R1a и 1KG/PGP проекты

[Centurion]

Обнаружились несколько кандидатов в SNP у семплов HG00277 (фин) и семпла из другого проекта (PGP) - PGP17(предки из Украины). Эти варианты вероятно могут быть эквивалентны Z92 или дочерние по отношению к нему. Точно сказать можно будет, когда появится еще образец ("отрицательный"), потому что у HG00382 эти сегменты не прочитаны.

Z2466
Z2467
Z2468

[Centurion]

У двух (NA12155 и CAGI19(PGP)) семплов L664+ обнаружилось несколько кандидатов в SNP. Варианты могут быть эквивалентны L664 или дочерние по отношению к нему.

Z2459
Z2460
Z2461
Z2462
Z2463
Z2464
Z2465

[Semargl]

Результаты будут поступать регулярно, поэтому прикреплю тему.

[Centurion]

Результаты будут поступать регулярно, поэтому прикреплю тему.

да, только жаль что возможно "в стол" 

[Semargl]

Результаты будут поступать регулярно, поэтому прикреплю тему.

да, только жаль что возможно "в стол" 

"В стол" не "в стол", но пригодится.
Я понимаю, что FTDNA не интересно продвигать новые снипы, создавая конкуренцию сестринскому продукту "geno-2". Тем более, по каким-то причинам, их не интересуют снипы из восточной европы. Сужу по кол-ву принятых в проект снипов для R1b и для R1a. Поживем - увидим. Но не век же FTDNA быть у руля?

[Lesla]

Эти варианты вероятно могут быть эквивалентны Z92 или дочерние по отношению к нему...
Z2466
Z2467
Z2468

Спасибо за инфу! Заманчивые снипы!
Как обычно, запасемся терпением 

[Centurion]

Спасибо за инфу! Заманчивые снипы!
Как обычно, запасемся терпением 

их еще бы проверить у "русского генома"... я написал Грегу

но не стоит обольщаться, вероятно их могут и не запускать в тестирование... кто знает ))

[Centurion]

Lesla

эти снипы вам известны?

Z683
Z684
Z685
Z686

они были давно найдены - где-то около или ниже Z92

у PGP17  Z683+ Z684+ Z686+

[Lesla]

эти снипы вам известны?

Нет. Впервые слышу.

[Semargl]

Lesla

эти снипы вам известны?

Z683
Z684
Z685
Z686

они были давно найдены - где-то около или ниже Z92

у PGP17  Z683+ Z684+ Z686+

Что у PGP17 со снипом Z685?
Отрицательный или не прочитан? Если отрицательный, то именно Z685 будет интересен для венедов и невров, вероятно он разделит эти ветви.

PS FTDNA не спешит добавлять новые снипы. Z2122 обещают запустить через месяц - два.

[asdgood]

А вы пользовались vcf файлом? Если да, то можно ли его посмотреть?
И ещё, есть ли у PGP17 снип Z1907?

[Centurion]

судя по данным у PGP7

Z1907-
Z685-

[Centurion]

А вы пользовались vcf файлом?

нет, с TSV у PGP и с BAM у 1KG

[Centurion]

Новые кандидаты. Обнаружены ниже Z2122 у HG01617 и PGP4, у семпла HG01982 все снипы в минусе.

Z2469
Z2470
Z2471
Z2472
Z2473
Z2474
Z2475
Z2476
Z2477
Z2478

Дополнительно еще один кандидат, который или эквивалентен Z93, Z94, Z95, или совсем рядом с ними.

Z2479

 

[Yurgan]

Новые кандидаты. Обнаружены ниже Z2122 у HG01617 и PGP4, у семпла HG01982 все снипы в минусе.

Z2469
Z2470
Z2471
Z2472
Z2473
Z2474
Z2475
Z2476
Z2477
Z2478

Дополнительно еще один кандидат, который или эквивалентен Z93, Z94, Z95, или совсем рядом с ними.

Z2479

Посчитал.
У R-M458 и R-Z280 239 общих снипов, которых нет у Z93