АвторТема: Загадки статистики или Рассуждения об Y-ДНК по Азербайджану  (Прочитано 13251 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Цитировать
Насидзе опубликовал 9-маркерные гаплотипы некоторых народов Кавказа, а также Ирана и Турции в статье 2003 г. без указания, к какой гаплогруппе относится каждый из этих гаплотипов.
Что значит без указания гаплогрупп? Вверху темы  карта от Насидзе.
к какой гаплогруппе относится каждый из этих гаплотипов

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2845/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
к какой гаплогруппе относится каждый из этих гаплотипов
Я навреное чего-то не понимаю? Ученый дает диаграмму, основанную на исселедованных образцах, но как указывает некто Fire нужно смотреть не на данные исследователя, а на то, что он - Fire прокатал на предикторе спустя десять лет после выхода работы?

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
к какой гаплогруппе относится каждый из этих гаплотипов
Я навреное чего-то не понимаю? Ученый дает диаграмму, основанную на исселедованных образцах, но как указывает некто Fire нужно смотреть не на данные исследователя, а на то, что он - Fire прокатал на предикторе спустя десять лет после выхода работы?
Простым языком написано что близко к каждому гаплотипу нет обозначения гаплогрупы.
И не я проводил исследования по ним, а Алекс, но вы и это не заметили в моем сообщении.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2845/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Простым языком написано что близко к каждому гаплотипу нет обозначения гаплогрупы.
И не я проводил исследования по ним, а Алекс, но вы и это не заметили в моем сообщении.
А, ну это совсем другое дело - если Алекс, это серьезно. Жалко в работе не было ссылки , что нужно верить не ее данным, а исследованиям некоего Алекса, проведенным через десяток лет.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 9609
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
с увеличением выборки она станет более менее репрезентативной, к тому же возможно те выборки брались из определенных районов, где живут одни гаплогруппы, как было у казахов с Восточным Казахстаном.
Приформировании другой выборки у казахов те соотношения процентов, которые были в выборке по казахам восточного казахстана не подтвердились.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Простым языком написано что близко к каждому гаплотипу нет обозначения гаплогрупы.
И не я проводил исследования по ним, а Алекс, но вы и это не заметили в моем сообщении.
А, ну это совсем другое дело - если Алекс, это серьезно. Жалко в работе не было ссылки , что нужно верить не ее данным, а исследованиям некоего Алекса, проведенным через десяток лет.
Тот под ником Алекс он генетист, работает в такой лаборатории в Америке, его настоящее имя я не могу дать.
И он это иследование сделал давно, почти сразу после того как были опубликованы данные гаплотипов.
Сейчас скорее всего если кто-нибуть будет проверять сного в ysearch и через новый предиктор данные будут лучше.
Насидзе тоже по предиктору определял, у него почти нет снипирования.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2845/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Тот под ником Алекс он генетист, работает в такой лаборатории в Америке, его настоящее имя я не могу дать.
И он это иследование сделал давно, почти сразу после того как были опубликованы данные гаплотипов.
Сейчас скорее всего если кто-нибуть будет проверять сного в ysearch и через новый предиктор данные будут лучше.
Насидзе тоже по предиктору определял, у него почти нет снипирования.
Да хоть полярник из Антарктиды. В чем вы меня пытаетесь убедить?
Я умею читать и мне не нужно разъяснять что хотел сказать автор, я могу прочесть прямую речь.

"All SNP markers (except M130) were typed by means of Taqman® (Applied Biosystems) assays as described previously (Nasidze et al. 2003). M130 was typed using the PCR-RFLP method described elsewhere (Kayser et al. 2000), while the YAP Alu insertion was typed as described previously (Hammer & Horai,1995) The samples were genotyped according to the hierarchical order of the markers (Underhill et al. 2000)."
M9 was typed in individuals with
the mutant state at M89, and M45 was typed in individuals with the mutant state at M9. M124 was typed in individuals with the mutant state at M45, while M173 was typed in individuals with the mutant state at M45 and the ancestral state at M124. M17 was typed only in individuals with the mutant state at M173. M170, M172 and M201 were typed in individuals with the mutant state at M89 and the ancestral state at M9. The Y-SNP haplogroup nomenclature used here is according to the recommendations of the Y Chromosome Consortium (2002).

" Eleven Y-SNP haplogroups were found in the Caucasus (Table 3, Figure 1)."

То есть тот же М170 таки делали. Так насколько ж "кривые" должны быть выборки практически по всем популяциям, чтобы получилось:
Гаплогруппа I
Darginians 58%
Abkhazians 33%
North Ossetians from Ardon 32%
Turks 26%
Iran (Tehran) 34%

Это же жесть!

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Например по гаплотипам Осетин у Насидзе все правильно, гаплотипы полностью совпадают с гаплотипами Балановских.
Только вот по типированию а предлагаю всем не смотреть на работу Насидзе, а по гаплотипам всё правильно.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2845/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Например по гаплотипам Осетин у Насидзе все правильно, гаплотипы полностью совпадают с гаплотипами Балановских.
Только вот по типированию а предлагаю всем не смотреть на работу Насидзе, а по гаплотипам всё правильно.
Скажите, вы не пробовали не только что-то писать, но и читать что вам пишут?
Что значит не смотреть на работу, если гаплотипы ИССЛЕДОВАЛИ НА СНИПЫ? Какой нафиг предиктор? Вы вообще что предлагаете - работы в топку , тянуть оттуда гаплотипы(как здесь 9-маркерные) и через предиктор? И безоговорочно верить не снипам, а данным предиктора?  :o
Где-то я что-то подобное уже слышал. Вы слишком долго с Клесовым общались.

