R1b-Z2103/Z2105

[smal]

Спасибо, теперь, я надеюсь, мы узнаем, принадлежат ли эти сиквенсы (NA20532 из 1KGP, 16133 Turkish Jew и 16886 Moroccan Jew из статьи Rootsi at.al. 2013) ветке L277. Это сильно поможет в развитии дерева.

[Lesla]

Кто носители Z2106+? Восточная Европа/Русская равнина?

Да много кто, это же довольно старый снип. Важно было бы проверить его у L277+ ветви, чтобы убедиться в правильности дерева. Сейчас Z2106 стал доступен в YSEQ.

Заказал Z2106 для L277+.
Спасибо спонсору!

Готов результат по Z2106.



Сергей, пожалуйста, не скинешь эту информацию там где нужно (имею ввиду заграничные форумы). Спонсору там... 

[smal]

Сергей, пожалуйста, не скинешь эту информацию там где нужно (имею ввиду заграничные форумы). Спонсору там... 

Да, спасибо, уже там обсудили. Подтвердилось деление R-Z2103 на 3 ветви L584, Z2106 и L277.

[Lesla]

Спасибо!

А Z2106 более большой субклад, чем L584 и L277? По возможному количеству носителей.
И какие-то датировки возможны по этим ветвям?

[smal]

Трудно сказать, думаю, в Европе Z2106 среди трех ветвей преобладает. Пик L584 смещен к Закавказью, а L277 везде равномерно присутствует. Возраст ветвей уходит куда-то в мезолит.

[Lesla]

Да уж. Копать и копать ещё. В смысле, тестировать.

[Optatus]

Смол, как считаете: стоит мне все-таки заказать у YSEQ - CTS7822? На днях он стал доступен для заказа.

Решать вам. Можете увеличить количество STR до 67-111, надежность предсказания ветви от этого вырастет. Можете тестировать снипы CTS7822 или пару CTS7763, CTS8966.

Фух, наконец-то закончилась моя эпопея с YSEQ, есть CTS7822:

Теперь, Сергей, как советуете, что стоит заказать?

[Lesla]

Фух, наконец-то закончилась моя эпопея с YSEQ, есть CTS7822:

Мои поздравления!

[smal]

Фух, наконец-то закончилась моя эпопея с YSEQ, есть CTS7822:
Теперь, Сергей, как советуете, что стоит заказать?

Спасибо за результат. Пожалуйста, присоединяйтесь в YSEQ к группе 19 (Group R1b-L23_Z2103 & Subclades Alleles Browser).
У CTS7822 известны два субклада CTS9219 и CTS699, есть также образцы, которые не входят в эти субклады. Ваш гаплотип, к сожалению, невозможно отнести с уверенностью к этим субкладам. Вы дошли до уровня, когда и положительные и отрицательные результаты будут иметь ценность. CTS9219 - большой субклад, но ваш гаплотип на его границе - может +, может -. Про CTS699 ветку почти ничего не известно, 2 образца без STR маркеров. Кроме этих двух маркеров есть пару одиночных результатов Chromo2 теста. Наибольшую ценность сейчас, конечно, имеют BigY тесты, решайте...

[Lesla]

Сергей, не поможешь?

Dear Viacheslav,

 We just finished the analysis of your A368 SNP. Could you please check the position of the SNP? It looks like it is actually 40 bases shifted. Please have a look at the picture of the sequence. We have A368 at 16387123, but the mutation (M) shows up at 16387143. Do you think it could have been a typo?
 Maybe you remember where you had the information about the mutation from. You've mentioned Rootsi et al. 2013. I don't have access to the article. It would be very helpful if you could check where the SNP is located at. If it is at 16387143 I can easily correct it.

 Thank you very much,
 Astrid

[smal]

Lesla, я извиняюсь, случайно в том сообщении написал 16387123, а надо было 16387143 (A368). И это пошло дальше копироваться. Слава Богу, что нужная область попала в сиквенс, так что большой беды не случилось. Статья в открытом доступе Астрид может найти эту мутацию в  электронном приложении

Результаты показывают, что сиквенсы (NA20532 из 1KGP, 16133 Turkish Jew и 16886 Moroccan Jew из статьи Rootsi at.al. 2013) относятся к ветке L277, наша версия подтвердилась.

На дереве YFull появился человек, принадлежащий к L277. Было бы очень интересно с ним связаться.

[Yurgan]

Новый гаплотип или маркеры; Z2103+; 111 маркеров; R-M269; R1b1b2; Tutunzi; Russian Federation; 301843; Z2103+ (на расстоянии 24 от R1b1a2a; R1b1b2; Ciulla; Italy; 84950)

Не исключено, что L277+

[smal]

Удалось кое-что вытащить с помощью BgY matching utility. Собрал данные из разных источников в новую версию дерева ветки Z2106^

[Lesla]

По древу от команды YFull, на уровне L277 найдены также снипы: Y4362, Y4363, Y4364, Y4365, Y4366, Y4367, Y4368, Y4369, Y4370, Y4372. По результатам двух образцов: YF01708, NA20532.

[Optatus]

CTS9219 тоже подтвержден!