АвторТема: MitoTyper - тестирование новой разработки!  (Прочитано 1862 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн a1exeyАвтор темы

  • Сообщений: 1
  • Рейтинг +0/-0
Уважаемые коллеги!

Помогите с тестированием новой разработки!

Мы вели работы по созданию программы для анализа образцов мтДНК, и они в своей финальной стадии.
В связи с этим нам очень важно узнать Ваше мнение о программе, получить обоснованную критику.
Мы будем Вам очень признательны, если бы сможете потратить несколько минут и взглянуть на плоды нашего труда.
Для этого - скачайте, пожалуйста, и установите программу по нижеследующей ссылке и напишите свой е-мейл в этой теме или на адрес mitotyper@gmail.com, чтобы получить код активации.

Ссылка на дистрибутив:
http://ifolder.ru/13383826

P.S.

На настоящий момент программа распознает файлы в формате *.ab1, и для корректной работы с ней вам понадобится Microsoft .NET Framework 2.0.
Для ОС Vista и Windows XP (Service Pack 2) и выше никаких дополнительных пакетов устанавливать не надо.

Спасибо!
« Последнее редактирование: 04 Август 2009, 00:38:15 от Grigoriev »

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5522
  • Страна: 00
  • Рейтинг +435/-6
  • Ultimate Matriarchy
Добрый вечер! Когда буду за машиной где стоит Виндоуз - обязательно взгляну. Небольшая просьба - пожалуйста, уточните несколько моментов.


1) По какой лицензии будет распространяться программа? Если она будет поставляться бесплатно областным СМЭ - одно дело, если же это исключительно коммерческая разработка РЦСМЭ - совсем другое.

2) В чем заключается тест? От фонаря, первое что приходит в голову:

- охват Вашей базы, скажем сколько в ней русских образцов? западноевропейских? Популяции бывшего СССР?

- Полиморфизмы кодирующей части молекулы? Если нет то это конечно плохо, если есть - то как представлены - в виде ПДРФ или готовые буковки? Можно ли считать частоту гаплотипа ГВС1+ГВС2+снип в кодирующей части? Или ГВС1+ГВС2+гаплогруппа?

- Качество выравнивания? Дополнительные фичи?

- Могу ли я скажем считать частоту по составному участку из любого набора контигов, скажем хочу ГВС1 с сайта 16075 до 16410 с вырезанным С-трактом?

- Качество описания популяций? Если в использованной публикации было написано "французы в 3м поколении" то я увижу эту информацию в базе?

- Степень автоматизации процесса. Я скормил программе трейс, говорю дай частоту в таджикской популяции - и вижу результат сразу :)


По каждому из этих пунктов проверять серьезный продукт можно долго. Уточните пожалуйста что для Вас важнее.




Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3216
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: MitoTyper - тестирование новой разработки!
« Ответ #2 : 04 Август 2009, 00:31:12 »
Интересно! Валера, спасибо за вопросы.

Ув.a1exey, а Вы не представитесь нам? Кто Вы, что за коллектив, откуда? Как о нас узнали?
Какими еще разработками занимаетесь?
Из какого журнала публикация? Если желаете, мы можем обсудить вопрос размещения Вашей публикации в нашем журнале RJGG (rjgg.org или ru.rjgg.org)...

Спасибо.
« Последнее редактирование: 04 Август 2009, 00:39:18 от Grigoriev »

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 10121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +565/-2
Re: MitoTyper - тестирование новой разработки!
« Ответ #3 : 04 Август 2009, 11:39:13 »
У нас журнал ДНК-генеалогии...  :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100