Что по гаплотипам осетин совпадает с Балановскими?

Ossetians (Ardon)

K - 7%
P - 4%
R1a1 -4%
F - 4%
G - 21%
J2 -29%
I -32%
 
С какими данными Балановских или кого-либо иного это совпадает?

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Я имел в виду в таком значении.
Many genetic testing companies use the term 'haplotype' to refer to an individual collection of short tandem repeat (STR)

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Ардонцы они в основном Туальцы

Дибирова
Туальцы, Южная Осетия + Северная Осетия Алагирский раён
ОСЕТИНЫ–5
58% G2a1a1(P18) 4% G2a1a(P16) 10% J2* 23% J2a4b* 4% R1b1b2

STRs of Nossidze vs SNPs of Дибирова
Ossetians (Ardon)
G2a1a -57.1% vs 62% G2a1a
J2 -32.1% vs 33% J2
Q -3.6%
R1a -3.6%
R1b -3.6% vs 4% R1b1b2

Osset_Ard N = 28

93 15 14 23 9 10 15 17 11 28 n = 9 HG: G2a1a 6Osset_Digor, 9Osset_Ardon Predictor: G2a - 68.1%; H - 25.0%; C3 - 2.2% Y-Search: G (1/9)
92 15 14 22 10 10 15 17 12 29 n = 1 HG: G2a1a 2Osset_Digor, 1Osset_Ardon, 3Georg, 3Kabard, 2Abazin Predictor: G2a - 96.6%; H - 2.9% Y-Search: G (1/9)
106 15 14 23 10 10 15 17 11 27 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon Predictor: H - 43.6%; G2a - 29.3%; I2 - 12.8%; G1 - 10.8% Y-Search: G (1/9)
108 15 14 23 10 10 15 17 12 28 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon Predictor: G2a - 33.4%; G1 - 30.2%; H - 15.3%; I2 - 11.9% Y-Search: G (2/9)
109 15 15 23 9 10 15 17 11 28 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon Predictor: G2a - 63.5%; H - 16.5%; J2 - 6.7%; C3 - 6.7% Y-Search: G (0/9)
110 15 14 22 10 10 15 16 11 28 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon Predictor: G2a - 98.7% Y-Search: G (1/9)
112 15 13 22 10 10 16 16 12 29 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon, 1Georg Predictor: G2a - 93.3%; H - 3.0%; L - 2.2% Y-Search: G (2/9)
113 16 13 23 10 10 16 16 12 30 n = 1 HG: G2a1a 1Osset_Ardon Predictor: G1 - 52.3%; G2a - 29.3%; I2 - 6.9%; E - 5.3% Y-Search: J2 (3/9)
104 14 12 25 10 11 13 14 13 31 n = 3 HG: J2 3Osset_Ardon Predictor: J1 - 61.4%; J2 - 37.8% Y-Search: J2 (0/9)
33 15 12 23 10 11 13 16 13 29 n = 1 HG: J2 1Iran_Tehr, 1Iran_Isfah, 1Osset_Digor, 1Osset_Ardon, 1Armen, 1Azerb, 2Kabard, 1Chechen Predictor: J2 - 98.5% Y-Search: J2 (0/9)
105 14 12 25 10 11 13 14 12 30 n = 1 HG: J2 1Osset_Ardon Predictor: J2 - 59.9%; J1 - 38.8% Y-Search: J2 (1/9)
111 14 12 25 10 11 13 14 13 32 n = 1 HG: J2 1Osset_Ardon Predictor: J1 - 72.0%; J2 - 27.4% Y-Search: J2 (1/9)
328 14 12 23 10 11 14 18 14 30 n = 3 HG: J2? 2Iran_Tehr, 1Turk, 3Osset_Ardon, 1Abkhaz, 2Rutul, 1Armen, 4Georg, 2Dargin, 1Chechen Predictor: J2 - 75.9%; J1 - 22.9%; Y-Search: J2, J1 (0/9)
107 13 13 23 9 16 13 17 13 28 n = 1 HG: Q 1Osset_Ardon Predictor: Q - 82.6%; T - 17.4% Y-Search: Q (2/9)
114 16 13 23 11 11 11 15 13 30 n = 1 HG: R1a? 1Osset_Ardon Predictor: I2 - 73.3%; R1a - 20.7%; C3 - 6.0% Y-Search: R1a (1/9)
337 14 12 24 11 13 11 14 12 29 n = 1 HG: R1b 1Iran_Tehr, 2Osset_Digor, 1Osset_Ardon Predictor: R1b - 100% Y-Search: R1b (0/9)

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Уважаемый Zastrug, я что-то плохо вижу, или на ваш конкретный вопрос Файеру каждый раз поступает пустота?

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11271
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2845/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Боюсь правильно видите. Человеку в который раз пытаешься объяснить что данные исследовались на снипы и у 32% был выявлен снип I М-170, а он продолжает подгонять эти же данные  до нужного через  один из предикторов и утверждать, что на снип внимания обращать не стоит, а на самом деле гаплотипы эти - G2a1a.
Увы, я просто не знаю что еще можно сказать. Зачем мы вообще на снипы и 67,111 маркеров тратимся? Можно скинуть девять маркеров Fire и он железно определит любую гаплогуппу.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Уважаемый Zastrug, я что-то плохо вижу, или на ваш конкретный вопрос Файеру каждый раз поступает пустота?
А что я обязан отвечать?

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Может Насидзе "обманул", что сделал снипирование?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.