АвторТема: Оракул AdMix4  (Прочитано 32915 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Оракул AdMix4
« : 09 Ноябрь 2012, 19:31:48 »
Я решил сочинить собственный Оракул на основе JTest Polako - для людей, у который среди ближайших предков присутствует более двух народов. Метод расчета следующий: допустим, каждый из предков точно соответствует какой-либо из исходный популяций Полако, и каждый из предков передает своему потомку одинаковый процент генов. Попробуем перебрать все сочетания и выберем варианты с наименьшим среднеквадратичным отклонением. К сожалению, для восьми предков количество сочетаний очень велико, поэтому пока посчитал для четырех.

Update 3:

Статистика по доле генома, наследуемого от каждого из четырех предков

Update 2:  С 4 декабря Оракул четырех предков доступен в полном объеме на сайте gedmatch.com (для калькуляторов, у которых есть и обычный оракул - это все калькуляторы проектов MDLP, DODECAD, Harappa и калькуляторы JTest, EUTest проекта Eurogenes). Используйте кнопку Oracle-4 на странице вывода результатов нужного калькулятора. Расчет делается методом минимизации среднеквадратичного отклонения, результаты могут несколько отличаться от выложенных ранее в этой теме из-за различия в исходных данных популяций.

Update:
Уважаемый Alex AXe разработал программу, рассчитывающую возможных четырех предков по разным алгоритмам и с возможностью подстановки данных из разных калькуляторов.
Версия 0.97 (самая свежая на момент изменения этого сообщения): http://db.tt/634mFXL2
Комментарий автора:
Сделал нормальную реализацию метода постоянной дисперсии и нормальную нормировку расстояний в нем. Удалось немножко его оптимизировать.

Полностью пересмотрел модель шума и порогов.
Теперь не используется параметр "порог метода", вместо него в соответствующей строчке файла input.txt нужно поставить 1 для использования gaussian-метода и 0 для его отключения. Метод наименьших квадратов будет использован в обоих случаях.

Формат input.txt для версии 0.97:
1-я строка: имя (условное) человека, чьи данные анализируются.
2-я строка: имя файла с данными популяций
3-я строка: имя файла с результатами
4-я строка: число выдаваемых результатов приближений. Для режима 4-х предков будет выдано удвоенное число результатов.
5-я строка: минимальный порог компонентов. Значения меньше его будут отброшены. Для автоопределения порога нужно ввести минус единицу.
6-я строка: 1 для использования Gaussian или же 0 для использования только LSM
7-я и далее строки: значения компонентов

Кстати, долгожданный графический интерфейс готов. Сделал его отдельной программой. При запуске нужно выбрать используемый калькулятор (путем указания файла с данными популяций) и потом ввести значения для конкретного человека.
После нажатия на кнопку "Go!" будет сгенерирован input.txt и запустится внешняя программа расчетов.
Можно одновременно запускать несколько для разных данных одного калькулятора (так как input.txt читается только в момент начала расчетов). Естественно, выходные файлы указывать разными. Смотреть их все так же -блокнотом.

Версия 0,95: http://db.tt/q5pEFZCh

Комментарии автора (несколько отредактированы для удобства):

Просто редактируйте файл input.txt подставляя туда свои значения из результатов калькулятора (вместо прочерков для отсутствующих компонент вводите нули).

В начале файла input.txt указываются следующие параметры:
1. Имя (условное) тестируемого. Сделано для удобства идентификации данных, также это имя потом указывается в выходном файле.
2. Имя файла с данными популяций.
3. Имя файла с результатами. Сделано для удобства.
4. Число выдаваемых приближений.
5. Порог компонента. Значения компонентов, которые меньше его, принимаются равными нулю.
6. Порог метода. При вычислении расстояний между данными и приближением, расстояние между компонентами, меньшие этого порога, не учитываются.
7. Номер метода вычисления расстояний, который будет использован. Доступно 8 методов с номерами от 0 до 7, показавших наилучшие результаты. Ноль соответствует методу квадратов. Если указать в качестве номера метода отрицательное число, то будут последовательно использованы все методы.

