Хм. Я так сделал специально.
Александр прав.
Ведь насколько я понимаю, минимальный набор данных, при котором нужно использовать "Метод выборочных пар" - 3 гаплотипа.
Два гаплотипа это уже не ветви, а черенок от лопаты )
Для двух гаплотипов нужно использовать ASD или линейный метод.
На самом деле для 2-х гаплотипов и линейный и классический методы также будут безбожно врать, точнее, разброс оценки будет также велик, как и для метода выборочных пар. Поэтому для 2-х гаплотипов можно использовать Метод выборочных пар.
Именно одновременно и независимо для одного и того же набора гаплотипов можно использовать все три метода. Другое дело, что метод выборочных пар по сравнению с классическим и линейным методами дополнительно требует предварительной филогенической обработки совокупности гаплотипов и разделения их на ветви. Такова плата за более точную оценку ВБОП.
Забавно то, что для двух гаплотипов мы АВТОМАТИЧЕСКИ имеем БЕЗОШИБОЧНОЕ филогеническое решение: две ветви, в каждой из которых по одному гаплотипу
. Таким образом, для двух гаплотипов оценка ВБОП по методу выборочных пар должна быть вроде бы лучше, чем для классического метода. Но с другой стороны, если посмотреть на вычислительные формулы МВП и классического методов, то для двух гаплотипов формула МВП вырождается и совпадает с формулой для классического метода