Aleks->
Насидзе опубликовал 9-маркерные гаплотипы некоторых народов Кавказа, а также Ирана и Турции в статье 2003 г. без указания, к какой гаплогруппе относится каждый из этих гаплотипов.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14550619 Я попытался определить гаплогруппы для гаплотипов Насидзе двумя способами: (1) с помощью предиктора Athey и (2) путем поиска похожих гаплотипов в Y-Search. На основании полученных результатов каждый гаплотип был «приписан» к определенной гаплогруппе. В некоторых случаях как предиктор, так и поиск в Y-Search давали один и тот же результат, который с большой долей вероятности указывал на принадлежность гаплотипа к определенной гаплогруппе. В других случаях наоборот, наблюдался «разнобой», затрудняя однозначное предсказание гаплогруппы. Такие спорные гаплогруппы я помечал вопросительным знаком. Разумеется точно определить гаплогруппу можно лишь с помощью SNP теста, а потому ошибочное предсказание возможно для любого из приведенных гаплотипов, включая непомеченные вопросительными знаками. Тем не менее я полагаю, что большинство гаплогрупп предсказаны верно, а во многих спорных случаях «спор» идет лишь между двумя или тремя гаплогруппами, что значительно сужает круг возможных для данного гаплотипа гаплогрупп. К примеру, часто бывает трудно однозначно определить, относится ли гаплотип к гаплогруппе J1 или J2, но можно почти наверняка причислить его к гаплогруппе J.
Разумеется неточности в предсказанных таким способом гаплогруппах неизбежны. Вместе с тем я надеюсь, что со временем можно будет внести уточнения на основе более детального анализа гаплотипов, а также сопоставления их с результатами других исследований. Буду признателен, если кто-либо, включая специалистов по гаплотипам определенных гаплогрупп или этногрупп, укажет на возможные ошибки. Привожу полученные результаты, но еще раз призываю относиться к ним с большой осторожностью, помня о том, что это предсказанные, а не экспериментально установленные гаплогруппы.
Каждая строка начинается с номера гаплотипа, за которым следует сам 9-маркерный гаплотип (с последовательностью маркеров DYS19, DYS393, DYS390, DYS391, DYS392, DYS385a , DYS385b, DYS389-1, DYS389-2), число повторов гаплотипа, предсказанная гаплогруппа, распределение гаплотипа по популяциям, результат анализа предиктора и результат поиска в Y-Search. Некоторые гаплотипы в опубликованной в статье таблице одинаковые. Я заметил, что одинаковыми являются пары гаплотипов 148 и 149, 152 и 153, 178 и 179, 266 и 267, 342 и 343. Возможно имеются и другие одинаковые гаплотипы. В гаплотипе #150 я заменил значение маркера DYS390 с 12 на 22, т.к. 12 на мой взгляд - это явная опечатка.
-----------------
Те же гаплотипы, сгруппированные по популяциям.