Как и было обещано, теперь выдаются приближения не только для 4 предков, но и для меньшего их числа. В случае 3-х предков, считается, что первый - это один из родителей, а остальные двое - это бабушка и дедушка со стороны другого родителя.


Окончание первоначального сообщения:
Результаты уважаемого Alex AXe:

1. EE ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  3.74
2. LIT ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  3.87
3. LIT ; Komi ; North_Swedish ; GE ;  3.87
4. LIT ; Komi ; South_&_Central_Swedish ; GE ;  4
5. LIT ; Komi ; NO ; GE ;  4.12
6. LIT ; Udmurt ; North_Swedish ; GE ;  4.24
7. LIT ; Udmurt ; South_&_Central_Swedish ; GE ;  4.24
8. LIT ; Komi ; West_&_Central_German ; Lezgin ;  4.36
9. LIT ; Komi ; NL ; Lezgin ;  4.36
10. LIT ; Southwest_Finnish ; Udmurt ; GE ;  4.36
11. EE ; Southwest_Finnish ; Udmurt ; GE ;  4.36
12. EE ; Erzya ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
13. LIT ; Udmurt ; NO ; GE ;  4.47
14. EE ; East_Russian ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
15. LIT ; Komi ; English ; Lezgin ;  4.47
16. LIT ; Komi ; Orcadian ; Lezgin ;  4.47
17. LIT ; East_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
18. Belorussian ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  4.58
19. EE ; East_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.58
20. Erzya ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.58

Мы видим в каждом из сочетаний одного жителя Кавказа и одного жителя Поволжья, что, как мы знаем точно соответствует истине. К сожалению, ни чеченцев, ни татар среди исходных популяций Поляко нет. Однако на месте, где должны быть русские, появляются более северные и западные народы. Впрочем, такое отклонение для Alex AXe было видно и в других оракулах, видимо, так сложились гены.
« Последнее редактирование: 22 Октябрь 2013, 10:16:51 от Srkz »

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #1 : 09 Ноябрь 2012, 19:33:55 »
Результаты уважаемого Y-Chrome:
1. West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.29
2. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.29
3. UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.29
4. EE ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.29
5. UA ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.29
6. PL ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.39
7. Belorussian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.39
8. West_Russian ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.39
9. Belorussian ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.39
10. UA ; UA ; East_Russian ; Komi ;  5.39
11. PL ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.48
12. UA ; West_Russian ; West_Russian ; Komi ;  5.48
13. UA ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Komi ;  5.48
14. UA ; PL ; East_Russian ; Komi ;  5.48
15. Belorussian ; UA ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.48
16. EE ; UA ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.48
17. Belorussian ; UA ; East_Russian ; Komi ;  5.48
18. UA ; UA ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.57
19. PL ; Ukrainian-Russian ; East_Russian ; Komi ;  5.57
20. EE ; West_Russian ; Ukrainian-Russian ; Komi ;  5.57

Здесь просто в яблочко - как я понял, у Y-Chrome 3/4 предков - русские Урала и 1/4 - Украина

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #2 : 09 Ноябрь 2012, 19:44:13 »
Мои результаты:

1. East_Russian ; North_Russian ; Southwest_Finnish ; UA ;  4
2. Belorussian ; East_Russian ; East_Russian ; Southwest_Finnish ;  4.12
3. Komi ; Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ; UA ;  4.12
4. Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ; UA ; Udmurt ;  4.12
5. North_Russian ; North_Russian ; Southwest_Finnish ; UA ;  4.12
6. South_Finnish ; UA ; UA ; Udmurt ;  4.12
7. East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ;  4.12
8. East_Russian ; East_Russian ; Southwest_Finnish ; UA ;  4.12
9. Belorussian ; Southwest_Finnish ; UA ; Udmurt ;  4.12
10. Belorussian ; South_Finnish ; UA ; Udmurt ;  4.12
11. Belorussian ; East_Russian ; North_Russian ; Southwest_Finnish ;  4.24
12. East_Russian ; East_Russian ; LIT ; Southwest_Finnish ;  4.24
13. East_Russian ; East_Russian ; South_Finnish ; UA ;  4.24
14. Belorussian ; Belorussian ; Southwest_Finnish ; Udmurt ;  4.24
15. LIT ; Southwest_Finnish ; UA ; Udmurt ;  4.24
16. Belorussian ; Komi ; Southwest_Finnish ; UA ;  4.24
17. Belorussian ; Komi ; Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ;  4.24
18. Komi ; Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ; West_Russian ;  4.36
19. East_Russian ; North_Russian ; Southwest_Finnish ; West_Russian ;  4.36
20. Belorussian ; Northwest_Russian ; Southwest_Finnish ; Udmurt ;  4.36

Я не знаю большинство своих предков, до генотипирования считал, что у меня все русские. Один из моих дедушек Ukrainian-Russian, также я подозреваю на основании RelFinder и калькуляторов сильную связь с двумя районами - Русский Север/Финляндия и Сибирь/Поволжье. Посмотрим, что покажет расчет восьми предков.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #3 : 09 Ноябрь 2012, 20:27:54 »
Уважаемый Mouglley:

1. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  2.45
2. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  2.45
3. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  2.65
4. UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3
5. UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3
6. East_Russian ; UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3
7. Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.16
8. Erzya ; UA ; UA ; Ukrainian-Russian ;  3.16
9. PL ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.16
10. Erzya ; UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.16
11. Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.16
12. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.16
13. North_Russian ; UA ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.16
14. East_Russian ; UA ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.32
15. HU ; North_Russian ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.32
16. Erzya ; HU ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.32
17. UA ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.32
18. Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.32
19. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.32
20. Belorussian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.32

Как мы помним, Ukrainian-Russian это Курск  :) Кого-нибудь еще посчитать?

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7904
  • Страна: hr
  • Рейтинг +433/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #4 : 09 Ноябрь 2012, 21:22:18 »
Хорошая метода.
Я - чисто хохло-кацап.

А вообще, наверное, Ваш метод надо бы изложить поподробнее и представить в каком-нибудь блоге.

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4573
  • Страна: ru
  • Рейтинг +307/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3128
  • мтДНК: V16
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #5 : 10 Ноябрь 2012, 00:16:06 »
Как мы помним, Ukrainian-Russian это Курск  :) Кого-нибудь еще посчитать?
Меня пожалуйста посчитате... M135314

Онлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10299
  • Страна: tt
  • Рейтинг +1730/-45
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #6 : 10 Ноябрь 2012, 00:49:00 »
Интересно.. Если будет время и желание - я, русский M214648, сын русский-украинец M890743

Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 325
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #7 : 10 Ноябрь 2012, 02:24:39 »
Я решил сочинить собственный Оракул на основе JTest Polako - для людей, у который среди ближайших предков присутствует более двух народов. Метод расчета следующий: допустим, каждый из предков точно соответствует какой-либо из исходный популяций Полако, и каждый из предков передает своему потомку одинаковый процент генов. Попробуем перебрать все сочетания и выберем варианты с наименьшим среднеквадратичным отклонением. К сожалению, для восьми предков количество сочетаний очень велико, поэтому пока посчитал для четырех.

Результаты уважаемого Alex AXe:

1. EE ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  3.74
2. LIT ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  3.87
3. LIT ; Komi ; North_Swedish ; GE ;  3.87
4. LIT ; Komi ; South_&_Central_Swedish ; GE ;  4
5. LIT ; Komi ; NO ; GE ;  4.12
6. LIT ; Udmurt ; North_Swedish ; GE ;  4.24
7. LIT ; Udmurt ; South_&_Central_Swedish ; GE ;  4.24
8. LIT ; Komi ; West_&_Central_German ; Lezgin ;  4.36
9. LIT ; Komi ; NL ; Lezgin ;  4.36
10. LIT ; Southwest_Finnish ; Udmurt ; GE ;  4.36
11. EE ; Southwest_Finnish ; Udmurt ; GE ;  4.36
12. EE ; Erzya ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
13. LIT ; Udmurt ; NO ; GE ;  4.47
14. EE ; East_Russian ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
15. LIT ; Komi ; English ; Lezgin ;  4.47
16. LIT ; Komi ; Orcadian ; Lezgin ;  4.47
17. LIT ; East_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.47
18. Belorussian ; Southwest_Finnish ; Komi ; GE ;  4.58
19. EE ; East_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.58
20. Erzya ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ; GE ;  4.58

Мы видим в каждом из сочетаний одного жителя Кавказа и одного жителя Поволжья, что, как мы знаем точно соответствует истине. К сожалению, ни чеченцев, ни татар среди исходных популяций Поляко нет. Однако на месте, где должны быть русские, появляются более северные и западные народы. Впрочем, такое отклонение для Alex AXe было видно и в других оракулах, видимо, так сложились гены.
Спасибо. Я тоже подумывал о подобной методике расчета. Отмечу, что число вариантов растет экспоненциально при увеличении числа рассматриваемых предков. Так при рассмотрении порядка сотни возможных национальностей, для 8 предков получаем квадриллионы вариантов.  :o Вряд ли это реально посчитать на домашнем компьютере за обозримое время. Значит надо либо привлекать видеокарты для расчета (может кто умеет программировать под CUDA? ) либо как-то оптимизировать алгоритм.  ???
Кстати, вы говорили, у вас есть экселевский файл с указанием значений MDLP World-22 для разных популяций. Можете точнее указать, где вы его взяли или прислать мне? Хочу сделать такой оракул на базе этого калькулятора.  ::)
Еще-б как-нибудь похромосоные данные учесть... (я в той теме писал о взаимной корреляции некоторых компонентов - учет их будет полезен)

Что касается западноевропейского компанента во мне -то он мне до сих пор не дает покоя. Часть его, очевидно, досталась с Кавказа. Но все-равно как-то его много.
Мама сказала, что Антоновы были из окрестностей Новгорода - может еще и оттуда что-то досталось?

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #8 : 10 Ноябрь 2012, 08:09:57 »
Спасибо. Я тоже подумывал о подобной методике расчета. Отмечу, что число вариантов растет экспоненциально при увеличении числа рассматриваемых предков. Так при рассмотрении порядка сотни возможных национальностей, для 8 предков получаем квадриллионы вариантов.  :o Вряд ли это реально посчитать на домашнем компьютере за обозримое время. Значит надо либо привлекать видеокарты для расчета (может кто умеет программировать под CUDA? ) либо как-то оптимизировать алгоритм.  ???
Именно так! Запустил на ночь для себя расчет восьми предков, но номер не прошел и программа вылетела с ошибкой. Я написал ее на языке 1С, который для таких вещей не предназначен. Впрочем, думаю, восемь предков рассчитать реально за какое-то разумное время - порядка суток, а вот 16 уже никак. Да это и бессмысленно, на таком расстоянии передача генов наверняка очень случайна. Количество национальностей у Поляко 80.
Кстати, вы говорили, у вас есть экселевский файл с указанием значений MDLP World-22 для разных популяций. Можете точнее указать, где вы его взяли или прислать мне? Хочу сделать такой оракул на базе этого калькулятора.  ::)
Еще-б как-нибудь похромосоные данные учесть... (я в той теме писал о взаимной корреляции некоторых компонентов - учет их будет полезен)

