АвторТема: Список возможных тем для статей  (Прочитано 31621 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #30 : 13 Сентябрь 2009, 18:18:37 »
По пунктам:
Я дал ответ, воспроизвожу:

Чистой воды паранойя. Павел пропал больше месяца назад, связи с ним нет.
Понятно. Мы не в ответе за того, кого приручили.

На Родстве я никаких операций с сервером не провожу. Да я не и очень понимаю, зачем мне в это дело лезть?
Разве я заподозрил Вас в умении проводить операции с сервером?
Речь шла о ПШ.

Вы как красна-девица - то Вестник печатаете, то не печатаете, и после объявления, что не печатаете, просите меня что-то там на сервере Родства сделать?

Логика сего мне не ясна. Либо мы сотрудничаем, либо нет.
Ответ прост - нет. Пользы от Вас мало. Вернее - никакой.

Но вообще забавно - Вы увидели, что Вестник НАМНОГО более популярен, чем RJGG, и решили дать задний ход и Вестник закрыть. Не слишком мужской шаг.
Это то, что я говорил об отсутствии у Вас практицизма и здравого смысла.
В данном случае Вы пытаетесь говорить о вещах, которые не понимаете вовсе.
Речь идёт о динамике распространения издания.
Мне эта динамика ясна. Вам даже опыт в скоростях реакций не помогает.

Следующее. Первое место по популярности занимают порносайты.
И?
Ваш (теперь только Ваш) Вестник - суть личный блог.
Печатная версия отсутствует (блог тоже может быть распечатан автором в 2-3 экземплярах, как и последние номера Вестника). Т.е. имеет место один из миллионов интернет-проектов.

RJGG - будет журналом. С тиражом печатных версий по каждому выпуску не менее 50-70 экземпляров, распространенных среди лучших библиотек мира и по ведущим лабораториям. И с количеством закачек, превышающим 1000.

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3216
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #31 : 22 Октябрь 2009, 23:20:55 »
Верну тему в русло заголовка "Список возможных тем для статей".

Сразу же скажу, почему я предлагаю нижеследующую тему. Я не умею рассчитывать TMRCA, не владею техникой, не знаю нюансов. Я знаю лишь то, что некоторые участники легко с этим справляются. Также, я знаю, что существует некоторые разногласия в этих расчетах...
Я хочу научиться считать. Что мне для этого надо сделать? Найти на форуме, тему, и среди множества страниц то место, где даются рекомендации... Но, надо также прошерстить всю тему, потому как позднее было много комментариев.
Удобно ли это? Нет! Гораздо проще (и логичнее) иметь на столе выпуск RJGG, в котором одна из статей полностью посвящена существующим, актуальным на текущий момент, методам расчета с понятными примерами. Это была бы энциклопедичная статья, если так можно выразиться, которая не сомневаюсь, подняла бы рейтинг выпуска и журнала в целом.

Вопрос. Может кто-нибудь написать такую статью? Пусть методы спорные, но если указать все их особенности, то это будет как "срез" текущего развития ДНК-генеалогии в области расчетов. В будущем, опираясь на эту показательную статью, можно опубликовать корректировки...

Аналогичную статью можно было бы сделать по филогении, т.е. по построениям - чтобы не на форуме искать методики, а в журнале.

Как идея?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #32 : 22 Октябрь 2009, 23:53:25 »
Как это - нет обобщающей статьи? Публикации Адамова в Вестнике содержат все основные методы расчётов, сравнительный их анализ и учёт погрешностей.
 
Есть и перспективные работы Каржавина, которые пока ещё сложны и громоздки для любительского воплощения.
 
Первые работы можно использовать как справочник, вторые - как пищу для дискуссий. Отмечу, что по глубине изложения материала эти работы не уступают лучшим статьям таких ДНК-генеалогов как Кен Нортведт или Динекес, а по системности - превосходят. А дальше - уже тёмный лес начинается.
 
Так что справочник по TMRCA (ВБОП) есть. Разве только попросить Адамова изложить уже написанное конспективно, опустив доказательную базу именно в виде справочника для расчётов в RJGG.
 
С филогенией - сложнее. Тут нужно читать книги, чтобы понять, каким методам, насколько и когда можно доверять. А вот опять же - справочник по Мурке Валерий мог бы написать. Программа чертовски хороша, но очень неудобоварима в практическом использовании - масса непонятных параметров, отсутствие чётких указаний, какие из них и когда следует применять в СТР-филогении.
 
Так что, если Валерий найдёт время для русскоязычного руководства по Мурке, расчитанного на нашего брата ДНК-генеалога - было бы великолепно. А если ещё напишет статью об основных принципах филогении и парсимонии - просто чудесно. Ну хотя бы не слишком сложную в математическом отношении литературу на эту тему порекомендует.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #33 : 23 Октябрь 2009, 00:13:44 »
Спасибо за идею, кв. Овод. Я давно хотел написать статью с подробным разбором парсимонистской методы, без больших купюр в доказательствах, чтобы там было ровно про ту часть которая не вошла в известный учебник Семпла и Стила 2003 года, и которая, по тем или иным причинам, мне интереснее на практике. И наверное, еще сокращенный вариант с картинками, для читателя, у которого мало времени на чтение доказательств.

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3216
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #34 : 23 Октябрь 2009, 00:25:49 »
Валера, давно ждем!

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #35 : 23 Октябрь 2009, 18:43:57 »
Так что справочник по TMRCA (ВБОП) есть. Разве только попросить Адамова изложить уже написанное конспективно, опустив доказательную базу именно в виде справочника для расчётов в RJGG.
Если бы Дмитрий свёл всё в одну статью-памятку - было бы действительно очень здорово!