-----------------
Azerb N = 72
348 16 13 25 10 11 12 13 13 29 n = 2 HG: C3 1Turk, 2Azerb, 2Georg, 1Abazin Predictor: C3 - 96.4% Y-Search: C3b (0/9)
43 15 13 24 10 11 12 13 13 30 n = 1 HG: C3? 1Iran_Isfah, 1Azerb Predictor: C3 - 90.7%; I2 - 6.9%; R1a - 2.1% Y-Search: I, R1a, C3 (1/9)
206 14 15 24 8 13 15 18 13 29 n = 1 HG: C3? 1Azerb Predictor: C3 - 32.3%; Q - 29.8%; T - 27.6%; L - 8.4% Y-Search: I2b (4/9)
225 13 13 21 10 12 15 16 13 31 n = 1 HG: E 1Azerb Predictor: E - 51.0%; Q - 45.7%; T - 2.1% Y-Search: E1b1 (2/9)
325 13 13 24 10 11 17 18 13 30 n = 1 HG: E 4Iran_Tehr, 1Azerb Predictor: E - 100% Y-Search: E1b1b1 (0/9)
222 15 14 21 10 11 14 16 12 29 n = 1 HG: E? 1Azerb Predictor: G2a - 97.1%; E - 2.8% Y-Search: E1b1a (0/9)
119 15 14 23 10 11 13 15 12 29 n = 1 HG: G2a3 1Abkhaz, 1Azerb, 1Georg, 2Kabard Predictor: G2a - 94.8%; I1 - 4.1% Y-Search: G (0/9)
214 15 15 22 11 11 12 15 12 28 n = 1 HG: G2a3 1Azerb Predictor: G2a - 97.3%; I1 - 2.1% Y-Search: G (1/9)
235 17 13 22 10 11 14 16 12 28 n = 1 HG: G2a3? 1Azerb Predictor: G2a - 51.2%; I1 - 40.3%; J2 - 2.8%; I2 - 2.0% Y-Search: I1, G2a3b (1/9)
319 15 12 22 10 11 15 17 13 29 n = 1 HG: H 1Iran_Tehr, 1Azerb, 2Chechen Predictor: H - 99.7% Y-Search: H1a (0/9)
234 14 13 22 11 12 14 14 12 28 n = 1 HG: I1 1Azerb Predictor: I1 - 80.0%; G1 - 19.5% Y-Search: I1a (0/9)
215 15 14 23 10 11 13 14 13 29 n = 1 HG: I1? 1Azerb Predictor: C3 - 36.0%; G2a - 29.2%; I1 - 28.9%; J2 - 5.3% Y-Search: I1a (0/9)
219 14 14 23 10 11 13 14 14 32 n = 1 HG: I1? 1Azerb, 1Kabard Predictor: J2 - 58.1%; J2a - 19.0%; J1 - 8.4%; I1 - 6.7% Y-Search: I1 (1/9)
200 16 13 24 11 11 11 12 12 30 n = 1 HG: I2? 1Azerb Predictor: I2 - 92.9%; R1a - 6.5% Y-Search: R1a1, I2a, B, C (3/9)
229 16 13 24 9 11 12 14 14 31 n = 1 HG: I2? 1Azerb Predictor: C3 - 95.8%; R1a - 2.1%; I2 - 2.1% Y-Search: I2a (1/9); C, R1a (2/9)
349 14 12 23 10 11 12 18 13 31 n = 1 HG: J1 1Turk, 1Rutul, 1Armen, 1Azerb, 1Georg Predictor: J1 - 84.5%; J2 - 15.4% Y-Search: J1 (0/9)
338 14 12 23 10 11 13 18 13 30 n = 2 HG: J1? 1Iran_Tehr, 3Iran_Isfah, 2Armen, 2Azerb, 3Georg, 3Kabard, 1Dargin, 2Ingush, 1Chechen Predictor: J1 - 79.1%; J2 - 20.8% Y-Search: J1e, J2a4b (0/9)
224 14 12 23 11 11 13 13 13 30 n = 1 HG: J1? 1Azerb, 1Georg, 1Chechen Predictor: J2 - 82.6%; J1 - 17.2% Y-Search: J1 (0/9)
353 15 12 23 10 11 13 18 13 30 n = 2 HG: J1? 1Rutul, 2Lezgin, 1Armen, 2Azerb Predictor: J1 - 58.4%; J2 - 41.4% Y-Search: J2, J1 (0/9)
