Гаплогруппа G2a1a L293.

[Fire]

Mold3      male   G2a1  GS000021476-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000021476-DID/ASM/
Abkhaz5  male   G2a1  GS000018407-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018407-DID/ASM/
Lezg3      male   G2a1  GS000018399-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018399-DID/ASM/
NOsset2  male   G2a1  GS000018413-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018413-DID/ASM/
NOsset6  male   G2a1  GS000018414-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018414-DID/ASM/

Дерево от Эстонской Лаборатории
http://s019.radikal.ru/i637/1502/11/555aeca1af40.jpg

[сармат]

Интересная картина по J2a и G2a. В особенности география.

[сармат]

Жаль правда что там только два осетина протестировали на Big-Y. Притом с одной гаплогруппы и даже с одного субклада.

[Fire]

Дерево от Эстонской Лаборатории
http://s019.radikal.ru/i637/1502/11/555aeca1af40.jpg

Это дерево основано на различиях в STR маркерах или же они SNP тоже тщательно разобрали ?

Дерево основано на SNP данных

[G-Man]

Кто нибудь может пробить VCF файлы данных субъектов на наличие или отсутствие снипов ..?

Lezg3   GS000018399-DID   Lezgins Dagestan_Makhachkala
G2a1a1a2 FGC1160+   FGC1159+


Mold3   GS000021476-DID   Moldavians   
G2a1a1a1 Z6638+

equivalents: F3099 (20920932 G->A), FGC645/Z6632 (3286594 G->A), FGC649/Z6706 (3436849 G->C), FGC654/Z6633 (4103438 C->T), FGC657/Z6634(4875204 C->T), FGC665/Z6637 (6523505 T->A), FGC671/Z6640 (7201442 A->G),  FGC675/Z6635 (7401406 T->G), FGC676/Z6643 (7521305 A->G), FGC694/Z6654 (9875076 G->A), FGC698/Z6670 (14090458 A->G), FGC713/Z6677 (14966960 A->G), FGC725/Z6687 (16706014 G->A), FGC726/Z6688 (16822896 A->G), FGC731/Z6691 (17735981 T->A), FGC732/Z6692 (18033285 T->A), FGC734/Z6694 (18064524 A->G), FGC738/Z6697 (18584780 C->A), FGC751/Z6714 (21277501 G->A), FGC761/Z6720 (22216590 G->T), FGC763/Z6728 (22470116 G->T), FGC765/Z6734 (22565625 G->A), FGC766/Z8014 (22616539 C->T),  Z6639 (7446025 A->G)

Невыделенные жирным снипы - положительные.
По выделенным снипам нет информации в VCF. Вполне вероятно, что они отрицательные – многовато снипов скопилось на уровне G2a1a1a1.


Abkhaz5   GS000018407-DID   Abkhazians   Abkhazia_Gudauta
G2a1a1a1a1 Z7940+

equivalents: FGC692 (9398814 C->G), Z7956 (3739922 C->A), Z7957 (5110314 T->G),Z7961 (14263684 C->T), Z8008 (14581807 G->A), Z8011 (18588967 C->T)

Все +, кроме Z7957 (нет информации).
По нисходящим снипам также нет данных. Вероятно, минус.


NOsset2 GS000018413-DID   North-Ossetians   North_Ossetia_Chikola_Lesken
NOsset6 GS000018414-DID   North-Ossetians   North_Ossetia_Novyy-Batako

G2a1a1a1a1b1 Z7947 equivalents: FGC677 (7684012 G->A), FGC681 (8103927 A->G), FGC717 (15466762 C->T), FGC718 (15604482 C->G), FGC723 (16348599 A->C), FGC729 (17434600 G->C), FGC730 (17585176 T->A), FGC745 (19120315 T->C), FGC756 (21826021 A->G), FGC767 (22678493 G->A), FGC770 (22911676 C->T), FGC775 (23595687 A->C), FGC777 (23895077 T->G), Z7948 (7236385 G->T)
G2a1a1a1a1b1 Z7947 found shared in Z7947 men but not tested in other relevant men: Z17856 (3544963 G->A)

Все +

[Fire]

Lezg3   GS000018399-DID   Lezgins Dagestan_Makhachkala
G2a1a1a2 FGC1160+   FGC1159+

Ближе к Семенову или к ветви Кагермазов-Ашкеназы ?

Abkhaz5   GS000018407-DID   Abkhazians   Abkhazia_Gudauta
G2a1a1a1a1 Z7940+

equivalents: FGC692 (9398814 C->G), Z7956 (3739922 C->A), Z7957 (5110314 T->G),Z7961 (14263684 C->T), Z8008 (14581807 G->A), Z8011 (18588967 C->T)

Все +, кроме Z7957 (нет информации).
По нисходящим снипам также нет данных. Вероятно, минус.

