с материнской стороны:
1. West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; Erzya ;  3.61
2. West_Russian ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Erzya ;  3.61
3. West_Russian ; West_Russian ; UA ; Erzya ;  3.74
4. Northwest_Russian ; Erzya ; Erzya ; HU ;  3.74
5. LIT ; Erzya ; Erzya ; HU ;  3.74
6. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Erzya ;  3.87
7. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; HU ; Udmurt ;  3.87
8. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ; Erzya ;  3.87
9. West_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Udmurt ;  3.87
10. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ; HU ;  4
11. West_Russian ; West_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ;  4
12. West_Russian ; West_Russian ; PL ; Erzya ;  4
13. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; PL ; Erzya ;  4
14. LIT ; Erzya ; Erzya ; RO ;  4
15. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Udmurt ;  4
16. UA ; UA ; Erzya ; Erzya ;  4
17. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ;  4
18. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; PL ; Udmurt ;  4
19. UA ; PL ; Erzya ; Erzya ;  4.12
20. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ; RO ;  4.12
Близко к типичным русским

M233435 - тетя по отцу (белорусы):
1. North_Russian ; UA ; Belorussian ; Belorussian ;  4
2. North_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Belorussian ;  4.12
3. North_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; UA ;  4.12
4. North_Russian ; UA ; UA ; Belorussian ;  4.24
5. North_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; PL ;  4.24
6. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; Belorussian ;  4.24
7. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ;  4.24
8. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; UA ;  4.24
9. North_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; Belorussian ;  4.24
10. North_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; PL ;  4.24
11. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Belorussian ;  4.24
12. East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Belorussian ;  4.24
13. North_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; PL ;  4.36
14. North_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; UA ;  4.36
15. Ukrainian-Russian ; Belorussian ; Belorussian ; Belorussian ;  4.36
16. Ukrainian-Russian ; North_Russian ; Belorussian ; Belorussian ;  4.36
17. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Belorussian ; Belorussian ;  4.36
18. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ;  4.36
19. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ;  4.36
20. Ukrainian-Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ;  4.36
Получилось Беларусь+Балтика+Украина, в среднем как раз где-то в Беларуси.

M000047 - муж-украинец (Сумская + Днепропетровская обл.):
1. UA ; UA ; UA ; UA ;  4
2. UA ; UA ; UA ; PL ;  4.12
3. UA ; UA ; UA ; Belorussian ;  4.24
4. UA ; UA ; UA ; EE ;  4.24
5. UA ; UA ; UA ; South_Finnish ;  4.36
6. UA ; UA ; PL ; PL ;  4.47
7. UA ; UA ; Belorussian ; PL ;  4.47
8. UA ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ;  4.47
9. UA ; LIT ; EE ; Serbian ;  4.47
10. UA ; Belorussian ; Belorussian ; HU ;  4.47
11. Ukrainian-Russian ; UA ; UA ; UA ;  4.47
12. Belorussian ; Belorussian ; Belorussian ; HU ;  4.58
13. UA ; Belorussian ; EE ; HU ;  4.58
14. UA ; Belorussian ; LIT ; Serbian ;  4.58
15. Ukrainian-Russian ; UA ; UA ; PL ;  4.58
16. Belorussian ; Belorussian ; LIT ; Serbian ;  4.58
17. UA ; Belorussian ; LIT ; HU ;  4.58
18. UA ; UA ; UA ; East_Finnish ;  4.58
19. West_Russian ; UA ; UA ; UA ;  4.69
20. UA ; UA ; LIT ; HU ;  4.69
Украина получилась лучше всего  :D

Онлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2255/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #42 : 11 Ноябрь 2012, 08:26:03 »
И на этом сеанс профессора Макдональда пока закончен  ;D ;D

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 325
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #43 : 11 Ноябрь 2012, 12:29:57 »
25 первых моих результатов:

Balkarian+Belarusian_V+British+Tartar_Mishar @ 3,545825
Balkarian+Belarusian_V+CEU+Tartar_Mishar @ 3,61545
Balkarian+Belarusian_V+Orcadian+Tartar_Mishar @ 4,165825
Balkarian+British+Polish_V+Tartar_Mishar @ 4,206325
Balkarian+French+Lithuanian_V+Tartar_Mishar @ 4,21995
Adygei+Belarusian_V+British+Tartar_Mishar @ 4,22045
Balkarian+Slovakian+Swedish+Tartar_Mishar @ 4,25395
Belarusian_V+CEU+Cirkassian+Tartar_Mishar @ 4,2997
Balkarian+Czech+Swedish+Tartar_Mishar @ 4,31445
Adygei+Belarusian_V+Orcadian+Tartar_Mishar @ 4,3367
British+Cirkassian+Russian_South+Tartar_Mishar @ 4,33907499999999
Belarusian_V+British+Cirkassian+Tartar_Mishar @ 4,361325
Adygei+Belarusian_V+CEU+Tartar_Mishar @ 4,433825
Balkarian+British+Russian_cossack+Tartar_Mishar @ 4,44595
Cirkassian+German-South+Polish+Tartar_Mishar @ 4,4492
British+Cirkassian+Polish_V+Tartar_Mishar @ 4,480575
Balkarian+CEU+Polish_V+Tartar_Mishar @ 4,48095
Balkarian+French+Russian+Tartar_Mishar @ 4,481325
British+Cirkassian+Russian_cossack+Tartar_Mishar @ 4,4952
British+Cirkassian+Tartar_Mishar+Ukrainian @ 4,5747
Balkarian+CEU+Sorb+Tartar_Mishar @ 4,601575
Cirkassian+German-North+Slovakian+Tartar_Mishar @ 4,621325
CEU+Cirkassian+Polish_V+Tartar_Mishar @ 4,62394999999999
British+Cirkassian+Tartar_Mishar+Ukrainian-East @ 4,64195
Belarusian_V+British+Kabardinian+Tartar_Mishar @ 4,648575

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19613
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1483/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #44 : 11 Ноябрь 2012, 12:53:34 »
Мама, но ее данные сгенерированы, поэтому могут быть ошибки.
То есть это фазированные данные? Я хотел сгенерировать данные отца (он умер) путем вычитания из моего генома генома матери, это такой же метод? Разница получается очень большая

Ага. Разница ощутима.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100