АвторТема: Новый J1 снип: L147  (Прочитано 6427 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11540
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2105/-8
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #30 : 27 Декабрь 2017, 10:37:03 »
здесь уж больно часто повторяется мутация на разных ветвях. Получаестя , что с некой долей вероятности и друие снипы, по  котрым строили логику определения ветвей, тоже рано или поздно могут выплыть повторения.

Не вижу ничего негативного в этом, тем более в эпоху такого сравнительно доступного NGS, как Big Y. Да и до Big Y никто этих появляющихся в разных гаплогруппах полиморфизмов не боялся.
« Последнее редактирование: 27 Декабрь 2017, 10:47:07 от Yaroslav »

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11540
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2105/-8
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #31 : 27 Декабрь 2017, 10:44:17 »
Интересно что влияет на появление этого снипа, или даже может что влияет на выявление это снипа только у некоторых.

Точечные мутации, как и для всех полиморфизмов. Но, насколько я понимаю, L147.1 показал свою нестабильность в пределах своей ветки (у кого-то он есть, а у кого-то нет), почему его и нет в YFull.

Я не специалист в молекулярной ДНК генеалогию, но есть скорей всего грешная мысль что этот снип мог появиться еще в гаплогруппе IJ, но по каким то причинам его трудно выявить.

Без разницы. Если он то входит, то выходит (с), нет смысла обращать на него внимание.

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4551
  • Страна: ru
  • Рейтинг +300/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3128
  • мтДНК: V16
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #32 : 27 Декабрь 2017, 12:47:26 »
здесь уж больно часто повторяется мутация на разных ветвях. Получаестя , что с некой долей вероятности и друие снипы, по  котрым строили логику определения ветвей, тоже рано или поздно могут выплыть повторения.

Не вижу ничего негативного в этом, тем более в эпоху такого сравнительно доступного NGS, как Big Y. Да и до Big Y никто этих появляющихся в разных гаплогруппах полиморфизмов не боялся.
В плане способов аналитики для "отсева" подобных "ловушек" да, проблем, тем более с приходом BigY, нет. Но вот если предположить что если охват  населения "снипированием" увеличить хотя бы до 5-7% вот тогда, надо полагать, количество "нестабильных" мутуций увеличится. А L147 всё-таки хотелсь пониять, почему его сразу не выкинули, а стали индексировать - вот в чём вопрос, впрочем это уже не так важно.

Оффлайн Serge1

  • Сообщений: 195
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #33 : 29 Декабрь 2017, 21:39:07 »
Но поглядим, что ответят на запрос специалисты из FTDNA- просто  жуть как интересно.
Они ответили, но без конкретного ответа)))
Цитировать
This is a recurrent SNP that occurs in multiple branches of the tree. This is a somewhat antiquated nomenclature for it, meaning that SNP L147 occurs in J1, J2, and I, and is designated by L147.1 in J1, L147 in J2, and L147.2 in I. In other words, it's the same SNP, it just occurs in multiple places on the tree.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11540
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2105/-8
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #34 : 29 Декабрь 2017, 21:54:07 »
В плане способов аналитики для "отсева" подобных "ловушек" да, проблем, тем более с приходом BigY, нет. Но вот если предположить что если охват  населения "снипированием" увеличить хотя бы до 5-7% вот тогда, надо полагать, количество "нестабильных" мутуций увеличится. А L147 всё-таки хотелсь пониять, почему его сразу не выкинули, а стали индексировать - вот в чём вопрос, впрочем это уже не так важно.

Так и не понял, в чём заключается "ловушка"? Если один и тот же полиморфизм возникает в разных гаплогруппах, но стабилен в своих гаплогруппах, он вполне может использоваться как в филогении, так и в расчёте возрастов.

Они ответили, но без конкретного ответа)))

Они ответили слово в слово, как сказали выше уважаемый ТАРАНТАС и я: этот полиморфизм появился в разных гаплогруппах. Единственно, только, по каким-то причинам YFull, например, не стал включать его в своё дерево.
« Последнее редактирование: 29 Декабрь 2017, 22:15:28 от Yaroslav »

Оффлайн Serge1

  • Сообщений: 195
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #35 : 29 Декабрь 2017, 22:02:03 »
Они ответили слово в слово, как сказали выше уважаемый ТАРАНТАС и я: этот полиморфизм случается в разных гаплолгруппах. Единственно, только, по каким-то причинам YFull, например, не стал включать его в своё дерево.
Да, но они не ответили почему у них снип L147 еть на ветке J2, а на J1 нету.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 11540
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2105/-8
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #36 : 29 Декабрь 2017, 22:23:58 »
Да, но они не ответили почему у них снип L147 еть на ветке J2, а на J1 нету.

А, ну тогда придётся ещё раз переспрашивать, почему там есть, а здесь нет. :) Хотя, как по мне, более интересно, почему всё-таки YFull вообще не стал включать его в своё дерево ни в одной из гаплогрупп.

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4551
  • Страна: ru
  • Рейтинг +300/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3128
  • мтДНК: V16
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #37 : 02 Январь 2018, 01:49:16 »
В плане способов аналитики для "отсева" подобных "ловушек" да, проблем, тем более с приходом BigY, нет. Но вот если предположить что если охват  населения "снипированием" увеличить хотя бы до 5-7% вот тогда, надо полагать, количество "нестабильных" мутуций увеличится. А L147 всё-таки хотелсь пониять, почему его сразу не выкинули, а стали индексировать - вот в чём вопрос, впрочем это уже не так важно.

Так и не понял, в чём заключается "ловушка"? Если один и тот же полиморфизм возникает в разных гаплогруппах, но стабилен в своих гаплогруппах, он вполне может использоваться как в филогении, так и в расчёте возрастов.
Под словом "ловушка" я имел в виду все полимрфизмы и их природу, а не именно L147. Бывают же и не стабильные в гаплогруппах и субкладах, а полносью ситематизировать их невозможно при таком, увы,  малом проценте протестированных людей от населения Земли. Посему там могут быть и ловушки... 

Оффлайн VictorV.

  • Сообщений: 4551
  • Страна: ru
  • Рейтинг +300/-16
    • Дворянский род Безручко-Высоцких и другие фамилии.
  • Y-ДНК: J-ZS3128
  • мтДНК: V16
Re: Новый J1 снип: L147
« Ответ #38 : 02 Январь 2018, 02:04:44 »

Они ответили слово в слово, как сказали выше уважаемый ТАРАНТАС и я: этот полиморфизм появился в разных гаплогруппах. 

Да, как минимум теперь стало понятным, что  инлексируют, а не выкинули  его не потому, что он одинаков на разных ветвях, а потому что он в этих гаплах стабилен внутри каждой их них.
Стало быть Сергею всё-таки стоит держать его в обойме на всякий случай и выше я был неправ, советуя ему забыть про него. Ну, а  теперь настаиваю на том, что хотя природа этой мутации и одинакова, но как известно снипы имеют своё  значение только в цепочках, т.е. связках как блокчейны, а не по отдельности, посему ИМХО считаю что это разные снипы с учётом вполне себе достойного проживания в разных связках этой мутации и вот по этой причине их   проиндексировали - в технической документации индекс показыввает различе по назначению и применению при структурной  схожести. Ну, скажем, поступили логично,  предложив это решение с учётом стабильности этой мутации в разных группах.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100