Что касается западноевропейского компанента во мне -то он мне до сих пор не дает покоя. Часть его, очевидно, досталась с Кавказа. Но все-равно как-то его много.
Мама сказала, что Антоновы были из окрестностей Новгорода - может еще и оттуда что-то досталось?
Вот ссылки для MDLP W22:
 Quote Originally Posted by Vadim Verenich View Post
Populations used with mean K=22 values https://docs.google.com/spreadsheet/ccc?key=0Aqn7iMc2P-yQdEItR3hlYzVVSE5yQjBkUzBzT1E5Ymc
MDS plot with MDLP synthetic populations of "pure components" http://image-upload.de/image/UFhVmK/052076d5e1.png
DIY version of MDLP Wolrd-22 -all-in-one kit for all off-line needs of yourself. https://docs.google.com/open?id=0B6n7iMc2P-yQMnN2OXVERlhjSXM
MOracle(m: DodecadOracle) tool for inferring population sharing https://docs.google.com/file/d/0B6n7iMc2P-yQMkVZYXd1TEFHMGM/edit

По поводу Новгорода - у псковичей находят сильное влияние балтийских народов, может быть, здесь какое-то влияние.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #9 : 10 Ноябрь 2012, 08:16:06 »
Уважаемый VictorV:

1. North_Russian ; West_Russian ; LIT ; HU ;  2.45
2. North_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; HU ;  2.65
3. North_Russian ; Northwest_Russian ; PL ; HU ;  2.65
4. East_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; HU ;  2.65
5. North_Russian ; LIT ; UA ; HU ;  2.65
6. East_Russian ; West_Russian ; LIT ; HU ;  2.65
7. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; West_Russian ; HU ;  2.65
8. Northwest_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; HU ;  2.65
9. North_Russian ; Northwest_Russian ; West_Russian ; HU ;  2.65
10. East_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; HU ;  2.65
11. North_Russian ; LIT ; PL ; HU ;  2.65
12. East_Russian ; Northwest_Russian ; LIT ; HU ;  2.83
13. East_Russian ; Northwest_Russian ; West_Russian ; HU ;  2.83
14. East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; HU ;  2.83
15. East_Russian ; LIT ; UA ; HU ;  2.83
16. North_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; HU ;  2.83
17. East_Russian ; Northwest_Russian ; PL ; HU ;  2.83
18. North_Russian ; Ukrainian-Russian ; LIT ; HU ;  2.83
19. North_Russian ; Belorussian ; West_Russian ; HU ;  2.83
20. East_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; AT ;  3

Не знаю происхождения, часть предков, насколько я помню, малороссы? Видимо, венгры появляются во всех сочетаниях, чтобы привнести повышенные количества Западного и Восточного Средиземноморья.

Уважаемый Zastrug

1. West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.16
2. West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; UA ;  3.32
3. Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.32
4. Belorussian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.46
5. Northwest_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.46
6. West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; PL ;  3.46
7. Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ; UA ;  3.61
8. Northwest_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; UA ;  3.61
9. Ukrainian-Russian ; Belorussian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.61
10. Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ; PL ;  3.61
11. East_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; UA ;  3.61
12. Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.61
13. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.61
14. Northwest_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; PL ;  3.74
15. East_Russian ; West_Russian ; UA ; PL ;  3.74
16. Belorussian ; West_Russian ; West_Russian ; UA ;  3.74
17. East_Russian ; West_Russian ; UA ; UA ;  3.74
18. Ukrainian-Russian ; EE ; West_Russian ; West_Russian ;  3.74
19. East_Russian ; West_Russian ; West_Russian ; PL ;  3.74
20. East_Russian ; Belorussian ; West_Russian ; UA ;  3.74

Очень близок к типичному русскому

и Zastrug Junior:

1. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  2.83
2. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3
3. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3
4. Erzya ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ;  3.16
5. Erzya ; Ukrainian-Russian ; UA ; UA ;  3.32
6. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.32
7. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ;  3.32
8. Erzya ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; UA ;  3.32
9. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.32
10. Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.32
11. East_Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; UA ;  3.46
12. Ukrainian-Russian ; West_Russian ; West_Russian ; West_Russian ;  3.46
13. Erzya ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.46
14. Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.46
15. Erzya ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; PL ;  3.46
16. Erzya ; West_Russian ; UA ; UA ;  3.46
17. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; UA ;  3.46
18. Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ; UA ;  3.46
19. Erzya ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ; West_Russian ;  3.46
20. East_Russian ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Ukrainian-Russian ;  3.46

