Новички I1

[NathanS]

Да и "подарок" невозможно использовать из-за того, что FTDNA не предоставляет по mtFull ни vcf, ни BAM файлы...

Дла митоДНК другой формат файла - FASTA.
Кликните на Mutations


А потом внизу страницы справа Download FASTA:


FASTA файл и грузится на Yfull.

[Valery]

А как же их утверждение, что "данные, извлеченные из .VCF-файла, являются неполными. ~50-70% от данных, которые можно получить из .BAM-файла"?

это правда. Но усилия, которые тратятся на филогенетическую часть работы, примерно равны. Иногда в случае неполных данных, какие бывают в случае VCF, может требоваться больше ручного вмешательства, чем с BAM.

Да и "подарок" невозможно использовать из-за того, что FTDNA не предоставляет по mtFull ни vcf, ни BAM файлы...

консенсусная FASTA легко генерится из vcf (как и из BAM)

[Farroukh]

данные, извлеченные из .VCF-файла, являются неполными. ~50-70% от данных, которые можно получить из .BAM-файла

Бам включает в себя снипы и маркёры. Висиэф - только снипы. По моему скромному, маркёры не нужны, снипы - необходимы.

[Аббат Бузони]

А у меня радость, появился оооооочень близкий кузен, он сделал Биг и мы без капризов загрузили несколько vcf на yfull, спасибо ребятам они уже выделили ветку в live варианте древа. Настоящий прорыв с 2007 года, когда я впервые сдал тест.

https://www.yfull.com/live/tree/I-SHTR1/

[Valery]

Бам включает в себя снипы и маркёры. Висиэф - только снипы. По моему скромному, маркёры не нужны, снипы - необходимы.

VCF может содержать и инделы, в тч STR в виде длинных блоков. Но я не в курсе, рассчитана ли технология YFull на извлечние STR из VCF за-call-енных FTDNA. Теоретически, в VCF можно запихнуть все мапированные риды, поместив их свойства в поле INFO, я так иногда делаю. Поэтому разговор имет смысл более конкретный: что можно, а что нельзя выудить из VCF после коллинга FTDNA.

[grimsvotn]

А у меня радость, появился оооооочень близкий кузен, он сделал Биг и мы без капризов загрузили несколько vcf на yfull, спасибо ребятам они уже выделили ветку в live варианте древа. Настоящий прорыв с 2007 года, когда я впервые сдал тест.

https://www.yfull.com/live/tree/I-SHTR1/

Поздравляю! А примерный TMRCA какой?)

[Аббат Бузони]

А у меня радость, появился оооооочень близкий кузен, он сделал Биг и мы без капризов загрузили несколько vcf на yfull, спасибо ребятам они уже выделили ветку в live варианте древа. Настоящий прорыв с 2007 года, когда я впервые сдал тест.

https://www.yfull.com/live/tree/I-SHTR1/

Поздравляю! А примерный TMRCA какой?)

Скоро узнаем точно. Но у кузена крайний предок примерно 1687г. жил в Пошехонье.

[grimsvotn]

Клёво, да, интересно! Ждем новой версии YFull

[Аббат Бузони]

Клёво, да, интересно! Ждем новой версии YFull

Головоломка))

[Valery]

А у меня радость, появился оооооочень близкий кузен ...
https://www.yfull.com/live/tree/I-SHTR1/

твоим именем ветви называют )) уважуха

[Valery]

не кратеры на луне, но чую, скоро имена снипов можно будет продавать

[Valery]

выставить что ли на продажу немножко GG* ))

[Аббат Бузони]

А у меня радость, появился оооооочень близкий кузен ...
https://www.yfull.com/live/tree/I-SHTR1/

твоим именем ветви называют )) уважуха

Фамилия предков, у меня другая )))

[Александр Колчин]

Добрый день! Я веду это исследование от лица моего деда, Александра Колчина. Мы получили результаты Y111 от FTDNA, гаплогруппа I-M253, mtDNA -  U5a2b. Мне показалось это весьма странным, поскольку наша ветвь Колчиных происходит из крестьян юга современной Пензенской области, а по результатам получается что-то скандинавское.
Может ли кто-то пролить свет на данные результаты?

[Farroukh]

Опубликуйте тут Ваши 111 маркёров и матч-лист, а то штатные телепаты в отпуске