202 14 12 23 11 12 13 20 12 31 n = 1 HG: J1? 1Azerb Predictor: J1 - 59.4%; J2 - 29.5%; Q - 10.4% Y-Search: J1e (3/9)
205 14 14 23 11 11 14 18 13 30 n = 1 HG: J1? 1Azerb Predictor: J2 - 75.6%; J1 - 15.1%; E - 7.5% Y-Search: E, J1, R2 (2/9)
207 13 12 23 10 11 12 19 13 31 n = 1 HG: J1? 1Azerb Predictor: J1 - 90.8%; J2 - 8.6% Y-Search: J1, J2a4b1 (2/9)
209 15 12 23 10 11 15 19 14 31 n = 1 HG: J1? 1Azerb, 1Dargin Predictor: J2 - 38.7%; H - 29.3%; J1 - 27.8%; C3 - 2.4% Y-Search: J1e (1/9)
218 14 12 23 11 12 13 20 12 29 n = 1 HG: J1? 1Azerb Predictor: J2 - 48.4%; J1 - 37.3%; Q - 7.2%; L - 7.0% Y-Search: J1 (2/9)
231 14 12 23 9 13 12 18 14 30 n = 1 HG: J1? 1Azerb Predictor: J1 - 52.8%; L - 42.6% Y-Search: L, E1b1a, J1, J2 (3/9)
317 14 12 23 10 11 13 16 13 29 n = 7 HG: J2 6Iran_Tehr, 4Iran_Isfah, 1Osset_Digor, 2Rutul, 1Lezgin, 2Armen, 7Azerb, 1Kabard, 4Dargin, 1Abazin, 2Ingush, 3Chechen Predictor: J2 - 80.7%; J1 - 19.2% Y-Search: J2 (0/9)
25 14 12 22 10 11 12 15 13 31 n = 1 HG: J2 1Iran_Tehr, 1Azerb Predictor: J2 - 81/7%; J1 - 18.3% Y-Search: J2 (1/9)
33 15 12 23 10 11 13 16 13 29 n = 1 HG: J2 1Iran_Tehr, 1Iran_Isfah, 1Osset_Digor, 1Osset_Ardon, 1Armen, 1Azerb, 2Kabard, 1Chechen Predictor: J2 - 98.5% Y-Search: J2 (0/9)
208 17 12 23 10 11 13 15 14 31 n = 1 HG: J2 1Azerb Predictor: J2 - 97.3% Y-Search: J2 (2/9)
227 14 12 21 9 11 13 18 13 29 n = 1 HG: J2 1Azerb Predictor: J2 - 76.3%; J1 - 21.0%; H - 2.3% Y-Search: J2a4 (2/9)
228 14 12 23 9 12 13 18 13 29 n = 1 HG: J2 1Azerb Predictor: J2 - 76.5%; J1 - 20.4% Y-Search: J2a4 (1/9)
236 14 12 22 10 11 13 16 13 30 n = 1 HG: J2 1Azerb, 1Georg Predictor: J2 - 96.3%; J1 - 3.5% Y-Search: J2a4b1 (0/9)
240 14 12 24 11 11 12 12 14 31 n = 1 HG: J2 1Azerb, 1Dargin Predictor: J2 - 81.4%; J1 - 12.1%; I2 - 5.3% Y-Search: J2a2 (2/9)
320 15 12 24 10 11 14 19 13 29 n = 1 HG: J2 2Iran_Tehr, 1Iran_Isfah, 1Turk, 1Armen, 1Azerb Predictor: J2 - 97.4%; J1 - 2.4% Y-Search: J2 (0/9)
210 15 13 23 10 10 12 17 12 28 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 67.6%; G2a - 18.9%; L - 6.6%, G1 - 3.3% Y-Search: I2a, G2a (2/9)
211 14 12 23 10 11 14 18 15 31 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 77.8%; J1 - 21.0% Y-Search: J1, J2 (1/9)
213 14 12 23 10 11 11 18 14 29 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 76.3%; J1 - 21.7% Y-Search: J2, J1 (1/9)
216 14 12 24 11 11 13 15 13 29 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 78.0%; J1 - 21.7% Y-Search: J2a4b, J1 (1/9)