Тоже без сюрпризов.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #10 : 10 Ноябрь 2012, 09:10:23 »
Восемь предков для меня по упрощенной схеме. Чтобы уменьшить количество комбинаций, ввел два ограничения:
1. На первых четырех местах из восьми могут быть только удмурты, русские, украинцы, беларусы
2. Количество популяций ограничено 20 с наивысшим содержанием East_European
Результат примерно тот же:
1. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
2. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
3. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; Belorussian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
4. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
5. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; UA ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
6. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  3.87
7. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; South_Finnish ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ;  4
8. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
9. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
10. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; East_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
11. East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
12. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
13. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
14. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; South_Finnish ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ;  4
15. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
16. North_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
17. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; North_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
18. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
19. North_Russian ; North_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
20. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
21. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; East_Russian ; LIT ; UA ; UA ; NO ;  4
22. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
23. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; EE ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ;  4
24. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; EE ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ;  4
25. Udmurt ; North_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
26. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; LIT ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
27. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Northwest_Russian ; LIT ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
28. Udmurt ; North_Russian ; North_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
29. North_Russian ; North_Russian ; North_Russian ; East_Russian ; UA ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4
30. Udmurt ; East_Russian ; East_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; UA ; Southwest_Finnish ; Southwest_Finnish ;  4

Увы, если кто-то из прадедушек/прабабушек был из более дальних мест, упрощенным методом его не поймать  :(

Онлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6412
  • Страна: ru
  • Рейтинг +830/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #11 : 10 Ноябрь 2012, 11:54:16 »
А меня можете посчитать?   :D
F183394

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #12 : 10 Ноябрь 2012, 12:39:23 »
А меня можете посчитать?   :D
F183394
Готово:
1. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Udmurt ;  2.45
2. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Belorussian ; Udmurt ;  2.65
3. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Udmurt ;  2.65
4. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; UA ; Udmurt ;  2.65
5. LIT ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Udmurt ;  2.83
6. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; West_Russian ; Udmurt ;  2.83
7. Northwest_Russian ; UA ; Erzya ; Erzya ;  2.83
8. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Ukrainian-Russian ; Erzya ;  2.83
9. Northwest_Russian ; Belorussian ; Erzya ; Erzya ;  2.83
10. Northwest_Russian ; Belorussian ; Ukrainian-Russian ; Udmurt ;  2.83
11. LIT ; UA ; Erzya ; Erzya ;  2.83
12. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; PL ; Udmurt ;  3
13. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; West_Russian ; Erzya ;  3
14. Northwest_Russian ; Belorussian ; Belorussian ; Udmurt ;  3
15. Northwest_Russian ; UA ; North_Russian ; Erzya ;  3
16. Belorussian ; Belorussian ; Erzya ; Erzya ;  3
17. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ; East_Russian ;  3
18. Northwest_Russian ; Northwest_Russian ; Erzya ; Erzya ;  3
19. LIT ; Ukrainian-Russian ; Erzya ; Erzya ;  3
20. Northwest_Russian ; Belorussian ; Erzya ; East_Russian ;  3.16

По одному человеку из Поволжья, остальные тяготеют к Балтике. Насколько правдоподобно?

Онлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6412
  • Страна: ru
  • Рейтинг +830/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #13 : 10 Ноябрь 2012, 12:53:35 »
Не очень правдоподобно.
У меня все линии с Балтики - беларусы, русские Твери, немцы, финны.
Можно конечно предположить что было вливание с Поволжья, но только на более глубоком уровне и точне не во втором поколении.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 5473
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2254/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Оракул AdMix4
« Ответ #14 : 10 Ноябрь 2012, 12:59:25 »
Могу только предположить, что финны расщепились на Балтику и Поволжье - в Поволжье ушла Восточная Европа и Сибирь, на Балтику - Центральная Европа и Атлантика.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100