Повозился ещё с разбором GLI002 - да, сложный случай.
Есть как положительные, так и отрицательные единичные прочтения на уровне M269.
Вот ещё два случая за (двойные прочтения):
Y429* C>T
chrY:22 530 830
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 0
T : 2 (100%, 0+, 2- )
N : 0
PF6412* G>A
chrY:5 224 862
Total count: 2
A : 2 (100%, 0+, 2- )
C : 0
G : 0
T : 0
N : 0
А это три случая против:
YSC0000072**** T>C
chrY:7 766 712
Total count: 3
A : 0
C : 0
G : 0
T : 3 (100%, 2+, 1- )
N : 0
YSC0000238**** G>C
chrY:23 242 935
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 2 (100%, 0+, 2- )
T : 0
N : 0
CTS10834*** T>C
chrY:22 796 697
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 0
T : 2 (100%, 1+, 1- )
N : 0
Так что пусть спецы посмотрят по гаплогруппе E. Может, там более однозначно.