по Z7957 есть информация у двух Осетин Эстонской работы?
если есть значит они тестировали этот снип, и значит что скорее всего Абхаз отрицателен на него

Mold3   GS000021476-DID   Moldavians   
G2a1a1a1 Z6638+

equivalents: F3099 (20920932 G->A), FGC645/Z6632 (3286594 G->A), FGC649/Z6706 (3436849 G->C), FGC654/Z6633 (4103438 C->T), FGC657/Z6634(4875204 C->T), FGC665/Z6637 (6523505 T->A), FGC671/Z6640 (7201442 A->G),  FGC675/Z6635 (7401406 T->G), FGC676/Z6643 (7521305 A->G), FGC694/Z6654 (9875076 G->A), FGC698/Z6670 (14090458 A->G), FGC713/Z6677 (14966960 A->G), FGC725/Z6687 (16706014 G->A), FGC726/Z6688 (16822896 A->G), FGC731/Z6691 (17735981 T->A), FGC732/Z6692 (18033285 T->A), FGC734/Z6694 (18064524 A->G), FGC738/Z6697 (18584780 C->A), FGC751/Z6714 (21277501 G->A), FGC761/Z6720 (22216590 G->T), FGC763/Z6728 (22470116 G->T), FGC765/Z6734 (22565625 G->A), FGC766/Z8014 (22616539 C->T),  Z6639 (7446025 A->G)

Невыделенные жирным снипы - положительные.
По выделенным снипам нет информации в VCF. Вполне вероятно, что они отрицательные – многовато снипов скопилось на уровне G2a1a1a1.

По выделенным снипам что у Абхазца?

[Fire]

У Lezg3  male   G2a1  GS000018399-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018399-DID/ASM/   имеется снип - G2a1a1a FGC715/Z6679  equivalents: FGC733/Z6693 (18039294 T->C)

Y   18039294   .   T   C   .   .   NS=1;AN=1;AC=1   GT:PS:FT:GQ:HQ:EHQ:CGA_CEHQ:GL:CGA_CEGL:DP:AD:CGA_RDP   1:.:PASS:505:505,.:505,.:52,.:-505,0:-52,0:20:20,.:0

а также "G2a1a1a1 Z6638 equivalents: F3099 (20920932 G->A)"
Y   20920932   .   G   A   .   .   NS=1;AN=1;AC=1;CGA_XR=dbsnp.79|rs233744;CGA_FI=159119|NM_001001877.1|HSFY2|INTRON|UNKNOWN-INC&159119|NR_003509.1|HSFY2|INTRON|UNKNOWN-INC;CGA_SDO=1   GT:PS:FT:GQ:HQ:EHQ:CGA_CEHQ:GL:CGA_CEGL:DP:AD:CGA_RDP   1:.:PASS:119:119,.:119,.:43,.:-119,0:-43,0:19:19,.:0

Два снипа F3099 (20920932 G->A)  и FGC733/Z6693 (18039294 T->C)
кажется не охватываются тестом Big-Y
поэтому эти два снипа могут быть эквивалентами снипа FGC715/Z6679

[Fire]

У осетина NOsset2  male   G2a1  GS000018413-DID  -  http://evolbio.ut.ee/chrY/GS000018413-DID/ASM/    имеется такая запись -

Y   5110314   .   T   G   .   .   NS=1;AN=1;AC=1;CGA_XR=dbsnp.126|rs35277547;CGA_FI=83259|NM_032973.1|PCDH11Y|INTRON|UNKNOWN-INC;CGA_RPT=Tigger1|TcMar-Tigger|18.1;CGA_SDO=1   GT:PS:FT:GQ:HQ:EHQ:CGA_CEHQ:GL:CGA_CEGL:DP:AD:CGA_RDP   1:.:PASS:54:54,.:54,.:24,.:-54,0:-24,0:5:3,.:2

Наверно означает наличие этого снипа -  Z7957 (5110314 T->G)

Спасибо большое!
Значит Абхазец Z7957- скорее всего в "родительской" ветви и к Дигорцам Z7957+  Z7941+ и к Иронцам(Ос-Багатаровцам) Z7957+ Z7947+

[Fire]

Два снипа F3099 (20920932 G->A)  и FGC733/Z6693 (18039294 T->C)
кажется не охватываются тестом Big-Y
поэтому эти два снипа могут быть эквивалентами снипа FGC715/Z6679

То есть Семёнова не проверяли на снип G2a1a1a1 Z6638 equivalents: F3099 (20920932 G->A) ?

Проверил данные и Семенова и данные Микадзе у обоих нет данных на этот снип

[G-Man]

Lezg3   GS000018399-DID   Lezgins Dagestan_Makhachkala
G2a1a1a2 FGC1160+   FGC1159+

Ближе к Семенову или к ветви Кагермазов-Ашкеназы ?

К Семенову точно не близок (нет данных ни по одному «приватнику» Семенова у лезгина).
Ашкеназских снипов с дерева Бэнкса также нет.

По выделенным снипам что у Абхазца?