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #36 : 23 Октябрь 2009, 18:55:44 »
Если бы Дмитрий свёл всё в одну статью-памятку - было бы действительно очень здорово!

Да, и обязательно надо бы дать сравнительный анализ - когда и по какому методу лучше считать. Какие здесь подводные камни в смысле возможных ошибок. Ещё - добавить к уже имеющемуся у него спектру методов "неопределённые аллели".
 
 Многие зарубежные генеалоги до сих пор по нему считают. И надо сказать - на коротких генеалогиях этот метод имеет сокровенный смысл, поскольку помогает избежать ложного учёта многошаговых мутаций. При том что возвратные и повторные мутации в одном маркере на коротких отрезках времени крайне маловероятны.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #37 : 23 Октябрь 2009, 19:32:50 »
Да, и обязательно надо бы дать сравнительный анализ - когда и по какому методу лучше считать.
Вот это вряд ли.

Дело в том, что на коротких дистанциях все методы считают примерно одинаково.
А на длиных их пока по определению проверить нельзя. Только опосредственными методами: созданием модели (которые тоже бывают хорошие и плохие, слишком упрощённые и не очень, и никогда не воспроизводят реальности). Затем просчетом и выверкой времён по этим самым моделям.

Поэтому хорошо бы просто перечислить используемые методы в сводной статье-обзоре и при этом постараться избежать безаппеляционности а-ля Анатоль.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #38 : 23 Октябрь 2009, 19:44:24 »
Дело в том, что на коротких дистанциях все методы считают примерно одинаково.

Ну так уж и одинаково на коротких...Что-то я этого не замечал в ряде случаев. Хотя Клёсов постоянно доказывает свои выводы схожестью результатов по разным методам расчёта.
 
Но вот найдешь себе на 67 маркерах родича на трёх маркерах дистанции, у которого в одном маркере разница в три аллеля. Разница по "неопределённому" и квадратичному методу будет ровно в четыре раза. По линейному - почти в два. Какой верен?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #39 : 23 Октябрь 2009, 19:56:45 »
Но вот найдешь себе на 67 маркерах родича на трёх маркерах дистанции, у которого в одном маркере разница в три аллеля. Разница по "неопределённому" и квадратичному методу будет ровно в четыре раза. По линейному - почти в два. Какой верен?
С одним родичем по 67 маркерам ни один из методов не даст определенности.
Все без исключения методы действуют только для групп.
Что толку, что у парово3 есть 67 маркерный совпаденец? Это мог бы быть и папа, а мог кто-нибудь с общим предком в 17-18 веках.

Тут Вам на 23эндМи, если степень близкого  (до 10-12 поколения) родства хотите оценить.

Если же говорить именно об игреке, то я придерживаюсь цифр и методик от Соренсона. Не потому, что мормонов люблю, а потому как они самые массово выверенные.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #40 : 23 Октябрь 2009, 20:06:27 »
Опять же не соглашусь. Можете помножить ситуацию на 100 участников с таким же эффектом между некоторыми. Что изменится?
 
Тут дело не в определённости (для этого есть доверительные интервалы в каждом из методов), а в том - по которому из них считать, чтобы достичь "большей лучшести".
 
Но мы отклонились от темы. Хотя запишите моё особое мнение в протокол заседания - тема о правильности применения методов в конкретных ситуациях крайне важна. Иногда и по Животовсому стоит посчитать - если речь идёт о тесной популяции, изолированной тысячелетиями.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #41 : 23 Октябрь 2009, 20:11:13 »
Опять же не соглашусь. Можете помножить ситуацию на 100 участников с таким же эффектом между некоторыми. Что изменится?
Изменится очень многое.
Для 100 человек - одно статистическое распределение.
Для 1000 - другое.

По одному человеку Вас устроит вероятностный интервал?
Или высказывание "находится в пределах погрешности"?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 30834
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2273/-38
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #42 : 23 Октябрь 2009, 20:14:25 »
Насчёт лучшей лучности :), я бы всё-таки воздержался от оценок. Или обязательно подчеркуть, что речь идёт о неподтверждённой персональной точке зрения.

Ну, а беспристрастный обзор - это было бы всё-таки всего лучше.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2176
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #43 : 23 Октябрь 2009, 20:14:45 »
И всё же, "I rest my case" (c) Вадим Веренич.

Оффлайн Каржавин

  • ...
  • Сообщений: 1936
  • Рейтинг +144/-2
Re: Список возможных тем для статей
« Ответ #44 : 23 Октябрь 2009, 21:27:33 »
Спасибо за идею, кв. Овод. Я давно хотел написать статью с подробным разбором парсимонистской методы, без больших купюр в доказательствах, чтобы там было ровно про ту часть которая не вошла в известный учебник Семпла и Стила 2003 года, и которая, по тем или иным причинам, мне интереснее на практике. И наверное, еще сокращенный вариант с картинками, для читателя, у которого мало времени на чтение доказательств.
Никаких сокращенных вариантов! Время найдем!!! Уважаемый Овод прав, надо не только подробное описание работы мс программной, но и развернутые рекомендации, как и в каких случаях задавать параметры.
Я, как крайне заинтересованный читатель, очень бы хотел увидеть и статью по теоретическим основам филогении и парсимонии, ПРИМЕНИТЕЛЬНО К НАШИМ ЗАДАЧАМ. Этого очень не хватает.
P.S. Автор должен приложить труд для продвижения своего детища, и лучше ничего не придумать, как дать отличную документацию с подробнейшими рекомендациями по использованию.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100