0 Пользователей и 10 Гостей просматривают эту тему.
Вижу сообщение уважаемого Semargl http://forum.molgen.org/index.php/topic,5782.msg470154/topicseen.html#msg470154и хотел узнать мнение знатоков: не лучше ли WGS (Whole Genome Sequencing) 30X на Illumina NovaSeq 6000 за $180, чем апгрейд c Y-37 до Big Y за $319 на FTDNA? Всё равно ведь задача загрузить на YFULL или что-то существенное упускаю из вида?
Что касается сравнения WGS с Big Y700, то при равных характеристиках чтения, любой WGS лучше. Не помню какая сейчас длина чтения у Данте, но если 100 как раньше, то Y700 от FTDNA будет лучше с их длиной больше 150bp.
А длина рида и Данте теперь 150 bp. Я не знаю по последним тестам, но даже с 100 bp покрытие игрека примерно 99,8% с глубиной примерно 20Х. У BigY покрытие примерно 80% с глубиной примерно 40Х.
не лучше ли WGS (Whole Genome Sequencing) 30X на Illumina NovaSeq 6000 за $180, чем апгрейд c Y-37 до Big Y за $319 на FTDNA? Всё равно ведь задача загрузить на YFULL или что-то существенное упускаю из вида?
Если задача только снипы сделать и нет проблем со вторичным взятием образцов, то можно WGS рассмотреть этот вариант.Если планируется и маркеры задействовать (к снипам), а затем их сравнить с большим количеством других протестированных, то все равно ФТДНА.
В субклад R-Z92 добавлен новый субклад R-Y62303 с SNPs BY100539, Y61822, Y62303, Y64044, Y66168, Y66612, Y68434, Y69475, Y69526, Y71131, Y71390, Y73959, Y74389, Y74784, Y76003, Y77012.
Цитата: Semargl от 29 Ноябрь 2019, 10:58:22В субклад R-Z92 добавлен новый субклад R-Y62303 с SNPs BY100539, Y61822, Y62303, Y64044, Y66168, Y66612, Y68434, Y69475, Y69526, Y71131, Y71390, Y73959, Y74389, Y74784, Y76003, Y77012.Это id:YF67567 и id:YF07740?
Цитата: Feroce от 29 Ноябрь 2019, 12:46:45Цитата: Semargl от 29 Ноябрь 2019, 10:58:22В субклад R-Z92 добавлен новый субклад R-Y62303 с SNPs BY100539, Y61822, Y62303, Y64044, Y66168, Y66612, Y68434, Y69475, Y69526, Y71131, Y71390, Y73959, Y74389, Y74784, Y76003, Y77012.Это id:YF67567 и id:YF07740?Да. Это получается третья ветвь под Z92
Класс, можно всем говорить, что Толкиен родственник и пофиг, что предок жил 4400 лет назад.
Цитата: Alexey_V.B. от 09 Ноябрь 2019, 23:07:52не лучше ли WGS (Whole Genome Sequencing) 30X на Illumina NovaSeq 6000 за $180, чем апгрейд c Y-37 до Big Y за $319 на FTDNA? Всё равно ведь задача загрузить на YFULL или что-то существенное упускаю из вида?Если задача только снипы сделать и нет проблем со вторичным взятием образцов, то можно WGS рассмотреть этот вариант.Если планируется и маркеры задействовать (к снипам), а затем их сравнить с большим количеством других протестированных, то все равно ФТДНА.
Заказал ugrade Y-37 до Big Y - Batch 1031. FTDNA планирует завершить 9 марта, надеюсь к концу марта будет готов.
Цитата: Alexey_V.B. от 03 Декабрь 2019, 14:24:02Заказал ugrade Y-37 до Big Y - Batch 1031. FTDNA планирует завершить 9 марта, надеюсь к концу марта будет готов.А для какого кита?