FGC657/Z6634, FGC665/Z6637 нет данных. Остальные +.

Проверил данные и Семенова

У Семенова +.
F3099 действительно уровня G2a1a1a FGC715/Z6679.

[Fire]

Lezg3   GS000018399-DID   Lezgins Dagestan_Makhachkala
G2a1a1a2 FGC1160+   FGC1159+

Ближе к Семенову или к ветви Кагермазов-Ашкеназы ?

К Семенову точно не близок (нет данных ни по одному «приватнику» Семенова у лезгина).
Ашкеназских снипов с дерева Бэнкса также нет.

У Лезгина
FGC1119 ?   9982407   no-call   =   ?

Возможно Лезгин "родительский" к двум ветвям если он FGC1119-

[Fire]

Снип  A205+   (отрицателен у двоих других  NOsset2 и  Berezov)
Dzutsev и NOsset6     ->  23545405   snp   G   T   586   586

A200+   (Dzutsev + NOsset6)  15072838   snp   T   C   688   688 (отрицателен у двоих других  NOsset2 и  Berezov)
A199+   (Dzutsev + NOsset6) 8262108   snp   G   A (отрицателен у двоих других  NOsset2 и  Berezov)




NOsset6   male   G2a1   North-Ossetians   North-Ossetians   North_Ossetia_Novyy-Batako   Russia   Caucasus   North_Caucasus   43,215936   44,496689   GS01567-DNA   blood   normal   135   2.2.0.26   2,2   GS01567-DNA_B08   GS000013739-ASM   GS000018414-DID   non commercial, academic research   freely downloadable

[Fire]

YFull Experimental YTree v3.6 - http://yfull.com/tree/G/
Composite Y-DNA Tree - https://sites.google.com/site/compositeytree/g

G-Y5797 FGC602/Z6562 * FGC586/Z6544 * FGC7543/Z6589... 75 SNPs formed 17700 ybp, TMRCA 9500 ybp
G-Z17775 Y7123 * Z17774 * Y7122... 3 SNPs formed 9500 ybp, TMRCA 5800 ybp      G2a1a2 Z17774
G-Z6653 Z6653 * Z6638 * Z6687...     2 SNPs formed 9500 ybp, TMRCA 7000 ybp      G2a1a1 FGC693/Z6653

Не слишком ли завышен возраст ...  Если ветвь G2a1a1 FGC693/Z6653 откололась 9500 лет назад (время образования ветви или снипа) - так они могли попасть на Кавказ без всяких там блужданий на запад или восток.. (TMRCA - это время жизни общего предка современных ветвей).

У  Германа G2a1a старее ветвь но 35 собственых снипов(его нет на дереве YFull)
У Семенова G2a1a1b помоложе но 50  собственых снипов

[Fire]

http://yfull.com/tree/G/   YFULL даёт ветви Z17775+  (В проекте  G2a1b YCA=13, 21)(G2a1a2a Z17775)  9500 лет в то время как ветке ныне живущего пенджабца id:HG03708PJL где-то 5800 лет - там не учитывался 11871   Phillips возраст которого приблизительно  58*118=6844 лет G2a1a2 Z17774/Z1775+  (G2a1b)

Другой ветви Z6653 также 9500 лет. (https://sites.google.com/site/compositeytree/g G2a1a1 FGC693/Z6653 10.5 KY) Общий предок кавказцев этой ветки жил 7000 лет назад (TMRCA - время жизни общего предка современных ветвей - id:YF02867RUS [RU-KC]new карачаевец)  Очевидно, что ветви FGC1160 и Z6638 разошлись именно в этот период..
G2a1a Dys505=9, Z6616+   204988   German попадает в промежуток между 9500 и 7000 лет, а 310961   Rodenberg намного старше... G2a1b Z30704+  108*118=12744 лет.

Для примера YFULL даёт снипу Z645 гапло R1a всего лишь 5400 лет, так что сомневаться в завышение возраста не приходиться..

Вот что Рэй Бэнкс отправил Герману который на ветке которая выше чем ветка Семенова
Finally, there is a group of 30 SNP mutations which I have listed as just ‘new’ for you.  These are the real treasure here.  These were acquired by your paternal grandparents .  If someone in the P16 subgroup shares one or more of these in the future, it will be the basis of a new subgroup and thus provide insights into the geographical pattern of your ancestral movements.  It is thought that one of these mutations in Big Y occurs about once every 150 yrs.  This means it has been about 4500 yrs since you last shared a common male ancestor with anyone, like you, who has had sequencing.
 

[G-Man]

falcon16

Все нормально там.

У карачаевца YF02867 52 приватных снипа

У мегрела YF03017 27 приватных + 5 снипов уровня G-Z7958 + 21 снип уровня G-Z6634 = 53 снипа

Как видите, одно и то же расстояние. Поэтому 7000 лет - вполне реальный TMRCA кавказских G2a1a.