230 14 12 23 11 11 13 13 12 28 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 64.2%; I1 - 30.2%; J1 - 5.6% Y-Search: J2, I1 (1/9)
232 13 12 21 11 11 13 15 12 29 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: J2 - 75.6%; J1 - 21.5% Y-Search: I1, A (3/9)
237 14 12 25 10 11 14 14 13 29 n = 1 HG: J2? 1Azerb, 1Kabard Predictor: J2 - 96.1%; J1 - 3.7% Y-Search: J2, E, I1a (1/9)
239 15 13 22 10 11 13 15 13 30 n = 1 HG: J2? 1Azerb Predictor: G2a - 49.1%; J2 - 27.3%; I1 - 17.4%; Y-Search: G, I1, A, J2, I2 (1/9)
220 15 12 23 10 14 9 16 13 30 n = 1 HG: L 1Azerb, 1Chechen Predictor: L - 99.9% Y-Search: L (2/9)
226 15 11 23 10 16 12 16 13 30 n = 1 HG: L 1Azerb Predictor: L - 99.9% Y-Search: L (3/9)
75 16 11 24 10 15 12 16 13 29 n = 1 HG: L? 1Turk, 1Azerb Predictor: L - 99.8% Y-Search: O3 (4/9)
223 14 14 23 11 16 11 11 14 30 n = 1 HG: N 1Azerb Predictor: N - 100% Y-Search: N1c1 (2/9)
203 13 14 23 10 15 15 17 14 29 n = 1 HG: Q? 1Azerb Predictor: Q - 78.7%; T - 21.3% Y-Search: Q1b (3/9)
201 16 12 25 10 11 11 14 14 31 n = 1 HG: R1a 1Azerb Predictor: R1a - 97.1%; C3 - 2.8% Y-Search: R1a1 (1/9)
324 16 13 25 10 11 12 15 13 30 n = 1 HG: R1a? 1Iran_Tehr, 1Turk, 1Azerb, 3Kabard Predictor: I2 - 43.7%; C3 - 35.3%; R1a - 20.9% Y-Search: R1a1 (0/9)
19 14 12 24 11 14 11 14 13 29 n = 1 HG: R1b 1Iran_Tehr, 1Azerb Predictor: R1b - 96.1%; N - 3.9% Y-Search: R1b (0/9)
71 14 13 23 10 14 12 14 13 29 n = 1 HG: R1b 1Turk, Azerb Predictor: R1b - 75.2%; N - 17.1%; T - 4.0% Y-Search: R1b (0/9)
334 14 12 24 11 13 12 15 13 29 n = 2 HG: R1b 1Iran_Tehr, 2Turk, 5Armen, 2Azerb, 2Georg, 1Kabard Predictor: R1b - 97.8% Y-Search: R1b (0/9)
217 14 12 24 11 13 11 14 13 28 n = 1 HG: R1b 1Azerb Predictor: R1b - 100% Y-Search: R1b (0/9)
233 13 12 22 11 13 11 14 14 30 n = 1 HG: R1b 1Azerb Predictor: R1b - 94.9%; Q - 2.5% Y-Search: R1b (2/9)
65 14 12 25 11 13 13 15 13 29 n = 3 HG: R1b? 1Iran_Isfah, 1Turk, 3Azerb, 1Georg Predictor: J1 - 76.0%; R1b - 21.0% Y-Search: R1b (1/9)
238 14 12 24 11 12 12 14 13 31 n = 1 HG: R1b? 1Azerb Predictor: R1b - 52.1%; J2 - 42.4% Y-Search: R1b, J2 (2/9)
221 14 13 23 10 10 14 20 14 30 n = 1 HG: R2? 1Azerb Predictor: Q - 34.4%; H - 34.1%; J2 - 19.4%; J1 - 4.3% Y-Search: R2, J2 (2/9)
204 14 13 23 10 13 14 16 15 32 n = 1 HG: T 1Azerb Predictor: T - 99.6% Y-Search: T (0/9)
212 14 13 23 10 13 14 15 14 32 n = 1 HG: T 1Azerb Predictor: T - 99.2% Y-Search: K, T (0/9)
329 13 13 23 10 13 15 15 14 30 n = 1 HG: T 1Iran+Tehr, 1Azerb Predictor: T - 97.5%; Q - 2.5% Y-Search: T (0/9)