АвторТема: Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com  (Прочитано 1414 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6246
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1116/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com
« : 10 Июль 2012, 23:09:21 »
На GEDmatch новая фишка - Rare SNP Search Utility, то есть поиск редких (имеется ввиду со специфическими аллельными значениями) снипов.
Цитировать
This utility finds rare SNPs that are shared by more than one person.
It may be useful for identifying SNPs from deep common ancestry,
or SNPs related to shared characteristics.

Что интересно. По моим 5 китам (отец, я, трое детей) вышел набор редких снипов. Причем если для каждого из них можно найти достаточно много совпаденцев, то уже для сочетания двух значений выходим только мы, впятером. Т.е. можно сказать, что эти два значения характерны для нашей семьи и унаследваны по мужской линии (по крайней мере от моего отца).

Оффлайн Valikhan

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 2371
  • Страна: kz
  • Рейтинг +101/-1
  • Ysearch 63CDM. Mitosearch EEVT3
    • Turkic World
  • Y-ДНК: N1c1d1 - L1034 (L1032, L1033)
  • мтДНК: B5a1a
Re: Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com
« Ответ #1 : 16 Июль 2012, 15:30:10 »
Олсон проапгрейдил этот тул и для некоторых снипов можно узнать географическое происхождение.
Вот несколько из моих с дочкой:
 rs36017044 East Asia/Poland
rs3772174 Ireland
rs12218766 East Asia/Poland
rs12569222 Guatemala/Hungary/Poland/Ukraine

Обращает на себя внимание связь Восточной Европы с Восточной же Азией.

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 388
  • Страна: us
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com
« Ответ #2 : 09 Август 2012, 18:52:24 »
На GEDmatch новая фишка - Rare SNP Search Utility, то есть поиск редких (имеется ввиду со специфическими аллельными значениями) снипов.
Цитировать
This utility finds rare SNPs that are shared by more than one person.
It may be useful for identifying SNPs from deep common ancestry,
or SNPs related to shared characteristics.

Что интересно. По моим 5 китам (отец, я, трое детей) вышел набор редких снипов. Причем если для каждого из них можно найти достаточно много совпаденцев, то уже для сочетания двух значений выходим только мы, впятером. Т.е. можно сказать, что эти два значения характерны для нашей семьи и унаследваны по мужской линии (по крайней мере от моего отца).
"The webpage cannot be found"  :'(

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6246
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1116/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com
« Ответ #3 : 09 Август 2012, 20:09:15 »
Да. Опция пропала... Кто у нас общается лично с администраторами GEDmatch? В чем там дело?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 34615
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2952/-47
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Rare SNP Search Utility @GEDmatch.Com
« Ответ #4 : 09 Август 2012, 20:44:04 »
Да. Опция пропала... Кто у нас общается лично с администраторами GEDmatch? В чем там дело?
Думаю, идёт отладка.
Слишком большой замах в проекте и слишком много ляпов и недоделок, требующих доводки.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100